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솔리루브로박테르목

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목차

1. 개요

솔리루브로박테르목은 방선균문의 루브로박테르아강에 속하는 세균 목이다. 2009년에 테르모레오필룸목과 함께 신설되었으며, 솔리루브로박테르과, 코넥시박테르과, 파툴리박테르과를 포함한다. 그람 양성, 중온성 또는 저온 내성을 가지며, 세포벽의 펩티도글리칸에 meso-디아미노피멜산을 포함하는 것이 특징이다. 하위 분류에는 Baekduiaceae, Conexibacteraceae, Parviterribacteraceae, Patulibacteraceae, Solirubrobacteraceae 등이 있다.

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솔리루브로박테르목 - [생물]에 관한 문서
개요
학문 분야세균
분류
도메인세균
문방선균문
강서모레오필리아강
목솔리루브로박테르목
학명Solirubrobacterales
명명자Reddy and Garcia-Pichel, 2009
하위 분류군과
하위 분류백두이아과
카필리미크로비움과
코넥시박터과
파라코넥시박터과
파르비테리박터과
파툴리박터과
솔리루브로박테르과
모식 속솔리루브로박테르속
모식 속 명명자Singleton et al., 2003

2. 역사

솔리루브로박테르속 타입의 솔리루브로박테르속과 타입종인 솔리루브로박테르 파울리(Solirubrobacter pauli)는 2003년 미국 조지아주 농업 토양의 지렁이(Lumbricus rubellus) 굴에서 분리된 것으로 보고되었으며, 방선균문 루브로박테르아강(Rubrobacteridae)의 신속 및 신종으로 제안되었다.[25][26] 2003년에 솔리루브로박테르속은 코넥시박테르속(Conexibacter)과 함께 솔리루브로박테르목 내에서 깊이 관련되어 있으며, 다른 속과는 별도의 그룹을 형성하는 것으로 밝혀졌다. 또한, 이와는 별도로 테르모레오필룸속(Thermoleophilum)도 목 내에서 분기하고 있다는 것도 밝혀졌다.[27] 2004년 Stackebrandt는 루브로박테르목 내를 코넥시박테르과(Conexibacteraceae), 솔리루브로박테르과(Solirubrobacteraceae), 테르모레오필룸과(Thermoleophilaceae)의 3개로 나누는 것을 제안했다[17](2006년에 파툴리박테르과(Patulibacteraceae)도 추가되었다[23])。

2009년에 루브로박테르목(Rubrobacterales)으로부터 테르모레오필룸과 및 솔리루브로박테르과가 분리되는 형태로 테르모레오필룸목(Thermoleophilales) 및 솔리루브로박테르목이 신설되었다. 이때, 솔리루브로박테르목에는 솔리루브로박테르과, 코넥시박테르과, 파툴리박테르과가 할당되었다.[10]

2012년에 루브로박테르아강의 분석에 기초하여 루브로박테르강과 테르모레오필룸강이 신설되었다. 이때, 테르모레오필룸강에 테르모레오필룸목과 솔리루브로박테르목이 할당되었다.[28][21]

3. 특징

그람 양성이며, 중온성이며 때로는 저온 내성을 가지며, 세포벽의 펩티도글리칸 3번 위치의 디아미노산으로 meso-디아미노피멜산을 포함한다.[10]

16S rRNA 유전자 서열의 시그니처 뉴클레오티드로는 G–C(63 : 104), G–C(70 : 98), C–G(370 : 391), U–A(580 : 776), U–A(657 : 749), A–U(670 : 736), U–A(681 : 709), A–U(941 : 1342), G–C(953 : 1228), G–C(954 : 1226), G–C(1051 : 1207), U–A(1118 : 1155), A–U(1311 : 1326) 등이 있다.[10]

4. 하위 분류


  • Baekduiaceae
  • Conexibacteraceae
  • Parviterribacteraceae
  • Patulibacteraceae
  • Solirubrobacteraceae

4. 1. 계통 분류

현재 통용되는 분류는 명명법에 따른 원핵생물 이름 목록(LPSN)[2]과 국립 생명공학 정보 센터(NCBI)를 기반으로 한다.[3]

16S rRNA 기반 LTP_08_2023[4][5][6]120개 마커 단백질 기반 GTDB 08-RS214[7][8][9]
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4. 1. 1. 16S rRNA 기반 LTP 계통 분류

현재 통용되는 분류는 명명법에 따른 원핵생물 이름 목록(LPSN)[2]과 국립 생명공학 정보 센터(NCBI)를 기반으로 한다.[3]

16S rRNA 기반 LTP_08_2023[4][5][6]120개 마커 단백질 기반 GTDB 08-RS214[7][8][9]
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4. 1. 2. 120개 마커 단백질 기반 GTDB 계통 분류

현재 통용되는 분류는 명명법에 따른 원핵생물 이름 목록(LPSN)[2]과 국립 생명공학 정보 센터(NCBI)를 기반으로 한다.[3]

