Jmol
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1. 개요
Jmol은 자바 프로그래밍 언어로 작성된 분자 시각화 프로그램이다. 윈도우, macOS, 리눅스, 유닉스 등 자바가 설치된 다양한 운영체제에서 실행되며, 자유-오픈 소스 소프트웨어로 GNU Lesser General Public License (LGPL) 버전 2.0으로 배포된다. 독립 실행형 애플리케이션과 소프트웨어 개발 키트(SDK) 형태로 제공되며, 분자를 다양한 방식으로 표시하는 기능을 제공하고, 웹 페이지에 통합 가능한 애플릿 형태로도 사용 가능하다. 단백질 데이터 은행(pdb) 등 다양한 화학 파일 형식을 지원하며, 자바스크립트 전용 버전인 JSmol은 자바가 없는 환경에서도 사용할 수 있다. Jmol은 더 이상 개발되지 않는 MDL 차임 플러그인의 대안으로, 다양한 브라우저 및 플랫폼에서 작동한다.
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Jmol - [IT 관련 정보]에 관한 문서 | |
---|---|
일반 정보 | |
![]() | |
개발자 | Jmol 개발팀 |
최초 릴리스 | 2001년 |
최신 릴리스 날짜 | }} |
프로그래밍 언어 | 자바 |
운영체제 | 크로스 플랫폼 |
플랫폼 | 자바 및 자바가 없는 웹 브라우저 |
지원 언어 | 카탈루냐어 중국어 체코어 덴마크어 네덜란드어 영어 프랑스어 독일어 헝가리어 인도네시아어 이탈리아어 한국어 포르투갈어 스페인어 터키어 우크라이나어 |
언어 수 | 16 |
장르 | 분자 모델링 |
라이선스 | LGPL 2.0 |
웹사이트 | www.jmol.org |
리포지토리 | sourceforge.net/projects/jmol |
상세 정보 | |
설명 | 오픈 소스 자바 뷰어, 3D 화학 구조용 |
2. 소프트웨어
Jmol은 자바로 작성되었으며, 자바가 설치되어 있다면 윈도우, macOS, 리눅스, 유닉스 운영 체제에서 실행할 수 있다. GNU Lesser General Public License (LGPL) 버전 2.0으로 배포되는 자유-오픈 소스 소프트웨어이다. 독립 실행형 애플리케이션과 소프트웨어 개발 키트 (SDK)가 존재하며, 바이오클립스 및 타버나와 같은 다른 자바 애플리케이션에 통합될 수 있다.
2. 1. 기능
Jmol은 웹 페이지에 통합되어 다양한 방식으로 분자를 표시할 수 있는 애플릿 기능을 제공한다. 예를 들어, 공-막대 모형, 공간 채움 모형, 리본 다이어그램 등으로 분자를 나타낼 수 있다.[4] Jmol은 단백질 데이터 은행 (pdb), 결정학 정보 파일 (cif), MDL 몰파일 (mol), 화학 마크업 언어 (CML) 등 다양한 화학 파일 형식을 지원한다. 자바가 없는 컴퓨터에서도 사용할 수 있는 자바스크립트 전용 (HTML5) 버전인 '''''JSmol'''''도 있다.[5]Jmol 애플릿은 더 이상 활발하게 개발되지 않는 차임 플러그인의 대안을 제공한다.[3] Jmol에는 차임에 없는 많은 기능이 있지만, 특히 ''Sculpt'' 모드를 포함하여 차임의 모든 기능을 재현하지는 않는다.
2. 2. JSmol
'''JSmol'''은 자바스크립트 전용 (HTML5) 버전으로, 자바가 없는 컴퓨터에서도 Jmol을 사용할 수 있게 해준다.[5]2. 3. 차임과의 비교
Jmol 애플릿은 더 이상 활발하게 개발되지 않는 차임 플러그인의 대안을 제공한다.[3] Jmol은 차임에 없는 많은 기능을 가지고 있지만, 특히 ''Sculpt'' 모드를 포함하여 모든 차임 기능을 재현한다고 주장하지는 않는다. 차임은 플러그인 설치와 마이크로소프트 윈도우에서 인터넷 익스플로러 6.0 또는 파이어폭스 2.0, 또는 Mac OS 9에서 넷스케이프 커뮤니케이터 4.8을 필요로 한다. 반면 Jmol은 자바 설치를 필요로 하며, 모질라 파이어폭스, 인터넷 익스플로러, 오페라, 구글 크롬, 사파리 등 다양한 플랫폼에서 작동한다.3. 스크린샷
Jmol을 사용하여 생성한 다양한 스크린샷을 통해 분자 구조를 시각적으로 확인할 수 있다.
3. 1. 주요 스크린샷 예시
참조
[1]
웹사이트
Jmol translations
https://translations[...]
[2]
서적
Guide to Graphics Software Tools
https://books.google[...]
[3]
간행물
Biomolecules in the Computer: Jmol to the Rescue
http://eric.ed.gov/E[...]
[4]
서적
How to Use Jmol to Study and Present Molecular Structures, Volume 1
https://books.google[...]
[5]
웹사이트
JSmol
http://wiki.jmol.org[...]
2015-11-02
[6]
웹사이트
Jmol translations
https://translations[...]
[7]
간행물
Biomolecules in the Computer: Jmol to the Rescue
http://eric.ed.gov/E[...]
[8]
서적
Guide to Graphics Software Tools
https://books.google[...]
[9]
서적
How to Use Jmol to Study and Present Molecular Structures, Volume 1
https://books.google[...]
[10]
간행물
Processing CML conventions in Java
http://www.mendeley.[...]
[11]
웹사이트
JSmol
http://wiki.jmol.org[...]
2015-11-02
[12]
웹사이트
Jmol translations
https://translations[...]
[13]
서적
Guide to Graphics Software Tools
https://books.google[...]
[14]
간행물
Biomolecules in the Computer: Jmol to the Rescue
http://eric.ed.gov/E[...]
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