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리보플라빈 키네이스

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1. 개요

리보플라빈 키네이스는 X선 결정학 및 핵자기 공명(NMR)으로 관찰할 수 있는 효소이다. 테르모플라스마 아시도필룸에서 분리한 리보플라빈 키네이스는 220개의 아미노산을 포함하며, 2.20 Å 해상도로 X선 결정학을 통해 구조가 밝혀졌다. 이차 구조는 알파 나선 형태의 69개 잔기(30%)와 베타 시트 형태의 60개 잔기(26%)를 포함하며, 아미노산 131번과 133번에 마그네슘 결합 부위, 아미노산 188번과 195번에 플라빈 모노뉴클레오타이드 결합 부위를 갖는다. 2007년 말 기준으로 14개의 3차 구조가 밝혀졌으며, 단백질 데이터 뱅크(PDB) 접근 코드는 1N05, 1N06, 1N07, 1N08, 1NB0, 1NB9, 1P4M, 1Q9S, 2P3M, 2VBS, 2VBT, 3CTA, 2VBU, 2VBV이다.

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리보플라빈 키네이스
효소 정보
이름리보플라빈 키네이스
EC 번호2.7.1.26
CAS 번호9032-82-0
GO 코드0008531
Thermoplasma acidophilum 유래 리보플라빈 키네이스의 결정 구조
단백질 패밀리 정보
심볼플라보키네이스
이름리보플라빈 키네이스
Thermotoga maritima 유래 FAD 합성 효소에 플라빈 결합 결정 구조
PfamPF01687
InterProIPR015865
SMART해당 없음
PROSITE해당 없음
MEROPS해당 없음
SCOP1mrz
TCDB해당 없음
OPM 패밀리해당 없음
OPM 단백질해당 없음
CAZy해당 없음
CDD해당 없음

2. 구조

리보플라빈 키네이스의 소수성 플롯.
왼쪽


리보플라빈 키네이스의 소수성 플롯.
없음


리보플라빈 키네이스 효소의 전체 배열은 X선 결정학과 핵자기 공명(NMR)을 통해 관찰할 수 있다. 테르모플라스마 아시도필룸에서 분리한 리보플라빈 키네이스 효소는 220개의 아미노산으로 구성되어 있으며, X선 결정학을 통해 2.20 Å 해상도로 구조가 밝혀졌다. 이 효소의 이차 구조는 알파 나선 형태의 잔기 69개(30%)와 베타 시트 형태의 잔기 60개(26%)를 포함한다. 마그네슘 결합 부위는 아미노산 131번과 133번에, 플라빈 모노뉴클레오타이드 결합 부위는 아미노산 188번과 195번에 있다.

2. 1. 3차 구조



전체 효소 배열은 X선 결정학과 핵자기 공명(NMR)으로 관찰할 수 있다.

''테르모플라스마 아시도필룸''에서 분리한 리보플라빈 키네이스 효소는 아미노산 220개로 구성되어 있다. 이 효소의 구조는 X선 결정학을 통해 2.20 Å 해상도로 밝혀졌다. 이차 구조는 알파 나선 형태의 잔기 69개(30%)와 베타 시트 형태의 잔기 60개(26%)를 포함한다. 효소는 아미노산 131번과 133번에 마그네슘 결합 부위, 아미노산 188번과 195번에 플라빈 모노뉴클레오타이드 결합 부위를 가지고 있다.

2007년 말 기준으로, 리보플라빈 키네이스 효소의 3차 구조는 14개가 밝혀졌다. PDB 접근 코드는 1N05, 1N06, 1N07, 1N08, 1NB0, 1NB9, 1P4M, 1Q9S, 2P3M, 2VBS, 2VBT, 3CTA, 2VBU, 2VBV이다.

2. 2. 테르모플라스마 아시도필룸 유래 효소

''테르모플라스마 아시도필룸''에서 분리한 리보플라빈 키네이스 효소는 아미노산 220개로 구성된다. 이 효소의 구조는 X선 결정학을 통해 2.20 Å 해상도로 밝혀졌다. 이차 구조는 알파 나선 형태의 잔기 69개(30%)와 베타 시트 형태의 잔기 60개(26%)를 포함한다. 마그네슘 결합 부위는 아미노산 131번과 133번에 있으며, 플라빈 모노뉴클레오타이드 결합 부위는 아미노산 188번과 195번에 있다.

참조

[1] 논문 Crystal structure of riboflavin kinase from Thermoplasma acidophilum
[2] 논문 Ligand binding-induced conformational changes in riboflavin kinase: structural basis for the ordered mechanism
[3] 논문 Over-expression in Escherichia coli, purification and characterization of isoform 2 of human FAD synthetase
[4] 논문 A conserved domain in prokaryotic bifunctional FAD synthetases can potentially catalyze nucleotide transfer
[5] 논문 A CTP-Dependent Archaeal Riboflavin Kinase Forms a Bridge in the Evolution of Cradle-Loop Barrels https://www.uniprot.[...]



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