피로딕티움과

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1. 개요
2. 분포 및 특징
3. 계통 발생
- 3.1. 16S rRNA 기반 LTP_06_2022
- 3.2. 53개 마커 단백질 기반 GTDB 09-RS220
4. 참고 문헌
참조

1. 개요

피로딕티움과는 주로 연안 또는 심해 열수 광상에서 발견되는 고세균의 한 과이다. 디스크형 또는 불규칙한 구균 형태의 세포를 가지며, 높은 온도에서 생존하는 호열성 미생물이다. 수소와 황을 이용하여 독립 영양적으로 증식하거나, 당류와 같은 복합 기질로 황을 환원하여 종속 영양적으로 증식한다. 16S rRNA와 53개 마커 단백질 기반 계통 발생 분석 결과에 따라 분류가 이루어진다.

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피로딕티움과 - [생물]에 관한 문서
기본 정보
학명	Pyrodictiaceae
명명자	Burggraf, Huber & Stetter 1997
분류
도메인	고균
계	크렌고균계
문	크렌고균문
강	테르모프로테우스강
목	데술푸로코칼레스목
속	게오겜마속 ("Geogemma") 히페르테르무스속 (Hyperthermus) 피로딕티움속 (Pyrodictium) 피로폴리스속 (Pyrofollis) 피롤로부스속 (Pyrolobus)

2. 분포 및 특징

파이로딕티움과는 육상 열수계에서 발견되지 않으며, 주로 연안 또는 심해의 열수 광상에 분포한다.^[11]^[12] 세포 형태는 디스크형에서 약간 불규칙한 구균이다. 때로는 관으로 여러 세포가 연결된 네트워크를 형성한다.^[11]^[12] 편모를 가진 종은 드물다.

Pyrolobus fumarii를 제외하고는 대부분 절대 혐기성이며, 전형적인 종은 수소 존재 하에 황을 환원하여 독립 영양적으로 증식한다.^[11]^[12] 당류 등을 포함한 복합 기질로 황을 환원하여 종속 영양적으로 증식하는 종도 많다. 산소나 티오황산염, 질산염을 환원하는 종도 있다.^[10]^[13]

호열성이 매우 뛰어나며, 최적 증식 온도는 97-107에 달한다. 증식 가능 온도는 대략 80-110이며, 최고 증식 온도는 ''Pyrolobus fumarii''의 113이다.^[10] 미기재 종(Strain 121) 중에는 121에서 증식했다는 보고도 있다.^[14] 1982년부터 2008년까지, 이 과에 속하는 생물이 최고 증식 온도 기록을 보유하고 있었다.

3. 계통 발생

현재 받아들여지는 분류는 명명법에 따른 원핵생물 이름 목록(LPSN)^[2]과 국립생물공학정보센터(NCBI)를 기반으로 한다.^[3] 16S rRNA 기반 LTP_06_2022^[4]^[5]^[6]와 53개 마커 단백질 기반 GTDB 09-RS220^[7]^[8]^[9]에 따른 계통 발생은 약간의 차이를 보인다.

16S rRNA 기반 LTP_06_2022	53개 마커 단백질 기반 GTDB 09-RS220
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3. 1. 16S rRNA 기반 LTP_06_2022

현재 받아들여지는 분류는 명명법에 따른 원핵생물 이름 목록(LPSN)과 국립생물공학정보센터(NCBI)를 기반으로 한다.^[2]^[3] 16S rRNA 기반 LTP_06_2022에 따르면,^[4]^[5]^[6] '파이로로부스 푸마리'와 '파이로딕티움 브로키이'가 가장 가까운 관계이며, '하이퍼서머스 부틸리쿠스'는 '파이로딕티움' 속에 속하는 종들과 가깝다. '파이로딕티움' 속은 'P. 옥컬툼', 'P. 아비시', 'P. 델라네이' 등으로 나뉜다.

3. 2. 53개 마커 단백질 기반 GTDB 09-RS220

현재 받아들여지는 분류는 명명법에 따른 원핵생물 이름 목록(LPSN)^[2]과 국립생물공학정보센터(NCBI)를 기반으로 한다.^[3]

53개 마커 단백질 기반 GTDB 09-RS220에 따르면,^[7]^[8]^[9] 파이로로부스 푸마리는 하이퍼서머스 부틸리쿠스와 함께 파이로딕티움 속에 가까운 관계를 가진다. 파이로딕티움 속은 P. 델라네이와 P. 옥컬툼으로 나뉜다.

4. 참고 문헌

Huber H.와 Stetter K.O.는 2001년에 《Bergey's Manual of Systematic Bacteriology Volume 1: The Archaea and the deeply branching and phototrophic Bacteria》 2판에서 "Order II. Desulfurococcales ord. nov." 챕터를 저술했다. 이 책은 Springer Verlag에서 출판되었으며, ISBN은 978-0-387-98771-2이다.

참조

_[1] 간행물 Caldisphaera lagunensis gen. nov., sp. nov., a novel thermoacidophilic crenarchaeote isolated from a hot spring at Mt Maquiling, Philippines 2003
_[2] 웹사이트 Pyrodictiaceae http://www.bacterio.[...] List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature 2011-11-17
_[3] 웹사이트 Pyrodictiaceae https://www.ncbi.nlm[...] National Center for Biotechnology Information 2011-06-05
_[4] 웹사이트 The LTP https://imedea.uib-c[...] 2023-05-10
_[5] 웹사이트 LTP_all tree in newick format https://imedea.uib-c[...] 2023-05-10
_[6] 웹사이트 LTP_06_2022 Release Notes https://imedea.uib-c[...] 2023-05-10
_[7] 웹사이트 GTDB release 09-RS220 https://gtdb.ecogeno[...] 2024-05-10
_[8] 웹사이트 ar53_r220.sp_label https://data.gtdb.ec[...] 2024-05-10
_[9] 웹사이트 Taxon History https://gtdb.ecogeno[...] 2024-05-10
_[10] 문서 Reclassification of the crenarchaeal orders and families in accordance with 16S rRNA sequence data 1997
_[11] 문서 Pyrodictium gen. nov., a new genus of submarine disc-shaped sulphur reducing archaebacteria growing optimally at 105°C 1983
_[12] 문서 Ultrathin mycelia-forming organisms from submarine volcanic areas having an optimum growth temperature of 105 °C 1982
_[13] 문서 Pyrolobus fumarii, gen. and sp. nov., represents a novel group of archaea, extending the upper temperature limit for life to 113 degrees C 1997
_[14] 문서 Extending the Upper Temperature Limit for Life 2003
_[15] 웹인용 NCBI taxonomy resources ftp://ftp.ncbi.nih.g[...] National Center for Biotechnology Information 2010-11-23
_[16] 저널 Caldisphaera lagunensis gen. nov., sp. nov., a novel thermoacidophilic crenarchaeote isolated from a hot spring at Mt Maquiling, Philippines http://ijs.sgmjourna[...] 2010-11-23

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