SARS-CoV-2 오미크론 변이

3. 역사

오미크론 변이의 잠재적 경제적 영향에 대한 우려로 2021년 11월 26일 세계 시장이 급락했다. 다우존스 산업평균지수는 2021년 최악의 하락을 기록했고, 브렌트유와 서텍사스산 중질유 가격은 각각 10%와 11.7% 하락했다.^[727] 암호화폐 시장도 하락했으며,^[728][729] 남아프리카 공화국 랜드는 미 달러 대비 가치가 6% 하락하며 2021년 사상 최저치를 기록했다.^{[730][731][732]}

3. 1. 초기 발생 및 확산

• 11월 25일, 말라위에서 돌아온 여행객으로부터 이스라엘에서 확진자가 확인되었고,^[41] 남아프리카공화국에서 돌아온 두 명과 마다가스카르에서 돌아온 한 명이 더 있었다.^[42]
• 11월 26일, 벨기에에서 첫 번째 사례가 확인되었다. 감염자는 11월 11일 터키를 경유하여 이집트에서 온 백신 접종을 받지 않은 사람이었다.^[27]
• 11월 27일, 영국에서 두 건, 독일 뮌헨에서 두 건, 이탈리아 밀라노에서 한 건의 사례가 감지되었다.^[45]
• 11월 28일, 네덜란드에서 11월 26일 남아프리카공화국에서 도착한 624명의 항공 승객 중 13건이 확진되었고, 이후 추가로 5건이 확인되었다.^[46][47] 오스트레일리아에서는 남부 아프리카에서 도하 공항을 경유하여 시드니 공항으로 이동한 두 사람이 확진되었다.^[49] 같은 날, 덴마크와 오스트리아에서도 첫 번째 오미크론 사례가 확인되었으며,^[52] 체코와 캐나다에서도 오미크론 사례가 보고되었다.^[53][54]
• 11월 29일, 오스트레일리아 다윈에서 확진자가 발생했다.^[55] 포르투갈에서는 축구 클럽 회원 13명이 확진되었고,^[57] 스웨덴과 스페인에서도 첫 번째 사례가 확인되었다.^[58][59]
• 11월 30일, 일본에서 첫 번째 사례가 확인되었다.^[62]
• 12월 1일, 미국 샌프란시스코에서 11월 22일 남아프리카공화국에서 돌아온 거주자가 확진 판정을 받으며 미국 내 첫 사례가 보고되었다.^[71] 대한민국과 아일랜드에서도 첫 번째 사례가 보고되었다.^[72] 한국은 나이지리아에서 입국한 5명의 여행객으로부터 사례를 보고했다.^[73]

3. 2. 대한민국

4. 특징

2021년 11월 26일, 세계보건기구(WHO)는 SARS-CoV-2의 새로운 변이(PANGO 식별자 B.1.1.529)를 우려 변이로 지정하고 그리스 문자 오미크론(ο)으로 명명했다.^{[522][525][526]} 이전 변이인 뮤 변이(μ) 다음의 그리스 문자인 뉴(ν)와 크사이(ξ)는 건너뛰었는데, 뉴(ν)는 영어 단어 "New"와 혼동될 수 있고,^[522][523] 크사이(ξ)는 중국의 일반적인 성씨와 겹칠 수 있기 때문이었다.^{[523][527][528]} 특히 크사이(ξ)를 건너뛴 것은 시진핑 중화인민공화국 주석의 성씨와의 중복을 피하기 위한 것이라는 추측도 있었지만,^[522][529] WHO는 흔한 성씨이기 때문에 사용하지 않았다고 설명했다.^[530]

GISAID 프로젝트는 이 변이에 GR/484A 식별자를, Nextstrain 프로젝트는 21K 식별자를 할당했다.^[520]

WHO는 과거 감염이나 백신 접종으로 형성된 면역력이 오미크론 변이에 의해 약화될 가능성을 우려했다. 2021년 11월 말, 변이의 효과는 아직 명확히 밝혀지지 않았지만, WHO는 백신 접종률이 낮은 국가에서 의료 붕괴가 발생할 가능성을 경고하며, 모든 국가에 백신 접종률을 높일 것을 촉구했다.^[566]

