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자코바속

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목차

1. 개요

자코바속은 해양 및 고염분 환경에서 발견되는 세균 포식성 편모충류로, 이분법을 통해 무성 생식을 한다. 자코바는 두 개의 편모를 가진 자유롭게 헤엄치는 영양 세포이며, 세포 핵, 골지체, 납작한 크리스테를 가진 미토콘드리아 등의 세포 소기관을 갖는다. 특히 미토콘드리아 유전체는 다른 진핵생물보다 세균과 더 유사한 특징을 보이며, 77개의 유전자를 포함하는 환형 미토콘드리아 게놈을 가지고 있다. 현재 배양 가능한 자코바 리베라 균주는 3가지가 있으며, 자코바속에는 히스티오나, 레클리노모나스, 말라위모나스, 레토르타모나스류, 카르페디에모나스 유사 생물 등의 속이 포함된다.

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자코바속 - [생물]에 관한 문서
기본 정보
속자코바속
학명Jakoba
명명자Patterson 1990
모식종Jakoba libera
모식종 명명자(Ruinen 1938) Patterson 1990
분류
역진핵생물
미분류 계엑스카바타계
강야코베아강
목야코바목
과야코바과
하위 분류
속 종류J. bahamiensis
J. libera

2. 생활사

자코바는 무성 생식의 일종인 이분법으로 생식한다. 유성 생식 또는 낭포 형성은 관찰되지 않는다.[13][6]

3. 형태 및 특징

''자코바''는 해양[6] 및 고염분 환경[5]에서 발견되는 작은 세균 포식성 동물 편모충류(자코비드류)이다. 이들은 두 개의 편모를 가진, 자유롭게 헤엄치는 영양 세포이며, 길이는 5um~10um이다. 세포는 직선으로 헤엄치기 위해 종축을 따라 회전한다[6]}. 단, 부스러기에 압착되어 변형과 "꿈틀거림"이 발생하는 경우는 예외이다. 먹이를 먹는 동안, 세균은 후부 편모가 만들어내는 물의 흐름에 의해 물기둥에서 제거된다. 이 흐름은 세균이 세포의 오른쪽 배쪽 면에 있는 홈[7]에 모이게 하여[6] 섭취를 돕고 음식 액포를 생성한다.[7]

4. 세포 소기관

자코바의 세포 구성 요소는 특별히 독특하지 않다. 이들은 편모 기저부 근처에 위치한 단일 핵, 단일 골지체, 그리고 다른 판상 크리스테 생물군과의 관계를 시사하는 납작한 미토콘드리아 크리스테를 가지고 있다. 자코바의 미토콘드리아는 독특한 세균 유사 미토콘드리아 유전체 때문에 진화적으로 특히 흥미롭다. 자코바의 미토콘드리아 유전체는 다른 진핵생물 그룹보다 훨씬 더 많은 기능성 유전자를 포함하고 있으며, 다른 모든 미토콘드리아를 가진 진핵생물에서 바이러스형 중합효소로 대체된 조상 유세균 RNA 중합효소를 유지하고 있는 것으로 보인다. 전반적으로, 자코바류 미토콘드리아 유전체는 다른 어떤 미토콘드리아보다 프로테오박테리아 조상과 더 유사하다는 점에서 원시적으로 복잡하다.[8]

5. 미토콘드리아 유전체

자코바의 미토콘드리아는 독특한 세균 유사 미토콘드리아 유전체를 가지고 있어 진화적으로 특히 흥미롭다. 자코바의 미토콘드리아 유전체는 다른 진핵생물 그룹보다 훨씬 많은 기능성 유전자를 포함하고 있으며, 다른 모든 미토콘드리아를 가진 진핵생물에서 바이러스형 중합효소로 대체된 조상 유세균 RNA 중합효소를 유지하고 있는 것으로 보인다.[8] 전반적으로, 자코바류 미토콘드리아 유전체는 다른 어떤 미토콘드리아보다 프로테오박테리아 조상과 더 유사하다는 점에서 원시적이다.[8]

5. 1. 유전자 구성

미토콘드리아 게놈 크기는 96.6kbp이다. 염기 서열 분석은 거의 완료되었으며, 현재까지 77개의 유전자가 확인되었다. 이 중 인트론을 포함하는 유전자는 없다. 유전자 간 영역은 게놈의 약 30%를 차지하며, 단위 길이가 약 20bp인 일련의 반복 서열 클러스터를 포함한다. 전사된 유전자는 두 DNA 가닥 모두에서 발견된다. 표준 유전 암호가 번역에 사용된다.

