간균과

3. 명명

이 과에 속하는 속들은 흔히 "바킬리"(bacilli) 또는 "간균"이라고 불리기도 한다. 그러나 이러한 용어는 바실루스강(Bacilli), 바실루스목(Bacillales), 간균과(Bacillaceae), 바실루스속(''Bacillus'')을 명확히 구분하지 않으므로 모호한 표현이다.

4. 하위 분류

간균과(Bacillaceae)는 후벽균문에 속하는 세균의 한 과이다. 역사적으로 간균속(''Bacillus'')을 중심으로 다양한 그람 양성균 속들을 포함하는 분류군으로 여겨져 왔으나, 최근 16S rRNA 염기서열 분석이나 유전체 비교 등 분자 계통학적 연구를 통해 다계통군임이 밝혀졌다.^{[3][4][5][6][7][8][9][10]} 이에 따라 기존의 분류 체계가 재검토되고 있으며, 여러 속들이 새로운 과로 재분류되거나 새로운 속이 제안되는 등 분류에 변동이 있다.

간균과에는 모델 생물로 널리 연구되는 간균속(''Bacillus'') 외에도, 고온 환경에서 발견되는 ''지오바실러스''(Geobacillus)나 특정 아미노산을 분해하는 ''리시니바실러스''(Lysinibacillus), 염분이 높은 환경에 서식하는 ''할로바실러스''(Halobacillus) 등 다양한 환경에 적응한 속들이 포함된다. 한국의 전통 발효 식품인 젓갈에서 분리된 ''젓갈리바실러스''(Jeotgalibacillus)처럼^[3] 독특한 환경에서 유래한 속들도 존재한다.

자세한 분류 체계는 연구 방법론(예: LPSN, NCBI, LTP, GTDB)에 따라 다르게 제시되기도 하며, 아래 하위 섹션에서 주요 분류 기준에 따른 속 목록을 확인할 수 있다.

4. 1. LPSN 및 NCBI 분류

4. 2. 16S rRNA 기반 LTP 및 120개 마커 단백질 기반 GTDB 분류

참조

_[1] 서적 The low G + C Gram-positive Bacteria Bergey's Manual of Systematic Bacteriology (2 ed.), Volume 3. 2008. Editors: De Vos, P., Garrity, G., Jones, D., Krieg, N.R., Ludwig, W., Rainey, F.A., Schleifer, K.-H. and W.B. Whitman
_[2] 논문 Pontibacillus chungwhensis gen. nov., sp. nov., a moderately halophilic Gram-positive bacterium from a solar saltern in Korea http://ijs.sgmjourna[...] Lim, J.M., Jeon, C.O., Song, S.M., and C.J. Kim. 2005. Int. J. Syst. Evol. Microbiol.
_[3] 웹사이트 Bacillaceae https://lpsn.dsmz.de[...] List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature 2022-03-02
_[4] 웹사이트 Bacillaceae https://www.ncbi.nlm[...] National Center for Biotechnology Information 2022-03-02
_[5] 웹사이트 The LTP https://imedea.uib-c[...] 2022-06-20
_[6] 웹사이트 LTP_all tree in newick format https://imedea.uib-c[...] 2022-06-20
_[7] 웹사이트 LTP_01_2022 Release Notes https://imedea.uib-c[...] 2022-06-20
_[8] 웹사이트 GTDB release 07-RS207 https://gtdb.ecogeno[...] 2022-06-20
_[9] 웹사이트 bac120_r207.sp_labels https://data.gtdb.ec[...] 2022-06-20
_[10] 웹사이트 Taxon History https://gtdb.ecogeno[...] 2022-06-20
_[11] 서적 The low G + C Gram-positive Bacteria Bergey's Manual of Systematic Bacteriology (2 ed.), Volume 3. 2008. Editors: De Vos, P., Garrity, G., Jones, D., Krieg, N.R., Ludwig, W., Rainey, F.A., Schleifer, K.-H. and W.B. Whitman
_[12] 논문 Pontibacillus chungwhensis gen. nov., sp. nov., a moderately halophilic Gram-positive bacterium from a solar saltern in Korea http://ijs.sgmjourna[...] Lim, J.M., Jeon, C.O., Song, S.M., and C.J. Kim. 2005. Int. J. Syst. Evol. Microbiol.
_[13] 서적 The low G + C Gram-positive Bacteria Bergey's Manual of Systematic Bacteriology (2 ed.), Volume 3. 2008. Editors: De Vos, P., Garrity, G., Jones, D., Krieg, N.R., Ludwig, W., Rainey, F.A., Schleifer, K.-H. and W.B. Whitman
_[14] 논문 Pontibacillus chungwhensis gen. nov., sp. nov., a moderately halophilic Gram-positive bacterium from a solar saltern in Korea http://ijs.sgmjourna[...] Lim, J.M., Jeon, C.O., Song, S.M., and C.J. Kim. 2005. Int. J. Syst. Evol. Microbiol.