이온 펌프
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1. 개요
이온 펌프는 이온 수송체라고도 하며, 세포막을 가로질러 이온을 수송하는 막 수송 단백질의 일종이다. 이온 펌프는 기질의 하전된 특성에 따라 분류되며, 수송 메커니즘, 에너지원, DNA 서열 등에 따라 그룹화된다. 이온 채널과 달리 형태를 변경하여 이온을 수송하며, 능동 수송과 수동 수송을 모두 수행할 수 있다. 에너지 사용 방식에 따라 1차 수송체와 2차 수송체로 나뉘며, 1차 수송체는 ATP를 사용하여 이온을 농도 기울기에 반하여 이동시키고, 2차 수송체는 1차 수송체에 의해 생성된 농도 기울기를 이용하여 다른 이온이나 분자를 수송한다. 이온 펌프는 인산화, 알로스테릭 조절, 이온 농도 변화 등 다양한 방식으로 조절되며, 패치 클램프, X선 결정학, 광표백 후 형광 회복(FRAP) 등의 연구 방법을 통해 연구된다.
이온 수송체는 12개의 수송체 패밀리를 포함하는 슈퍼패밀리의 수송체로 분류된다.[4] 이들 패밀리는 국제 생화학 및 분자 생물학 연합 (IUBMB)에서 사용하는 수송체 분류(TC) 시스템의 일부이며, 수송되는 기질, 수송 메커니즘, 사용되는 에너지원, 그리고 각 단백질을 구성하는 DNA 서열을 비교하는 것과 같은 특성에 따라 그룹화된다. 가장 중요한 통합 요인은 기질의 하전된 특성으로, 이는 중성 종이 아닌 이온의 수송을 나타낸다는 것이다.[4]
이온 펌프는 다양한 에너지원을 사용하여 작동한다. 1차 수송체는 ATP를 에너지원으로 사용하거나, 전자 전달 사슬과 같은 방법을 통해 ATP를 생성한다.[5][6] 2차 수송체는 ATP를 직접 사용하지 않고, 1차 수송체가 만든 이온 농도 기울기를 이용하여 다른 이온이나 분자를 수송한다.[5]
이온 수송체는 인산화, 알로스테릭 억제 또는 활성화, 이온 농도에 대한 민감성과 같은 다양한 방식으로 조절될 수 있다. 단백질 키나아제를 사용하여 인산기를 추가하거나 인산가수분해효소를 사용하여 단백질을 탈인산화하면 수송체의 활성이 변경될 수 있다.[14] 인산기의 첨가로 단백질이 활성화되는지 또는 억제되는지는 특정 단백질에 따라 달라진다. 알로스테릭 억제를 통해 조절 리간드가 조절 부위에 결합하여 수송체를 억제하거나 활성화할 수 있다. 이온 수송체는 용액 내 이온의 농도(반드시 수송하는 이온일 필요는 없음)에 의해서도 조절될 수 있다. 예를 들어, 전자 전달 연쇄는 용액 내 H+ 이온(pH)의 존재에 의해 조절된다.[5]
이온 펌프 연구에는 다양한 방법이 사용된다.
2. 분류 및 구분
이온 수송체는 이온 채널과는 상당히 다르다. 채널은 막을 통과하는 기공인 반면, 수송체는 막의 어느 쪽으로 열려 있는지 전환하기 위해 모양을 변경해야 하는 단백질이다. 이 때문에 수송체는 분자를 이동시키는 속도가 채널보다 훨씬 느리다.
전기화학적 기울기 또는 농도 기울기는 두 개의 별도 영역에서 화학 분자 또는 이온의 농도 차이이다.[5] 평형 상태에서 두 영역의 이온 농도는 동일하므로 농도에 차이가 있으면 이온은 농도 기울기 "아래" 또는 고농도에서 저농도로 흐르려고 한다. 이온 채널은 채널에 들어갈 특정 이온이 농도 기울기 아래로 흘러 세포막 양쪽의 농도를 동일하게 할 수 있도록 한다. 이온 채널과 이온 수송체는 촉진 확산을 통해 이를 수행하며, 이는 일종의 수동 수송이다. 그러나 이온 수송체만이 농도 기울기에 반하여 이온을 이동시키는 능동 수송을 수행할 수 있다.[6] ATP와 같은 에너지원을 사용하여 이온 수송체는 농도 기울기에 반하여 이온을 이동시킬 수 있으며, 이는 2차 수송체 또는 다른 단백질에서 에너지원으로 사용될 수 있다.[5]
3. 에너지원
3. 1. 1차 수송체
1차 수송체는 Na+, K+, Ca2+와 같은 이온을 세포막을 가로질러 수송하기 위해 에너지를 사용하며 농도 기울기를 만들 수 있다.[5] 이러한 수송은 ATP를 에너지원으로 사용하거나, 식물의 전자 전달 사슬과 같은 방법을 통해 ATP를 생성하는 데 사용될 수 있다.[6][5]
3. 1. 1. 능동 수송체
능동 수송체는 ATP를 사용하여 ATP의 에너지를 농도 기울기 형태의 위치 에너지로 변환한다. 이들은 ATP를 사용하여 낮은 농도에서 더 높은 농도로 이온을 수송한다. ATP를 사용하는 단백질의 예로는 인산화를 통해 Na+, K+, Ca2+ 이온을 전달하는 P형 ATP가수분해효소와 음이온을 전달하는 A형 ATP가수분해효소, 광범위한 분자를 수송하는 ABC 수송체가 있다.[5] P형 ATP가수분해효소의 예로는 야누스 키나제-2에 의해 조절되는 Na+/K+-ATP가수분해효소[6][7][8]와 ADP 및 ATP 농도에 민감한 Ca2+ ATP가수분해효소가 있다.[10] P-당단백질은 인체 내 ABC 수송 결합 단백질의 예이다.
