SNOMED CT
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1. 개요
SNOMED CT는 1965년 병리학의 체계적 명명법으로 시작되어 의료 용어로 발전한 용어 체계이다. 1999년 미국 병리학회와 영국 국립 보건 서비스의 용어를 통합하여 SNOMED CT가 만들어졌으며, 2002년 1월에 최종 제품이 출시되었다. SNOMED CT는 4개의 핵심 구성 요소(개념 코드, 설명, 관계, 참조 세트)를 통해 헬스케어 절차를 특징짓고 기록하는 데 필요한 모든 것을 범주화한다. 현재 311,000개 이상의 개념을 포함하며, 전자건강기록 시스템 등 다양한 분야에서 활용된다. SNOMED International에서 관리하며, 상업적 사용에는 라이선스가 필요하다. 한국은 2020년 SNOMED International의 회원국이 되었다.
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SNOMED CT - [IT 관련 정보]에 관한 문서 | |
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개요 | |
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개발 | SNOMED 인터내셔널 |
장르 | 의학 용어 |
웹사이트 | SNOMED International |
기술 정보 | |
기타 |
2. 역사
SNOMED는 1965년 병리학의 체계적 명명법(SNOP)으로 시작되어 발전했다. 1999년 미국 병리학회(CAP)가 개발한 SNOMED 참조 용어(SNOMED RT)와 영국 국립 보건 서비스(NHS)가 개발한 임상 용어 버전 3(CTV3) (이전에는 Read 코드로 알려짐)을 병합, 확장 및 재구성하여 SNOMED CT가 만들어졌다. 최종 제품은 2002년 1월에 출시되었다.
SNOMED RT는 120,000개 이상의 개념을 통해 의료 전문 분야 데이터를, CTV3는 200,000개의 상호 연결된 개념으로 1차 진료 상담 정보를 구조화하여 저장했다. 현재 SNOMED CT는 311,000개 이상의 개념을 포함하며 전자건강기록(EHR)을 위한 핵심 용어체계이다.[51]
2003년 7월, 국립 의학 도서관(NLM)은 베치 험프리스가 이끈 협상팀을 통해[52] 미국 보건 복지부 대신 미국 병리학회와 계약, SNOMED CT를 통합 의료 언어 시스템 UMLS 메타테서러스를 통해 미국 사용자에게 무료로 제공했다.
2007년 4월, SNOMED CT 지적 재산권은 CAP에서 국제 의료 용어 표준 개발 기구(IHTSDO)로 이전되어 국제적인 채택과 사용이 촉진되었다. 현재 SNOMED International로 거래되는 이 조직은 SNOMED CT의 유지, 개발, 품질 보증 및 배포를 담당하며, 회원국은 다음과 같다.
국가 |
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아르헨티나 |
호주 |
벨기에 |
브루나이 |
캐나다 |
체코 |
칠레 |
덴마크 |
에스토니아 |
홍콩 |
아이슬란드 |
인도 |
아일랜드 |
이스라엘 |
리투아니아 |
말레이시아 |
몰타 |
네덜란드 |
뉴질랜드 |
노르웨이 |
폴란드 |
포르투갈 |
싱가포르 |
슬로바키아 |
슬로베니아 공화국 |
스페인 |
스웨덴 |
스위스 |
영국 |
미국 |
우루과이 |
SNOMED CT는 다국적, 다언어 용어이며, 현재 미국 영어, 영국 영어, 스페인어, 덴마크어, 스웨덴어로 제공된다. 프랑스어 및 네덜란드어 번역은 진행 중이거나 거의 완료되었다. SNOMED CT는 ICD-9-CM, ICD-10, ICD-O-3, ICD-10-AM, LOINC, OPCS-4 등 다른 용어와 상호 매핑되며, ANSI, DICOM, HL7, ISO 표준을 지원한다.
한국은 2020년 8월 SNOMED International의 39번째 국가 회원이 되었고[https://www.kosmi.org/bbs/board.php?bo_table=sub7_3&wr_id=33], 한국보건의료정보원이 국가배포센터(NRC, National Release Center)[https://www.k-his.or.kr/]로 지정되었다.
2. 1. SNOMED의 기원과 발전 (1965년 ~ 1999년)
SNOMED는 1965년 병리학의 체계적 명명법(SNOP)으로 시작되었고 더 개발되어 논리 기반의 의료 용어체계가 되었다.[46][47]SNOMED CT는 1999년 미국 병리학회(CAP)에서 개발한 SNOMED 참조 용어(SNOMED RT)와 영국의 NHS에서 개발한 임상 용어 버전 3 (CTV3) (이전에는 Read 코드로 알려져있었음)의 두 가지 대규모 용어를 병합, 확장 및 재구성하여 만들어졌다.[48][49] 최종 제품은 2002년 1월에 배포되었다.
SNOMED의 역사적 강점은 의료 전문 분야를 보장하는 것이었다. 120,000개 이상의 개념을 가진 SNOMED RT는 여러 기관들과 개인들이 기록한 병리학적 데이터의 통합과 검색을 위한 공통의 참조용어체계로서 제공되도록 설계되었다. CTV3의 강점은 일반적인 실무용 용어체계라는 것이었다. 200,000개의 상호연관된 개념들을 가진 CTV3는 개개인의 환자중심 기록에서 1차 의료에 대한 구조화된 정보를 저장하기 위해 사용되었다.[50]
2. 2. SNOMED CT의 탄생 (1999년 ~ 2002년)
SNOMED는 1965년에 Systematized Nomenclature of Pathology (SNOP)로 시작되었고 더 개발되어 논리기반의 헬스케어 용어체계가 되었다.[46][47]SNOMED CT는 1999년에 미국 병리학회(CAP)가 개발한 SNOMED 참조 용어(SNOMED RT)와 영국 국립 보건 서비스(NHS)가 개발한 임상 용어 버전 3(CTV3) (이전에는 Read 코드로 알려짐)의 두 가지 대규모 용어를 병합, 확장 및 재구성하여 만들어졌다.[48][49] 최종 제품은 2002년 1월에 배포되었다.