카디프대학교의 폴 모건 교수는 백신 접종을 권장하며, 면역력이 완전히 사라지는 것이 아니라 약화될 가능성이 높다고 설명했다. 바이러스가 스파이크 단백질의 모든 에피토프를 잃으면 기능하지 못하기 때문에, 이전 바이러스나 백신으로 생성된 항체 및 T세포 클론의 일부는 효과가 없을 수 있지만, 나머지는 효과를 유지할 것이라고 말했다.^[567]

2022년에 들어서면서, 화이자와 모더나 등은 오미크론 변이에 대응하는 백신(기존 바이러스와 오미크론 변이의 정보를 결합한 2가 백신) 개발 및 시험을 진행했고,^{[569][570][571][572]} 유럽, 미국, 일본 등에서는 같은 해 9월 이후 순차적으로 접종이 시작되었다.^{[573][574][575]}

4. 1. 변이

4. 2. 전염력

4. 3. 증상

4. 4. 중증도

5. 하위 변이

오미크론 변이에는 여러 하위 변이체가 발견되었으며, 새로운 변이체가 계속 등장하고 있다.^[10] 현재 오미크론 변이체와 관련된 판고 계통은 310개이다.^[130] '표준' 하위 계통은 BA.1(또는 B.1.1.529.1)이며, 다른 두 개의 하위 계통은 BA.2(또는 B.1.1.529.2)와 BA.3(또는 B.1.1.529.3)으로 알려져 있다.^[131] 2022년에는 BA.4(또는 B.1.1.529.4)와 BA.5(또는 B.1.1.529.5)가 여러 국가에서 검출되었다.^[132]

BA.1과 BA.2는 32개의 돌연변이를 공유하지만 28개의 차이점이 있다.^[133] BA.1은 BA.1과 BA.1.1(또는 B.1.1.529.1.1)로 나뉘는데, 주요 차이점은 후자에 R346K 돌연변이가 있다는 것이다.^[134]

표준 PCR 검사와 신속 항원 검사는 모든 오미크론 하위 변이체를 COVID-19로 계속 검출하지만, 하위 변이체와 다른 COVID-19 변이체를 구별하려면 추가 검사가 필요하다.^[135]

BA.2('스텔스 오미크론')는 2021년 11월 15일 채취한 샘플에서 처음 발견되었다.^[137] 2022년 2월에 공개된 사전 출판본에서는 BA.2가 BA.1보다 전파력이 더 강하고 더 심각한 질병을 유발할 수 있다고 제시했다.^[138] 그러나 2022년 10월 후반에 발표된 연구에서 BA.2는 BA.1에 비해 실제로 질병의 중증도가 낮았고(BA.1은 델타 변이에 비해 질병의 중증도가 낮았다), 이는 반박되었다.^[139] COVID-19 감염자 치료에 사용되는 치료용 단클론 항체는 BA.2에 거의 효과가 없었는데, 카시리비맙과 임데비맙에는 "거의 완전히 내성이 있었고", 소트로비맙에는 BA.1 하위 변이보다 35배 더 내성이 있었다.

2022년 4월, 세계보건기구(WHO)는 BA.4와 BA.5 하위 변이를 추적하고 있다고 발표했으며, BA.4는 남아프리카공화국, 보츠와나, 덴마크, 스코틀랜드, 잉글랜드에서 검출되었다.^[184] 남아프리카공화국에서 수집된 초기 자료는 BA.4와 BA.5가 BA.2보다 상당한 성장 우위를 가지고 있음을 시사했으며, 5월 12일 유럽 질병예방통제센터(ECDC)는 BA.4와 BA.5를 우려 변이로 지정했고, 5월 20일에는 영국 보건안전청(UKHSA)도 같은 조치를 취했다.^{[185][186][187][188]} 5월 25일에는 포르투갈에서 BA.5가 우세 변이가 되어, 신규 확진자의 3분의 2를 차지했다.^[189] 6월 24일까지 영국과 독일에서는 BA.4와 BA.5가 함께 우세 변이가 되었다.^{[190][191][192][193]} 이 두 하위 변이는 6월 28일까지 미국에서도 우세 변이가 되었다.^[194][195] 6월에는 프랑스에서 BA.5가 우세 하위 변이가 되어, 신규 확진자의 59%가 BA.5와 관련이 있었다.^[196][197]

