리케차과
1. 개요
리케차과는 알파프로테오박테리아강에 속하는 세균 과이다. 옥시덴티아속, 오리엔티아속, 리케차속 등을 포함하며, 오리엔티아속에는 O. tsutsugamushi가, 리케차속에는 R. rickettsii 등이 속한다. 유전체학 연구를 통해 리케차과에서만 발견되는 특정 단백질과 보존된 시그니처 삽입-결실이 확인되었고, 16S 및 23S 리보솜 RNA 서열 비교를 통해 계통도가 추론되었다.
리케차과 - [생물]에 관한 문서
기본 정보
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시카다니 세포 내부에서 증식하는 리케차 리케차이(R. rickettsii)
분류학적 정보
| 역 | 세균 (Bacteria) |
|---|---|
| 문 | 프로테오박테리아문 (Pseudomonadota) |
| 강 | 알파프로테오박테리아강 (Alphaproteobacteria) |
| 목 | 리케차목 (Rickettsiales) |
| 과 | 리케차과 (Rickettsiaceae) |
| 학명 | Rickettsiaceae Pinkerton 1936 (Approved Lists 1980) |
| 타입 속 | 리케차속 (Rickettsia) da Rocha-Lima 1916 (Approved Lists 1980) |
하위 분류
| 속 | 오키덴티아속 (Occidentia) Mediannikov et al. 2017 오리엔티아속 (Orientia) Tamura et al. 1995 리케차속 (Rickettsia) da Rocha-Lima 1916 "Candidatus" Arcanobacter Martijn et al. 2015 "Candidatus" Cryptoprodota corrig. Ferrantini et al. 2009 Dermacentroxenus Wolbach 1919 "Candidatus" Gigarickettsia Vannini et al. 2014 "Candidatus" Hemipteriphilus Bing et al. 2013 "Candidatus" Megaira Schrallhammer et al. 2013 "Candidatus" Phycorickettsia Yurchenko et al. 2018 "Candidatus" Sarmatiella Castelli et al. 2021 "Candidatus" Spectririckettsia Castelli et al. 2019 "Candidatus" Tisiphia Davison et al. 2022 "Candidatus" Trichorickettsia Vannini et al. 2014 "Candidatus" Xenohaliotis Friedman et al. 2000 |
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아나플라스마는 진드기를 통해 숙주에 감염되는 세균 속으로, 혈액 검사로 진단하고 테트라사이클린으로 치료하며, 알파프로테오박테리아에 속한다.
2. 하위 분류
* 옥시덴티아속
* 오리엔티아속 - O. tsutsugamushi영어 등
* 리케차속 - R. rickettsii영어 등
3. 계통 분류
2013년 펄라 등(Ferla et al.)의 연구에 기반한 알파프로테오박테리아의 계통 분류는 다음과 같다.
비교 게놈 분석을 통해 리케차과(Rickettsiaceae)에 속하는 구성원에게서만 독점적으로 발견되고 이 과의 분자 표지자 역할을 하는 RP030, RP187 및 RP192의 세 가지 단백질이 확인되었다. 또한, 전사 복구 결합 인자(transcription repair coupling factor) Mfd에 있는 4개의 아미노산 삽입, 리보솜 단백질 L19에 있는 10개의 아미노산 삽입, FtsZ 단백질과 주요 시그마 인자 70에 각각 1개의 아미노산 삽입, 그리고 리케차과 종에 특정한 엑소뉴클레아제 VII(exonuclease VII) 단백질의 1개의 아미노산 삭제를 포함하여 다수의 단백질에서 보존된 시그니처 삽입-결실이 확인되었다.
알파프로테오박테리아의 개략적인 리보솜 RNA 계통수는 다음과 같으며, 리케차과의 계통도는 펄라 등에 의해 16S + 23S 리보솜 RNA 서열 비교를 통해 추론되었다.
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4. 유전체학
비교 게놈 분석을 통해 리케차과(Rickettsiaceae)에 속하는 구성원에게서만 독점적으로 발견되고 이 과의 분자 표지자 역할을 하는 RP030, RP187 및 RP192의 세 가지 단백질이 확인되었다. 또한, 전사 복구 결합 인자(transcription repair coupling factor) Mfd에 있는 4개의 아미노산 삽입, 리보솜 단백질 L19에 있는 10개의 아미노산 삽입, FtsZ 단백질과 주요 시그마 인자 70에 각각 1개의 아미노산 삽입, 그리고 리케차과 종에 특정한 엑소뉴클레아제 VII(exonuclease VII) 단백질의 1개의 아미노산 삭제를 포함하여 다수의 단백질에서 보존된 시그니처 삽입-결실이 확인되었다.