SNOMED의 역사적인 강점은 의학적 전문성을 보장하는 것이었다. 120,000개 이상의 개념을 가진 SNOMED RT는 여러 기관들과 개인들이 기록한 병리학적 데이터의 통합과 검색을 위한 공통의 참조용어체계로서 제공되도록 설계되었다. CTV3의 강점은 일반적인 실무용 용어체계라는 것이었다. 200,000개의 상호연관된 개념들을 가진 CTV3는 개개인의 환자중심 기록에서 1차 의료에 대한 구조화된 정보를 저장하기 위해 사용되었다.[50]
2. 3. 국제화 및 관리 주체 변화 (2002년 ~ 현재)
SNOMED CT는 1999년 미국 병리학회(CAP)가 개발한 SNOMED 참조 용어(SNOMED RT)와 영국 국립 보건 서비스(NHS)가 개발한 임상 용어 버전 3(CTV3) (이전에는 Read 코드로 알려짐)의 두 가지 대규모 용어를 병합, 확장 및 재구성하여 만들어졌다.[48][49] SNOMED RT는 120,000개 이상의 개념을 통해 여러 기관 및 개인에 의해 기록된 병리학 의료 데이터의 집계 및 검색을 위한 공통 참조 용어 역할을 하도록 설계되었고, CTV3는 200,000개의 상호 관련된 개념을 통해 개별 환자 기반 기록에서 1차 진료 상담에 대한 구조화된 정보를 저장하는 데 사용되었다.[50] 최종 제품은 2002년 1월에 출시되었다.[9][10]2003년 7월, 국립 의학 도서관(NLM)은 미국 보건 복지부를 대신하여 미국 병리학회와 계약을 체결하여 SNOMED CT를 NLM의 통합 의료 언어 시스템 UMLS 메타테서러스를 통해 미국 사용자에게 무료로 제공했다. 베치 험프리스가 이끈 NLM 협상팀은[52] NLM에 핵심 SNOMED CT(스페인어 및 영어)와 지속적인 업데이트에 대한 영구 라이선스를 제공했다.[48][53][54]
2007년 4월, SNOMED CT 지적 재산권은 CAP에서 국제 의료 용어 표준 개발 기구(IHTSDO)로 이전되어 SNOMED CT의 국제적인 채택과 사용을 촉진했다. 현재 SNOMED International로 거래되고 있는 이 조직은 국제적으로 "SNOMED CT의 지속적인 유지, 개발, 품질 보증 및 배포"를 담당하고 있으며[46][45][49], 이 조직의 회원에는 다음 국가들이 포함되어 있다.[55]
국가 |
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아르헨티나 |
호주 |
벨기에 |
브루나이 |
캐나다 |
체코 |
칠레 |
덴마크 |
에스토니아 |
홍콩 |
아이슬란드 |
인도 |
아일랜드 |
이스라엘 |
리투아니아 |
말레이시아 |
몰타 |
네덜란드 |
뉴질랜드 |
노르웨이 |
폴란드 |
포르투갈 |
싱가포르 |
슬로바키아 |
슬로베니아 공화국 |
스페인 |
스웨덴 |
스위스 |
영국 |
미국 |
우루과이 |
SNOMED CT는 다국적 및 다언어 용어이며, 다양한 언어와 방언을 관리할 수 있다. SNOMED CT는 현재 미국 영어, 영국 영어, 스페인어, 덴마크어 및 스웨덴어로 제공되며, 프랑스어 및 네덜란드어 번역이 진행 중이거나 거의 완료되었다. SNOMED CT는 ICD-9-CM, ICD-10, ICD-O-3, ICD-10-AM, 실험실 LOINC 및 OPCS-4와 같은 다른 용어로 상호 매핑된다. 이는 ANSI, DICOM, HL7 및 ISO 표준을 지원한다.
한국은 2020년 8월 SNOMED International의 39번째 국가 회원이 되었고[https://www.kosmi.org/bbs/board.php?bo_table=sub7_3&wr_id=33], 한국보건의료정보원이 국가배포센터(NRC, National Release Center)[https://www.k-his.or.kr/]로 지정되었다.
2. 4. 한국의 SNOMED CT 도입 (2020년 ~ 현재)
한국은 2020년 8월 SNOMED International의 39번째 회원이 되었고[55], 한국보건의료정보원이 국가배포센터(NRC, National Release Center)로 지정되었다.[55]3. 구조
SNOMED CT는 다음과 같은 네 가지 주요 핵심 구성 요소로 구성된다.[56]
SNOMED CT "개념"은 의료 절차를 특징짓고 기록하는 데 필요한 모든 것을 범주화하는 표현 단위이다. 각 개념은 고유한 ID로 식별된다. 예를 들어, 개념 22298006은 심근경색을 나타낸다. 모든 SNOMED CT 개념은 비순환 분류(is-a) 계층 구조로 구성된다. 예를 들어, ''바이러스성 폐렴''은 ''감염성 폐렴''의 상위 개념이고, ''감염성 폐렴''은 ''폐렴''의 상위 개념이며, ''폐렴''은 ''폐 질환''의 상위 개념이다. 개념은 여러 부모를 가질 수 있는데, 예를 들어 ''감염성 폐렴''은 ''폐 질환'' 뿐만 아니라 ''감염성 질환''의 하위 개념이다.
