PABPC4
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1. 개요
PABPC4는 폴리 A 결합 단백질(PABP)의 일종으로, T 세포 활성화 시 발현이 증가하는 단백질이다. mRNA의 안정성 조절, 혈소판 내 단백질 번역 조절, 폴리아데닐레이트 결합 또는 안정화 등에 관여할 수 있다. PABPC4는 PHLDA1과 상호작용하며, 'Pabpc4' 결합 쥐 실험에서 포도당 내성 검사 결과가 비정상적으로 나타났다.
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PABPC4 | |
---|---|
기본 정보 | |
유전자 기호 | PABPC4 |
전체 이름 | 폴리(A) 결합 단백질, 세포질 4 (유도형) |
염색체 | 19 |
염색체 위치 | 19p13.2 |
Entrez Gene | '8761' |
OMIM | '606034' |
RefSeq | NM_004738 |
UniProt | O15028 |
기타 식별자 | |
별칭 | IPABP PABP2 PABP-2 PABP-4 PABPI |
유전자 정보 | |
설명 | 이 유전자는 세포질 폴리(A) 결합 단백질(PABP) 패밀리의 구성원을 암호화한다. 이 단백질은 폴리(A) 꼬리에 결합하여 mRNA의 안정성과 번역을 조절한다. 이 유전자의 발현은 세포 분화 및 증식에 의해 유도된다. 이 유전자는 인간 게놈의 19번 염색체에서 PABPC1 유전자와 역방향으로 병치되어 있다. 이 유전자에는 관련 가성유전자가 2개 있다. |
2. 기능
폴리(A) 결합 단백질(PABP)은 대부분의 진핵생물 전령 RNA(mRNA)의 3' 말단에 있는 폴리(A) 꼬리에 결합하는 단백질이다.[6][2] PABPC4는 유도성 PABP(IPABP)라고도 불리며, 활성화가 유도된 T 세포에서 발현되는 단백질로 처음 분리되었다.[6][2] T 세포가 활성화되면 PABPC4 전령 RNA의 양이 약 5배 증가한다.[6][2]
폴리 A 결합 단백질(PABP)은 대부분의 진핵생물 전령 RNA(mRNA)의 3' 말단에 있는 폴리(A) 꼬리에 결합하는 단백질이다. PABPC4는 유도성 PABP(IPABP)라고도 불리며, 활성화된 T 세포의 mRNA로부터 처음 분리되었다. T 세포가 활성화되면 PABPC4 mRNA의 양이 약 5배 증가하는 것으로 관찰되었다.
''Pabpc4'' 유전자의 기능을 이해하기 위해 모델 유기체를 활용한 연구가 진행되었다. 특히 쥐 모델에서 해당 유전자를 결핍시킨 후 다양한 표현형 스크리닝을 수행하여 유전자의 영향을 조사했다.
이 단백질은 4개의 RNA 결합 도메인과 프롤린이 풍부한 C 말단을 가지고 있으며, 주로 세포질에 존재한다.[6][2] PABPC4는 활성화된 T 세포 내에서 불안정한 mRNA의 안정성을 조절하는 데 필요한 역할을 할 것으로 추정된다.[6][2]
또한, PABPC4는 트롬빈에 의해 활성화된 토끼 혈소판에서 발현되는 항원인 APP1(활성화 혈소판 단백질-1)과 동일한 물질로 확인되었다.[6][2] 이를 바탕으로 PABPC4는 혈소판 및 거핵세포에서 단백질 번역 과정을 조절하거나, 혈소판의 치밀 과립 내에서 폴리아데닐산염(polyadenylate)의 결합 또는 안정화에 관여할 가능성이 있다.[6][2]
3. 상호작용
PABPC4 단백질은 4개의 RNA 결합 도메인과 프롤린이 풍부한 C 말단 영역을 가지고 있으며, 주로 세포질에 존재한다. PABPC4는 활성화된 T 세포 내에서 불안정한 mRNA의 안정성을 조절하는 데 관여할 가능성이 제기되었다.
또한, PABPC4는 트롬빈에 의해 활성화된 토끼 혈소판에서 발현되는 항원인 APP1(Activated Platelet Protein 1)과 동일한 단백질로 확인되었다. 이를 통해 PABPC4가 혈소판 및 거핵구(megakaryocyte)에서 단백질 번역 과정을 조절하거나, 혈소판 내 밀집 과립(dense granule)에서 폴리아데닐레이트(polyadenylate)의 결합 또는 안정화에 기여할 수 있음을 시사한다.[6]
PABPC4는 단백질-단백질 상호작용을 통해 PHLDA1 단백질과 상호작용하는 것으로 밝혀졌다.[3]
4. 모델 유기체
아래 표는 ''Pabpc4'' 유전자가 결핍된 쥐에서 나타나는 표현형을 정리한 것이다. 대부분의 검사 항목에서는 정상적인 표현형을 보였으나, 포도당 내성 검사에서는 비정상적인 결과가 관찰되었다.[7]특성 표현형 동종 접합 생존력 표준 Fertility 표준 체중 표준 불안 표준 신경학적 평가 표준 악력 강도 표준 전열기 테스트 표준 이형성 표준 간접 열량 측정 표준 포도당 내성 검사 비정상[7] 청각 뇌간 반응 표준 DEXA 표준 방사선 촬영 표준 체온 표준 눈 형태 표준 임상화학 표준 혈액학 표준 말초 혈액 림프구 표준 소핵 시험 표준 심장 무게 표준 [8][9] 모든 테스트 및 분석
4. 1. 포도당 내성 검사 이상
''Pabpc4'' 유전자가 결핍된 쥐 모델을 대상으로 한 표현형 스크리닝에서, 포도당 내성 검사 결과가 비정상으로 나타났다.[7]
참조
[1]
논문
Chromosomal localization of three human poly(A)-binding protein genes and four related pseudogenes
1999-11
[2]
웹사이트
Entrez Gene: PABPC4 poly(A) binding protein, cytoplasmic 4 (inducible form)
https://www.ncbi.nlm[...]
[3]
논문
Inhibition of protein synthesis by the T cell receptor-inducible human TDAG51 gene product
2001-05
[4]
저널
Chromosomal localization of three human poly(A)-binding protein genes and four related pseudogenes
1999-11
[5]
웹인용
Entrez Gene: PABPC4 poly(A) binding protein, cytoplasmic 4 (inducible form)
https://www.ncbi.nlm[...]
[6]
웹인용
Entrez Gene: PABPC4 poly(A) binding protein, cytoplasmic 4 (inducible form)
https://www.ncbi.nlm[...]
[7]
웹인용
Glucose tolerance test data for Pabpc4
http://www.sanger.ac[...]
Wellcome Trust Sanger Institute
[8]
저널
The Sanger Mouse Genetics Programme: High throughput characterisation of knockout mice
[9]
문서
Mouse Resources Portal
http://www.sanger.ac[...]
Wellcome Trust Sanger Institute
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