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메타노켈라속

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1. 개요

메타노켈라속은 고세균의 한 속으로, 16S rRNA 기반 LTP_01_2022 및 53개 마커 단백질 기반 GTDB 09-RS220에 따른 계통발생학적 분류가 이루어진다. 현재까지 M. arvoryzae, M. conradii, M. paludicola의 3종이 알려져 있으며, M. paludicola는 기준종이다.

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메타노켈라속 - [생물]에 관한 문서
기본 정보
학명Methanocella Sakai et al. 2008
명명자Sakai et al. 2008
유형 종M. paludicola
유형 종 명명자Sakai et al. 2008
분류
도메인고균
에우리아키오타
에우리아키오타
메타노미크로비아
메타노켈라목
목 명명자Sakai et al. 2008
메타노켈라과
과 명명자Sakai et al. 2008
메타노켈라속
속 명명자Sakai et al. 2008
하위 분류
하위M. arvoryzae
M. conradii
M. paludicola

2. 분류

메타노켈라속의 계통발생학적 분류는 16S rRNA 염기서열을 기반으로 하는 LTP (LTP_01_2022 버전)[3][4][5]와 53개의 마커 단백질을 기반으로 하는 GTDB (09-RS220 버전)[6][7][8]에서 유사한 결과를 보인다. 이 두 분류 체계는 메타노켈라속에 속하는 종들 간의 관계를 파악하는 데 활용된다.

2. 1. 하위 종

학명발견 정보주요 특징
Methanocella arvoryzaeSakai 외, 2010년이탈리아 논 토양에서 분리
Methanocella conradiiLu & Lu, 2012
Methanocella paludicolaSakai 외, 2008모식종. 일본 나가오카시 논 토양에서 분리


  • ''Methanocella paludicola'' (메타노켈라 팔루디콜라): 모식종으로, 일본 나가오카시의 논 토양에서 분리되었다. 게놈 크기는 2,957,635bp이며, 3,004개의 해독틀(ORF)을 가지고 있다.
  • ''Methanocella arvoryzae'' (메타노켈라 아르보리자에): 2010년 이탈리아의 논 토양에서 보고되었다.

2. 2. 계통발생

16S rRNA 기반 LTP_01_2022[3][4][5]53개 마커 단백질 기반 GTDB 09-RS220[6][7][8]


참조

[1] 웹사이트 NCBI taxonomy resources http://ftp.ncbi.nih.[...] National Center for Biotechnology Information 2022-03-19
[2] 웹사이트 Methanocellales https://lpsn.dsmz.de[...] List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature 2021-11-17
[3] 웹사이트 The LTP https://imedea.uib-c[...] 2022-02-23
[4] 웹사이트 LTP_all tree in newick format https://imedea.uib-c[...] 2022-02-23
[5] 웹사이트 LTP_01_2022 Release Notes https://imedea.uib-c[...] 2022-02-23
[6] 웹사이트 GTDB release 09-RS220 https://gtdb.ecogeno[...] 2024-05-10
[7] 웹사이트 ar53_r220.sp_label https://data.gtdb.ec[...] 2024-05-10
[8] 웹사이트 Taxon History https://gtdb.ecogeno[...] 2024-05-10
[9] 웹사이트 Genus Methanocella https://lpsn.dsmz.de[...] 원핵생물명 목록(List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature, LPSN)
[10] 웹인용 Methanocella https://www.ncbi.nlm[...]



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