5-아미노이미다졸 리보뉴클레오타이드
1. 개요
5-아미노이미다졸 리보뉴클레오타이드(AIR)는 퓨린 고리 시스템과 비타민 B12, 티아민 생합성에 사용되는 생합성 중간체이다. 5-아미노이미다졸 유도체는 불안정하여 합성이 어려웠지만, 1988년에 AIR의 비효소적 합성이 처음 발표되었고, 1990년대에 일반적인 합성 방법이 개발되었다. AIR은 오탄당 인산 경로를 통해 생성되며, 퓨린, 티아민, 5-하이드록시벤즈이미다졸의 생합성에 관여한다.
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| IUPAC 명칭 | 1-(5-아미노-1H-이미다졸-1-일)-1-데옥시-β-D-리보푸라노스 5-(다이하이드로젠 포스페이트) |
|---|---|
| 계통명 | [(2R,3S,4R,5R)-5-(5-아미노-1H-이미다졸-1-일)-3,4-다이하이드록시옥솔란-2-일]메틸 다이하이드로젠 포스페이트 |
| 기타 이름 | AIR '[5-(5-아미노-1-이미다졸릴)-3,4-다이하이드록시-2-테트라하이드로푸라닐]메틸 다이하이드로젠 포스페이트 |
| ChemSpider ID | '141854' |
|---|---|
| StdInChI | 1S/C8H14N3O7P/c9-5-1-10-3-11(5)8-7(13)6(12)4(18-8)2-17-19(14,15)16/h1,3-4,6-8,12-13H,2,9H2,(H2,14,15,16)/t4-,6-,7-,8-/m1/s1 |
| StdInChIKey | PDACUKOKVHBVHJ-XVFCMESISA-N |
| CAS 등록번호 | '25635-88-5' |
| ChEBI | '138560' |
| KEGG | C03373 |
| PubChem | '161500' |
| SMILES | O=P(O)(O)OC[C@H]2O[C@@H](n1cncc1N)[C@H](O)[C@@H]2O |
| MeSH 이름 | 아미노이미다졸 리보티드 |
| 분자식 | C8H14N3O7P |
|---|---|
| 몰 질량 | 295.186 g/mol |
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뉴클레오타이드 -
아데노신 삼인산
아데노신 삼인산(ATP)은 아데닌, 리보스, 세 개의 인산기로 구성된 뉴클레오티드로서, 고에너지 인산 결합의 가수분해를 통해 에너지를 방출하여 세포 과정에 사용되는 생명체의 주요 에너지 저장 및 전달 분자이며, 다양한 대사 경로를 통해 생성 및 재생될 뿐만 아니라 세포 신호 전달과 DNA 및 RNA 합성에도 필수적인 역할을 한다. -
뉴클레오타이드 -
폴리뉴클레오타이드
폴리뉴클레오타이드는 DNA와 RNA를 구성하는 뉴클레오타이드가 연결된 고분자이며, 생물체의 게놈을 구성하고 생화학 실험, 의학 및 미용 분야에서 활용된다.
2. 화학
5-아미노이미다졸 유도체는 불안정하여 합성이 어려운 것으로 여겨졌다. 5-아미노이미다졸 리보타이드(AIR)의 최초의 비효소적 합성은 1988년에 발표되었으며, 1990년대에 다른 예에 대한 일반적인 방법론이 개발되었다.
3. 생합성
푸라노스(5-탄소 당)는 5-아미노이미다졸 리보뉴클레오타이드(AIR)의 오탄당 인산 경로에서 나오며, 이는 포도당을 리보스 5-인산(R5P)으로 변환한다. 분자의 아미노 이미다졸 부분을 부착하는 후속 반응은 R5P가 피로인산 유도체인 인산리보실 피로인산(PRPP)으로 활성화될 때 시작된다. 이 반응은 리보스-인산 디포스포키나아제에 의해 촉매된다.