암호화된 유전자에는 일반적으로 mtDNA에서 발견되는 유전자와 원생생물에 전형적이지만 동물 또는 곰팡이 mtDNA에는 없는 유전자, 그리고 다른 미토콘드리아 게놈에서는 드물거나 존재하지 않지만 세균에는 존재하는 유전자가 있다.

종류유전자 목록
일반적으로 mtDNA에서 발견되는 유전자nad1, 2, 3, 4, 4L, 5, 6, cob, cox1, 2, 3, atp6, 8, 9, 대단위체(rnl) 및 소단위체(rns) rRNA 유전자, 22개 이상의 tRNA 유전자
원생생물에 전형적이지만 동물 또는 곰팡이 mtDNA에는 없는 유전자nad7, 9, 11, atp1, rpl2, 5, 6, 14, 16, rps2-4, 11-14, 19
다른 미토콘드리아 게놈에서는 드물거나 존재하지 않지만 세균에는 존재하는 유전자dpo, rpoB, C, rrn5, rnpB, tufA, yejU-W 및 여러 리보솜 단백질 유전자



"J. libera" mtDNA는 또한 여러 고유한 ORF를 암호화한다.

"J. libera" mtDNA의 유전자 배열 비교는 "세균"에서는 발견되지 않지만 원 미토콘드리아가 세균 계통에서 분기된 후 미토콘드리아 게놈의 진화 과정에서 나타난 클러스터를 보여준다. 예로는 sdh3에서 nad5까지의 클러스터 (5개의 유전자 포함), atp8-[trn]-rps4-atp9, nad11-nad1-cox11-cox3-tufA가 있다.

5. 2. 특이 유전자

"자코바 리베라(Jakoba libera)" ATCC 50422 균주의 환형 미토콘드리아 게놈 크기는 96.6 kbp이다. 염기 서열 분석은 거의 완료되었다. 현재까지 77개의 유전자가 확인되었으며, 이 중 인트론을 포함하는 유전자는 없다. 유전자 간 영역은 게놈의 약 30%를 차지하며, 단위 길이가 약 20 bp인 일련의 반복 서열 클러스터를 포함한다. 전사된 유전자는 두 DNA 가닥 모두에서 발견된다. 표준 유전 암호가 번역에 사용된다.

암호화된 유전자에는 nad1,2,3,4,4L,5,6, cob, cox1,2,3, atp6,8,9, 대단위체(rnl) 및 소단위체(rns) rRNA 유전자, 그리고 22개 이상의 tRNA 유전자를 포함하여 일반적으로 mtDNA에서 발견되는 유전자가 포함된다. 또한 원생생물에 전형적이지만 동물 또는 곰팡이 mtDNA에는 없는 nad7,9,11, atp1, rpl2,5,6,14,16, rps2-4,11-14,19를 포함한 여러 단백질 유전자도 존재한다. "J. libera" mtDNA는 또한 여러 고유한 ORF를 암호화한다.

"J. libera"의 여러 미토콘드리아 유전자는 다른 미토콘드리아 게놈에서는 드물거나 존재하지 않지만 세균에는 존재한다. 이러한 희귀하거나 고유한 mtDNA 암호화 유전자 중에는 dpo, rpoB,C, rrn5, rnpB, tufA, yejU-W 및 여러 리보솜 단백질 유전자가 있다.

"J. libera" mtDNA의 유전자 배열 비교는 "세균"에서는 발견되지 않지만 원 미토콘드리아가 세균 계통에서 분기된 후 미토콘드리아 게놈의 진화 과정에서 나타난 클러스터를 보여준다. 예로는 sdh3에서 nad5까지의 클러스터(5개의 유전자 포함), atp8-[trn]-rps4-atp9 및 nad11-nad1-cox11-cox3-tufA가 있다.