3. 1. Concept Codes (개념 코드)
SNOMED CT는 4개의 기본적인 핵심 컴포넌트들로 구성된다.[56]- '''개념 코드''' – 임상 용어들을 식별하는 숫자로 된 코드들이며, 원시(primitive) 또는 완전히 정의됨(fully defined)으로 구분되어 계층구조에 구조화되어 있다.
- '''설명''' – 개념 코드의 문자열
- '''관계''' – 관련된 의미를 갖는 개념 코드 간의 관계
- '''참조 집합''' – 개념 또는 설명을 그룹으로 묶어 세트로 만드는데 사용되며, 참조 세트와 다른 분류체계나 표준에 상호 매핑하는 것을 포함한다.
SNOMED CT "개념"은 헬스케어 절차를 특징지우고 기록할 필요가 있는 모든 것을 범주화하는 표현의 단위이다. 2020년 SNOMED CT는 352,000개 이상의 개념을 포함하며, 유일한 concept ID로 식별된다. 예를 들어 concept 22298006는 ''심근경색''을 참조한다. 모든 SNOMED CT 개념은 비순환 분류학적 계층구조(is-a)로 조직화되어 있다. 예를 들어 ''바이러스성 폐렴'' IS-A ''감염성 폐렴'' IS-A ''폐렴'' IS-A ''폐 질환''. 개념은 다중의 부모를 가질 수 있는데, 예를 들어, ''감염성 폐렴''은 ''폐 질환'' 뿐만 아니라 ''감염성 질환''의 자식이다. 분류학적 구조는 데이터가 저장될 수 있고, 이후에 상이한 수준의 통합 방식으로 접근될 수 있도록 한다. SNOMED CT 개념은 3,040,000개 이상의 'relationships'라고 불리는 링크들로 연결되어 있다.[57]
개념은 Descriptions라 불리는 다양한 임상 용어들 또는 문단들로 기술될 수 있는데, 이들은 ''완전히 명시된 명칭(Fully Specified Names, FSNs)'', ''선호용어(Preferred Terms, PTs)'', ''동의어(Synonyms)''로 나뉜다. 각 개념은 SNOMED CT 전체에서 정확히 1개의 유일한 FSN를 가진다. 추가로 이것은 정확히 1개의 PT를 가지는데, 임상의 그룹이 해당 concept의 의미를 표현하는 가장 공통된 방식이 되도록 PT를 결정한다. 이것은 동의어가 없거나 또는 많은 수의 동의어를 가질 수 있다. 동의어는 해당 개념을 참조하는 추가적인 용어들과 문단들이다. 그것들은 유일하거나 명확할 필요는 없다.
3. 2. Descriptions (설명)
SNOMED CT에서 개념(Concepts)은 Descriptions(설명)이라고 불리는 다양한 임상 용어 또는 문구들로 기술될 수 있다. Descriptions는 다음과 같이 나뉜다.- Fully Specified Names (FSNs, 완전히 명시된 명칭): 각 개념은 SNOMED CT 전체에서 정확히 하나의 유일한 FSN을 가진다.
- Preferred Terms (PTs, 선호용어): 각 개념은 정확히 하나의 PT를 가지는데, 임상의 그룹이 해당 개념의 의미를 표현하는 가장 일반적인 방식이라고 결정한 용어이다.
- Synonyms (동의어): 각 개념은 동의어를 가지지 않거나, 여러 개의 동의어를 가질 수 있다. 동의어는 해당 개념을 참조하는 추가적인 용어 또는 문구이다. 동의어는 유일하거나 명확할 필요는 없다.
3. 3. Relationships (관계)
SNOMED CT 개념은 3,040,000개 이상의 '관계'라고 불리는 링크로 연결되어 있다.[57] 분류학적 구조는 데이터가 저장되고, 이후에 상이한 수준의 통합 방식으로 접근할 수 있도록 한다. 예를 들어, ''Infectious pneumonia(감염성 폐렴)''는 ''Lung disease(폐질환)'' 뿐만 아니라 ''Infectious disease(감염성 질환)''의 자식이다.3. 4. Reference Sets (참조 세트)
SNOMED CT는 개념(Concepts) 또는 설명(Descriptions)을 그룹으로 묶어 세트로 만드는데 사용되며, 참조 세트와 다른 분류 체계나 표준에 상호 매핑하는 것을 포함한다.[56]3. 5. 개념(Concepts)
SNOMED CT "개념"은 의료 절차를 특징짓고 기록할 필요가 있는 모든 것을 범주화하는 표현의 단위이다. 2020년 SNOMED CT는 352,000개 이상의 개념을 포함하며, 각 개념은 고유한 concept ID로 식별된다. 예를 들어 concept 22298006은 ''심근경색''을 나타낸다.[57] 모든 SNOMED CT concepts는 비순환 분류학적 계층구조(is-a)로 조직화되어 있다. 예를 들어 ''바이러스성 폐렴'' IS-A ''감염성 폐렴'' IS-A ''폐렴'' IS-A ''폐 질환''과 같이 표현된다. Concepts는 다중의 부모를 가질 수 있는데, 예를 들어 ''감염성 폐렴''은 ''폐 질환'' 뿐만 아니라 ''감염성 질환''의 자식이기도 하다. 이러한 분류학적 구조는 데이터가 저장될 수 있고, 이후에 상이한 수준의 통합방식으로 접근될 수 있도록 한다. SNOMED CT concepts는 3,040,000개 이상의 'relationships'라고 불리는 링크들로 연결되어 있다.[57]Concepts는 Descriptions라 불리는 다양한 임상 용어들 또는 문단들로 기술될 수 있는데, 이들은 ''Fully Specified Names(완전히 명시된 명칭)'' (FSNs), ''Preferred Terms(선호용어)'' (PTs), ''Synonyms(동의어)''로 나뉜다. 각 Concepts는 SNOMED CT 전체에서 정확히 1개의 유일한 FSN를 가진다. 추가로 이것은 정확히 1개의 PT를 가지는데, 임상의의 그룹이 해당 concept의 의미를 표현하는 가장 공통된 방식이 되도록 PT를 결정한다. 이것은 synonym이 없거나 또는 많은 수의 synonyms를 가질 수 있다. Synonyms는 해당 concept를 참조하는 추가적인 용어들과 문단들이다. 그것들은 유일하거나 명확할 필요는 없다.
