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TAE 완충용액

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1. 개요

TAE 완충용액은 아가로스 겔 전기영동의 실행 완충액과 겔 자체에 사용되는 완충액이다. DNA 이동성 연구에 활용되며, 고농도의 염이 DNA 밴딩 패턴 해석에 영향을 줄 수 있다. 일반적으로 50배 농축액 형태로 제조되어 사용되며, 1배 농축액으로 희석하여 사용하기도 한다. TAE 완충용액은 트리스 염기, 아세트산, EDTA를 포함하며, EDTA는 용해 시간이 오래 걸려 제조 시 교반기를 사용한다. 유사한 용액으로는 EDTA가 없는 TA 완충용액과 아세트산 대신 붕산을 사용하는 TBE 완충용액이 있다.

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TAE 완충용액
개요
종류완충 용액
사용 목적DNA 또는 RNA 전기 영동
구성 성분트리스 (하이드록시메틸) 아미노메탄 (Tris)
아세트산 (Acetic acid)
에틸렌다이아민테트라아세트산 (EDTA)
상세 정보
풀이TAE 완충 용액은 DNA 및 RNA 전기 영동에 널리 사용되는 완충 용액이다.
특징낮은 이온 강도
장점DNA 손상 감소
더 빠른 DNA 이동 속도
단점이온 고갈로 인한 완충 능력 저하
대안TBE 완충 용액 (TBE buffer)

2. 사용

TAE(트리스-아세트산-EDTA) 완충액은 아가로스 겔 전기영동에서 실행 완충액과 겔 자체로 사용된다.[9] 변성 구배 겔 전기영동 방법에서 광범위한 돌연변이 분석을 위해 사용되기도 한다.[10] TAE는 염화 나트륨 유무에 따른 DNA 이동성 연구에 다양한 농도로 활용된다.[11] 그러나 DNA 샘플에 고농도의 염화 나트륨(및 기타 많은 염)이 존재하면 이동성이 지연되어 DNA 밴딩 패턴 해석에 영향을 미칠 수 있다.

3. 구성

TAE 완충용액은 실험실에서 주로 50배 농축액(50x) 형태로 만들어 사용하며, 필요에 따라 물로 희석하여 1배 농축액(1x)으로 사용한다. 50x TAE 완충용액은 물에 Tris 염기 242g, 아세트산 57.1ml, 50mM EDTA (pH 8.0) 용액 100ml를 넣고, 최종 부피를 1리터로 맞춰 제조한다. 1x TAE 완충용액은 Tris 40mM, 아세트산 20mM, EDTA 1mM을 포함한다.[12]

3. 1. 조성표

TAE 완충용액의 조성은 다음과 같다.

No.이름1 몰당50× 용액1× 용액
1트리스 염기121.1 g/L242.2 g/L4.844 g/L
2아세트산57.1 ml/L57.1 ml/L1.21 ml/L
3EDTA 이나트륨염 이수화물372.24 g/L18.612 g/L0.372 g/L



50× 용액을 기준으로 1× 용액을 만들 때, 트리스 염기는 2M (2000 mM)을 50으로 나눈 40 mM, 아세트산은 1M (1000 mM)을 50으로 나눈 20 mM, EDTA는 50 mM을 50으로 나눈 1 mM이 된다.[12]

EDTA는 용해하는 데 시간이 오래 걸리므로, 교반기를 사용하여 3~4회에 걸쳐 소량씩 첨가하는 것이 좋다.[12]

4. 비슷한 종류의 용액

TAE 완충용액과 비슷한 종류의 용액으로는 TA 완충용액과 TBE 완충용액이 있다. TA 완충용액은 TAE 완충용액에서 EDTA가 빠진 용액이며, TBE 완충용액은 아세트산 대신 붕산을 사용한 용액이다.[13]

4. 1. TA 완충용액

이름 그대로 TAE 완충용액의 E인 EDTA가 빠진 용액이다.

4. 2. TBE 완충용액

TBE 완충용액은 TAE 완충용액에서 아세트산(acetic acid) 대신 붕산(boric acid)을 사용한 용액이다.[13]

참조

[1] 논문 Electrophoresis in agarose and acrylamide gels 1987
[2] 논문 History and principles of conductive media for standard DNA electrophoresis http://www.cc.ahs.ch[...] 2004
[3] 서적 Molecular Cloning: A Laboratory Manual Cold Spring Harbor Laboratory Press 1989
[4] 논문 Improvements in gel composition and electrophoretic conditions for broad-range mutation analysis by denaturing gradient gel electrophoresis 1999
[5] 논문 The free solution mobility of DNA in Tris-acetate-EDTA buffers of different concentrations, with and without added NaCl 2002
[6] 웹사이트 Recipe for 50x TAE buffer https://www.protocol[...] 2018-04-06
[7] 논문 Electrophoresis in agarose and acrylamide gels 1987
[8] 저널 인용 History and principles of conductive media for standard DNA electrophoresis https://linkinghub.e[...] 2004-10
[9] 서적 Molecular Cloning: A Laboratory Manual Cold Spring Harbor Laboratory Press 1989
[10] 논문 Improvements in gel composition and electrophoretic conditions for broad-range mutation analysis by denaturing gradient gel electrophoresis 1999
[11] 논문 The free solution mobility of DNA in Tris-acetate-EDTA buffers of different concentrations, with and without added NaCl 2002
[12] 저널 인용 Recipe for 50x TAE buffer v1 https://www.protocol[...]
[13] 저널 인용 History and principles of conductive media for standard DNA electrophoresis http://www.cc.ahs.ch[...]



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