균류 색인

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1. 개요
2. 역사와 발전
3. 내용 및 범위
4. 기능 및 서비스
- 4.1. 메타데이터 표준
참조

1. 개요

균류 색인(Index Fungorum)은 유효하게 출판된 모든 곰팡이 이름을 목록화하는 것을 목표로 하는 데이터베이스이다. 19세기부터 시작되어 20세기에는 프란츠 페트라크의 목록을 통해 발전했으며, 제국 균학국에서 시작하여 여러 기관을 거쳐 현재 영국 왕립 식물원 큐에서 운영되고 있다. 최근에는 출판 전 등록 시스템을 도입하여, 국제조류·균류·식물명명규약에 따라 새로운 곰팡이 이름은 공인된 저장소에서 식별자를 인용해야 한다. 균류 색인은 곰팡이 이름의 표준화 및 접근성을 위해 MycoBank, Fungal Names와 협력하며, 생명 과학 식별자를 제공하고, XML 기반 워크플로우 및 웹 서비스를 통해 데이터베이스 검색을 지원한다. 또한, FAIR 데이터 원칙을 준수하며, 곰팡이 표본 메타데이터에 대한 특정 표준을 권장한다.

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균류 색인
일반 정보
이름	Index Fungorum (균류 색인)
유형	데이터베이스
등록	필요 없음
소유자	Index Fungorum Partnership (균류 색인 파트너십)
저자	Index Fungorum Partnership (균류 색인 파트너십)
상업성	아니오
URL	IndexFungorum.org
상세 정보
설명	모든 진균류의 공식적인 (과학적인) 이름을 색인화하는 국제적인 프로젝트이다.
권장 저장소	MycoBank, Index Fungorum 및 진균류 이름은 2013년에 공식 명명 저장소로 권장되었다.

2. 역사와 발전

균류 명칭 색인(Index Fungorum)의 역사는 19세기 초로 거슬러 올라가며, 여러 주목할 만한 편집을 통해 Index Fungorum이 탄생하게 되었다. 가장 초기의 포괄적인 시도 중 하나는 피에르 안드레아 사카르도(Pier Andrea Saccardo)의 "균류 총람(Sylloge Fungorum)"(1882–1931)으로, 알려진 모든 균류 명칭과 그 설명을 편집하는 것을 목표로 했다. 20세기에는 프란츠 페트라크(Franz Petrak)의 "목록(Lists)"(1920-1939)이 이 전통을 이어받아 새로운 균류 명칭과 문헌 자료를 포괄적으로 색인했다.

Index Fungorum의 개발은 다양한 기관 변화를 통해 추적할 수 있다. 1920년에 설립된 제국 균학국(Imperial Bureau of Mycology, IBM)의 노력에서 시작되었으며, 이는 1948년에 영국 연방 균학 연구소(Commonwealth Mycological Institute, CMI)로 발전했다. 1986년에는 CAB 인터내셔널(CAB International)의 일부가 되었고, 결국 현재의 Index Fungorum 프로젝트로 발전했다. 2016년 현재, Index Fungorum 시스템을 영국 왕립 식물원 큐(Royal Botanic Gardens, Kew)로 이전하여 국제 식물 명칭 색인(International Plant Names Index, IPNI)과 함께 운영할 계획이 진행 중이었다. 이러한 움직임은 식물과 균류 명칭 등록 시스템 간의 더 긴밀한 통합을 촉진할 것으로 예상된다.

2013년 1월 1일부터 새로운 균류 명칭은 국제조류·균류·식물명명규약(ICN)에 따라, 출판 전에 인정된 저장소(Index Fungorum, MycoBank, Fungal Names)에서 발급한 식별자를 인용해야 한다.

3. 내용 및 범위

''균류 색인''(Index Fungorum)은 유효하게 정의된 모든 곰팡이 이름을 포괄적으로 목록화하는 것을 목표로 한다. 여기에는 상반되거나 더 이상 사용되지 않는 이름도 포함된다. 이 데이터베이스는 상과 이상에서 종내에 이르기까지 모든 계급의 새로운 분류군, 새로운 대체 이름, 신조합, 그리고 다양한 유형 지정을 포함한 광범위한 명명 행위를 다룬다. 또한 역사적으로 때때로 별도로 취급되었던 지균류를 형성하는 곰팡이의 이름도 통합한다.

