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루브로박테르속

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목차

1. 개요

루브로박테르속은 방선균에 속하는 세균 속으로, 호기성이며 방사선에 내성을 가진 종이 많다. 현재 인정되는 분류는 명명법에 따라 확립된 원핵생물 이름 목록(LPSN) 및 국립 생명공학 정보 센터(NCBI)를 기반으로 한다. 대표적인 종으로는 루브로박테르 아플리시나이, 루브로박테르 브라카렌시스, 루브로박테르 칼리디플루미니스, 루브로박테르 나이아디쿠스, 루브로박테르 라디오톨레란스 등이 있다.

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루브로박테르속 - [생물]에 관한 문서
기본 정보
학명Rubrobacter
속 명명Suzuki et al. 1989
기준 종Rubrobacter radiotolerans
기준 종 명명(Yoshinaka, Yano & Yamaguchi 1973) Suzuki et al. 1989
분류
도메인세균
문방선균문
강루브로박테르강
목루브로박테르목 (Rubrobacterales)
과루브로박테르과 (Rubrobacteraceae)
종
종 목록R. aplysinae
R. bracarensis
R. calidifluminis
R. naiadicus
Rubrobacter radiotolerans
R. taiwanensis
R. xylanophilus

2. 분류


  • '''루브로박테르목''' (Rubrobacterales)
  • * '''루브로박테르과''' (Rubrobacteraceae)
  • ** '''루브로박테르속''' (''Rubrobacter'')

''Rubrobacter radiotolerans''
''Rubrobacter taiwanensis''
''Rubrobacter xylanophilus''

현재 인정되는 분류는 LPSN[5] 및 NCBI의 데이터를 기반으로 한다.[6] 속 내 종들 간의 상세한 계통 발생학적 관계는 #계통 발생 부분에서 다룬다.

2. 1. 계통 발생

현재 인정되는 분류는 명명법에 따라 확립된 원핵생물 이름 목록(LPSN)[5] 및 국립 생명공학 정보 센터(NCBI)의 데이터를 기반으로 한다.[6] 아래 표는 두 가지 주요 계통 분석 방법(16S rRNA 및 120개 마커 단백질)에 따른 루브로박테르속 내 종들의 관계를 비교하여 보여준다.

16S rRNA 기반 LTP_08_2023[7][8][9]120개 마커 단백질 기반 GTDB 08-RS214[10][11][12]
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3. 특징

방선균 중에서도 호기성이며 방사선에 내성을 가진 균종이 많다.

4. 대표적인 종

현재 인정되는 분류는 LPSN[5] 및 NCBI를 기반으로 한다.[6]

루브로박테르속(''Rubrobacter'')에 포함되는 대표적인 종들은 다음과 같다. 이들은 기본적으로 호기성 그람 양성 세균이다.


  • ''R. aplysinae'' Kämpfer 외. 2014[7][8][9]
  • ''R. bracarensis'' Jurado 외. 2013[7][8][9]
  • ''R. calidifluminis'' Albuquerque 외. 2014[7][8][9]
  • ''R. indicoseani'' Chen 외. 2018[7][8][9]
  • ''R. marinus'' Chen 외. 2020[7][8][9]
  • ''R. naiadicus'' Albuquerque 외. 2014[7][8][9]
  • ''R. radiotolerans'' (Yoshinaka, Yano & Yamaguchi 1973) Suzuki 외. 1989[7][8][9]: 방사선에 내성을 가진다.
  • ''R. spartanus'' Norman 외. 2017[7][8][9]
  • ''R. taiwanensis'' Chen 외. 2004[7][8][9]
  • ''R. tropicus'' Chen 외. 2020[7][8][9]
  • ''R. xylanophilus'' Carreto 외. 1996[7][8][9]


'''미확정 종''' (Incertae sedis)

참조

[1] 논문 Proposal for a new hierarchic classification system, ''Actinobacteria'' classis nov.
[2] 논문 Chemotaxonomic characterization of a radiotolerant bacterium ''Arthrobacter radiotolerans'': Description of ''Rubrobacter radiotolerans'' gen. nov., comb. nov.
[3] 웹사이트 ''Rubrobacter'' https://lpsn.dsmz.de[...] List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature (LPSN) 2021-06-23
[4] 논문 Rubrobacter taiwanensis sp. nov., a novel thermophilic, radiation-resistant species isolated from hot springs http://ntur.lib.ntu.[...]
[5] 웹사이트 ''Rubrobacteria'' https://lpsn.dsmz.de[...] 2021-06-23
[6] 웹사이트 Rubrobacteria https://www.ncbi.nlm[...] National Center for Biotechnology Information (NCBI) taxonomy database 2021-03-20
[7] 웹사이트 The LTP https://imedea.uib-c[...] 2023-11-20
[8] 웹사이트 LTP_all tree in newick format https://imedea.uib-c[...] 2023-11-20
[9] 웹사이트 LTP_08_2023 Release Notes https://imedea.uib-c[...] 2023-11-20
[10] 웹사이트 GTDB release 08-RS214 https://gtdb.ecogeno[...] 2023-05-10
[11] 웹사이트 bac120_r214.sp_label https://data.gtdb.ec[...] 2023-05-10
[12] 웹사이트 Taxon History https://gtdb.ecogeno[...] 2023-05-10
[13] 저널 Proposal for a new hierarchic classification system, Actinobacteria classis nov. http://ijs.sgmjourna[...] 2011-07-04
[14] 저널 Rubrobacter taiwanensis sp. nov., a novel thermophilic, radiation-resistant species isolated from hot springs


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