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부유균문

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목차

1. 개요

부유균문(Planctomycetota)은 플랑크토미케스강에 속하는 세균 문으로, 세포 구조, 생리적 특성 및 분류학적 특징을 공유한다. Planctomycetota는 일반적으로 분홍색 또는 흰색 집락을 형성하며, 구형, 타원형 또는 배 모양의 세포 구조를 가지고 있다. 이들은 호기성 호흡을 하며, 다른 박테리아와는 달리 줄기 모양의 구조를 사용하여 생물막 생산을 돕고, 지질 및 지방산 조성이 다른 과들과 차이를 보인다. 현재 LPSN 및 NCBI를 기반으로 분류되며, 2022년 기준으로 Planctomycetaceae 내에 14개의 속과 29개의 종이 존재한다.

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부유균문 - [생물]에 관한 문서
플랑크토미케스과
플랑크토미케스 베케피이의 현미경 이미지. 세포를 덩어리로 연결하는 줄기 모양 구조를 보여준다.
플랑크토미케스 베케피이, 줄기 모양 구조로 세포를 덩어리로 연결하는 모습
분류학적 정보
상위 분류플랑크토미케스목
학명Planctomycetaceae Schlesner and Stackebrandt 1987
명명자Schlesner and Stackebrandt 1987
하위 분류
속Ancalichlamydia
Aquisphaera
Blastopirellula
Gimesia
Isosphaera
Pirellula
Planctopirus
Planctomyces
Rhodopirellula
Schlesneria
Zavarzinella
참고 자료
LPSN플랑크토미케스목
참고 문헌Wiegand, Sandra; Jogler, Mareike; Boedeker, Christian; Pinto, Daniela; Vollmers, John; Rivas-Marín, Elena; Kohn, Timo; Peeters, Stijn H.; Heuer, Anja; Rast, Patrick; Oberbeckmann, Sonja; Bunk, Boyke; Jeske, Olga; Meyerdierks, Anke; Storesund, Julia E. (2020년 1월). "Cultivation and functional characterization of 79 planctomycetes uncovers their unique biology". Nature Microbiology. 5 (1): 126–140. doi:10.1038/s41564-019-0588-1. ISSN 2058-5276. PMC 7286433. PMID 31740763.
Vitorino, Inês Rosado; Lage, Olga Maria (2022-02-01). "The Planctomycetia: an overview of the currently largest class within the phylum Planctomycetes". Antonie van Leeuwenhoek. 115 (2): 169–201. doi:10.1007/s10482-021-01699-0. ISSN 1572-9699.
Schlesner H, Stackebrandt E. Assignment of the genera Planctomyces and Pirella to a new family Planctomycetaceae fam. nov. and description of the order Planctomycetales ord. nov. Syst. Appl. Microbiol. 1986;8(3):174–176. doi:10.1016/S0723-2020(86)80072-8
계통 발생
속Ancalichlamydia
Aquisphaera
Blastopirellula
Gimesia
Isosphaera
Pirellula
Planctopirus
Planctomyces
Rhodopirellula
Schlesneria
Zavarzinella
부유균문
부유균문
부유균문
분류학적 정보
역세균
문부유균문 (Planctomycetes)
하위 분류피키스파이라강 (Phycisphaerae)
플랑크토미케스강 (Planctomycetia)

2. 형태

Planctomycetaceae영어과는 부유균문(Planctomycetales)강의 다른 종들에 비해 분류학적으로 뚜렷하게 구별되는 특징이 거의 없다.[5]

2. 1. 세포 구조

Planctomycetaceae영어과 종들은 전형적으로 분홍색 또는 흰색 집락을 형성한다.[5] 세포는 보통 구형이지만, 많은 종들이 타원형 또는 배 모양을 하고 있으며 크기는 0.4µm에서 2.5µm 사이이다.[5][6]

Planctomycetaceae영어는 번식할 때 주로 로제트나 응집된 집단 형태로 관찰된다. Thalassoglobus neptuniusla는 이 과에서 유일하게 사슬 형태로 성장하는 종으로 알려져 있다.[5] Planctomycetaceae영어의 일부 구성원(다른 Planctomycetota영어 분류군 포함)은 줄기 모양 돌기를 발달시키기도 한다.[5][6] 특히 Planctomyces bekefiila는 줄기를 가진 것으로 잘 알려져 있으며, 이 줄기를 통해 새로 생성된 세포들을 연결한다.[6]