3. 6. 의미론적 태그(Semantic tag)
SNOMED CT는 각 개념에 의미론적 태그를 할당한다. 의미론적 태그는 각 개념의 완전 지정 이름(FSN) 괄호 안에 표시된다. 각 SNOMED CT 최상위 계층 내에서 여러 개의 의미론적 태그가 사용될 수 있다. 예를 들어, 의약품/생물학적 제품의 최상위 계층은 제품, 의약품, 의약품 형태 및 임상 약물의 의미론적 태그를 사용한다. 각 개념에는 하나의 의미론적 태그만 사용할 수 있다.4. 모델
SNOMED CT는 온톨로지 기반의 다국어 시소러스로 특징지을 수 있다. 시소러스와 같은 특징은 concept 82272006에 대한 동의어 설명이 "Acute coryza", "Acute nasal catarrh", "Acute rhinitis", "Common cold" (그리고 스페인어 "resfrío común"와 "rinitis infecciosa")와 같이 개념-용어 관계를 갖는다는 것이다.
온톨로지적인 부분을 자세히 살펴보면, SNOMED CT는 (ICD와 같은 전형적인 통계적인 분류체계와 달리 광범위한 클래스들의 중첩을 갖는) 클래스 계층이다. 이것은 SNOMED CT concept 82272006이 "common cold(감기)"에 대한 기준과 일치하는 모든 개별 질환 인스턴스의 클래스를 정의한다는 것을 의미한다. 예를 들어, 한 환자가 기록에 "head cold"라고 적거나 다른 환자의 기록에 "Acute corynza"라고 적혀있을 수 있는데, 두 경우 모두 "common cold"의 인스턴스로 찾을 수 있다. 수퍼클래스 (IS-A) 관계는 멤버들을 포함한다는 의미에서 클래스들을 연결한다. 즉, 모든 개별적인 "cold-processes"는 바이러스성 상기도감염과 같이 클래스 Common cold의 모든 상위클래스에 포함된다.
SNOMED CT의 관계형 문장(relational statements)은 ''finding site''과 ''due to'' 등과 같은 적은 수의 (linkage concepts라는) 관계타입인 Relationx을 갖는 Concept1 – Relationx – Concept2의 기본적인 세 쌍의 형태이다. 이 세 쌍의 해석은 (함축적으로) 단순 기술 논리 (DL)의 의미론을 기반으로 하는데, 예를 들어, ''Common Cold(감기)'' – '''causative agent(병인)''' – ''Virus(바이러스)'' 세 쌍은 일차술어논리(first-order) 표현과 일치한다.
forall x: instance-of (x, ''Common cold'') -> exists y: instance-of (y, ''Virus'') and '''causative-agent''' (y, x)
또는 더 직관적인 DL 표현은 다음과 같다.
''Common cold'' subClassOf '''causative-agent''' some ''Virus''
''Common cold(감기)'' 예에서, concept description은 "primitive"이며, 이것은 각 인스턴스에 대해서 만족해야 하는 필요(necessary) 기준은 주어졌지만 ''Common cold''의 인스턴스로 질환이 분류되는데 충분하지는(sufficient) 않다는 것을 의미한다. 반대로 ''Viral upper respiratory tract infection(바이러스성 상기도감염)''은 다음과 같이 기술논리적으로 fully defined concept(완전히 정의된 개념)로 표현되었음을 보여준다.
''Viral upper respiratory tract infection'' equivalentTo
''Upper respiratory infection'' and ''Viral respiratory infection'' and
'''Causative-agent''' some ''Virus'' and
'''Finding-site''' some ''Upper respiratory tract structure'' and
'''Pathological-process''' some ''Infectious process''
이것은 모든 정의적 기준을 만족하는 각각 그리고 모든 개별 질환은 바이러스성 상기도감염의 인스턴스로 분류될 수 있다는 것이다.
4. 1. 정규 모델
SNOMED CT는 온톨로지 기반을 갖는 다국어 시소러스로 특징지을 수 있다. 시소러스와 같은 특징은 개념-용어 관계인데, 예를 들어 82272006 개념에는 "Acute coryza", "Acute nasal catarrh", "Acute rhinitis", "Common cold" (그리고 스페인어 "resfrío común"와 "rinitis infecciosa")와 같은 동의어 설명이 있다.온톨로지적인 부분을 상세히 보면, SNOMED CT는 (ICD와 같은 전형적인 통계적인 분류체계와 반대로 광범위한 클래스들의 중첩을 갖는) 클래스 계층이다. 이것은 SNOMED CT 82272006 개념이 "common cold(감기)"에 대한 기준과 일치하는 모든 개별 질환 인스턴스의 클래스를 정의한다는 것을 의미한다. (예를 들어, 한 환자가 기록에 "head cold"라고 적혀있거나 또 다른 기록에 "Acute corynza"라고 적혀있을 수도 있는데, 두 개 모두 "common cold"의 인스턴스로 찾을 수 있다). 수퍼클래스 (IS-A) 관계는 멤버들을 포함한다는 의미에서 클래스들을 연결시킨다. 즉, 모든 개별적인 "cold-processes"는 바이러스성 상기도감염(그림)과 같이 Common cold 클래스의 모든 상위클래스에 포함된다.
