치료 표적 데이터베이스

3. 치료 표적 검증

치료 표적 검증은 표적이 질병 관련 세포나 조직에서 발현되는지, 약물에 의해 조절될 수 있는지, 그리고 표적 조절이 질병 개선에 효과가 있는지 확인하는 과정이다.^[6][7][8] 단백질, 핵산 등 다양한 분자들이 치료 표적으로 연구되고 있으며, 이러한 표적과 관련 약물에 대한 정보는 신약 개발에 유용하게 활용될 수 있다.^[41][42] 치료 표적 및 초기 약물 후보 관련 정보는 신약 개발 가능성,^[49] 시스템 약리학,^[50] 새로운 트렌드 및 분자적 전망,^[51] 신약 개발 도구 개발^[52] 등의 연구를 쉽게 할 수 있도록 돕는다.^[48]

3. 1. 표적 검증 데이터

• 약물의 주요 표적에 대한 실험적으로 결정된 효능.^[6]
• 주요 표적과 관련된 질병 모델(세포주, ex-vivo, in-vivo 모델)에 대한 약물의 명백한 효능 또는 효과.^[8]
• in-vivo 모델에서 표적 유전자 제거, 녹다운, RNA 간섭, 형질전환, 항체 또는 안티센스 처리의 관찰된 효과.^[7]

• 83개의 표적 및 104개의 표적/약물 조절 유전자에서 2,000개의 약물 내성 변이^[36]
• 질병과 관련된 약물 표적 조직^[37] 및 비표적 조직에서 758개의 표적의 차등적 발현 프로파일^[38]
• 1,764개 약물의 1,008개 표적 조합^[39]과 664개 다중 표적 약물의 1,604개 표적 조합^[40]
• 임상 시험 약물과 그 표적,^[44] 그리고 그들의 구조와 실험 활성 값^[45]
• 특허 취득된 약물과 그 표적,^[46] 그리고 그들의 구조 및 실험적 활성 값^[47]
• 표적 조절 마이크로RNA^[55] 및 전사 인자,^[56] 표적 상호작용 단백질^[57]
• 여러 경로 데이터베이스에 의해 완전히 참조되는 포괄적인 표적-경로 쌍^[58][59]
• 이러한 경로 항목과 교차 연결된 여러 표적 및 약물에 대한 간편한 접근^[60]

4. 치료 표적 분류

TTD(치료 표적 데이터베이스)의 치료 표적은 약물의 최고 상태 및 분자 유형에 따라 분류된다. 약물의 최고 상태에 따른 분류는 하위 섹션 "임상 상태에 따른 분류"에서, 분자 유형에 따른 분류는 단백질, 핵산 및 요산, 철, 활성 산소 등을 포함하는 기타 분자로 나뉜다는 내용은 하위 섹션 "분자 유형에 따른 분류"에서 자세히 설명되어 있다.

4. 1. 임상 상태에 따른 분류

• 성공적인 표적: 최소 1개의 승인된 약물에 의해 표적화됨.
• 임상 시험 표적: 승인된 약물에 의해 표적화되지 않았지만, 최소 1개의 임상 시험 약물에 의해 표적화됨.
• 전임상 표적: 승인/임상 시험 약물에 의해 표적화되지 않았지만, 최소 1개의 전임상 약물에 의해 표적화됨.
• 특허 표적: 승인/임상 시험/전임상 약물에 의해 표적화되지 않았지만, 최소 1개의 특허 약물에 의해 표적화됨.
• 문헌 보고 표적: 조사 약물에 의해서만 표적화됨.

4. 2. 분자 유형에 따른 분류

• 단백질: 약물 개발에서 가장 흔한 유형의 표적이다.
• 핵산: DNA, mRNA, miRNA, lncRNA 표적을 포함한다.
• 기타 분자: 요산, 철, 활성 산소 등을 포함한다.

• 임상 시험 약물과 그 표적^[44], 그리고 그들의 구조와 실험 활성 값^[45]。
• 특허 취득된 약물과 그 표적^[46], 그리고 그들의 구조 및 실험적 활성 값^[47]。

5. 약물 유형

TTD는 저분자 화합물, 항체, 핵산 약물, 세포 치료제, 유전자 치료제, 백신 등 다양한 유형의 약물을 수집한다. 이러한 약물들의 표적이 되는 단백질, 핵산 등은 수백 개에 달하며, 승인된 의약품, 임상시험 약물, 특허 약물의 표적으로 연구되고 있다^[41]。 이 표적들과 관련 약물, 특히 임상 용도, 임상 시험, 특허 약물에 대한 정보는 신약 개발에 유용하다^[42]。

5. 1. 주요 약물 유형

• 저분자 화합물: 제약 시장에서 가장 흔한 의약품이다.
• 항체: 단클론 항체와 항체-약물 접합체, 이중특이성 항체, IgG 혼합물 및 항체 융합 단백질과 같은 여러 대안을 포함한다.
• 핵산 약물: 주로 안티센스 올리고뉴클레오티드, 소형 간섭 RNA, 소형 활성 RNA, 마이크로RNA, mRNA 등을 포함한다.
• 세포 치료제: 약효를 발휘하기 위해 생존 가능한 세포를 환자에게 주입, 이식 또는 삽입하는 치료법이다.
• 유전자 치료제: 치료 효과를 내기 위해 유전자 발현을 조작하거나 살아있는 세포의 생물학적 특성을 변경하는 치료법이다.
• 백신: 특정 감염성 또는 악성 질환에 대해 능동적인 후천성 면역을 제공한다.

6. 표적 변이 및 발현 프로파일

TTD는 83개의 표적 및 104개의 표적/약물 조절 유전자에서 2,000개의 약물 내성 변이^[36]와 질병 관련 약물 표적 조직^[37] 및 비표적 조직에서 758개 표적의 차등적 발현 프로파일^[38] 정보를 제공한다.

6. 1. 제공 데이터

7. 표적 조절 인자 및 신호 전달 경로

치료 표적 및 초기 약물 후보에 관한 지식은 신약 개발 개선에 도움이 된다^[48]。 특히 표적 조절 인자 및 관련 신호 전달 경로 데이터는 신약 개발 가능성^[49], 시스템 약리학^[50], 새로운 트렌드, 분자적 전망^[51], 신약 개발 도구 개발 등의 연구를 용이하게 할 수 있다^[52]。 이러한 정보를 제공하기 위해^[53], TTD에서는 여러 수송체 데이터베이스를 제공하고 있다^[54]。

7. 1. 제공 데이터

• 표적 조절 마이크로RNA^[55] 및 전사 인자^[56], 표적 상호작용 단백질.^[57]
• 여러 경로 데이터베이스에 의해 완전히 참조되는 포괄적인 표적-경로 쌍.^[58][59]
• 이러한 경로 항목과 교차 연결된 여러 표적 및 약물에 대한 간편한 접근.^[60]

참조

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