5개의 생합성 단계가 변환을 완료한다.
| 단계 | 효소 | 반응 | 설명 |
|---|---|---|---|
| 1 | 아미도포스포리보실전이효소 | + → + + PPi | 글루타민에서 나온 암모니아를 아노머 탄소의 리보타이드에 부착하여 포스포리보실아민(PRA)을 형성한다. |
| 2 | 포스포리보실아민—글리신 연결효소 | + + ATP → + ADP + Pi | 아데노신 삼인산(ATP)에 의해 구동되는 과정에서 글리신과 아미드 결합을 형성하여 글리신아미드 리보뉴클레오타이드(GAR)로 변환한다. |
| 3 | 포스포리보실글리시나미드 포르밀전이효소 | GAR + 10-포르밀테트라히드로엽산 → FGAR + 테트라히드로엽산 | GAR에 10-포르밀테트라히드로엽산에서 포르밀기를 첨가하여 포스포리보실-N-포르밀글리신아미드(FGAR)를 생성한다. |
| 4 | 포스포리보실포르밀글리시나미딘 합성효소 | FGAR + ATP + 글루타민 + H2O → FGAM + ADP + 글루타메이트 + Pi | 글루타민에서 아미노기를 전달하여 ATP를 필요로 하는 반응에서 FGAR을 아미딘으로 변환하여 5′-포스포리보실포르밀글리시나미딘(FGAM)을 생성한다. |
| 5 | AIR 합성효소 | FGAM + ATP → AIR + ADP + Pi + H+ | ATP를 사용하여 말단 카르보닐기를 활성화하여 아노머 중심의 질소 원자가 공격하게 하여 FGAM을 AIR로 변환한다. |
4. 생합성 중간체로서의 이용
5-아미노이미다졸 리보뉴클레오타이드(AIR)는 여러 생화학 반응에서 중요한 중간체로 작용한다.
퓨린 뉴클레오타이드 생합성 과정에서 5-아미노이미다졸 리보뉴클레오타이드(AIR)는 포스포리보실아미노이미다졸 카르복실라제에 의해 5'-포스포리보실-4-카복시-5-아미노이미다졸(CAIR)로 전환되어 퓨린 고리 시스템 형성에 필수적인 역할을 한다.
또한, 5-아미노이미다졸 리보뉴클레오타이드(AIR)는 라디칼 SAM 효소군에 의해 촉매되는 반응을 통해 티아민(비타민 B1) 합성과 5-하이드록시벤즈이미다졸 생성에 관여하며, 특히 5-하이드록시벤즈이미다졸은 비타민 B12 합성에 필요한 전구체로 사용된다.
4.1. 퓨린
핵산 이노신 일인산(IMP)의 퓨린 고리 시스템은 5-아미노이미다졸 리보뉴클레오타이드(AIR)에서 시작하여 포스포리보실아미노이미다졸 카르복실라제가 이미다졸 고리에서 카르복실화 유도체인 5'-포스포리보실-4-카복시-5-아미노이미다졸(CAIR)로 전환될 때 형성된다.
:AIR + CO2 → CAIR + 2 H+
동일한 화합물은 효소가 5-(카르복시아미노)이미다졸 리보뉴클레오티드 합성효소와 5-(카르복시아미노)이미다졸 리보뉴클레오티드 뮤테이스일 때 2단계 경로로 형성될 수 있다.
4.2. 라디칼 SAM 반응
AIR은 라디칼 SAM 슈퍼패밀리 효소에 의해 촉매되는 반응에서 다양한 생화학 경로에 관여한다. 이들은 철-황 단백질이며, S-아데노실 메티오닌을 보조 인자로 사용하여 라디칼 중간체를 통해 변환을 시작한다.
4.2.1. 티아민 (비타민 B1)
포스포메틸피리미딘 합성효소에 의해 촉매되는 반응에서 5-아미노이미다졸 리보뉴클레오타이드(AIR)는 티아민의 피리미딘 고리 형성에 사용된다.
4.2.2. 5-하이드록시벤즈이미다졸
일부 혐기성 세균에서 AIR은 5-하이드록시벤즈이미다졸 생성효소에 의해 5,6-디메틸벤즈이미다졸의 전구체인 5-하이드록시벤즈이미다졸로 전환된다. 5-하이드록시벤즈이미다졸은 이후 코발라민 생합성 단계에서 비타민 B12에 통합된다.
생성물의 모든 탄소 원자는 AIR로부터 전달된다.