''균류 색인''은 유효하게 정의된 모든 곰팡이 이름의 전 세계적인 목록을 의도했지만, 그중 많은 이름이 상충되거나 더 이상 사용되지 않는다. 영국 왕립 식물원, 큐에 기반을 둔 밀접하게 관련된 프로젝트인 ''균류 종''(Species Fungorum)은 CABI의 지원을 받아 ''균류 색인'' 이름 중 현재 유효한 것으로 권장되는 하위 집합을 결정한다. ''균류 색인'' 또는 ''균류 종'' 목록에서 개별적으로 검색할 수 있으며, ''균류 색인'' 결과는 ''균류 종''에 대한 상호 참조를 제공한다(사용 가능한 경우). 이러한 참조가 없는 이름은 일반적으로 역사적 관심 대상일 뿐이며 현재 사용에 신뢰할 수 있는 것으로 간주해서는 안 된다.^[1]^[2]

4. 기능 및 서비스

균류 색인(Index Fungorum)은 데이터베이스에 있는 기록에 대해 생명 과학 식별자(LSID)를 제공하여, 다양한 데이터베이스와 출판물에서 균류 분류군을 고유하게 식별하고 참조할 수 있게 한다. 등록을 위해 XML 기반의 기계 대 기계 워크플로우를 개발하고 있으며, 출판사의 시스템과 연동하여 균류 이름의 출판 전 효율적인 등록을 가능하게 하는 자동화된 프로세스를 제공한다. 이는 여러 분류학적 이름 등록 기관에서 표준화된 등록 프로세스를 만들기 위한 광범위한 노력의 일환이다.

균류 이름 등록 개념은 시간이 지남에 따라 발전했으며, 최근에는 새로운 균류 이름을 적절하게 기록하고 과학계에서 이용할 수 있도록 균류 색인과 함께 작동하는 MycoBank와 같은 온라인 등록 시스템이 개발되었다.

균류 색인은 데이터베이스 검색 및 기록 검색을 위한 SOAP 프로토콜 웹 서비스를 제공하며, WSDL 파일이 제공된다.^[3] 또한, 과학 데이터의 효과적인 공유 및 활용에 필요한 FAIR 데이터 원칙(찾기 쉬움, 접근성, 상호 운용성 및 재사용성)을 준수하여 연구자에게 데이터베이스의 유용성을 높이고 다른 생물 다양성 정보학 리소스와의 통합을 강화한다.

균류 색인은 국제 균류 명명 위원회에서 인정한 MycoBank 및 Fungal Names와 함께 균류 이름에 대한 세 개의 공식 등록 기관 중 하나이며, 이 세 개의 저장소는 플랫폼 간의 일관성을 유지하기 위해 매월 데이터를 동기화한다. 이 시스템은 균류학 커뮤니티가 최신화되고 조화된 명명 정보를 이용할 수 있도록 보장하며, 이러한 저장소 간의 협업은 균류 명명의 표준화 및 접근성에 있어 중요한 발전이다.

4. 1. 메타데이터 표준

균류 명명 데이터의 정확한 기록 및 검색을 쉽게 하기 위해 ''균류 색인''은 표본 메타데이터에 대한 특정 표준을 권장한다. 여기에는 수집 위치, 서식지, 기질, 수집 날짜 및 저장소 정보에 대한 자세한 정보가 포함된다. 이러한 표준은 데이터베이스가 분류학자 및 기타 연구자에게 포괄적이고 유용한 정보를 제공하는 데 도움이 된다.

참조

_[1] 웹사이트 "''Index Fungorum'' home page" http://www.indexfung[...] Royal Botanic Gardens Kew 2016-10-25
_[2] 웹사이트 "''Species Fungorum'' home page" http://www.speciesfu[...] Royal Botanic Gardens Kew 2016-10-25
_[3] 웹사이트 Fungus Web Service http://www.indexfung[...]
_[4] 저널 MycoBank, Index Fungorum, and Fungal Names recommended as official nomenclatural repositories for 2013 https://web.archive.[...] 2020-01-07

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