2022년 5월, 캘리포니아에서 새로운 하위 변이인 BA.5.2.1의 사례가 보고되었다.^[198] 7월 10일, 상하이시는 우간다에서 온 한 남성에게서 BA.5.2.1의 첫 번째 사례를 보고하여 새로운 검사 물결을 일으켰다.^[199] 7월 22일, 캐나다 온타리오주는 7월 2일경 온타리오주에서 BA.5.2.1이 BA.2.12.1을 주요 변이로 추월했다고 발표했다.^[200] BF.7은 BA.5.2.1.7의 하위 변이의 축약된 이름이다. 이 하위 변이는 오미크론의 BA.5 변이에 속하며, 전 세계적으로 가장 많은 사례가 보고되었고, 모든 사례의 76.2%를 차지했다.^[203]

2022년 10월, BA.5 하위 변이 두 가지가 발견되었는데, BQ.1(또는 B.1.1.529.5.3.1.1.1.1.1)과 BQ.1.1(또는 B.1.1.529.5.3.1.1.1.1.1.1)이다.^{[204][205][206]} 2022년 11월 미국에서는 이 변이들이 신규 감염의 44%를 차지한다고 보고되었다. 초기 실험실 검사 결과, 이 하위 변이들은 이전 변이들보다 1차 및 부스터 백신을 회피하는 능력이 더 뛰어난 것으로 나타났다.^[209]

하위 변이체 BQ.1 및 BQ.1.1은 2022년에 발견되었으며, 이전 변이체보다 1차 및 부스터 백신을 회피하는 능력이 뛰어나고 단클론 항체 치료의 효과를 더욱 감소시키는 것으로 나타났다.^[249]

오미크론 변이(B.1.1.529)의 하위 계통으로는 2022년 7월 시점에서 BA.1/B.1.1.529.1, BA.2/B.1.1.529.2, BA.3/B.1.1.529.3, BA.4/B.1.1.529.4, BA.5/B.1.1.529.5 등이 있다.^[544]

BA.2.12.1은 2021년 12월 미국에서 검출되었고,^[520] L452Q 돌연변이 등을 가지고 있다.^[551] BA.2.75(일명 '''켄타우루스''')^[553]는 2022년 5월 인도에서 검출되었고,^[520] L452와 Q493R 돌연변이는 없지만 원래 BA.2와 비교하여 스파이크 단백질에 많은 돌연변이를 가지고 있다.^[546][554]

BA.2.75의 자손 계통으로 나타난 BJ.1 계통과 BM.1.1.1 계통이 스파이크 단백질의 수용체 결합 도메인(RBD)에서 유전자 재조합을 일으킨 XBB 계통이 2022년 6월 중순부터 7월 상순에 걸쳐 나타나 2022년 9월경부터 인도를 중심으로 급속히 유행이 확대되었다. XBB 계통은 실효 재생산수의 명확한 상승이 관찰된 최초의 SARS-CoV-2 변이주이다.^[559] 2023년 2월에는 XBB 계통에서 EG.5 계통(일명 '''에리스''')이 처음 보고되었고, WHO는 같은 해 8월 주목해야 할 변이(VOI)로 지정했다.^[560]

2023년 7월에는 이스라엘과 덴마크에서 BA.2 계통과 비교하여 스파이크 단백질에 아미노산 돌연변이가 30개 이상 있는 BA.2.86 계통이 보고되었고, 같은 해 11월까지 하위 계통으로 BA.2.86.1 계통, BA.2.86.2 계통, BA.2.86.3 계통, JN 계통, JQ 계통이 보고되었다.^[561] 이 중 '''JN.1/BA.2.86.1.1'''은 2023년 12월 19일 WHO에 의해 VOI로 지정되었다.^[562]

이후 JN.1 계통의 직계 자손인 JN.1.11.1에서 파생된 KP1.1, '''KP.2/JN.1.11.1.2'''가 크게 유행하여, 특히 KP.2는 2024년 4월 말 시점에서 미국에서 코로나19 환자의 약 25%를 차지할 정도로 급증했다. 이 두 종은 FLiRT라는 별칭이 붙어 있다. ^[564][563]

FLiRT와 마찬가지로 JN.1 계통에서 파생된 '''KP.3/JN.1.11.1.3''', '''LB.1/JN.1.9.2.1''', 및 '''KP.2.3/JN.1.11.1.2.3'''은 2024년 6월 시점에서 유행이 확대되고 있다. ^[564]

