부유균문

1. 개요

부유균문(Planctomycetota)은 플랑크토미케스강에 속하는 세균 문으로, 세포 구조, 생리적 특성 및 분류학적 특징을 공유한다. Planctomycetota는 일반적으로 분홍색 또는 흰색 집락을 형성하며, 구형, 타원형 또는 배 모양의 세포 구조를 가지고 있다. 이들은 호기성 호흡을 하며, 다른 박테리아와는 달리 줄기 모양의 구조를 사용하여 생물막 생산을 돕고, 지질 및 지방산 조성이 다른 과들과 차이를 보인다. 현재 LPSN 및 NCBI를 기반으로 분류되며, 2022년 기준으로 Planctomycetaceae 내에 14개의 속과 29개의 종이 존재한다.

2. 형태

Planctomycetaceae^영어과는 부유균문(Planctomycetales)강의 다른 종들에 비해 분류학적으로 뚜렷하게 구별되는 특징이 거의 없다.

2.1. 세포 구조

Planctomycetaceae^영어과 종들은 전형적으로 분홍색 또는 흰색 집락을 형성한다. 세포는 보통 구형이지만, 많은 종들이 타원형 또는 배 모양을 하고 있으며 크기는 0.4µm에서 2.5µm 사이이다.

Planctomycetaceae^영어는 번식할 때 주로 로제트나 응집된 집단 형태로 관찰된다. Thalassoglobus neptunius^라틴어는 이 과에서 유일하게 사슬 형태로 성장하는 종으로 알려져 있다. Planctomycetaceae^영어의 일부 구성원(다른 Planctomycetota^영어 분류군 포함)은 줄기 모양 돌기를 발달시키기도 한다. 특히 {{lang는 줄기를 가진 것으로 잘 알려져 있으며, 이 줄기를 통해 새로 생성된 세포들을 연결한다.

2.2. 줄기

Planctomycetaceae^영어과의 일부 구성원(Planctomycetota의 다른 분류군 포함)은 줄기 모양의 돌기를 발달시킨다. Planctomyces bekefii는 이 과에서 줄기를 가진 것으로 잘 알려져 있으며, 이 줄기를 사용하여 새로 생성된 세포를 연결한다.

3. 생리

Planctomycetales강 내에서 연구가 더 많이 진행된 과들은 혐기성 호흡을 하는 것으로 알려져 있으며, 특히 Brocadiaceae과는 혐기성 암모늄 산화(anammox) 능력으로 잘 알려져 있다. Planctomycetaceae과는 호기성이며, anammox 반응을 수행할 수 없는 `Planctomycetales`강의 많은 과 중 하나이다.

3.1. 운동성

다른 과들과 마찬가지로, 부유균문의 Planctomycetaceae과 구성원들은 편모를 사용하여 운동성을 가질 수 있으며, 일부는 운동성 및 비운동성 생활 주기를 갖는다.

3.2. 부착

다른 박테리아와 달리, 이 그룹은 줄기 모양의 구조를 사용하여 생물막 생산을 돕고, 통상적인 세포외 고분자 물질 외에 부착을 위한 두 번째 원천을 제공할 수 있다.

3.3. 지방산과 지질

`Planctomycetaceae`과에 의해 합성된 지방산과 지질은 `Planctomycetales`목의 다른 과들과 조성이 유사하지만, 분류학적으로 중요하다고 여겨질 만큼 독특하다. 포스포콜린, 포스파티딜콜린, 포스파티딜글리세롤은 이 과의 주요 지질로 간주되며, 다른 일부 과들만이 이를 합성할 수 있다. 특히, 지방산 C_18:1-ω9C는 이 Planctomycete 박테리아 과 내에서만 합성된다.

4. 분류

명명법에 따른 원핵생물 이름 목록(LPSN)과 국립생물정보센터(NCBI)에 따르면, 부유균문의 분류는 다음과 같다.

* 피키스파이라강 (Phycisphaerae)
피키스파이라목 (Phycisphaerales)
* 피키스파이라과 (Phycisphaeraceae)
* 플랑크토미케스강 (Planctomycetia)
플랑크토미케스목 (Planctomycetales)
* Brocadiaceae
*** 플랑크토미케스과 (Planctomycetaceae)

2022년 기준으로, Planctomycetaceae 내에는 14개의 속과 29개의 종이 존재하는 것으로 알려져 있다.

16S rRNA 기반 LTP_08_2023와 120개 마커 단백질 기반 GTDB 08-RS214에 따른 분류는 하위 섹션에 표로 자세히 나와 있다.

분류가 불확실한 속으로는 플랑크토미케스속(Planctomyces) 등이 있다.

4.1. 하위 분류

현재 받아들여지는 분류는 명명법에 따른 원핵생물 이름 목록(LPSN) 및 국립생물정보센터(NCBI)를 기반으로 한다.

하위 분류는 다음과 같다.

* 피키스파이라강 (Phycisphaerae) Fukunaga et al. 2010
피키스파이라목 (Phycisphaerales) Fukunaga et al. 2010
* 피키스파이라과 (Phycisphaeraceae) Fukunaga et al. 2010

* 플랑크토미케스강 (Planctomycetia) Cavalier-Smith 2002
플랑크토미케스목 (Planctomycetales) Schlesner and Stackebrandt 1987
* Brocadiaceae
*** 플랑크토미케스과 (Planctomycetaceae) Schlesner and Stackebrandt 1987

4.1.1. 속 (Genus)

* 피키스파이라속 (Phycisphaera) Fukunaga et al. 2010
* Candidatus Nostocoida limicola III
* Candidatus Brocadia Jetten et al. 2001
* Candidatus Kuenenia Schmid et al. 2000
* Candidatus Scalindua Schmid et al. 2003
* Candidatus Anammoxoglobus Kartal et al. 2006
* Candidatus Jettenia Quan et al. 2008
* Blastopirellula Schlesner et al. 2004
* Gemmata Franzmann and Skerman 1985
* Isosphaera Giovannoni et al. 1995
* Pirellula Schlesner and Hirsch 1987 emend. Schlesner et al. 2004
* 플랑크토미케스속 (Planctomyces) Gimesi 1924
* Rhodopirellula Schlesner et al. 2004
* Schlesneria Kulichevskaya et al. 2007
* Singulisphaera Kulichevskaya et al. 2008
* Zavarzinella Kulichevskaya et al. 2009


2022년 기준으로 연구자들은 Planctomycetaceae 내에 14개의 속과 29개의 종이 존재한다는 것을 발견했다.