16S rRNA 기반 LTP_08_2023[4][5][6]120개 마커 단백질 기반 GTDB 08-RS214[7][8][9]
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참조

[1] 논문 Description of ''Patulibacter americanus'' sp. nov., isolated from biological soil crusts, emended description of the genus ''Patulibacter'' Takahashi ''et al''. 2006 and proposal of ''Solirubrobacterales'' ord. nov. and ''Thermoleophilales'' ord. nov.
[2] 웹사이트 Solirubrobacterales https://lpsn.dsmz.de[...] List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature (LPSN) 2021-06-23
[3] 웹사이트 Solirubrobacterales https://www.ncbi.nlm[...] National Center for Biotechnology Information (NCBI) taxonomy database 2021-03-20
[4] 웹사이트 The LTP https://imedea.uib-c[...] 2023-11-20
[5] 웹사이트 LTP_all tree in newick format https://imedea.uib-c[...] 2023-11-20
[6] 웹사이트 LTP_08_2023 Release Notes https://imedea.uib-c[...] 2023-11-20
[7] 웹사이트 GTDB release 08-RS214 https://gtdb.ecogeno[...] 2023-05-10
[8] 웹사이트 bac120_r214.sp_label https://data.gtdb.ec[...] 2023-05-10
[9] 웹사이트 Taxon History https://gtdb.ecogeno[...] 2023-05-10
[10] 논문 Description of ''Patulibacter americanus'' sp. nov., isolated from biological soil crusts, emended description of the genus ''Patulibacter'' Takahashi ''et al''. 2006 and proposal of Solirubrobacterales ord. nov. and Thermoleophilales ord. nov. 2009-01-01
[11] 논문 Notification that new names and new combinations have appeared in volume 59, part 1, of the IJSEM 2009-04-01
[12] 웹사이트 Order ''Solirubrobacterales'' https://lpsn.dsmz.de[...] List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature (LPSN) 2023-01-23
[13] 논문 ''Baekduia soli'' gen. nov., sp. nov., a novel bacterium isolated from the soil of Baekdu Mountain and proposal of a novel family name, Baekduiaceae fam. nov. 2018-01-04
[14] 논문 List of new names and new combinations previously effectively, but not validly, published 2019-05-08
[15] 논문 ''Capillimicrobium parvum'' gen. nov., sp. nov., a novel representative of Capillimicrobiaceae fam. nov. within the order Solirubrobacterales, isolated from a grassland soil 2022-08-26
[16] 논문 Notification that new names of prokaryotes, new combinations, and new taxonomic opinions have appeared in volume 72, part 8 of the IJSEM 2022-11-30
[17] 논문 Will We Ever Understand? The Undescribable Diversity of the Prokaryotes 2004-12-01
[18] 논문 Validation of publication of new names and new combinations previously effectively published outside the IJSEM 2005-03-01
[19] 논문 ''Paraconexibacter algicola'' gen. nov., sp. nov., a novel actinobacterium isolated from a eutrophic lake during the end of cyanobacterial harmful algal blooms, and proposal of Paraconexibacteraceae fam. nov. in the order Solirubrobacterales 2019-11-07
[20] 논문 Notification that new names of prokaryotes, new combinations, and new taxonomic opinions have appeared in volume 70, part 2 of the IJSEM 2020-05-29
[21] 논문 ''Parviterribacter kavangonensis'' gen. nov., sp. nov. and ''Parviterribacter multiflagellatus'' sp. nov., novel members of Parviterribacteraceae fam. nov. within the order Solirubrobacterales, and emended descriptions of the classes Thermoleophilia and Rubrobacteria and their orders and families 2016-02-01
[22] 논문 Notification that new names of prokaryotes, new combinations, and new taxonomic opinions have appeared in volume 66, part 2, of the IJSEM 2016-05-01
[23] 논문 ''Patulibacter minatonensis'' gen. nov., sp. nov., a novel actinobacterium isolated using an agar medium supplemented with superoxide dismutase, and proposal of Patulibacteraceae fam. nov. 2006-02-01
[24] 논문 Notification that new names and new combinations have appeared in volume 56, part 2, of the IJSEM 2006-05-01
[25] 논문 ''Solirubrobacter pauli'' gen. nov., sp. nov., a mesophilic bacterium within the ''Rubrobacteridae'' related to common soil clones.
[26] 논문 Notification that new names and new combinations have appeared in volume 53, part 2, of the IJSEM 2003-07-01
[27] 논문 ''Thermoleophilum album'' and ''Thermoleophilum minutum'' are culturable representatives of group 2 of the Rubrobacteridae (Actinobacteria) 2003-03-01
[28] 서적 Bergey's Manual of Systematic Bacteriology Springer(New York)
[29] 문서 Order Solirubrobacterales https://lpsn.dsmz.de[...] 원핵생물명 목록(List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature, LPSN)
[30] 웹인용 솔리루브로박테르목(Solirubrobacterales) 정보 http://www.ncbi.nlm.[...] 미국 국립생물공학정보센터(NCBI) 2012-01-27


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