6. 진단

오미크론 변이는 전체 유전자배열 검사 없이도 기존 PCR 검사만으로 델타 변이를 비롯한 다른 변이와 구별되는 패턴을 보여줘 검사에서 쉽게 검출된다.^[278]

여러 유전자 표적을 검출하는 PCR 검사는 COVID-19 양성 여부를 확인할 수 있다. S 유전자 소실 또는 표적 실패(SGTF)는 오미크론 변이와 델타 변이를 구별하는 간편한 방법으로 제안되었다.^[278] 2021년 12월 기준으로, 덴마크와 노르웨이는 비교적 빠르고 여러 유전자를 확인하는 변이 qPCR 검사^[279]에서 발견된 사례를 완전한 시퀀싱 전에 오미크론으로 간주했다.^[343][280]

2021년 12월 7일 기준으로, BA.2는 BA.1과 달리 특징적인 S 유전자 표적 실패(SGTF)를 유발하는 결손(Δ69-70)이 없다는 것이 알려졌다. 많은 정량 PCR 검사는 이 결손을 통해 이전에 우세했던 델타 변이와 구분하여 오미크론(또는 알파) 변이 감염 사례를 빠르게 감지할 수 있었다.^[281][282] 2022년 오미크론이 우세해지고 델타 변이가 드물어짐에 따라, 정량 PCR 검사에서 델타와 BA.2를 유사하게 만들었던 SGTF 돌연변이는 BA.1과 BA.2를 서로 구분하는 데 유용한 것으로 밝혀졌다.^[286]

7. 백신

오미크론 변이는 기존 백신이 대응하도록 설계된 원래 코로나바이러스와는 상당히 다른 것으로 평가되었다.^[979] 스파이크 단백질에 변이가 많이 발생할수록 기존 백신이나 항체치료제의 효능이 떨어질 수 있으며, 최악의 경우 백신을 다시 개발해야 할 수도 있다는 경고도 나왔다.^[979]

BA.2 변이는 BA.1 변이보다 전파력이 더 강하고 더 심각한 질병을 유발할 수 있다는 연구 결과가 있었으나,^[138] 이후 BA.2가 BA.1에 비해 질병의 중증도가 낮았다는 연구 결과로 반박되었다.^[139] COVID-19 감염자 치료에 사용되는 치료용 단클론 항체는 BA.2에 거의 효과가 없었다.

2021년 12월/2022년 1월경 BA.2는 인도 일부 지역과 필리핀에서 우세해졌으며, 스칸디나비아, 남아프리카 공화국, 싱가포르에서 빈번해졌고, 독일과 영국에서 증가하는 조짐을 보였다.^{[150][151][152][153]} 덴마크에서는 2022년 2주차에 BA.2가 전체 사례의 약 50%를 차지하며 BA.1과 비슷한 수준이 되었고,^[157] 다음 주에는 65%를 차지하며 우세해졌다.^[158] 2022년 2월에는 남아프리카 공화국과 독일에서, 3월에는 영국에서 우세한 하위 변이가 되었다.^{[161][162][163]} 미국에서는 2022년 3월 29일에 BA.2가 우세 변이가 되었다.^[164]

2024년 ''JAMA 네트워크 오픈''에 발표된 연구에 따르면, 오미크론 변이 또는 델타 변이에 감염된 백신 접종자는 감염되지 않은 사람에 비해 새로운 자가면역 질환이 발생할 전체 위험이 더 높지 않았다.^[241]

7. 1. 백신 효과

7. 2. 백신 개발

8. 치료

덱사메타손과 같은 코르티코스테로이드와 토실리주맙(악템라)과 같은 IL-6 수용체 차단제는 중증 코로나19 초기 변이 바이러스를 가진 환자 관리에 효과적인 것으로 알려져 있다.^[287][288]

단클론 항체 치료와 관련하여, 시험관 내 의사 유사 바이러스 데이터에 대한 전임상 데이터는 고도로 보존된 에피토프를 사용하도록 설계된 일부 단클론 항체가 오미크론 치환의 주요 돌연변이에 대해 중화 활성을 유지함을 보여준다.^[289] 소트로비맙의 모 항체인 S309 항체는 오미크론을 2-3배 감소된 효능으로 중화했다.^[290]

