ExPASy
1. 개요
ExPASy는 단백질 서열 및 구조 분석, 2차원 겔 전기영동 분석을 위한 서버로 시작하여 생명과학 분야 최초의 웹사이트 중 하나로 1993년 8월에 개설되었다. UniProtKB/Swiss-Prot와 UniProtKB/TrEMBL을 호스팅했으며, 2011년 SIB 그룹에 의해 'SIB ExPASy 생물정보학 자원 포털'로 확장되었다. ExPASy는 160개 이상의 자원에 대한 통합 검색을 제공하며, EDAM 온톨로지를 기반으로 정보를 제공한다.
| 유형 | 단백질 분석 시스템 및 생물정보학 자원 |
|---|---|
| 운영 기관 | 스위스 생물정보학 연구소(SIB) |
| URL | www.expasy.org |
| 언어 | 영어 |
| 상태 | 활성 |
| 상업 여부 | 비상업적 |
| 개요 | ExPASy (Expert Protein Analysis System)는 단백질 및 유전체 서열과 구조를 분석하기 위한 생물정보학 자원이다. |
|---|---|
| 특징 | 단백질 서열 분석 도구 제공 단백질 모티프 및 도메인 검색 질량 분석 데이터 분석 단백질 3차원 구조 예측 다양한 단백질 데이터베이스 접근 제공 |
| 주요 데이터베이스 | UniProtKB/Swiss-Prot PROSITE ENZYME SWISS-MODEL |
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| 서열 분석 도구 | ProtParam: 단백질의 물리화학적 특성 계산 Translate: DNA 서열을 단백질 서열로 번역 PeptideMass: 펩타이드 질량 계산 |
|---|---|
| 모티프 검색 도구 | PROSITE: 단백질 패밀리 및 도메인 식별 ScanProsite: 사용자 서열에서 PROSITE 패턴 검색 |
| 구조 예측 도구 | SWISS-MODEL: 단백질 3차원 구조 예측 |
| 관련 프로젝트 | SIB(스위스 생물정보학 연구소) UniProt |
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스위스의 과학과 기술 -
제네바 모터쇼
제네바 모터쇼는 1905년 스위스 제네바에서 시작된 국제 모터쇼로, 세계 5대 모터쇼 중 하나이며, 신차와 기술을 선보이는 플랫폼으로서 디지털 기술 발전과 코로나19 팬데믹 등의 변화 속에서 새로운 도약을 준비하고 있다. -
스위스의 과학과 기술 -
CHEOPS
CHEOPS는 유럽 우주국과 스위스 우주국의 협력으로 개발된 우주 망원경으로, 외계 행성의 크기를 정밀하게 측정하고 밀도와 구성 물질을 파악하며, 2026년까지 외계 위성 탐색 임무를 수행할 예정이다. -
생물정보학 -
Rosetta@home
Rosetta@home은 분산 컴퓨팅 플랫폼 BOINC를 활용하여 단백질 구조 예측 연구를 수행하며, 신약 개발 및 질병 연구에 기여하는 것을 목표로 한다. -
생물정보학 -
발현체학
2. 역사
ExPASy는 원래 Expert Protein Analysis System (전문가 단백질 분석 시스템)이라고 불렸으며, 단백질 서열 및 구조, 2차원 겔 전기영동 분석을 위한 단백질체학 서버였다. 특히 단백질 서열 지식 베이스인 UniProtKB/Swiss-Prot와 컴퓨터 주석이 추가된 UniProtKB/TrEMBL을 호스팅했다.
ExPASy는 생명과학 분야 최초의 웹사이트였다.
2.1. 초기 역사 (1993년 ~ )
1993년 8월, ExPASy는 'Expert Protein Analysis System'의 약자로, 단백질 서열 및 구조, 2차원 겔 전기영동(2D 페이지 전기영동) 분석을 위한 단백질체학 서버로 처음 서비스를 시작했다. ExPASy는 특히 단백질 서열 지식 베이스인 UniProtKB/Swiss-Prot와 컴퓨터 주석이 추가된 UniProtKB/TrEMBL을 호스팅하며 중요한 역할을 수행했다. ExPASy는 생명과학 분야 최초의 웹사이트 중 하나였으며, 세계에서 가장 초기에 만들어진 150개 웹사이트 중 하나였다.