5. 3. 유전자 배열

"자코바 리베라"(Jakoba libera) ATCC 50422 균주의 환형 미토콘드리아 게놈 크기는 96.6kbp이다. 염기 서열 분석은 거의 완료되었다. 현재까지 77개의 유전자가 확인되었으며, 이 중 인트론을 포함하는 유전자는 없다. 유전자 간 영역은 게놈의 약 30%를 차지하며, 단위 길이가 약 20bp인 일련의 반복 서열 클러스터를 포함한다. 전사된 유전자는 두 DNA 가닥 모두에서 발견된다. 표준 유전 암호가 번역에 사용된다.

암호화된 유전자에는 nad1,2,3,4,4L,5,6, cob, cox1,2,3, atp6,8,9, 대단위체(rnl) 및 소단위체(rns) rRNA 유전자, 그리고 22개 이상의 tRNA 유전자를 포함하여 일반적으로 mtDNA에서 발견되는 유전자가 포함된다. 또한 원생생물에 전형적이지만 동물 또는 곰팡이 mtDNA에는 없는 nad7,9,11, atp1, rpl2,5,6,14,16, rps2-4,11-14,19를 포함한 여러 단백질 유전자도 존재한다. "J. libera" mtDNA는 또한 여러 고유한 ORF를 암호화한다.

"J. libera"의 여러 미토콘드리아 유전자는 다른 미토콘드리아 게놈에서는 드물거나 존재하지 않지만 세균에는 존재한다. 이러한 희귀하거나 고유한 mtDNA 암호화 유전자 중에는 dpo, rpoB,C, rrn5, rnpB, tufA, yejU-W 및 여러 리보솜 단백질 유전자가 있다.

"J. libera" mtDNA의 유전자 배열 비교는 "세균"에서는 발견되지 않지만 원 미토콘드리아가 세균 계통에서 분기된 후 미토콘드리아 게놈의 진화 과정에서 나타난 클러스터를 보여준다. 예로는 sdh3에서 nad5까지의 클러스터(5개의 유전자 포함), atp8-[trn]-rps4-atp9 및 nad11-nad1-cox11-cox3-tufA가 있다.

6. 배양

현재 배양 가능한 자코바 리베라( ''Jakoba libera'') 3가지 균주가 있다. 이들은 무균 배양은 불가능하지만, 박테리아 (''Klebsiella aerogenes'')를 첨가한 최소 배지에서 쉽게 배양할 수 있다.[6]

7. 유사 속


  • '''히스티오나''': 2~3종
  • '''레클리노모나스''': 1종[10]
  • '''말라위모나스''': 1종이 기술됨

참조

[1] 논문 Toward Resolving the Eukaryotic Tree: The Phylogenetic Positions of Jakobids and Cercozoans 2007-08
[2] 문서 On core jakobids and excavate taxa: the ultrastructure of Jakoba incarcerata https://doi.org/10.1[...] 2001
[3] 문서 Jakoba libera (Ruinen, 1938) a heterotrophic flagellate from deep oceanic sediments 1990
[4] 서적 Eine Enzyklopädie zu eponymischen Pflanzennamen https://doi.org/10.3[...] Botanic Garden and Botanical Museum, Freie Universität Berlin 2022-01-27
[5] 웹사이트 Jakoba libera http://tolweb.org/Ja[...] The Tree of Life Web Project 2012-04-03
[6] 웹사이트 Jakoba http://www.bch.umont[...] Protist Image Database 2012-04-03
[7] 웹사이트 Jakoba libera http://eol.org/pages[...] Encyclopedia of Life 2012-04-03
[8] 웹사이트 Jakobida http://tolweb.org/Ja[...] The Tree of Life Web Project 2012-04-13
[9] 웹사이트 Jakoba libera Mitochondria genome organization, gene content, genetic code http://megasun.bch.u[...] 2012-04-03
[10] 웹사이트 Introduction to the jakobid flagellates http://megasun.bch.u[...] Protist Image Database 2012-04-12
[11] 저널 Toward Resolving the Eukaryotic Tree: The Phylogenetic Positions of Jakobids and Cercozoans http://linkinghub.el[...]
[12] 웹인용 Jakoba libera http://tolweb.org/Ja[...] The Tree of Life Web Project 2012-04-03
[13] 웹인용 Jakoba http://www.bch.umont[...] Protist Image Database 2012-04-03


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