2021년 12월 기준으로 대부분의 단클론 항체는 오미크론에 대한 시험관 내 중화 활성을 잃었으며, 다른 연구에서 조사된 29가지 단클론 항체 중 3가지 항체만이 변하지 않은 효능을 유지했다. 광범위하게 중화하는 사르베코바이러스 단일클론항체의 일부는 RBM 외부의 항원 부위를 인식하여 오미크론을 중화했는데, 여기에는 소트로비맙(VIR-7831), S2X259 및 S2H97이 포함된다.^[291] 그러나 소트로비맙은 BA.2 오미크론 하위 계통에 대해서는 완전히 활성화되지 않았다.^[292] 2022년 2월 데이터에 따르면 오미크론은 상당한 체액성 면역 회피를 일으켰으며, 사르베코바이러스 보존 영역을 표적으로 하는 중화 항체가 가장 효과적이었다.^[293]

9. 국제적 대응

WHO는 오미크론 변이 확산 방지를 위해 각국에 감시 및 시퀀싱 강화, 정보 공유, 현장 조사 및 연구 수행 등을 권고했다.^[733] 그러나 여러 국가에서 남아프리카공화국 등 아프리카 국가에 대한 여행 제한 조치를 시행했다.^{[734][735][736][737][738][739][740][741]}

2021년 11월 26일, 유럽 질병 예방 통제 센터(ECDC)는 모델링 결과, 엄격한 입국 금지령으로 유럽 국가들에 대한 변이 바이러스의 영향을 2주 늦출 수 있으며, 각국이 대책을 세울 수 있는 가능성이 있다고 보고했다.^[577]

국가별 대응은 다음과 같다.

남아프리카공화국 보건부 장관은 이러한 입국 금지령이 WHO의 "규범과 기준"에 위배된다고 비판했다.^[745] 입국 금지는 해당 국가 경제에 중대한 영향을 미칠 수 있으며, 다른 국가들이 새로운 변이 바이러스 발견을 은폐할 가능성을 야기할 수 있다는 것이다.^[746] 또한, 개발도상국의 낮은 백신 접종률은 새로운 변이 바이러스가 출현할 기회를 만들어내며, 이들 국가가 백신 개발 및 생산을 위한 지적 재산권을 확보하는 데 어려움을 겪고 있다는 점도 지적되었다.^[746]

10. 통계

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_[972] 웹인용 What's Omicron? Here's what we know and don't know about the new COVID variant that's roiling markets and air travel https://fortune.com/[...] 2021-11-16
_[973] 웹인용 There are several COVID-19 variants you haven't heard of https://www.newsnati[...] 2021-11-27
_[974] 웹인용 WHO "새 변이 '오미크론'…우려 변이로 지정" https://www.youtube.[...] KBS 2021-11-27
_[975] 뉴스 "델타보다 전염력 5배" 남아공 삼킨 오미크론 우려 '확산'(종합) 뉴스1 2021-11-27
_[976] 웹인용 WHO "새 변이 ‘오미크론’…우려 변이로 지정" https://www.youtube.[...] KBS 2021-11-27
_[977] 뉴스 백신 무력화 돌연변이가 델타 2배… “오미크론, 공기 통해 번지는 듯” 조선일보 2021-11-27
_[978] 웹사이트 오미크론 변이바이러스: 역대 '최악' 변이바이러스 될까? https://www.bbc.com/[...] BBC뉴스코리아 2021-11-27
_[979] 뉴스 "코로나 유입 차단" 정부, 남아공 등 8개국 입국제한 파이낸셜뉴스 2021-11-27
_[980] 웹인용 국내서도 '오미크론 변이' 확인...40대 부부 등 5명 https://www.youtube.[...] YTN 2021-12-01
_[981] 뉴스 오미크론 확진 부부 거짓 진술…지인 가족, 400여 명 교회 모임 참석 https://www.youtube.[...] KBS 2021-12-03
_[982] 웹인용 인천 교회 '오미크론 집단감염' 우려...마을 거주지 선제검사 https://www.youtube.[...] YTN 2021-12-04
_[983] 뉴스 오미크론에 백신 무용론 등장..."3차 접종이 오미크론에도 효과" https://www.youtube.[...] YTN
_[984] 뉴스 인천 교회발 '오미크론' 확진 3명 또 추가...집단감염 현실화 우려 https://www.youtube.[...] YTN 2021-12-05
_[985] 웹인용 오미크론 감염 확인 12명 증가..."오미크론 대응 집중" https://www.youtube.[...] YTN 2021-12-06