2. 2. 줄기

Planctomycetaceae영어과의 일부 구성원(''Planctomycetota''의 다른 분류군 포함)은 줄기 모양의 돌기를 발달시킨다.[5][6] ''Planctomyces bekefii''는 이 과에서 줄기를 가진 것으로 잘 알려져 있으며, 이 줄기를 사용하여 새로 생성된 세포를 연결한다.[6]

3. 생리

Planctomycetales강 내에서 연구가 더 많이 진행된 과들은 혐기성 호흡을 하는 것으로 알려져 있으며, 특히 Brocadiaceae과는 혐기성 암모늄 산화(anammox) 능력으로 잘 알려져 있다.[7] Planctomycetaceae과는 호기성이며, anammox 반응을 수행할 수 없는 `Planctomycetales`강의 많은 과 중 하나이다.[8]

3. 1. 운동성

다른 과들과 마찬가지로, 부유균문의 Planctomycetaceae과 구성원들은 편모를 사용하여 운동성을 가질 수 있으며, 일부는 운동성 및 비운동성 생활 주기를 갖는다.[9]

3. 2. 부착

다른 박테리아와 달리, 이 그룹은 줄기 모양의 구조를 사용하여 생물막 생산을 돕고, 통상적인 세포외 고분자 물질 외에 부착을 위한 두 번째 원천을 제공할 수 있다.[8]

3. 3. 지방산과 지질

`Planctomycetaceae`과에 의해 합성된 지방산과 지질은 `Planctomycetales`목의 다른 과들과 조성이 유사하지만, 분류학적으로 중요하다고 여겨질 만큼 독특하다. 포스포콜린, 포스파티딜콜린, 포스파티딜글리세롤은 이 과의 주요 지질로 간주되며, 다른 일부 과들만이 이를 합성할 수 있다.[8] 특히, 지방산 C18:1-ω9C는 이 Planctomycete 박테리아 과 내에서만 합성된다.[8]

4. 분류

명명법에 따른 원핵생물 이름 목록(LPSN)과 국립생물정보센터(NCBI)에 따르면, 부유균문의 분류는 다음과 같다.[10][11]


  • 피키스파이라강 (Phycisphaerae)
  • * 피키스파이라목 (Phycisphaerales)
  • ** 피키스파이라과 (Phycisphaeraceae)
  • 플랑크토미케스강 (Planctomycetia)
  • * 플랑크토미케스목 (Planctomycetales)
  • ** Brocadiaceae
  • ** 플랑크토미케스과 (Planctomycetaceae)


2022년 기준으로, ''Planctomycetaceae'' 내에는 14개의 속과 29개의 종이 존재하는 것으로 알려져 있다.[12]

16S rRNA 기반 LTP_08_2023[13][14][15]와 120개 마커 단백질 기반 GTDB 08-RS214[16][17][18]에 따른 분류는 하위 섹션에 표로 자세히 나와 있다.

분류가 불확실한 속으로는 플랑크토미케스속(''Planctomyces'') 등이 있다.

4. 1. 하위 분류

현재 받아들여지는 분류는 명명법에 따른 원핵생물 이름 목록(LPSN)[10] 및 국립생물정보센터(NCBI)[11]를 기반으로 한다.

하위 분류는 다음과 같다.

  • 피키스파이라강 (Phycisphaerae) Fukunaga et al. 2010
  • * 피키스파이라목 (Phycisphaerales) Fukunaga et al. 2010
  • ** 피키스파이라과 (Phycisphaeraceae) Fukunaga et al. 2010

  • 플랑크토미케스강 (Planctomycetia) Cavalier-Smith 2002
  • * 플랑크토미케스목 (Planctomycetales) Schlesner and Stackebrandt 1987
  • ** Brocadiaceae
  • ** 플랑크토미케스과 (Planctomycetaceae) Schlesner and Stackebrandt 1987

4. 1. 1. 속 (Genus)


  • 피키스파이라속 (''Phycisphaera'') Fukunaga et al. 2010
  • ''Candidatus'' Nostocoida limicola III''
  • ''Candidatus'' Brocadia Jetten et al. 2001
  • ''Candidatus'' Kuenenia Schmid et al. 2000
  • ''Candidatus'' Scalindua Schmid et al. 2003
  • ''Candidatus'' Anammoxoglobus Kartal et al. 2006
  • ''Candidatus'' Jettenia Quan et al. 2008
  • ''Blastopirellula'' Schlesner et al. 2004
  • ''Gemmata'' Franzmann and Skerman 1985
  • ''Isosphaera'' Giovannoni et al. 1995
  • ''Pirellula'' Schlesner and Hirsch 1987 emend. Schlesner et al. 2004
  • 플랑크토미케스속 (''Planctomyces'') Gimesi 1924
  • ''Rhodopirellula'' Schlesner et al. 2004
  • ''Schlesneria'' Kulichevskaya et al. 2007
  • ''Singulisphaera'' Kulichevskaya et al. 2008
  • ''Zavarzinella'' Kulichevskaya et al. 2009
[10][11]