SNOMED CT의 관계형 문장(relational statements)은 ''finding site''과 ''due to'' 등과 같은 적은 수의 (linkage concepts라는) 관계타입인 Relationx을 갖는 Concept1 – Relationx – Concept2의 기본적인 세 쌍의 형태이다. 이 세 쌍의 해석은 (함축적으로) 단순 기술 논리 (DL)의 의미론을 기반으로 하는데, 예를 들어, ''Common Cold(감기)'' – '''causative agent(병인)''' – ''Virus(바이러스)'' 세 쌍은 일차술어논리(first-order) 표현과 일치한다.
forall x: instance-of (x, ''Common cold'') -> exists y: instance-of (y, ''Virus'') and '''causative-agent''' (y, x)
또는 더 직관적인 DL 표현은 다음과 같다.
''Common cold'' subClassOf '''causative-agent''' some ''Virus''
''Common cold(감기)'' 예에서, concept description은 "primitive"이며, 이것은 각 인스턴스에 대해서 만족해야 하는 필요(necessary) 기준은 주어졌지만 ''Common cold''의 인스턴스로 질환이 분류되는데 충분하지는(sufficient) 않다는 것을 의미한다. 반대로 ''Viral upper respiratory tract infection(바이러스성 상기도감염)''은 다음과 같이 기술논리적으로 fully defined concept(완전히 정의된 개념)로 표현되었음을 보여준다:
''Viral upper respiratory tract infection'' equivalentTo
''Upper respiratory infection'' and ''Viral respiratory infection'' and
'''Causative-agent''' some ''Virus'' and
'''Finding-site''' some ''Upper respiratory tract structure'' and
'''Pathological-process''' some ''Infectious process''
이것은 모든 정의적 기준을 만족하는 각각 그리고 모든 개별 질환은 바이러스성 상기도감염의 인스턴스로 분류될 수 있다는 것이다.
4. 2. 기술 논리 (Description Logics)
SNOMED CT는 온톨로지 기반의 다국어 시소러스로 특징지을 수 있다. 시소러스와 유사한 특징은 개념-용어 관계인데, 예를 들어 개념 82272006에 대한 동의어는 "급성 코리자", "급성 비강 카타르", "급성 비염", "감기" (스페인어로는 "resfrío común", "rinitis infecciosa")이다.온톨로지적 관점에서 SNOMED CT는 클래스 계층이다 (ICD와 같은 전형적인 통계적 분류와 달리 클래스 간 광범위한 중복이 존재한다). SNOMED CT 개념 82272006은 "감기" 기준을 충족하는 모든 개별 질병 사례의 클래스를 정의한다. 예를 들어, 한 환자의 기록에 "두통 감기"가 기록되거나 다른 환자는 "급성 코리자"가 기록될 수 있는데, 둘 다 "감기"의 사례로 나타난다. 상위 클래스 (Is-A) 관계는 구성원 포함 측면에서 클래스를 연결한다. 즉, 모든 개별 "감기 과정"은 감기 클래스의 모든 상위 클래스 (예: 바이러스성 상기도 감염)에 포함된다.
SNOMED CT의 관계적 구문은 기본적으로 Concept1 – Relationx – Concept2 형태의 삼중항이며, Relationx는 ''발견 부위'', ''~로 인한'' 등과 같은 소수의 관계 유형(연결 개념)에서 가져온다. 이러한 삼중항의 해석은 (암묵적으로) 단순한 기술 논리 (DL) 의미론을 기반으로 한다. 예를 들어, 삼중항 ''감기'' – '''원인''' – ''바이러스''는 1차 표현으로 다음과 같다.
forall x: instance-of (x, ''감기'') -> exists y: instance-of (y, ''바이러스'') and '''causative-agent''' (y, x)
더 직관적인 DL 표현은 다음과 같다.
''감기'' subClassOf '''원인''' some ''바이러스''
''감기'' 예시에서 개념 설명은 "원시적"인데, 이는 각 사례에 대해 충족되어야 하지만 질환을 ''감기''의 사례로 분류하기에는 충분하지 않은 필수 기준이라는 의미이다. 반면, ''바이러스성 상기도 감염'' 예시는 기술 논리로 표현되는 완전히 설명된 개념을 묘사한다.
''바이러스성 상기도 감염'' equivalentTo
''상기도 감염'' and ''바이러스성 호흡기 감염'' and
'''원인''' some ''바이러스'' and
'''발견 부위''' some ''상기도 구조'' and
'''병리학적 과정''' some ''감염 과정''
이는 모든 정의 기준이 충족되는 모든 개별 질환을 바이러스성 상기도 감염의 사례로 분류할 수 있음을 의미한다. 2021년 현재, SNOMED CT 콘텐츠는 EL++ 형식의 하위 집합으로 제한되어 다음 연산자만 사용한다.
- 최상위, 최하위
- 각각의 부모가 선언된 원시 역할 및 개념
- 개념 정의 및 접속(conjunction) (단, 선언(disjunction) 또는 부정(negation)은 아님)
- 역할 계층 구조 (단, 역할 구성은 아님)
- 도메인 및 범위 제약 조건
- 존재적 제한 (단, 보편적 제한은 아님)
- 제한된 형태의 역할 포함 공리(xRy ^ ySz => xRz)
- 일반적인 개념 포함 공리(A ⊆ B)
모델링을 이해하려면 개념의 명시적 관점과 추론된 관점을 살펴보는 것도 중요하다. 명시적 관점을 더 자세히 살펴보면, SNOMED CT는 과거에 '근위 부모' 접근법을 사용했다. 2015년 이후에는 "근위 원시 부모"라는 더 우수한 접근법이 채택되었다.
