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에리시펠로트릭스과

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목차

1. 개요

에리시펠로트릭스과는 세균 분류군으로, 현재까지 과 수준으로 명확하게 분류되지 않은 여러 속들을 포함한다. 돼지단독균을 포함하는 에리시펠로트릭스를 비롯하여 Absicoccus, Allobaculum, Anaerorhabdus 등 다양한 속들이 이에 속한다. 계통 발생 연구는 16S rRNA 및 120개 마커 단백질 기반 분석을 통해 이루어지며, 현재 받아들여지는 분류는 명명법에서 지위가 확립된 원핵생물 목록과 국립생물공학정보센터를 기반으로 한다.

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에리시펠로트릭스과 - [생물]에 관한 문서
기본 정보
에리시펠로트릭스 루시오파티아이의 세포 및 콜로니 형태
학명Erysipelotrichaceae
명명자Verbarg 외, 2004년
하위 분류 계급속
하위 분류본문 참조

2. 하위 분류

현재 받아들여지는 분류는 명명법에서 지위가 확립된 원핵생물 목록(LPSN) 및 국립생물공학정보센터(NCBI)[3]를 기반으로 한다.


  • ''Absicoccus''
  • ''Allobaculum''
  • ''Amedibacillus''
  • ''Amedibacterium''
  • ''Anaerorhabdus''
  • ''Breznakia''
  • ''Bulleidia''
  • ''Catenisphaera''
  • ''Dielma''
  • ''Dubosiella''
  • ''Erysipelothrix'' - 돼지단독균(`E. rhusiopathiae`)
  • ''Faecalibacillus''
  • ''Faecalibaculum''
  • ''Faecalicoccus''
  • ''Faecalitalea''
  • ''Holdemanella''
  • ''Holdemania''
  • ''Ileibacterium''
  • ''Intestinibaculum''
  • ''Longibaculum''
  • ''Longicatena''
  • ''Solobacterium''


16S rRNA 기반 LTP_08_2023[4][5][6] 및 120개 마커 단백질 기반 GTDB 08-RS214[7][8][9]에 따른 과의 하위 분류는 아래 표와 같다.

16S rRNA 기반 LTP_08_2023120개 마커 단백질 기반 GTDB 08-RS214
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미할당:


  • ''Absiella''
  • "''Ca.'' Colivicinus"
  • "Dakotella"

3. 계통 발생

현재 받아들여지는 분류는 명명법에서 지위가 확립된 원핵생물 목록(LPSN) 및 국립생물공학정보센터(NCBI)[3]를 기반으로 한다.

에리시펠로트릭스과의 계통 발생은 16S rRNA 기반 LTP_08_2023[4][5][6] 및 120개 마커 단백질 기반 GTDB 08-RS214[7][8][9]에 따라 분류된다.

16S rRNA 기반 LTP_08_2023120개 마커 단백질 기반 GTDB 08-RS214
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3. 1. 16S rRNA 기반 LTP 분석

16S rRNA 유전자 염기서열 분석 기반의 "전 종 생물 나무 프로젝트"(Living Tree Project, LTP) 결과는 다음과 같다.[4][5][6]

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3. 2. 120개 마커 단백질 기반 GTDB 분석

GTDB 08-RS214[7][8][9]에 따르면, 120개 마커 단백질을 기반으로 한 에리시펠로트릭스과의 계통 분류는 다음과 같다.

속



미할당:


  • ''압시엘라'' Paek 외. 2020
  • "''Ca.'' 콜리비시너스" Gilroy 외. 2022
  • "다코텔라" Ghimire 외. 2020

참조

[1] 웹사이트 "Erysipelotrichaceae" https://www.bacterio[...] "[[List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature]] (LPSN)" 2022-04-19
[2] 웹사이트 Classification of Bacteria http://www.bacterio.[...] 2018-01-28
[3] 웹사이트 Erysipelotrichia https://www.ncbi.nlm[...] "[[National Center for Biotechnology Information]] (NCBI) taxonomy database" 2013-03-20
[4] 웹사이트 The LTP https://imedea.uib-c[...] 2023-11-20
[5] 웹사이트 LTP_all tree in newick format https://imedea.uib-c[...] 2023-11-20
[6] 웹사이트 LTP_08_2023 Release Notes https://imedea.uib-c[...] 2023-11-20
[7] 웹사이트 GTDB release 08-RS214 https://gtdb.ecogeno[...] 2023-05-10
[8] 웹사이트 bac120_r214.sp_label https://data.gtdb.ec[...] 2023-05-10
[9] 웹사이트 Taxon History https://gtdb.ecogeno[...] 2023-05-10
[10] 웹사이트 Family Erysipelotrichaceae https://lpsn.dsmz.de[...] 원핵생물명 목록(List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature, LPSN)


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