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OmpA 유사 막관통 도메인

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목차

1. 개요

OmpA 유사 막관통 도메인은 8가닥의 베타 배럴 구조로 구성되며, 세균 독성에 기여하고 숙주 세포 또는 면역 조절 물질에 결합하는 기능을 수행한다. 대장균 OmpA, 페스트균 Ail 등이 대표적이며, 이들 단백질 중 일부는 백신 후보 물질로 연구되고 있다. 이 도메인은 세균의 숙주 세포 부착, 혈액뇌장벽 침투 등에 관여하며, 크로노박터 사카자키, 보렐리아 아프젤리 등 다양한 세균에서 발견된다.

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OmpA 유사 막관통 도메인
OmpA 유사 막관통 도메인
PfamPF01389
Pfam 클랜CL0193
InterProIPR000498
PROSITEPDOC00819
SCOP1bxw
TCDB1.B.6
OPM 패밀리26
OPM 단백질1qjp
PDB1g90A:22-195
1bxwA:22-192
1qjpA:22-192

2. 구조

OmpA 유사 막관통 도메인은 8가닥의 상하 베타 배럴 구조로 구성되어 있다. 이 가닥들은 4개의 세포 외 루프와 3개의 세포 내 회전을 통해 연결된다.[12][4]

3. 기능

OmpA 유사 막관통 도메인은 다양한 기전을 통해 세균 독성에 기여하는데, 주로 숙주 세포나 Factor H와 같은 면역 조절 물질에 결합하는 방식으로 작용한다.[13][14][15][16] 이러한 기능은 세균이 숙주 세포에 부착하고, 숙주의 면역 반응을 회피하며 질병을 유발하는 데 중요한 역할을 한다.

3. 1. 주요 기능 및 관련 세균

다수의 OmpA 유사 막관통 도메인은 숙주 세포 또는 Factor H와 같은 면역 조절 물질에 결합하는 등 다양한 기전을 통해 세균의 독성에 기여한다. 주목할 만한 예로는 대장균 OmpA와 페스트균 Ail이 있다. 이러한 단백질 중 일부는 백신 후보 물질이다.

  • '''대장균 OmpA''': 뇌 미세혈관 내피 세포에서 인간 당단백질인 Ecgp와 특정한 상호 작용을 하는 것으로 나타났다.[13][5]
  • '''크로노박터 사카자키 OmpA''': 신생아에게 뇌수막염을 유발하는 식품 매개 병원체이며, 피브로넥틴에 결합하여 혈액뇌장벽 침투에 중요한 역할을 한다.[14][6]
  • '''페스트균 Ail''': 라미닌과 헤파린에 결합하여 세균이 숙주 세포에 부착할 수 있게 한다.[15][7]
  • '''보렐리아 아프젤리 BAPKO_0422''': OmpA 유사 막관통 도메인이며, 인간 Factor H에 결합한다.[16][8]

3. 2. 백신 후보 물질

대장균(E. coli) OmpA와 페스트균(Yersinia pestis) Ail과 같이, 수많은 OmpA 유사 막관통 도메인은 숙주 세포 또는 Factor H와 같은 면역 조절 물질에 결합하는 등 다양한 기전을 통해 세균의 독성에 기여한다. 이러한 단백질 중 일부는 백신 후보 물질이다.[13][15][16][14]

참조

[1] 논문 Structure of the outer membrane protein A transmembrane domain 1998-11
[2] 논문 A molecular Swiss army knife: OmpA structure, function and expression 2007-08
[3] 논문 A novel sRNA that modulates virulence and environmental fitness of Vibrio cholerae 2009-07
[4] 논문 NMR structure of the integral membrane protein OmpX 2004-03
[5] 논문 Cloning and expression of the Escherichia coli K1 outer membrane protein A receptor, a gp96 homologue 2003-04
[6] 논문 Outer membrane protein A (OmpA) of Cronobacter sakazakii binds fibronectin and contributes to invasion of human brain microvascular endothelial cells 2009-05
[7] 논문 Structural insights into Ail-mediated adhesion in Yersinia pestis 2011-11
[8] 논문 The Borrelia afzelii outer membrane protein BAPKO_0422 binds human factor-H and is predicted to form a membrane-spanning β-barrel 2015
[9] 논문 Structure of the outer membrane protein A transmembrane domain 1998-11
[10] 논문 A molecular Swiss army knife: OmpA structure, function and expression 2007-08
[11] 논문 A novel sRNA that modulates virulence and environmental fitness of Vibrio cholerae 2009-07
[12] 논문 NMR structure of the integral membrane protein OmpX 2004-03
[13] 논문 Cloning and expression of the Escherichia coli K1 outer membrane protein A receptor, a gp96 homologue 2003-04
[14] 논문 Outer membrane protein A (OmpA) of Cronobacter sakazakii binds fibronectin and contributes to invasion of human brain microvascular endothelial cells 2009-05
[15] 논문 Structural insights into Ail-mediated adhesion in Yersinia pestis 2011-11
[16] 논문 The Borrelia afzelii outer membrane protein BAPKO_0422 binds human factor-H and is predicted to form a membrane-spanning β-barrel 2015


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