4. 3. 선조합(Precoordination)과 후조합(Postcoordination)
SNOMED CT는 온톨로지 기반의 다국어 시소러스로, 개념-용어 관계를 통해 시소러스와 같은 특징을 갖는다. 예를 들어, "감기"에 해당하는 concept 82272006은 "Acute coryza", "Acute nasal catarrh", "Acute rhinitis", "Common cold" 등의 동의어를 가진다.[58]온톨로지적인 측면에서 SNOMED CT는 클래스 계층을 가지며, 이는 각 개념이 상위 클래스에 포함되는 방식으로 구성된다. 예를 들어, "감기" 개념은 모든 개별적인 감기 증상을 포함하며, "바이러스성 상기도 감염"과 같은 상위 클래스에도 포함된다.
SNOMED CT의 관계는 Concept1 – Relationx – Concept2 형태의 삼중항으로 표현되며, 기술 논리 (DL) 의미론을 기반으로 해석된다. 예를 들어, "감기 – '''원인''' – 바이러스"는 다음과 같은 논리식으로 표현된다.
forall x: instance-of (x, ''감기'') -> exists y: instance-of (y, ''바이러스'') and '''causative-agent''' (y, x)
이는 "감기"의 모든 사례(x)에 대해, 그 원인이 되는 "바이러스"(y)가 존재한다는 의미이다.
SNOMED CT는 '선조합(Precoordination)'과 '후조합(Postcoordination)' 방식을 모두 사용한다. 선조합은 미리 정의된 개념을 사용하는 방식이고, 후조합은 여러 개념을 조합하여 새로운 의미를 표현하는 방식이다. 예를 들어, "뜨거운 물에 의한 왼쪽 검지의 3도 화상"과 같이 명시적인 개념이 없는 경우, 후조합을 통해 다음과 같이 표현할 수 있다.[58]
284196006 | 피부 화상 | :
116676008 | 관련 형태 | = 80247002 | 3도 화상 |
, 272741003 | 측면성 | = 7771000 | 왼쪽 |
, 246075003 | 원인 물질 | = 47448006 | 뜨거운 물 |
, 363698007 | 발견 부위 | = 83738005 | 검지 구조 |
후조합은 SNOMED CT 내에 방대한 수의 정의된 개념을 미리 생성해야 하는 부담을 줄여준다. 하지만, 일부 시스템에서는 후조합 표현을 지원하지 않아 호환성 문제가 발생할 수 있다. 이러한 후조합 표현은 정규 표현식으로 변환하여 유사한 개념과 비교할 수 있다.
과거에는 국제 질병 분류(ICD)에서는 사후조합을 허용하지 않았고, SNOMED CT가 유일하게 지원을 하였으나, 2020년 부터 ICD-11의 새로운 버전에서 사후조합을 지원한다.
5. 한계점 및 개선 전략
SNOMED CT의 초기 버전은 시맨틱 축에 의해 순서가 정해지는 구조를 가졌는데, 이는 코드를 조합하여 만드는 복잡한 환경을 필요로 했다. 이로 인해 두 가지 큰 약점이 발생했다. 첫째, 후조합(post-coordination)의 필요성은 사용자에게 친화적이지 않은 장애물로 인식되어 초기 SNOMED 버전의 낮은 도입에 기여했다. 둘째, 일관된 코딩이 어려웠는데, 예를 들어 "급성 충수염(Acute appendicitis)"은 의미론적 동치를 계산할 수 있는 방법 없이 세 가지 다른 방식으로 후조합될 수 있었다.[60]
SNOMED RT는 기술논리 공식을 도입하여 이 문제를 해결했다. CTV3의 추가로 수많은 개념들이 정규표현식을 이용하여 재정의되었다. 하지만, 사용자 친화적인 많은 설명을 가지고 역사적으로 성장한 CTV3와의 융합은 여전히 SNOMED CT에 영향을 주는 몇몇 문제점들을 야기했다. 다량의 다중상속을 갖는 많은 계층 단계들의 혼란스러운 분류학적 구조(예: ''Acute appendicitis''는 36개의 분류학적 조상이 있다) 외에도, 모호하고 문맥 의존적인 많은 개념들이 SNOMED CT에서 발견된다. 선조합(pre-coordination)은 때때로 극단적으로 추진되었는데, 예를 들어 머리에서 발견되는 350개의 서로 다른 화상 관련 개념이 존재한다.
SNOMED CT의 부분을 특징짓는 현상은 소위 ''전염성 침투(epistemic intrusion)''이다.[61] 원칙적으로 용어체계 (그리고 심지어 온톨로지)의 임무는 문맥에 자유로운 용어 및 클래스 의미를 제공하는 것으로 제한되어야 한다. 이러한 표현 단위의 문맥화는 이상적으로는 정보모델의 임무가 되어야 한다.[62] 사람의 언어는 ''자궁외 임신(Ectopic pregnancy)''과 ''임신 의심(Suspected pregnancy)''과 같이 마치 범주화된 명확한 엔터티들을 나타내기 위해 유사한 표현을 문법적으로 사용하는 것처럼 방향을 잘못 찾고 있다. 전자는 진짜 임신을 말하지만, 후자는 (불확실한) ''정보''의 한 조각이다. SNOMED CT에서 대부분의 (그러나 전부는 아닌) 이러한 문맥 의존적인 개념들은 ''Situation with explicit context''의 하위계층에 집중되어 있다. 이러한 개념들을 배제하지 못하는 중요한 이유는 현재 상태에서 정보모델이 구현되어 있지 않아, 많은 경우에 SNOMED CT가 정보모델의 기능을 담당하고 있기 때문이다.