3. 1. 2. ATP 생성 수송체
ATP 생성 수송체는 농도 기울기에 따라 이온을 고농도에서 저농도로 수송하지만, 이 과정에서 ATP가 형성된다. 농도 기울기 형태의 위치 에너지가 ATP를 생성하는 데 사용된다.[5] 동물에서 이러한 ATP 합성은 F형 ATPase라고도 알려진 ATP 합성효소를 사용하여 미토콘드리아에서 일어난다. 이 과정은 산화적 인산화라고 불리는 과정에서 전자 전달 연쇄를 활용한다.[11] V형 ATPase는 F형 ATPase의 반대 기능을 수행하며, 식물에서 ATP를 가수분해하여 양성자 기울기를 생성하는 데 사용된다. 이에 대한 예로는 소포를 산성화하기 위해 V형 ATPase를 사용하는 리소좀이나 엽록체의 광합성 과정에서 식물 액포가 있다.[6] 이 과정은 pH와 같은 다양한 방법을 통해 조절될 수 있다.[12]
3. 2. 2차 수송체
이차 수송체는 1차 수송체와 달리 ATP를 직접 사용하지 않고, 1차 수송체가 만든 이온 농도 기울기를 이용하여 다른 이온이나 분자를 수송한다.[5] 예를 들어 나트륨-포도당 수송체는 나트륨-칼륨 펌프로 형성된 나트륨 농도 기울기를 이용하여 포도당을 세포 안으로 운반한다.[13] 이는 나트륨이 농도 기울기를 따라 이동하면서 포도당을 함께 세포 안으로 끌어들이기 때문이다. 공동 수송체와 역수송체가 이차 수송체의 대표적인 예이다.
3. 2. 1. 공동 수송체
이차 수송체는 이온(또는 작은 분자)을 농도 기울기에 반하여, 즉 낮은 농도에서 높은 농도로 수송한다. 그러나 농도 기울기를 만들기 위해 ATP를 사용하는 일차 수송체와 달리, 이차 수송체는 일차 수송체에 의해 생성된 농도 기울기에서 잠재 에너지를 사용하여 이온을 수송한다.[5] 예를 들어, 소장과 신장에서 발견되는 나트륨-포도당 수송체는 나트륨-칼륨 펌프에 의해 세포 내에서 생성된 나트륨 기울기를 사용하여 포도당을 세포 안으로 운반하는 데 도움을 준다.[13] 이는 나트륨이 농도 기울기를 따라 흐르면서 포도당을 다시 세포 안으로 농도 기울기에 반하여 밀어낼 수 있는 충분한 에너지를 제공하기 때문에 발생한다. 이것은 포도당 손실을 방지하기 위해 소장과 신장에서 중요하다.
공동 수송체는 농도 기울기에 따라 이온을 수송하며, 두 번째 분자를 같은 방향으로 수송하는 것을 결합한다. 나트륨-포도당 수송체가 대표적인 예이다. 역수송체 또한 한 분자의 농도 기울기를 사용하여 다른 분자를 농도 기울기에 반하여 이동시키지만, 결합된 분자는 반대 방향으로 수송된다.[5]
3. 2. 2. 역수송체
역수송체는 한 분자의 농도 기울기를 사용하여 다른 분자를 농도 기울기에 반하여 이동시키지만, 결합된 분자는 반대 방향으로 수송된다.[5] 즉, 농도 기울기에 따라 이온을 수송하면서 다른 분자를 반대 방향으로 수송한다.
4. 조절
5. 연구 방법
5. 1. 패치 클램프
패치 클램프는 세포 내 채널과 수송체를 연구하기 위해 사용되는 전기생리학 기술로, 이들을 통해 흐르는 전류를 추적한다. 이 기술은 채널과 수송체의 존재가 알려지기 전에 호지킨과 헉슬리에 의해 완성되었다.[11][15] 패치 클램핑은 초창기 획기적인 연구 외에도, 이온 수송체와 환경 및 리간드가 수송체의 기능에 미치는 영향을 연구하기 위해 연구자들이 여전히 널리 사용하고 있다.[1][16]
5. 2. X선 결정학
X선 결정학은 단백질의 3차원 구조를 시각화할 수 있는 기술이지만, 단 하나의 단백질 구조에 대한 스냅샷일 뿐이다. 수송 단백질의 구조를 통해 연구자들은 수송체가 분자를 막을 가로질러 이동시키기 위해 어떻게, 그리고 무엇을 하는지 더 깊이 이해할 수 있다.[17][18]
5. 3. 광표백 후 형광 회복 (FRAP)
광표백 후 형광 회복(FRAP)은 세포막에서 지질이나 단백질의 확산을 추적하는 데 사용되는 기술이다. 이 기술은 세포 내 수송체의 이동성과 세포막 내 지질 도메인 및 지질 뗏목과의 상호 작용을 더 잘 이해하는 데 사용된다.[1]
5. 4. 훠스터 공명 에너지 전달 (FRET)
훠스터 공명 에너지 전달(FRET)은 형광을 이용하여 두 단백질 사이의 거리를 측정하는 기술이다. 이 기술은 이온 수송체가 다른 세포 단백질과 어떻게 상호작용하는지 연구하는 데 사용된다.[1]
6. 이온 수송체 목록
이온 수송체 |
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신경전달물질 수송체 |
글루탐산 수송체 |
모노아민 수송체 |
GABA 수송체 |
글리신 수송체 |
아데노신 수송체 |
세포막 Ca2+ ATPase |
나트륨-칼슘 교환체 |
나트륨-염화물 공수송체 |
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