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스트렙토미세스 알비도플라부스

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목차

1. 개요

스트렙토미세스 알비도플라부스(Streptomyces albidoflavus)는 다양한 항생 물질을 생성하며, 이종 단백질 발현에 사용될 수 있는 방선균의 일종이다. 이 세균은 소형 비암호화 RNA, 지방산 합성, DNA 수리 기작 등 다양한 생물학적 특성을 가지며, 유전체는 단일 선형 분자로 구성되어 있다. S. albidoflavus에 대한 연구는 항생제 개발, 유전학적 다양성 분석 등 다양한 분야에서 진행되어 왔다.

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스트렙토미세스 알비도플라부스 - [생물]에 관한 문서
기본 정보
스트렙토미세스 알비도플라부스
스트렙토미세스 알비도플라부스
학명Streptomyces albidoflavus
명명자(Rossi Doria 1891) Waksman and Henrici 1948 (Approved Lists 1980)
타입 균주AS 4.1291, ATCC 25422, BCRC 13699, CBS 416.34, CBS 920.69, CCRC 13699, CGMCC 4.1291, CIP 105122, DSM 40455, ETH 10209, ICMP 12537, ICSSB 1006, IFO 13010, IMRU 850, IMSNU 20133, IMSNU 21006, ISP 5455, JCM 4446, KCC S-0446, KCC S-0466, KCC S-1072, KCCS-0466, KCTC 9202, Lanoot R-8660, LMG 19300, MTCC 932, NBIMCC 2386, NBRC 13010, NCIB 10043, NCIMB 10043, NRRL B-1271, NRRL B-2663, NRRL B-B-2663, NRRL-ISP 5455, RIA 1202, strain ATCC 25422, VKM Ac-746, VTT E-991429
이전 학명"Actinomyces albidoflavus" (Rossi Doria 1891) Gasperini 1894
"Actinomyces globisporus subsp. caucasicus" Kudrina 1957
"Actinomyces sampsonii" Millard and Burr 1926
"Cladothrix albido-flava" [sic] (Rossi Doria 1891) Mace 1901
Streptomyces canescens Waksman 1957 (Approved Lists 1980)
Streptomyces champavatii Uma and Narasimha Rao 1959 (Approved Lists 1980)
Streptomyces coelicolor (Müller 1908) Waksman and Henrici 1948 (Approved Lists 1980)
Streptomyces felleus Lindenbein 1952 (Approved Lists 1980)
Streptomyces globisporus subsp. caucasicus (Kudrina 1957) Pridham et al. 1958 (Approved Lists 1980)
Streptomyces griseus subsp. solvifaciens Pridham 1970 (Approved Lists 1980)
Streptomyces limosus Lindenbein 1952 (Approved Lists 1980)
Streptomyces odorifer (Rullmann 1895) Waksman 1953 (Approved Lists 1980)
Streptomyces sampsonii (Millard and Burr 1926) Waksman 1953 (Approved Lists 1980)
"Streptothrix albidoflava" Rossi Doria 1891
"Streptotrix albidoflava" [sic] Rossi Doria 1891
"Streptothrix coelicolor" Müller 1908
특징
항진균 성분정제 및 특성 분석 Swiontek Brzezinska et al.
생리 활성 화합물디부틸 프탈레이트 Roy et al.
참고 문헌
2차 대사 조절Stuart Shapiro

2. 분류 및 명명

3. 생물학적 특성

3. 1. 소형 비암호화 RNA (sRNA)

세균 소형 RNA는 전사 후 조절에 관여한다. 딥 시퀀싱을 사용하여 대수 성장 말기에 ''S. albidoflavus'' 전사체를 분석한 결과, 63개의 소형 RNA가 확인되었다. 그중 11개의 발현이 노던 블롯으로 확인되었으며, 이 sRNA는 ''Streptomyces'' 종에만 존재하는 것으로 나타났다.[8]

sRNA scr4677 (''Streptomyces coelicolor'' sRNA 4677)은 항 시그마 인자 ''SCO4677'' 유전자와 추정 조절 단백질 유전자 ''SCO4676'' 사이의 비유전자 부위에 위치한다. ''scr4677''의 발현에는 ''SCO4677'' 활성이 필요하며, ''scr4677'' sRNA 자체가 ''SCO4676'' 관련 전사체의 수준에 영향을 미치는 것으로 보인다.[9]

글루타민 합성효소 I의 비부호화 RNA는 항생제 생산을 조절하는 것으로 나타났다.[10] 소형 RNA scr5239 (''Streptomyces coelicolor'' sRNA SCO5239 상류)는 아가라아제 DagA 발현을 억제하고, 메티오닌 합성효소 ''metE'' (SCO0985)의 번역을 억제한다.[11][12]

3. 2. 지방산 합성

''S. 알비도플라부스''의 아실-캐리어-단백질/acyl-carrier-protein영어 ''S''-말로닐전이효소(ACP ''S''-MT)는 지방산 합성 II와 폴리케타이드 합성효소에 모두 관여하며, 구조적으로 ''대장균''의 유사체와 유사하다는 결정 구조가 알려져 있다.[13]

