코리오박테리움과

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1. 개요
2. 하위 분류
- 2.1. 계통 발생
- 2.2. 속 목록
참조

1. 개요

코리오박테리움과는 코리오박테리움속, 엔노르마속, 콜린셀라속 등을 포함하는 세균 과(family)이다. 현재 분류는 명명법에 따른 원핵생물 이름 목록(LPSN)과 국립생물정보센터(NCBI) 정보를 기반으로 하며, 16S rRNA 기반 LTP_08_2023 및 120개 마커 단백질 기반 게놈 분류 데이터베이스(GTDB) 08-RS214에 따른 계통 발생 연구가 이루어지고 있다. 연구에 따라 과 내 속(genus) 간의 계통 관계가 다르게 나타난다.

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코리오박테리움과 - [생물]에 관한 문서
기본 정보
코리오박테리움과
학명	Coriobacteriaceae
명명자	Stackebrandt et al. 1997
유형 속	코리오박테리움속 (Coriobacterium)
분류
역	진정세균 (Bacteria)
문	방선균문 (Actinomycetota)
강	코리오박테리움강 (Coriobacteriia)
목	코리오박테리움목 (Coriobacteriales)
과	코리오박테리움과 (Coriobacteriaceae)
하위 분류
속	"알로리미콜라속" ("Ca." Allolimicola) 콜린셀라속 (Collinsella) "코프로우시아속" ("Ca." Coprousia) 코리오박테리움속 (Coriobacterium) 에노르마속 (Enorma) "올레구셀라속" (Olegusella)

2. 하위 분류

현재 통용되는 분류는 명명법에 따른 원핵생물 이름 목록(LPSN)^[3]과 국립생물정보센터(NCBI)의 정보를 기반으로 한다.^[4] 16S rRNA 기반 LTP_08_2023 및 120개 마커 단백질 기반 게놈 분류 데이터베이스(GTDB) 08-RS214에 따른 계통 발생은 다음과 같다.^[6]^[7]^[8]^[9]^[10]^[11]

Nouioui 외. 2018^[5]	16S rRNA 기반 LTP_08_2023^[6]^[7]^[8]	120개 마커 단백질 기반 GTDB 08-RS214^[9]^[10]^[11]
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2. 1. 계통 발생

현재 통용되는 분류는 명명법에 따른 원핵생물 이름 목록(LPSN)^[3]과 국립생물정보센터(NCBI)를 기반으로 한다.^[4]

코리오박테리아과 내 속(genus) 간의 계통 관계는 연구에 따라 조금씩 다르게 나타난다.

Nouioui 외. 2018^[5]	16S rRNA 기반 LTP_08_2023^[6]^[7]^[8]	120개 마커 단백질 기반 GTDB 08-RS214^[9]^[10]^[11]
style="vertical-align:top" \|

2. 1. 1. Nouioui 외. 2018

wikitext

style="vertical-align:top" |

2. 1. 2. 16S rRNA 기반 LTP_08_2023

'쿠르타나에로비움'' Sun 외. 2023이 추가되어 코리오박테리움속, 엔노르마속, 콜린셀라속과 함께 분기군을 형성한다.^[6]^[7]^[8]

2. 1. 3. 120개 마커 단백질 기반 GTDB 08-RS214

wikitext

2=콜린셀라 Collinsella^la Kageyama 외. 1999
1={{clade	1=코리오박테리움 Coriobacterium^la Haas 및 König 1988	2={{clade	1= "Ca. 알로리미콜라" corrig. Gilroy 외. 2021	2={{clade	1="Ca. 코프로우시아" Coprousia^la Gilroy 외. 2021	2=엔노르마 Enorma^la Mishra et al. 2016

2. 2. 속 목록

Collinsella Kageyama et al. 1999
코리오박테리움속 (''Coriobacterium'') Haas and König 1988
''Enorma'' Mishra et al. 2016
''Senegalimassilia'' corrig. Lagier et al. 2014

참조

_[1] 논문 Proposal for a new hierarchic classification system, ''Actinobacteria'' classis nov.
_[2] 논문 Gut Microbiota Composition Is Correlated to Grid Floor Induced Stress and Behavior in the BALB/c Mouse 2012-10-02
_[3] 웹사이트 Coriobacteriaceae https://lpsn.dsmz.de[...] 2021-06-23
_[4] 웹사이트 Coriobacteriaceae https://www.ncbi.nlm[...] National Center for Biotechnology Information 2021-03-20
_[5] 논문 Genome-Based Taxonomic Classification of the Phylum ''Actinobacteria''
_[6] 웹사이트 The LTP https://imedea.uib-c[...] 2023-11-20
_[7] 웹사이트 LTP_all tree in newick format https://imedea.uib-c[...] 2023-11-20
_[8] 웹사이트 LTP_08_2023 Release Notes https://imedea.uib-c[...] 2023-11-20
_[9] 웹사이트 GTDB release 08-RS214 https://gtdb.ecogeno[...] 2023-05-10
_[10] 웹사이트 bac120_r214.sp_label https://data.gtdb.ec[...] 2023-05-10
_[11] 웹사이트 Taxon History https://gtdb.ecogeno[...] 2023-05-10
_[12] 논문 Proposal for a New Hierarchic Classification System, Actinobacteria classis nov. 1997-01-01
_[13] 논문 Notification that New Names and New Combinations Have Appeared in Volume 47, No. 2, of the IJSB 1997-07-01
_[14] 논문 Coriobacterium glomerans gen. nov., sp. nov. from the Intestinal Tract of the Red Soldier Bug 1988-10-01
_[15] 논문 Phylogenetic and phenotypic evidence for the transfer of Eubacterium aerofaciens to the genus Collinsella as Collinsella aerofaciens gen. nov., comb. nov. 1999-04-01
_[16] 논문 Notification that new names and new combinations have appeared in volume 49, part 2, of the IJSB 1999-07-01
_[17] 논문 Non contiguous-finished genome sequence and description of ''Enorma massiliensis'' gen. nov., sp. nov., a new member of the Family Coriobacteriaceae 2013-06-06
_[18] 논문 List of new names and new combinations previously effectively, but not validly, published 2016-03-01
_[19] 웹사이트 Family ''Coriobacteriaceae'' https://lpsn.dsmz.de[...] List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature (LPSN) 2023-01-16
_[20] 웹사이트 Family Coriobacteriaceae https://lpsn.dsmz.de[...]
_[21] 간행물 Molecular signatures for the class Coriobacteriia and its different clades; proposal for division of the class Coriobacteriia into the emended order Coriobacteriales, containing the emended family Coriobacteriaceae and Atopobiaceae fam. nov., and Eggerthellales ord. nov., containing the family Eggerthellaceae fam. nov. 2013
_[22] 간행물 Notification list. Notification that new names and new combinations have appeared in volume 63, part 9 of the IJSEM. 2013

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