IHTSDO의 설립과 함께, SNOMED CT는 더 많은 사람들이 사용하게 되었다. 용어체계의 상태에 대한 비판은 수많은 실질적인 약점에 의해 발생될 뿐만 아니라 품질보장방법의 부족에도 기인한다.[63] 처음부터 IHTSDO는 그런 (또한 학문적인) 비판에 개방적이었다. 지난 몇 년간, 품질과 도구에 관해서는 상당한 진전이 있어왔다.
더 원칙적인 온톨로지적 기반에 대한 필요성은 점진적으로 받아들여졌으며, 기술논리 의미론에 대해서도 더 이해가 커졌다. 관찰(Observables),[64] 장애(disorder)와 소견(findings),[65], 물질(substance), 유기체(organisms) 등에 관한 우선순위 재설계가 공식화되었다. 번역 가이드라인[66] 뿐만 아니라 컨텐츠 제출에 관한 가이드라인, 선조합 컨텐츠의 포함에 관한 전략이 상세화되었다. SNOMED CT의 "온톨로지적 약속(ontological commitment)"과 관련된 여전히 알려진 결함이 있는데,[67] 예를 들어, 어떤 종류의 엔터티를 주어진 SNOMED CT 개념의 인스턴스인지 명확히 하는 것이다. 같은 용어는 질병 또는 질병을 가진 환자로 해석될 수 있는데, 예를 들어, ''종양(Tumour)''은 조직의 과정이나 조각으로 표현될 수 있고 ''알레르기(Allergy)''는 알레르기 반응 또는 단지 알레르기 성향으로 표현될 수 있다. 더 최근의 전략은 SNOMED CT 컨텐츠에서 모호성을 없애기 위해 타입이 지정된 상위레벨의 온톨로지들을 엄격하게 사용하는 것이다.
환자치료를 지원하기 위해 세계적으로 일상적인 사용에 대한 연구를 위한 SNOMED CT 채택이 증가함에 따라 더 큰 참여 커뮤니티가 생겨났다. 이는 SNOMED CT 용어를 저작하는 것에 할당되는 자원의 증가 뿐만 아니라 SNOMED CT를 튼튼한 산업계에서 사용하는 표준이 되게 하는 협업의 증가로 이어지고 있으며, 이는 구현을 지원하는 지식기반에 기여하는 수많은 소프트웨어 도구와 자료들의 개발 증가로 이어지고 있다. SNOMED CT의 특별한 측면과 SNOMED CT의 구현에 집중하는 수많은 온라인 커뮤니티들이 또한 발달하고 있다.
이론적으로, 기술논리추론은 어떠한 새로운 후보 후조합표현식이 기존의 선조합 개념에 대해서 부모인지 선조인지 자식인지 다른 자손인지 의미론적으로 동치인지를 평가하는데 적용될 수 있다. 그러나 부분적으로 CTV3와의 통합의 지속적인 문제때문에, SNOMED는 여전히 발견되지 않는 의미론적으로 중복된 primitive와 defined concepts를 포함하고 있다. 추가적으로 많은 개념들이 primitive로 남아있지만, 그들의 의미론은 역시 시스템 내에 함께 존재하는 다른 primitives와 roles로 합법적으로 정의될 수 있다. 이러한 의미론적 컨텐츠의 생략과 실질적 또는 가능한 중복때문에, 포섭(subsumption) 또는 의미론적 동치(equivalence)를 추론하는 알고리즘의 실제 수행력은 예측하기 어려워 불완전하다.
6. 다른 용어체계와의 관계
SNOMED CT는 임상적 목적에서 환자 데이터를 획득 및 표현하기 위해 설계된 임상 용어체계이다.[68] 국제 질병 및 관련 건강 문제 통계 분류(ICD)는 통계 분석, 역학, 보험금 청구, 자원 배치를 위한 진단 코드 및 일부 국가에서의 수정판에서는 처치 코드를 할당하는 데 사용되는 국제적으로 사용되는 의학 분류(의학 분류체계) 시스템이다.[69] 두 시스템은 표준화된 정의를 사용하고, 전자건강기록(EHR) 시스템 내에서 사용되는 공통 의학 언어를 만든다.[70] SNOMED CT는 환자 진료 과정에서 EHR 시스템으로 정보가 입력되도록 하며, ICD는 이차적 목적을 위해 정보 검색 또는 출력을 용이하게 한다.[70][71]
SNOMED CT | ICD | |
---|---|---|
타입 | 용어체계 시스템 | 분류체계 시스템 |
목적 | 정보 입력 | 정보 출력 |
기능 | 일차 목적을 위해 임상 정보를 정의하고 기술함 | 이차 목적을 위해 임상 정보를 통합하고 범주화함 |
LOINC는 검사실 검사를 포함하는 용어체계이다. 2017년부터 SNOMED CT International은 LOINC 구성 요소(components)를 위한 용어들을 만들기 시작했고, 수많은 LOINC 용어들의 의미를 획득하기 위해 SNOMED CT 표현식 세트를 만들었다.
