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오픈벅스

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1. 개요

오픈벅스(OpenBUGS)는 BUGS 언어로 작성된 모델 코드를 분석하여 사후 확률에서 표본을 생성하는 실행 파일을 생성하는 프로그램이다. WinBUGS와 달리 업데이트 알고리즘 선택에 유연성을 제공하며, 컴포넌트 파스칼 프로그래밍 언어로 작성되었다. Microsoft Windows용 바이너리를 제공하며, 이전 버전은 리눅스에서도 사용 가능했다. BUGS 언어는 S 프로그래밍 언어와 유사하며, S-Plus 및 R 프로그래밍 언어와 호환된다.

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오픈벅스 - [IT 관련 정보]에 관한 문서
기본 정보
종류통계 패키지
개발자OpenBUGS 재단
최초 출시일2005년
안정화 버전v3.2.3
안정화 버전 출시일2014년 3월 8일
프로그래밍 언어컴포넌트 파스칼
운영 체제마이크로소프트 윈도우
유닉스/리눅스 (with Wine)
macOS (with Wine)
플랫폼Intel x86 - 32비트
크기5.6 MB
언어영어
라이선스GNU 일반 공중 사용 허가서
웹사이트OpenBUGS

2. WinBUGS와의 차이점

오픈벅스는 WinBUGS와 비교했을 때 라이선스 및 운영 체제 지원 범위, 그리고 업데이트 알고리즘 선택 방식 등에서 주요한 차이점을 보인다.[1][2][3]

2. 1. 라이선스 및 운영 체제

오픈벅스는 다른 라이선스와 더 넓은 범위의 운영 체제를 지원하는 것 외에도, 각 노드의 전체 조건부 분포 클래스에 사용할 업데이트 알고리즘을 전문가 시스템이 선택하는 방식에서 WinBUGS와 근본적인 차이점을 보인다. WinBUGS는 가능한 각 클래스에 대해 하나의 알고리즘을 정의하는 반면, 오픈벅스가 사용할 수 있는 알고리즘 수에는 제한이 없어 더 큰 유연성과 확장성을 제공한다.[1][2] 사용자는 컴파일 후 각 노드에 사용될 업데이트 프로그램을 선택할 수 있다. 더 자세한 차이점은 오픈벅스 웹사이트에서 확인할 수 있다.[3]

2. 2. 업데이트 알고리즘 선택

오픈벅스는 WinBUGS와 비교했을 때, 각 노드의 전체 조건부 분포 클래스에 사용할 업데이트 알고리즘을 선택하는 방식에서 중요한 차이를 보인다. 오픈벅스는 전문가 시스템을 활용하여 이를 결정한다.[1][2] 반면, WinBUGS는 가능한 각 클래스에 대해 단 하나의 알고리즘만을 정의한다. 오픈벅스는 사용할 수 있는 알고리즘의 수에 제한이 없어 더 큰 유연성과 확장성을 제공한다는 장점이 있다.[1][2] 사용자는 컴파일 과정을 거친 후, 각 노드에 적용할 업데이트 프로그램을 직접 선택할 수도 있다. 더 상세한 차이점에 대한 정보는 오픈벅스 웹사이트에서 찾아볼 수 있다.[3]

3. 프로그래밍 언어

오픈벅스는 주로 두 가지 프로그래밍 언어와 관련이 있다. 핵심 소스 코드는 컴포넌트 파스칼 언어로 작성되었으며, 이는 특정 라이브러리에 의존한다. 사용자가 통계 모델을 정의하는 데 사용하는 언어는 BUGS 언어이다. 이 언어는 오픈벅스가 구문 분석하여 실행 가능한 코드를 생성하는 데 사용된다. BUGS 언어는 통계 분석 환경인 S 프로그래밍 언어와 유사하게 설계되었으며, 오픈벅스 자체도 초기에는 S-Plus와의 연동을 염두에 두고 개발되었다.[4] 현재는 R 환경과도 잘 연동되어 사용된다.

3. 1. 소스 코드

오픈벅스의 소스 코드는 컴포넌트 파스칼 프로그래밍 언어로 작성되었다. 이는 Oberon Microsystems에서 Blackbox Component Framework의 일부로 제공하는 컴포넌트 파스칼 라이브러리에 의존한다. 개발 도구는 오픈 소스로 제공된다.

