E형 간염바이러스

3. 유전체 및 단백체

E형 간염바이러스는 양성 단일가닥 RNA 바이러스로, 약 7200개의 염기로 구성된 유전체를 가진다. 유전체에는 세 개의 오픈 리딩 프레임(ORF1, ORF2, ORF3)이 존재하며, 각각 O1, O2, O3 단백질을 암호화한다.^[14][18]

• O1은 7개의 단백질로 쪼개진다.
• O2는 캡시드를 암호화한다.
• O3는 단일 단백질을 암호화한다.

• 유전자형 1: 아시아
• 유전자형 2: 아프리카 및 멕시코
• 유전자형 3: 유럽 및 북미
• 유전자형 4: 아시아
• 유전자형 5, 6: 아시아 멧돼지
• 유전자형 7, 8: 낙타^[2][6]

3. 1. O1 단백질

3. 2. O2 단백질

3. 3. O3 단백질

3. 4. 상호작용체

4. 구조

바이러스 입자는 지름이 27~34나노미터이며 외피가 없다.^{[14][16][2][4]}

5. 진화

현재 존재하는 E형 간염바이러스(HEV)는 536년에서 1344년 전쯤에 분기된 것으로 보인다.^[20] 일부 연구에서는 약 6000년 전 돼지 가축화와 함께 바이러스가 분기되었다는 분석도 제시되었다.^[21] 이후 인간을 주 숙주로 삼는 무리와 동물에서 지역 유행병처럼 나타나는 무리의 두 계통군으로 분기되었고, 각각 유전자형 1, 2와 유전자형 3, 4로 진화하였다.^[22]

지난 100년간 유전자형 1, 3, 4가 크게 확산되었으나, 유전자형 2는 상대적으로 드물게 발견된다.^[23]

6. 유전자형

''오르토헤페바이러스 A''는 8가지 유전자형으로 나뉜다. 유전자형 1은 주로 아시아, 유전자형 2는 아프리카와 멕시코, 유전자형 3은 유럽과 북아메리카, 유전자형 4는 아시아에서 발견된다. 유전자형 5와 6은 아시아의 멧돼지, 유전자형 7과 8은 낙타에서 발견되었다.^{[14][18][2][6]}

양성 단일가닥 RNA를 유전체로 가지며, 7200개의 염기로 이루어져있다. 세 개의 오픈 리딩 프레임(ORF1, ORF2, ORF3)이 존재하여 각각 O1, O2, O3 단백질을 암호화한다. 이 중 O1과 O2는 폴리단백질이며, 번역된 이후 쪼개져 서로 다른 기능을 수행하는 여러 종류의 단백질로 나뉜다. O1, O2, O3는 각각 다음의 단백질들로 나뉜다.

• '''O1''' - 7개의 단백질로 쪼개지는데 각각 메틸전이효소('''Met'''), Y-domain('''Y'''), 파파인 유사 단백질분해효소('''Plp'''), 프롤린 풍부 가변영역('''V'''), X-domain('''X'''), 헬리케이스('''Hel'''), 그리고 RNA 의존성 RNA 중합효소('''Rdrp''')이다. Plp, V, X 도메인을 합쳐서 '''Pvx''' 도메인이라 부르기도 한다.
• '''O2''' - 캡시드를 암호화하며, 이 캡시드는 다시 껍질 도메인('''S'''), 두 개의 돌출 도메인('''P1''', '''P2''')으로 나뉜다.
• '''O3''' - O3 단백질을 암호화한다. 폴리단백질이 아니므로 단 하나의 단백질만 암호화한다.^[7]

참조

_[1] 웹사이트 New Classification Scheme for ''Hepeviridae'' https://ictv.global/[...] 2014-06-01
_[2] 웹사이트 Hepeviridae - Hepeviridae - Positive-sense RNA Viruses - ICTV http://www.ictv.glob[...]
_[3] 논문 The global epidemiology of hepatitis E virus infection: A systematic review and meta-analysis 2020-07-01
_[4] 논문 Evidence for a virus in non-A, non-B hepatitis transmitted via the fecal-oral route
_[5] 논문 Isolation of a cDNA from the virus responsible for enterically transmitted non-A, non-B hepatitis
_[6] 문서 Genetic heterogeneity of hepatitis E virus 2001
_[7] 논문 Molecular virology of hepatitis E virus
_[8] 논문 The Hepatitis E virus intraviral interactome
_[9] 논문 Evolutionary History and Population Dynamics of Hepatitis E Virus 2010-12-17
_[10] 논문 Comprehensive analysis of genetic and evolutionary features of the hepatitis E virus 2019-10-29
_[11] 논문 New insights into the hepatitis E virus genotype 3 phylodynamics and evolutionary history
_[12] 문서 Hepatitis E Virus Infection 2014
_[13] 웹인용 New Classification Scheme for ''Hepeviridae'' https://talk.ictvonl[...] 2014-06-01
_[14] 웹인용 ICTV Online (10th) Report http://www.ictv.glob[...]
_[15] 문서 The global burden of hepatitis E virus genotypes 1 and 2 in 2005 2012
_[16] 논문 Evidence for a virus in non-A, non-B hepatitis transmitted via the fecal-oral route
_[17] 논문 Isolation of a cDNA from the virus responsible for enterically transmitted non-A, non-B hepatitis
_[18] 문서 Genetic heterogeneity of hepatitis E virus 2001
_[19] 논문 The Hepatitis E virus intraviral interactome null
_[20] 논문 Evolutionary History and Population Dynamics of Hepatitis E Virus 2010-12-17
_[21] 논문 Comprehensive analysis of genetic and evolutionary features of the hepatitis E virus 2019-10-29
_[22] 논문 New insights into the hepatitis E virus genotype 3 phylodynamics and evolutionary history null
_[23] 문서 Hepatitis E Virus Infection 2014