6. 1. ICD (International Classification of Diseases)
국제 질병 및 관련 건강 문제 통계 분류(ICD)는 국제적으로 사용되는 의학 분류 시스템으로, 통계 분석, 역학, 보험금 청구 및 자원 할당을 위해 진단 코드를 할당하는 데 사용된다. 일부 국가에서는 진단 코드 외에 처치 코드를 할당하기도 한다.[69][30] SNOMED CT와 ICD는 모두 표준화된 정의를 사용하며 전자 건강 기록(EHR) 시스템 내에서 사용되는 공통 의료 언어를 형성한다.[70][31] SNOMED CT는 환자 치료 과정에서 EHR 시스템에 정보를 입력하는 데 사용되는 반면, ICD는 2차적인 데이터 검색 또는 출력 목적으로 활용된다.[70][71][31][32]SNOMED CT | ICD | |
---|---|---|
유형 | 용어 시스템 | 분류 시스템 |
목적 | 정보 입력 | 정보 출력 |
기능 | 임상 정보를 1차적인 목적으로 설명하고 정의함 | 임상 정보를 2차적인 목적으로 집계하고 분류함 |
6. 2. LOINC (Logical Observation Identifiers Names and Codes)
LOINC는 검사실 검사를 포함하는 용어체계이다. 2017년부터 SNOMED CT International은 LOINC 구성 요소(components)를 위한 용어들을 만들기 시작했고, 수많은 LOINC 용어들의 의미를 획득하기 위해 SNOMED CT 표현식 세트를 만들었다.6. 3. MedDRA
MedDRA와 SNOMED CT 사이에는 제약 산업에 도움이 되지 않는 중복이 존재한다. 2021년, 두 조직(SNOMED CT에서 MedDRA로, MedDRA에서 SNOMED CT로)은 SNOMED CT와 MedDRA 사이의 두 가지 맵을 공동으로 발표했다.[33]7. 활용
SNOMED CT는 다양한 방식으로 활용될 수 있다. 예를 들어 의료 제공에 필요한 세부 수준의 임상 정보를 획득하고, 데이터 공유를 통해 환자의 건강 이력을 반복해서 설명할 필요성을 줄일 수 있다. 또한, 서로 다른 장소에서 기록된 정보를 환자 기록 내에서 결합할 수 있으며, 공통 용어 체계를 사용하여 정보 해석의 차이를 줄일 수 있다. FHIR 표준에 기반한 구조화된 데이터 캡처 의료 양식 및 설문지를 이용하면, 공통 방식의 전자 기록은 오류를 줄이고 데이터 기록의 완성도를 높이며, 표준화된 정보는 분석, 품질 지원, 비용 효과적인 실무, 연구 및 임상 가이드라인 개발을 용이하게 한다.[34] 임상 용어 체계는 헬스케어 제공자가 환자를 식별하고 효과적으로 관리하도록 돕는다.
7. 1. 활용 사례
SNOMED CT는 다양한 방식으로 활용될 수 있다.- 헬스케어 제공에 필요한 상세 수준에서 임상 정보를 획득한다.
- 데이터 공유를 통해, 헬스케어 전문가의 새로운 진료 때마다 건강 이력을 반복해서 전달해야 할 필요성을 줄일 수 있다.
- 서로 다른 장소에서 다른 사람들에 의해 정보가 기록될 수 있고, 환자 기록 내에서 단순한 정보 관점으로 결합될 수 있다.
- 공통 용어 체계를 사용하면 정보 해석이 달라질 가능성을 줄일 수 있다.
- 공통 방식의 전자 기록은 오류를 줄이고 모든 관련된 데이터 기록의 완성도를 높이는 데 도움이 될 수 있다.
- 표준화된 정보는 분석과 품질 지원, 비용 효과적인 실무 작업, 연구, 임상 가이드라인 개발을 용이하게 한다.
- 임상 용어 체계는 헬스케어 제공자가 특정한 코드화된 정보를 기반으로 환자를 식별하고 더 효과적으로 스크리닝, 치료 및 추적 관리를 하도록 돕는다.
더 구체적으로, 다음과 같은 컴퓨터 애플리케이션에서 SNOMED CT를 사용한다.
- 전자 건강 기록 시스템
- E-처방 또는 실험실 주문 입력을 포함한 전산화된 제공자 주문 입력(CPOE)
- 임상 서비스 카탈로그 (예: 진단 영상 절차)
- 임상 의사 결정 지원 시스템(CDSS)에 사용되는 지식 데이터베이스
- 원격 중환자실 모니터링
- 검사실 보고
- 응급실 차트 작성
- 암 보고
- 유전자 데이터베이스
8. 접근
SNOMED CT는 영국 런던에 위치한 국제 비영리 표준 개발 기구인 SNOMED International에서 유지 관리 및 배포한다.[1]
상품 시스템에서 SNOMED CT를 사용하려면 라이선스가 필요하다.[2] 라이선스에는 다음 두 가지 유형이 있다.[2]
- SNOMED International의 국가/영토 회원 자격 (국내 총생산에 따라 요금 부과).[2]
- 제휴 라이선스 (최종 사용자 수에 따라 다름).[2] 최저 개발국가 (LDC)는 SNOMED CT를 무료로 사용할 수 있다.[2]
의료 정보학 분야의 과학 연구, 시연 또는 평가 목적으로 SNOMED CT 소스를 자유롭게 다운로드하여 사용할 수 있다.[3] 표 형식의 원본 SNOMED CT 소스는 통합 의학 언어 시스템(UMLS)에 등록된 사용자가 계약을 체결한 경우 접근할 수 있다.[3] 수많은 온라인 및 오프라인 브라우저를 사용할 수 있다.[3]
SNOMED CT 사용에 대한 라이선스를 획득하고 다운로드하려는 사람은 IHTSDO 웹사이트에서 제공되는 링크를 통해 해당 국가의 릴리스 센터에 문의해야 한다.[4]
9. 최상위 개념(Top level concepts)
SNOMED CT 개념은 일반적(의약품-기기 결합 개념은 제외)으로 단일 계층에 속한다. 일부 계층은 정의된 개념 모델을 가지고 있다(예: 임상 소견). 다른 도메인(예: 유기체, 물질, 한정자 값)의 경우에는 아직 정의된 개념 모델이 없다.
2016년 기준으로 Event 계층은 정의된 개념 모델을 가지고 있지 않다. 2006년에 'Clinical findings' 계층의 몇몇 개념들이 Event 계층으로 이전되었다. 그 개념들은 그것들의 속성(attributes)을 유지했다(예: causative agent).[1]
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