기본단위체

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1. 개요

기본단위체(protomer)는 둘 이상의 소단위체로 구성된 생체 분자의 반복적인 구조적 단위이다. 헤모글로빈은 두 개의 α 소단위체와 두 개의 β 소단위체로 구성된 이종사량체이며, 두 개의 αβ 기본단위체가 결합한 이량체로 간주된다. 아스파르트산 카바모일기전이효소는 여섯 개의 αβ 기본단위체가 D₃ 대칭으로 배열된 α₆β₆ 소단위체로 구성된다. 바이러스의 캡시드는 기본단위체로 구성되며, 화학에서는 티로신이나 4-아미노벤조산과 같은 분자가 기본단위체의 예시로 사용된다.

기본단위체
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2. 프로토머의 예시

하나의 기본단위체 역할을 하는 캡시드 단백질 VP1 오량체. 각 단량체는 다른 색으로 그려져 있다.
하나의 기본단위체 역할을 하는 캡시드 단백질 VP1 오량체. 각 단량체는 다른 색으로 그려져 있다.

프로토머는 다양한 생체 분자에서 발견된다. 헤모글로빈은 이종사량체이지만, 구조적, 기능적으로는 두 개의 αβ 기본단위체가 결합한 이량체로 간주된다. 아스파르트산 카바모일기전이효소는 α6β6 소단위체로 구성되어 있으며, 여섯 개의 αβ 기본단위체가 D3 대칭으로 배열되어 있다. 바이러스의 캡시드 또한 기본단위체로 구성되는 경우가 많다. 화학에서는 타이로신이나 4-아미노벤조산을 예로 들 수 있다.

2.1. 헤모글로빈


헤모글로빈은 네 개의 소단위체, 즉 두 개의 α 소단위체와 두 개의 β 소단위체로 구성된 이종사량체이다. 그러나 구조적으로든 기능적으로든 헤모글로빈은 (αβ)2로 기술되는 편이 더 합리적이며, 따라서 두 개의 αβ 기본단위체가 결합한 이량체(또는 diprotomer)라고 한다.

2.2. 아스파르트산 카바모일기전이효소

아스파르트산 카바모일기전이효소는 α6β6 소단위체 조성을 가지며, 6개의 αβ 프로토머가 D3 대칭으로 배열되어 있다.

2.3. 바이러스 캡시드

바이러스의 캡시드는 종종 기본단위체로 구성되어 있다. 캡시드는 바이러스의 유전 물질을 보호하는 단백질 껍질이며, 반복되는 기본단위체의 배열로 형성된다.

2.4. 화학에서의 프로토머

화학에서 프로토머의 예시로는 타이로신이나 4-아미노벤조산이 있다. 타이로신의 경우 탈양성자화되어 카복실레이트와 페녹사이드 음이온을 형성할 수 있으며, 4-아미노벤조산은 아미노기나 카복실기가 양성자화될 수 있다.