오픈벅스를 윈도우에서 컴파일하는 것은 비교적 쉽지만, 리눅스에서의 컴파일은 문서화가 잘 되어 있지 않은 편이다. 현재 버전의 바이너리는 윈도우용으로 제공되며, 이전 버전은 리눅스용으로도 제공되었다. 리눅스에서는 WINE을 통해서도 실행할 수 있다. 설치, 개발, 사용과 관련된 질문은 오픈벅스 게시판에서 논의된다.

Gardens Point Component Pascal을 사용하여 오픈벅스를 자바로 이식하려는 시도가 있었으나, JAGS라는 새로운 구현을 더 선호하게 되면서 중단되었다.

BUGS 언어는 모델 코드를 지정하는 데 사용되는 언어이다. 오픈벅스는 이 BUGS 코드를 구문 분석하여, 실행 시 사후 확률에서 표본을 생성하는 실행 파일(컴파일된 코드)을 만든다.

오픈벅스는 본래 S-Plus[4]와 함께 실행되도록 설계되었으며, BUGS 언어 자체도 S 프로그래밍 언어와 유사한 면이 있다. 현재는 R과도 잘 연동된다. R2OpenBUGS 또는 BRugs 패키지를 통해 상호 운용성을 확보할 수 있으며, R 모듈은 추가적인 분석 작업을 돕는다.

3. 2. 컴파일 및 이식성

오픈벅스의 소스 코드컴포넌트 파스칼 프로그래밍 언어로 작성되었다. 이는 Oberon Microsystems에서 Blackbox Component Framework의 일부로 제공하는 컴포넌트 파스칼 라이브러리에 의존한다. 개발 도구는 오픈 소스로 제공된다.

오픈벅스를 윈도우 환경에서 컴파일하는 것은 비교적 쉽지만, 리눅스 환경에서의 컴파일은 문서화가 잘 되어 있지 않아 어려움이 있을 수 있다. 현재 버전의 바이너리는 윈도우용으로 제공되며, 이전 버전은 리눅스용으로도 제공되었다. 또한, 리눅스 환경에서는 WINE을 이용하여 윈도우 버전을 실행할 수도 있다. 설치, 개발, 사용과 관련된 질문은 오픈벅스 게시판에서 논의된다.

과거 Gardens Point Component Pascal을 사용하여 오픈벅스를 자바로 이식하려는 시도가 있었으나, JAGS라는 새로운 이식 가능한 구현을 더 선호하게 되면서 중단되었다.

오픈벅스는 모델 코드를 지정하는 BUGS 언어를 사용한다. 오픈벅스는 이 코드를 구문 분석하여, 실행 시 사후 확률에서 표본을 생성하는 실행 파일(컴파일된 코드)을 만든다.

오픈벅스는 원래 S-Plus[4]와 함께 사용되도록 설계되었으며, BUGS 언어 자체도 S 프로그래밍 언어와 유사한 면이 있다. 현재는 R과도 잘 연동된다. R 환경에서는 R2OpenBUGS 또는 BRugs 패키지를 통해 오픈벅스와의 상호 운용성을 확보할 수 있으며, R 모듈을 활용하여 추가적인 분석 작업을 수행할 수 있다.

4. BUGS 언어

BUGS 언어는 모델 코드를 지정하는 언어이다. OpenBUGS에 의해 구문 분석되며, 실행 시 사후 확률에서 표본을 생성하는 실행 파일(컴파일된 코드)을 생성한다.

4. 1. S 프로그래밍 언어와의 호환성

OpenBUGS는 S-Plus[4]와 함께 실행되도록 설계되었으며, BUGS 언어는 S 프로그래밍 언어와 유사하다. 또한 OpenBUGS는 R과도 잘 작동한다. R과의 상호 운용성을 위해 R2OpenBUGS 또는 BRugs 패키지가 제공되며, R 모듈은 추가적인 분석 작업을 돕는다.

참조

[1] 웹사이트 Overview http://www.openbugs.[...] 2010-10-09
[2] 논문 The BUGS project: Evolution, critique and future directions
[3] 웹사이트 Changes Between WinBUGS and OpenBUGS http://www.openbugs.[...] 2010-10-09
[4] 문서 BUGS 0.5 Manual http://www.mrc-bsu.c[...] 1996-08-14



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