2022년 기준으로 연구자들은 ''Planctomycetaceae'' 내에 14개의 속과 29개의 종이 존재한다는 것을 발견했다.[12]

{| class="wikitable"

|-

! 16S rRNA 기반 LTP_08_2023[13][14][15]

! 120개 마커 단백질 기반 GTDB 08-RS214[16][17][18]

|-

| style="vertical-align:top;" |

|



|}

불확실한 속:


  • ''Planctomyces'' Gimesi 1924
  • "''Rhodopilula''" Frank 2011
  • "''Stratiformator''" Kumar 등, 2023
  • "''Thermopirellula''" Liu 등, 2012

4. 1. 2. 불확실한 속


  • 플랑크토미케스속(Planctomyces) Gimesi 1924
  • "''Rhodopilulala''" Frank 2011
  • "''Stratiformatorla''" Kumar 등, 2023
  • "''Thermopirellulala''" Liu 등, 2012

5. 계통 발생

현재 받아들여지는 분류는 명명법에 따른 원핵생물 이름 목록(LPSN)[10] 및 국립생물정보센터(NCBI)를 기반으로 한다.[11] 2022년 기준으로 연구자들은 ''Planctomycetaceae'' 내에 14개의 속과 29개의 종이 존재한다는 것을 발견했다.[12]

16S rRNA 기반 LTP_08_2023[13][14][15]120개 마커 단백질 기반 GTDB 08-RS214[16][17][18]



불확실한 속:


  • ''Planctomyces'' Gimesi 1924
  • "''Rhodopilula''" Frank 2011
  • "''Stratiformator''" Kumar 등, 2023
  • "''Thermopirellula''" Liu 등, 2012

참조

[1] 논문 Assignment of the genera ''Planctomyces'' and ''Pirella'' to a new family ''Planctomycetaceae'' fam. nov. and description of the order ''Planctomycetales'' ord. nov.
[2] 웹사이트 Planctomycetales https://lpsn.dsmz.de[...] "[[List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature]] (LPSN)" 2021-08-25
[3] 논문 Cultivation and functional characterization of 79 planctomycetes uncovers their unique biology https://www.nature.c[...] 2020-01
[4] 논문 The Planctomycetia: an overview of the currently largest class within the phylum Planctomycetes https://link.springe[...] 2022-02-01
[5] 논문 The Planctomycetia: an overview of the currently largest class within the phylum Planctomycetes https://link.springe[...] 2022-02-01
[6] 웹사이트 On the maverick Planctomycetes https://academic.oup[...] 2024-11-11
[7] 논문 Anaerobic ammonium oxidation by anammox bacteria in the Black Sea https://www.nature.c[...] 2003-04
[8] 논문 The Planctomycetia: an overview of the currently largest class within the phylum Planctomycetes https://link.springe[...] 2022-02-01
[9] 웹사이트 On the maverick Planctomycetes https://academic.oup[...] 2024-11-11
[10] 웹사이트 Planctomycetaceae https://lpsn.dsmz.de[...] "[[List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature]] (LPSN)" 2022-09-09
[11] 웹사이트 Planctomycetaceae https://www.ncbi.nlm[...] "[[National Center for Biotechnology Information]] (NCBI) taxonomy database" 2022-09-09
[12] 논문 The Planctomycetia: an overview of the currently largest class within the phylum Planctomycetes https://link.springe[...] 2022-02-01
[13] 웹사이트 The LTP https://imedea.uib-c[...] 2023-11-20
[14] 웹사이트 LTP_all tree in newick format https://imedea.uib-c[...] 2023-11-20
[15] 웹사이트 LTP_08_2023 Release Notes https://imedea.uib-c[...] 2023-11-20
[16] 웹사이트 GTDB release 08-RS214 https://gtdb.ecogeno[...] 2023-05-10
[17] 웹사이트 bac120_r214.sp_label https://data.gtdb.ec[...] 2023-05-10
[18] 웹사이트 Taxon History https://gtdb.ecogeno[...] 2023-05-10


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