화학정보학

3. 기초

화학정보학은 화학, 컴퓨터 과학, 정보 과학 분야가 융합된 학문이다. 예를 들어 위상수학, 화학 그래프 이론, 정보 검색, 데이터 마이닝 등의 분야에서 화학 공간을 다룬다.^{[8][9][10][11]} 화학정보학은 제지 및 펄프, 염료 및 관련 산업과 같은 다양한 산업의 데이터 분석에도 적용될 수 있다.^[12]

화학 물질 공간은 적어도 $10^\{62\}$개의 분자 구조가 존재한다고 추정된다.^[24] 이에 비해 2005년 현재까지 알려진 화학 물질의 총 수는 $10^\{9\}$개 정도이다.

4. 응용 분야

화학정보학은 화학 화합물과 관련된 정보를 저장, 색인 및 검색하는 데 주로 응용된다.^[13] 효율적인 정보 검색을 위해 데이터 마이닝, 정보 검색, 정보 추출, 기계 학습과 같은 정보과학 분야의 지식이 활용된다.

화합물의 가상 라이브러리는 화학 공간을 탐색하고 원하는 특성을 가진 새로운 화합물을 예측하기 위해 다양한 방식으로 생성될 수 있다. 가상 스크리닝은 컴퓨터를 이용하여 ''silico'' 화합물 라이브러리에서 주어진 표적 단백질에 대해 생물학적 활성과 같은 원하는 물성을 가질 만한 물질을 찾는 방법이다. 정량적 구조-활성 관계(QSAR) 및 정량적 구조-성질 관계(QSPR) 값을 계산하는 QSAR 방법은 화합물의 구조로부터 활성을 예측하는 데 사용된다.

4. 1. 저장과 복구

• 비정형 데이터
• * 정보 검색
• * 정보 추출
• 구조화된 데이터의 마이닝
• * 데이터베이스 마이닝
• * 그래프 마이닝
• * 분자 마이닝
• * 서열 마이닝
• * 트리 마이닝
• 디지털 라이브러리

4. 1. 1. 파일 형식

4. 2. 가상 라이브러리

4. 3. 가상 스크리닝

4. 4. 구조-활성의 정량적 관계(QSAR)

5. 같이 보기

• 생물정보학
• 계산화학
• 통계학

참조

_[1] 논문 Basic Overview of Chemoinformatics
_[2] 서적 Quantitative Drug Design: A Critical Introduction Marcel Dekker 1978
_[3] 서적 Annual Reports in Medicinal Chemistry
_[4] 웹사이트 Cheminformatics or Chemoinformatics ? http://www.molinspir[...] 2006-03-31
_[5] 웹사이트 Biopharmaceutical glossary Tips & FAQs http://www.genomicgl[...]
_[6] 웹사이트 http://infochim.u-st[...]
_[7] 웹사이트 Open Access Journal of Cheminformatics now live! « SteinBlog http://www.steinbeck[...] 2022-06-20
_[8] 서적 Chemoinformatics: A Textbook Wiley 2004
_[9] 서적 An Introduction to Chemoinformatics Springer 2003
_[10] 논문 Chemoinformatics as a Theoretical Chemistry Discipline
_[11] 서적 Chemoinformatics: Theory, Practice, & Products Springer 2006
_[12] 웹사이트 Cheminformatics approaches to creating new hair dyes https://phys.org/new[...] 2022-06-20
_[13] 논문 Chemoinformatics: The Application of Informatics Methods to Solve Chemical Problems https://www.research[...] 2013-08-09
_[14] 논문 SMILES, a Chemical Language and Information System: 1: Introduction to Methodology and Encoding Rules
_[15] 논문 Chemical Markup, XML, and the Worldwide Web. 1. Basic Principles
_[16] 논문 FOG: Fragment Optimized Growth Algorithm for the de Novo Generation of Molecules occupying Druglike Chemical
_[17] 논문 Prediction-driven matched molecular pairs to interpret QSARs and aid the molecular optimization process
_[18] 서적 Chapter 35. Chemoinformatics: What is it and How does it Impact Drug Discovery
_[19] 논문 Editorial Opinion: Chemoinformatics – a ten year update
_[20] 웹사이트 Cheminformatics or Chemoinformatics ? http://www.molinspir[...]
_[21] 웹사이트 www.genomicglossaries.com Tips & FAQs for the Biopharmaceutical glossaries #3 http://www.genomicgl[...]
_[22] 문서 Obernai Declaration http://infochim.u-st[...]
_[23] 서적 Chemical Graph Theory: Introduction and Fundamentals Gordon and Breach Science Publishers
_[24] 논문 How many leads from HTS?
_[25] 저널
_[26] 저널
_[27] 웹 인용 http://www.molinspir[...]
_[28] 웹 인용 http://infochim.u-st[...]
_[29] 서적 Chemoinformatics : A Textbook
_[30] 서적 An Introduction to Chemoinformatics
_[31] 저널
_[32] 서적 Chemoinformatics: Theory, Practice, & Products
_[33] 저널
_[34] 웹사이트 http://www.jcheminf.[...]