3. 3. DNA 수리

''S. albidoflavus''의 DNA 수리 기작에서, Ku 상동체는 SCF55.25c이며, C-말단에 새우 알칼리성 인산 분해 효소 유사(SAP 유사) 도메인을 가지고 있다.[18] 또한, ''Streptomyces albidoflavus''는 단일 도메인 단백질 SC9H11.09c를 생성하는데, 이는 많은 세균성 LigD(DNA 연결 효소의 하위 집합)에 공통적으로 존재하는 LigD NucDom과 상동성을 보인다.[18] 세균에서 많은 LigD는 중심 연결 효소 도메인에서 분기된 추가적인 뉴클레아제 도메인을 가지고 있으며, 이 경우 뉴클레아제 도메인은 N-말단 연장이다.[18]

4. 유전체학

스트렙토미세스 알비도플라부스(''Streptomyces albidoflavus'')의 게놈은 단일 선형 분자로 구성되어 있다.[18] Ku가 말단 유지 기능을 수행할 것으로 예상되지만, 아직까지는 관찰된 바가 없다.[18]

5. 생명공학적 응용

''S. albidoflavus'' 균주는 액티노로딘, 메틸레노마이신, 운데실프로디기오신[14] 및 페리마이신을 포함한 다양한 항생물질을 생성한다.[15][16] 특정 ''S. albidoflavus'' 균주는 이종 단백질 발현에 사용될 수 있다.[17]

5. 1. 이종 단백질 발현

''S. albidoflavus'' 균주는 액티노로딘, 메틸레노마이신, 운데실프로디기오신[14] 및 페리마이신을 포함한 다양한 항생물질을 생성한다.[15][16] 특정 ''S. albidoflavus'' 균주는 이종 단백질 발현에 사용될 수 있다.[17]

6. 환경 및 생태

7. 연구 동향

''스트렙토미세스 알비도플라부스''(Streptomyces albidoflavus)에 대한 연구는 다양한 분야에서 꾸준히 진행되어 왔다. 1953년에는 ''S. albidoflavus''가 ''푸사리움 쿨모룸''(Fusarium culmorum)의 생장을 억제한다는 사실이 밝혀졌다. 이후 1997년에는 16S-23S 리보솜 DNA의 삽입서열(intergenic spacer) 크기와 수를 기반으로 ''S. albidoflavus'' 균주를 구별하는 방법이 제시되었다.

2005년에는 ''S. albidoflavus'' PU 23에서 폴리엔 계열이 아닌 항진균성 항생제를 발견했다. 2015년에는 ''S. albidoflavus''의 개체군 유전학 분석을 통해 서식지 장벽이 상동 재조합을 방해하여 스트렙토미세스(Streptomyces)의 다양화에 영향을 미친다는 사실이 밝혀졌다.

2013년에는 ''스트렙토미세스'' 연구 및 응용에 대한 최신 지견을 담은 서적이 출판되었다. 이러한 연구들은 ''S. albidoflavus''의 특성을 이해하고, 이를 활용하기 위한 다양한 시도가 이루어지고 있음을 보여준다. 특히, 항생제 개발 및 유전학적 다양성 연구는 ''S. albidoflavus''의 잠재적 가치를 보여주는 중요한 연구 결과이다.

참조

[1] 웹사이트 LPSN bacterio.net http://www.bacterio.[...]
[2] 웹사이트 Straininfo of Streptomyces albidoflavus http://www.straininf[...]
[3] UniProt UniProt https://www.uniprot.[...]
[4] 웹사이트 Deutsche Sammlung von Mikroorganismen und Zellkulturen https://www.dsmz.de/[...]
[5] 논문 Purification and characterization of Streptomyces albidoflavus antifungal components
[6] 논문 Dibutyl phthalate, the bioactive compound produced by Streptomyces albidoflavus 321.2
[7] 서적 Regulation of Secondary Metabolism in Actinomycetes CRC Press 1989
[8] 논문 Deep sequencing-based identification of small non-coding RNAs in Streptomyces coelicolor 2011-05
[9] 논문 Complex intra-operonic dynamics mediated by a small RNA in ''Streptomyces coelicolor'' 2014-01-01
[10] 논문 Noncoding RNA of glutamine synthetase I modulates antibiotic production in ''Streptomyces coelicolor'' A3(2) 2010-02
[11] 논문 ''Streptomyces coelicolor'' sRNA scr5239 inhibits agarase expression by direct base pairing to the ''dagA'' coding region 2012-02
[12] 논문 Identification of metE as a second target of the sRNA scr5239 in Streptomyces coelicolor 2015-01-01
[13] 논문 The Structural Biology of Type II Fatty Acid Biosynthesis Annual Reviews (publisher)
[14] 논문 Global negative regulation of ''Streptomyces coelicolor'' antibiotic synthesis mediated by an ''absA''-encoded putative signal transduction system 1996-06
[15] 논문 Fungimycin, biogenesis of its aromatic moiety 1972-03
[16] 논문 Perimycin. The structure of some degradation products 1969-05
[17] 웹사이트 Streptomyces coelicolor http://www.jic.ac.uk[...] John Innes Center 2010-01-25
[18] 논문 Nonhomologous End-Joining in Bacteria: A Microbial Perspective Annual Reviews (publisher)
[19] 웹인용 LPSN bacterio.net http://www.bacterio.[...] 2023-11-10
[20] UniProt UniProt https://www.uniprot.[...]
[21] 웹사이트 Deutsche Sammlung von Mikroorganismen und Zellkulturen https://www.dsmz.de/[...]
[22] 논문 Purification and characterization of Streptomyces albidoflavus antifungal components
[23] 논문 Dibutyl phthalate, the bioactive compound produced by Streptomyces albidoflavus 321.2
[24] 서적 Regulation of Secondary Metabolism in Actinomycetes CRC Press 1989


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