리케차목

3. 계통 분류

2013년 펄라 등(Ferla ''et al.'')의 연구에 기반한 알파프로테오박테리아의 계통 분류는 다음과 같다.^[32]

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! 알파프로테오박테리아

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| 마그네토코쿠스아강

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| 카울로박테리아아강

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| 리케차아강

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| 펠라지박터목

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| 원시-미토콘드리아

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| 아나플라스마과

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| ''볼바키아속''

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| ''네오리케차속''

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| 미디클로리아과

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| ''미디클로리아속''

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| 리케차과

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리케차목은 리케차과, 미디클로리아과, 에를리키아과의 세 가지 과로 구성된다. 대부분의 연구는 홀로스포라과를 포함하지만, 일부 연구에서는 이의를 제기한다.^[10] 홀로스포라과는 자체적인 목인 홀로스포라목으로 분류되어 리케차목에 속하지 않는다.

리케차목(''Rickettsiales'')은 원래 모든 편성 세포 내 기생 세균을 포함했지만, 클라미디아나 Q열 병원체(콕시엘라균 ''Coxiella burnetii'') 등은 근연성이 낮다고 하여 제외되었다. 현재 체계에서는 리케차과(''Rickettsiaceae'')와 에를리키아과(''Ehrlichiaceae'')의 2개 과가 존재한다. 홀로스포라과(''Holosporaceae'')가 포함되는 경우도 있지만, 최근에는 홀로스포라목(''Holosporales'')으로 별개의 계통으로 분류되고 있다.^[21][22]

4. 환원 진화

리케차목의 게놈은 환원 진화를 겪고 있으며, 일반적으로 작고(대개 1.5Mbp 미만), AT가 풍부하며(대개 40% GC 미만), 낮은 코딩 밀도(대개 85% 미만)와 상대적으로 많은 유사유전자를 가지고 있다.^[11] 게놈 크기, % GC 및 코딩 밀도, 그리고 유전자의 감소는 일반적으로 유전 부동과 뮬러 래칫에 기인한다. 유전 부동은 (내부 공생적 특성으로 인해) 낮은 개체수와 잦은 개체수 병목 현상으로 인해 리케차목 게놈에서 강화된다. 마찬가지로, 뮬러 래칫은 재조합 및 수평 유전자 전달의 부재를 통해 활성화된다(진핵생물 숙주 세포는 자연적인 장벽이다).

참조

_[1] 논문 Molecular identification of a novel intracellular proteobacteria from scallop ''Chlamys farreri''
_[2] 논문 Wolbachia: master manipulators of invertebrate biology
_[3] 서적 Rickettsiales: Biology, Molecular Biology, Epidemiology, and Vaccine Development Springer
_[4] 논문 Single-cell genomics of a rare environmental alphaproteobacterium provides unique insights into Rickettsiaceae evolution
_[5] 논문 New rRNA gene-based phylogenies of the Alphaproteobacteria provide perspective on major groups, mitochondrial ancestry and phylogenetic instability
_[6] 논문 A robust species tree for the alphaproteobacteria
_[7] 논문 Phylogenomic evidence for a common ancestor of mitochondria and the SAR11 clade
_[8] 논문 Independent genome reduction and phylogenetic reclassification of the oceanic SAR11 clade
_[9] 논문 The SAR11 group of alpha-proteobacteria is not related to the origin of mitochondria
_[10] 논문 New rRNA gene-based phylogenies of the Alphaproteobacteria provide perspective on major groups, mitochondrial ancestry and phylogenetic instability
_[11] 논문 Intracellular pathogens go extreme: genome evolution in the Rickettsiales
_[12] 서적 Bulletin de l'Académie Polonaise des Sciences Série des Sciences Biologiques
_[13] 논문 Approved Lists of Bacterial Names 1980-01-01
_[14] 논문 Zur Aetiologie des Fleckfeibers
_[15] 웹사이트 Order ''Rickettsiales'' https://lpsn.dsmz.de[...] List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature 2023-08-15
_[16] 논문 Cytotropic pathogenic infections and place of ''Rickettsia'' in the system of Chlamydozoa
_[17] 논문 Criteria for the accurate classification of the Rickettsial diseases (Rickettsioses) and of their etiological agents 1936-03-01
_[18] 논문 Wolbachia: master manipulators of invertebrate biology http://www.nature.co[...] 2008-10
_[19] 서적 Medical microbiology https://www.worldcat[...] University of Texas Medical Branch at Galveston 1996
_[20] 논문 Deep mitochondrial origin outside the sampled alphaproteobacteria http://www.nature.co[...] 2018-05
_[21] 논문 New rRNA Gene-Based Phylogenies of the Alphaproteobacteria Provide Perspective on Major Groups, Mitochondrial Ancestry and Phylogenetic Instability https://doi.org/10.1[...] 2013-12-11
_[22] 논문 An updated phylogeny of the Alphaproteobacteria reveals that the parasitic Rickettsiales and Holosporales have independent origins https://elifescience[...] 2019-02-25
_[23] 논문 A robust species tree for the alphaproteobacteria. http://jb.asm.org/cg[...]
_[24] 논문 The SAR11 group of alpha-proteobacteria is not related to the origin of mitochondria.
_[25] 논문 Independent Genome Reduction and Phylogenetic Reclassification of the Oceanic SAR11 Clade https://academic.oup[...] 2012-02-01
_[26] 논문 The SAR11 Group of Alpha-Proteobacteria Is Not Related to the Origin of Mitochondria https://doi.org/10.1[...] 2012-01-23
_[27] 서적 Bergey’s Manual of Determinative Bacteriology, 7th ed. The Williams and Wilkins Co., Baltimore
_[28] 서적 Bulletin de l'Academie Polonaise des Sciences, Serie des Sciences Biologiques
_[29] 서적 Bergey’s Manual of Determinative Bacteriology, 7th ed The Williams and Wilkins Co., Baltimore
_[30] 서적 Bergey's Manual of Systematic Bacteriology, 2nd edn, vol. 2 (The Proteobacteria), part C (The Alpha-, Beta-, Delta-, and Epsilonproteobacteria) Springer, New York
_[31] 논문 List of new names and new combinations previously effectively, but not validly, published 2006-01-01
_[32] 논문