부유균류

"오늘의AI위키"는 AI 기술로 일관성 있고 체계적인 최신 지식을 제공하는 혁신 플랫폼입니다.
"오늘의AI위키"의 AI를 통해 더욱 풍부하고 폭넓은 지식 경험을 누리세요.

1. 개요

부유균류는 플랑크토마이세테스문, 베루코미크로비움문, 클라미디아문을 포함하는 세균 그룹으로, 전통적인 분자 계통 발생 관점에서 문으로 간주되며, PVC 상위문에 속한다. 이 그룹은 보존된 시그니처 단백질과 보존된 시그니처 인델(CSI)과 같은 분자적 특징을 공유하며, 이는 다른 세균과 구별되는 특징이다. RNA 중합 효소 단백질 RpoB의 아미노산 삽입과 막 코트 유사 단백질, 튜불린, 스테롤 합성, 농축된 DNA의 존재 등도 이 계통군의 증거로 제시된다.

부유균류 - [생물]에 관한 문서

PVC 상문

이미지 준비중입니다.

Chlamydia trachomatis

분류

분류 상태	임시
상위 분류군	세균
하위 분류군 계급	문
하위 분류군	클라미디아균류 Kiritimatiellota 렌티스페라문 부유균문 우미균문 Ca. Hydrogenedentes Ca. Aureabacteria Ca. Omnitrophica
동의어	Planctobacteria Cavalier-Smith, 1987

PVC 상문 계통수

{"caption":"PVC 상문"}

참고 문헌

참고 문헌	Stefan Spring 외, (2016). Characterization of the first cultured representative of Verrucomicrobia subdivision 5 indicates the proposal of a novel phylum. Nature. George M. Garrity 편집, Bergey's Manual of Systematic Bacteriology, 제4권 Elena Rivas-Marín, Damien P. Devos, The Paradigms They Are a-Changin': past, present and future of PVC bacteria research, Antonie van Leeuwenhoek, 111(6), 785–799, 2018 Patrick Forterre, A new fusion hypothesis for the origin of Eukarya: better than previous ones, but probably also wrong, Research in Microbiology, 162(1), 77–91, 2011 David A Baum, Buzz Baum, An inside-out origin for the eukaryotic cell, BMC Biology, 12(1), 76, 2014 Cavalier-Smith T, The neomuran origin of archaebacteria, the negibacterial root of the universal tree and bacterial megaclassification, International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology, 52(Pt 1), 7–76, 2002 Cavalier-Smith T, Rooting the tree of life by transition analyses, Biol. Direct, 1(1), 19, 2006 Woese, C. R., Bacterial evolution, Microbiological Reviews, 51(2), 221–271, 1987 Rappe, M. S., Giovannoni, S. J., The Uncultured Microbial Majority, Annual Review of Microbiology, 57, 369–394, 2003 Wagner, M., Horn, M., The Planctomycetes, Verrucomicrobia, Chlamydiae and sister phyla comprise a superphylum with biotechnological and medical relevance, Current Opinion in Biotechnology, 17(3), 241–249, 2006

📚 더 읽어볼만한 페이지

세균 - GFAJ-1
GFAJ-1은 고농도 비소 환경에서 생장하며 비소를 이용하여 생장할 수 있다는 논란이 있었던 박테리아이다.
세균 - 황색포도상구균
황색포도상구균은 다양한 질병을 일으키는 그람 양성 구균으로, 인구의 약 30%가 보균하고 있으며 항생제 내성이 널리 퍼져 있어 효과적인 백신 개발과 항생제 내성 문제 해결을 위한 지속적인 연구가 필요하다.

1. 개요
2. 분자적 특징

2. 분자적 특징

플랑크토마이세테스문, 베루코미크로비움문, 클라미디아문은 PVC 상위문에 속하며, 이들을 구별하는 분자적 특징들이 존재한다. 보존된 시그니처 단백질과 보존된 시그니처 인델(CSI)은 이들 문을 특징짓는 중요한 요소이다. 막 코트 유사 단백질, 튜불린, 스테롤 합성, 농축된 DNA의 존재 등도 이 계통군의 존재를 뒷받침하는 추가적인 증거이다.

2.1. 보존된 시그니처 단백질

2.2. 보존된 시그니처 인델 (CSI)

플랑크토마이세테스문, 베루코미크로비움문, 클라미디아문을 서로 구별하고 다른 세균과도 구별하는, 각 문에 특이적인 보존된 시그니처 인델 (CSI)이 밝혀졌다. RNA 중합 효소 단백질 RpoB에는 세 개의 아미노산 삽입이 있는데, 이는 염기서열이 밝혀진 모든 베루코미크로비움, 클라미디아, 렌티스파에라 종에서 공유된다. 이 CSI는 인접한 플랑크토마이세테스와 포리박테리아에는 존재하지 않으며, CSI가 특이적인 그룹 간의 공통 조상을 시사한다.

2.3. 기타 증거

플랑크토마이세테스문, 베루코미크로비움문, 클라미디아문은 전통적인 분자 계통 발생 관점에서 문으로 간주되며, 후보 문인 Omnitrophica (이전 OP3) 및 Poribacteria와 함께 PVC 상위문에 속한다. 보존된 시그니처 단백질 형태의 중요한 분자 표지가 PVC 구성원들이 일관되게 공유하는 것으로 밝혀졌으며, Poribacteria는 예외이다. 보존된 시그니처 단백질은 공유 파생 형질 특성을 나타내고 이 세균 그룹을 구별하는 수단이 될 수 있다. 2014년 연구에서 이 단백질의 특성이 밝혀졌으며 DNA/RNA 결합에서 중요한 하우스키핑 기능을 수행하는 것으로 밝혀졌다. 이러한 관찰은 PVC 상위문을 구획하는 수단을 제공할 뿐만 아니라, 이 계통군이 다른 세균과 구별되는 진화적 관계를 공유한다는 것을 강력하게 뒷받침한다.

보존된 시그니처 인델 (CSI)은 또한 각 문을 서로 구별하고 다른 세균과도 구별하는 플랑크토마이세테스문, 베루코미크로비움문, 클라미디아문에 특이적인 것으로 밝혀졌다. RNA 중합 효소 단백질 RpoB에 세 개의 아미노산 삽입이 있어, 염기서열이 밝혀진 모든 베루코미크로비움, 클라미디아, 렌티스파에라 종에서 공유되는 것으로 밝혀졌다. CSI는 인접한 플랑크토마이세테스와 포리박테리아에는 존재하지 않으며, CSI가 특이적인 그룹 간의 공통 조상을 시사한다.

이 계통군의 존재에 대한 추가적인 증거로는 막 코트 유사 단백질, 튜불린, 스테롤 합성, 농축된 DNA의 존재 등이 있다.