불카니세타속
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1. 개요
불카니세타속은 혐기성, 종속 영양성, 고온성 고균 속으로, 85–90 °C와 pH 4.0–4.5에서 최적으로 성장한다. 일본의 온천에서 분리된 표본에서 발견되었으며, 말토스, 전분, 말산 등을 탄소원으로 사용하고 황과 티오황산염을 전자 수용체로 이용한다. 불카니세타속은 일본 온천 지역에서 주로 발견되며, 다른 국가에서는 분리되지 않아 제한적인 분포를 가질 가능성이 있다. 여러 종의 유전체가 해독되었으며, DNA의 G+C 함량은 44%에서 46% 사이이다.
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불카니세타속 - [생물]에 관한 문서 | |
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불카니세타속 | |
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분류 정보 | |
역 | 고균 |
문 | 테르모프로테우스문 |
강 | 테르모프로테우스강 |
목 | 테르모프로테우스목 |
과 | 테르모프로테우스과 |
속 | 불카니세타속 |
속 명명 | Itoh et al., 2002 |
하위 분류 | 종 |
하위 종 | 불카니세타 디스트리부타 (Vulcanisaeta distributa) V. moutnovskia 불카니세타 소우니아나 (Vulcanisaeta souniana) 불카니세타 테르모필라 (Vulcanisaeta thermophila) |
2. 형태 및 특징
`불카니세타속`(''Vulcanisaeta'')은 혐기성, 종속 영양성, 고온성 고세균이다. 최적 성장 조건은 온도 85°C–90°C, pH 4.0–4.5이다. 이 생물은 일본 동부의 황화산 지대 또는 파이프를 통해 공급되는 온천수에서 채취한 표본에서 분리되었다.
''불카니세타속''은 공기가 없는 환경(혐기성)에서 다른 유기물을 섭취하며 살아가는(종속 영양성) 고세균으로, 높은 온도(고온성)에서 잘 자란다. 최적 성장 조건은 온도 85–90 °C, pH 4.0–4.5이다. 이 생물은 일본 동부의 황 성분이 많은 화산 지대나 온천수 파이프에서 채취한 표본에서 처음 분리되었다.
여러 종의 ''불카니세타'' 유전체가 해독되었으며, 자세한 내용은 해독된 고세균 유전체 목록에서 확인할 수 있다. DNA의 G+C 함량은 44%에서 46% 사이로, 열보호세균과(Thermoproteaceae)에 속하는 다른 속들에 비해 비교적 낮은 것으로 예측된다.
현재 통용되는 분류는 LPSN[1] 및 NCBI[2]를 기반으로 한다. 상세한 계통수는 아래 하위 문서를 참고한다.
''불카니세타''의 세포는 폭이 0.4~0.6 μm인 곧거나 약간 구부러진 막대 모양이다. 어떤 경우에는 세포가 분기되거나 말단에 구형의 몸체를 갖기도 한다. 이 고세균은 탄소원으로 말토스, 전분, 말산, 효모 추출물, 펩톤, 쇠고기 추출물, 카사미노산, 젤라틴을 사용한다. 반면, D-아라비노스, D-과당, 락토스, 수크로스, D-자일로스, 아세트산, 부티르산, 포름산, 푸마르산, 프로피온산, 피루브산, 호박산, 메탄올, 포름아미드, 메틸아민, 트리메틸아민은 이용하지 못한다. 전자 수용체로는 황과 티오황산염을 사용한다. 유전적으로 유사한 다른 고세균인 ''테르모클라디움''(Thermocladium)이나 ''칼디비르가''(Caldivirga)와는 달리, ''불카니세타''는 배지에 비타민 혼합물이나 고세균 세포 추출액을 첨가하지 않아도 성장할 수 있다는 특징이 있다.
3. 생태
''불카니세타'' 세포는 폭이 0.4~0.6 μm 정도인 곧거나 약간 구부러진 막대 모양이다. 때로는 세포가 가지를 치거나 끝부분에 둥근 몸체가 달리기도 한다. 이 고세균은 탄소원으로 말토스, 전분, 말산, 효모 추출물, 펩톤, 쇠고기 추출물, 카사미노산, 젤라틴 등을 이용한다. 반면, D-아라비노스, D-과당, 락토스, 수크로스, D-자일로스, 아세트산, 부티르산, 포름산, 푸마르산, 프로피온산, 피루브산, 호박산, 메탄올, 포름아미드, 메틸아민, 트리메틸아민 등은 이용하지 못한다. 전자 수용체로는 황과 티오황산염을 사용한다. 유전적으로 가까운 ''테르모클라디움''이나 ''칼디비르가'' 같은 다른 고세균들과 달리, ''불카니세타''는 배지에 비타민 혼합물이나 다른 고세균 세포 추출액을 넣어주지 않아도 성장할 수 있다는 특징이 있다.
''불카니세타'' 균주는 일본의 온천 지역에서 발견되었다. 이 생물은 일본의 온천에서 분리된 유전자 분리체 중 가장 흔하게 발견되는 막대 모양의 크렌아키아임에도 불구하고, 아직 다른 나라에서는 분리된 보고가 없다. 이는 아조레스 제도, 아이슬란드, 인도네시아, 이탈리아, 일본, 필리핀, 러시아, 미국 등 전 세계적으로 넓게 분포하는 ''테르모프로테우스'' 속이나 ''파이로바큘럼'' 속과는 대조적인 모습이다. 따라서 ''불카니세타'' 속은 일본을 중심으로 한 제한적인 지역에만 분포할 가능성이 있다.[2]
4. 유전체 구조
5. 계통 분류
5. 1. 계통수
현재 통용되는 분류는 LPSN[1] 및 NCBI[2]를 기반으로 한다.
16S rRNA 기반 LTP_06_2022[3][4][5] | 53개 마커 단백질 기반 GTDB 08-RS214[6][7][8] |
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참조
[1]
웹사이트
Vulcanisaeta
https://lpsn.dsmz.de[...]
List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature
2023-06-10
[2]
웹사이트
Vulcanisaeta
https://www.ncbi.nlm[...]
National Center for Biotechnology Information
2023-06-10
[3]
웹사이트
The LTP
https://imedea.uib-c[...]
2023-05-10
[4]
웹사이트
LTP_all tree in newick format
https://imedea.uib-c[...]
2023-05-10
[5]
웹사이트
LTP_06_2022 Release Notes
https://imedea.uib-c[...]
2023-05-10
[6]
웹사이트
GTDB release 08-RS214
https://gtdb.ecogeno[...]
2023-05-10
[7]
웹사이트
ar53_r214.sp_label
https://data.gtdb.ec[...]
2023-05-10
[8]
웹사이트
Taxon History
https://gtdb.ecogeno[...]
2023-05-10
[9]
웹인용
NCBI taxonomy resources
ftp://ftp.ncbi.nih.g[...]
National Center for Biotechnology Information
2010-11-27
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