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테르모프로테우스과

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목차

1. 개요

테르모프로테우스과는 고세균의 한 과로, 테르모프로테우스목에 속한다. 16S rRNA 염기서열 분석 및 53개의 마커 단백질 기반 계통 분류를 통해 테르모클라디움과와 함께 분류된다. 테르모프로테우스과는 여러 속을 포함하며, 분류 기준에 따라 포함되는 속의 종류가 다르다.

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테르모프로테우스과 - [생물]에 관한 문서
분류 정보
역고균
계크렌고균계
문크렌고균문
강테르모프로테우스강
목테르모프로테우스목
과테르모프로테우스과
과 명명Zillig and Stetter, 1982
속칼디비르가속 (Caldivirga)
피로바쿨룸속 (Pyrobaculum)
테르모클라디움속 (Thermocladium)
테르모프로테우스속 (Thermoproteus)
불카니세타속 (Vulcanisaeta)

2. 계통 발생

현재 통용되는 분류는 명명법에 따라 유지되는 원핵생물 이름 목록(LPSN)[2] 및 국립생물공학정보센터(NCBI)[3]를 기반으로 한다.

16S rRNA 기반 LTP_06_2022[4][5][6]53개의 마커 단백질 기반 GTDB 08-RS214[7][8][9]
style="vertical-align:top|label1=테르모프로테우스과1={{clade1={{clade1=칼디비르가 Itoh et al. 19992=테르모클라디움 Itoh et al. 19982={{clade1=불카니세타 Itoh et al. 20022={{clade1=테르모프로테우스 Zillig and Stetter 19822=파이로바쿨룸 Huber et al. 1988label1=테르모프로테우스목1={{cladelabel1="테르모클라디움과"1={{clade2=불카니세타1={{clade1=칼디비르가2=테르모클라디움label2=테르모프로테우스과2={{clade1=테르모프로테우스2=파이로바쿨룸


2. 1. 16S rRNA 기반 계통 분류

16S rRNA 염기서열 분석 기반의 '모든 종 생물 트리 프로젝트'(LTP)에서는 테르모프로테우스목을 테르모프로테우스과와 테르모클라디움과로 분류한다.[4][5][6]

테르모프로테우스과



테르모클라디움과


2. 1. 1. 테르모프로테우스과

명명법에 따라 유지되는 원핵생물 이름 목록(LPSN) 및 국립생물공학정보센터(NCBI)의 분류에 따르면, 테르모프로테우스과는 다음 속을 포함한다.[2][3]

16S rRNA 기반 LTP_06_2022[4][5][6]


2. 1. 2. 테르모클라디움과

''칼디비르가'' Itoh et al. 1999

''테르모클라디움'' Itoh et al. 1998

''불카니세타''

2. 2. 53개 마커 단백질 기반 계통 분류

53개의 마커 단백질을 기반으로 하는 GTDB에서는 테르모프로테우스목을 테르모프로테우스과와 테르모클라디움과로 분류한다.[7][8][9]

53개의 마커 단백질 기반 GTDB 08-RS214[7][8][9]


2. 2. 1. 테르모프로테우스과

현재 통용되는 분류는 명명법에 따라 유지되는 원핵생물 이름 목록(LPSN)[2] 및 국립생물공학정보센터(NCBI)[3]를 기반으로 한다.

16S rRNA 기반 LTP_06_2022[4][5][6]53개의 마커 단백질 기반 GTDB 08-RS214[7][8][9]
style="vertical-align:top|


2. 2. 2. 테르모클라디움과

16S rRNA 기반 LTP_06_2022[4][5][6]에 따르면 테르모클라디움과는 테르모프로테우스과에 속하며, ''칼디비르가'' Itoh et al. 1999, ''테르모클라디움'' Itoh et al. 1998, ''불카니세타'' Itoh et al. 2002를 포함한다. 53개의 마커 단백질 기반 GTDB 08-RS214[7][8][9]에 따르면 "테르모클라디움과"는 ''불카니세타'', ''칼디비르가'', ''테르모클라디움''을 포함한다.

참조

[1] 웹사이트 NCBI taxonomy resources http://ftp.ncbi.nih.[...] National Center for Biotechnology Information 2007-03-19
[2] 웹사이트 Thermoproteaceae https://lpsn.dsmz.de[...] List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature 2021-05-15
[3] 웹사이트 Thermoproteaceae https://www.ncbi.nlm[...] National Center for Biotechnology Information (NCBI) taxonomy database 2011-06-05
[4] 웹사이트 The LTP https://imedea.uib-c[...] 2023-05-10
[5] 웹사이트 LTP_all tree in newick format https://imedea.uib-c[...] 2023-05-10
[6] 웹사이트 LTP_06_2022 Release Notes https://imedea.uib-c[...] 2023-05-10
[7] 웹사이트 GTDB release 08-RS214 https://gtdb.ecogeno[...] 2023-05-10
[8] 웹사이트 ar53_r214.sp_label https://data.gtdb.ec[...] 2023-05-10
[9] 웹사이트 Taxon History https://gtdb.ecogeno[...] 2023-05-10
[10] 웹인용 NCBI taxonomy resources ftp://ftp.ncbi.nih.g[...] National Center for Biotechnology Information 2010-11-25


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