드러그뱅크
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1. 개요
드러그뱅크는 2006년에 처음 출시된 약물 데이터베이스로, 다양한 버전 업데이트를 통해 정보를 확장해왔다. 각 버전은 FDA 승인 약물, 생명공학 약물, 약물 표적 정보 등을 포함하며, 버전 2.0부터는 판매 중단 약물, 불법 약물, 약물 상호작용, ADMET 매개변수 등 다양한 정보를 추가했다. 2014년 버전 4.0에서는 약물 대사 산물, 약물 분류, 약물 스펙트럼, 결합 상수, 화학 합성 정보 등 더욱 다양한 데이터가 포함되었으며, 공개 웹 인터페이스를 통해 접근할 수 있다.
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2. 버전 역사
드러그뱅크는 2006년 첫 번째 버전이 출시된 이후[1], 데이터의 양과 질적인 측면에서 꾸준히 발전해 왔다. 각 버전별 주요 특징은 다음과 같다.
2. 1. 버전 1.0 (2006년)
드러그뱅크의 첫 번째 버전은 2006년에 출시되었다.[11] 이 버전은 841개의 (FDA) 승인 소분자 약물, 113개의 생명공학 약물, 2133개의 약물 표적 정보를 포함했다.
2. 2. 버전 2.0 (2009년)
2009년에 출시된 드러그뱅크(DrugBank)의 두 번째 버전은 데이터베이스를 대폭 확장하고 개선했다.[2] 1344개의 승인된 소분자 약물, 123개의 생명공학 약물, 3037개의 고유 약물 표적 정보를 포함했다. 버전 2.0에는 판매 중단 약물, 불법 약물, 음식-약물 및 약물-약물 상호작용, ADMET (흡수, 분포, 대사, 배설 및 독성) 매개변수 정보도 처음으로 추가되었다.
2. 3. 버전 3.0 (2011년)
2011년에 출시된 드러그뱅크 버전 3.0은 1424개의 승인된 소분자 약물, 132개의 생명공학 약물, 4000개 이상의 고유 약물 표적 정보를 포함했다.[8] 또한 약물 수송체, 약물 경로, 약물 가격, 특허 및 제조 데이터와 5000개 이상의 실험 약물 정보가 추가되었다.[8]
2. 4. 버전 4.0 (2014년)
2014년에 출시된 드러그뱅크 버전 4.0은 1558개의 FDA 승인 소분자 약물, 155개의 생명공학 약물 및 4200개의 고유한 약물 표적 정보를 포함하고 있다.[4] 이 버전에는 약물 대사 산물(구조 및 반응), 약물 분류, 약물 스펙트럼, 약물 결합 상수 및 약물 합성 정보 또한 추가되었다.드러그뱅크 4.0에 대한 자세한 정보는 아래 표와 같다.
2. 5. 버전별 상세 정보
드러그뱅크의 첫 판은 2006년에 출시되었다.[11] 다음은 드러그뱅크 버전별 데이터 범위를 비교한 표이다.
드러그뱅크의 모든 자료는 공개된 비독점 소스에서 제공된다. 거의 모든 자료 항목은 원본 소스를 명시하여 추적 가능하다. 드러그뱅크 자료는 공개 웹 인터페이스를 통해 이용할 수 있다.[9]
[1]
논문
DrugBank: a comprehensive resource for in silico drug discovery and exploration
2006-01
3. 범위 및 접근성
참조
[2]
논문
DrugBank: a knowledgebase for drugs, drug actions and drug targets
2008-01
[3]
뉴스
The Dizzying Problem of Citationless Wikipedia "Facts" That Take On a Life of Their Own
https://slate.com/te[...]
2019-11-09
[4]
논문
DrugBank 5.0: shedding new light on drug metabolism
2014-01
[5]
논문
HMDB: a knowledgebase for the human metabolome
2009-01
[6]
논문
T3DB: a comprehensively annotated database of common toxins and their targets.
2010-01
[7]
논문
Small Molecule Pathway Database.
2014-01
[8]
논문
DrugBank 3.0: a comprehensive resource for 'omics' research on drugs.
2011-01
[9]
논문
DrugBank: a comprehensive resource for in silico drug discovery and exploration
https://academic.oup[...]
2006
[10]
논문
DrugBank: a comprehensive resource for in silico drug discovery and exploration
2006-01
[11]
논문
DrugBank: a comprehensive resource for in silico drug discovery and exploration
2006-01
[12]
논문
DrugBank: a knowledgebase for drugs, drug actions and drug targets
2008-01
[13]
논문
DrugBank 5.0: shedding new light on drug metabolism
2014-01
[14]
논문
HMDB: a knowledgebase for the human metabolome
2009-01
[15]
논문
T3DB: a comprehensively annotated database of common toxins and their targets.
2010-01
[16]
논문
Small Molecule Pathway Database.
2014-01
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