SARS-CoV-2 제타 변이
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1. 개요
SARS-CoV-2 제타 변이는 2020년 4월 브라질 리우데자네이루주에서 처음 발견된 SARS-CoV-2의 변이 바이러스이다. P.2 계통으로 명명되었으며, 2021년 5월 세계 보건 기구(WHO)에 의해 제타(ζ)로 명명되었다. 제타 변이 게놈은 E484K, D614G, V1176F의 3가지 아미노산 돌연변이를 가지며, 이들은 모두 바이러스의 스파이크 단백질 코드에서 발견된다. 일부 시퀀스에서는 F565L 돌연변이가 발견되기도 한다.
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SARS-CoV-2 베타 변이는 남아프리카공화국에서 처음 발견되어 WHO에 의해 명명되었으며, 스파이크 단백질에 여러 돌연변이를 가져 전파력이 높고 백신 효능을 감소시키며 젊은층 감염률이 높았으나, 2022년 3월 이전 유행 변이로 분류되었다.
| SARS-CoV-2 제타 변이 | |
|---|---|
| 명칭 | |
| 변이 이름 | 제타 변이 |
| 기타 명칭 | 계통 P.2 |
| 영어 명칭 | SARS-CoV-2 Zeta variant |
| 바이러스 분류 | |
| 바이러스 | SARS-CoV-2 |
| 계통 | P.2 (B.1.1.28.2) |
| 발견 및 보고 | |
| 최초 보고 위치 | 브라질 리우데자네이루 |
| 최초 보고 시점 | 2021년 1월 |
| 특징 | |
| 주요 변이 | E484K |
| 설명 | P.2 계통은 B.1.1.28 계통에서 파생됨. 스파이크 단백질에 E484K 변이를 가짐. 2020년 4월부터 리우데자네이루에서 순환이 증가함. |
| 세계보건기구 (WHO) 지정 | |
| 지정 상태 | 더 이상 관심 변이로 지정되지 않음. |
| 지정 해제일 | 2021년 9월 |
| 기타 정보 | |
| PANGO 계통 | P.2 |
2. 분류
2. 1. 명명
2020년 4월, 이 계통은 브라질 리오데자네이루주에서 처음 발견되었으며, 이후 '''계통 P.2'''로 명명되었다.[8][13] 2021년 5월 말, 세계 보건 기구(WHO)는 우려 변이 또는 주목해야 할 변이에 그리스 문자를 사용하는 새로운 방침을 도입하여, P.2 계통에 '''제타'''(ζ:Zeta)라는 명칭을 부여했다.[8][13]2. 2. 돌연변이
제타 변이 게놈은 E484K, D614G, V1176F 3가지 아미노산 돌연변이를 가지며, 이들은 모두 바이러스의 스파이크 단백질 코드에서 발견된다.[6] 미국 질병통제예방센터에 따르면, F565L이 일부 제타 변이 시퀀스에서 발견되었지만, 모든 시퀀스에서 발견되지는 않았다.[7]
2. 2. 1. 스파이크 단백질 돌연변이
제타 변이 게놈은 3개의 아미노산 돌연변이, 즉 E484K, D614G, V1176F를 가지고 있으며, 이들은 모두 바이러스의 스파이크 단백질 코드에서 발견된다.[6] 미국 질병통제예방센터에 따르면, F565L이 일부 제타 변이 시퀀스에서 발견되었지만, 모든 시퀀스에서 발견되지는 않았다.[7]
제타 변이주의 게놈에는 E484K, D614G, V1176F의 3가지 아미노산 변이가 있으며, 이들은 모두 바이러스의 스파이크 단백질 코드를 포함하고 있다[14]. 미국 질병통제예방센터(CDC)에 따르면, F565L은 모든 것은 아니지만, 일부 제타 변이주 염기서열에서 검출되고 있다[15]。
참조
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웹사이트
PANGO lineages Lineage P.2
https://cov-lineages[...]
2021-01-28
[2]
간행물
Genomic Characterization of a Novel SARS-CoV-2 Lineage from Rio de Janeiro, Brazil
2021-04-26
[3]
웹사이트
Genomic characterisation of an emergent SARS-CoV-2 lineage in Manaus: preliminary findings
https://virological.[...]
2021-01-12
[4]
간행물
Effectiveness of the CoronaVac vaccine in the elderly population during a Gamma variant-associated epidemic of COVID-19 in Brazil
[5]
웹사이트
Tracking SARS-CoV-2 variants
https://www.who.int/[...]
World Health Organization
[6]
웹사이트
Spike Variants: Zeta variant, aka P.2
https://covdb.stanfo[...]
Stanford University Coronavirus Antiviral & Resistance Database
2021-07-01
[7]
웹사이트
SARS-CoV-2 Variant Classifications and Definitions
https://www.cdc.gov/[...]
Centers for Disease Control and Prevention
2020-02-11
[8]
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Tracking SARS-CoV-2 variants
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World Health Organization
[9]
뉴스
感染・伝播性の増加や抗原性の変化が懸念される 新型コロナウイルス（SARS-CoV-2）の新規変異株について （第11報）
https://www.niid.go.[...]
国立感染症研究所
2021-07-17
[10]
웹사이트
当センターにおける新型コロナウイルス変異株のスクリーニング検査結果について（2021年10月12日更新）
http://www.tokyo-eik[...]
東京都健康安全研究センター
null
[11]
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PANGO lineages Lineage P.2
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2021-01-28
[12]
간행물
Genomic Characterization of a Novel SARS-CoV-2 Lineage from Rio de Janeiro, Brazil
https://www.ncbi.nlm[...]
2021-04-26
[13]
뉴스
新型コロナウイルス感染症の世界の状況報告
https://www.forth.go[...]
厚生労働省
2021-06-08
[14]
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Spike Variants: Zeta variant, aka P.2
https://covdb.stanfo[...]
Stanford University Coronavirus Antiviral & Resistance Database
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[15]
웹사이트
SARS-CoV-2 Variant Classifications and Definitions
https://www.cdc.gov/[...]
Centers for Disease Control and Prevention
[16]
웹인용
Genomic characterisation of an emergent SARS-CoV-2 lineage in Manaus: preliminary findings
https://virological.[...]
2021-01-12
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