인테그론

3. 구조

인테그론은 재조합효소를 코딩하는 유전자(''intI''), 재조합 부위(''attI''), 프로모터(''Pc'')를 기본적으로 포함한다.^{[21][22][6][7][14][15]}

3. 1. 핵심 구성 요소

• 부위-특이적 재조합효소를 코딩하는 유전자 ''intI'': 인테그라제 패밀리에 속한다.
• 근위 재조합 부위 ''attI'': 인테그론효소(integrase)에 인식되는 부위. 유전자 카세트가 삽입될 수 있다.^[23][8][16]
• 프로모터 ''Pc'': 카세트 인코딩된 유전자의 전사를 지시한다.

3. 2. 유전자 카세트

4. 인테그론 기능

인테그론은 항생제 내성에서의 역할을 통해 접합 플라스미드(conjugative plasmid)에서 처음 발견되었다.^[20] 이동성 인테그론은 항생제 내성과 직접 관련된 유전자를 포함한 다양한 카세트를 운반한다. 인테그론은 염색체 요소이며, 플라스미드로의 이동은 트랜스포존과 과도한 항생제 사용에 의해 촉진된다. 염색체 인테그론에서 발견되는 카세트의 대부분은 기능이 밝혀지지 않았다.

4. 1. 주요 기능 메커니즘

• 부위 특이적 재조합 효소를 코딩하는 유전자 ''intI''
• 재조합 효소에 의해 인식되어^[16] 유전자 카세트가 삽입되는 근위 재조합 부위 ''attI''
• 카세트에 코딩된 유전자를 직접 전사하는 프로모터 ''Pc''
• 유전자 카세트

4. 2. 추가 기능 정보

5. 존재

인테그론은 처음에는 항생제 내성에 관여하는 역할 때문에 접합성 플라스미드에서 발견되었다.^[2] 실제로, 이러한 이동성 인테그론은 항생제 내성과 관련된 유전자를 포함하는 다양한 카세트를 운반할 수 있다. 추가 연구를 통해 인테그론이 염색체 요소이며, 플라스미드로의 동원은 트랜스포존에 의해 촉진되었고 항생제의 집중적인 사용에 의해 선택되었다는 결론에 도달했다. 염색체 인테그론에서 발견되는 대부분의 카세트 기능은 아직 알려지지 않았다.^[13]

인테그론은 플라스미드나 트랜스포존 등의 이동 유전자 요소의 일부로 존재한다. 또한, 염색체 중에서도 발견된다.

6. 용어

처음으로 슈퍼-인테그론(''super-integron'')이라는 용어가 적용된 것은 ''비브리오 콜레라''의 작은 염색체에 긴 카세트 배열을 갖는 인테그론이었다.^[24][25] 이후 이 용어는 다양한 카세트 배열 길이의 인테그론 또는 박테리아 염색체의 인테그론(예: 플라스미드)에 사용되었다. 현재 "슈퍼 인테그론"은 그 의미가 명확하지 않기 때문에 사용을 권장하지 않는다.

1998년에 "슈퍼 인테그론"이라는 용어가 처음 사용되었지만, 정의 없이 콜레라균의 작은 염색체에 긴 카세트 배열을 가진 인테그론에 적용되었다.^[10][11] 이후 이 용어는 다양한 카세트 배열 길이의 인테그론 또는 세균 염색체상의 인테그론(예: 플라스미드와 비교)에 사용되었다. "슈퍼 인테그론"의 의미가 불분명해짐에 따라, 현재는 이 용어의 사용이 권장되지 않는다.^[10]

더 현대적인 용법에서는 세균 염색체에 위치한 인테그론을 "정착성 염색체 인테그론"이라고 부르며, 전이인자 또는 플라스미드와 관련된 인테그론을 "이동성 인테그론"이라고 부른다.^[12]

참조

_[1] 논문 "ASMscience {{!}} The Integron: Adaptation On Demand" http://www.asmscienc[...]
_[2] 논문 Integrons: agents of bacterial evolution
_[3] 논문 Mobile gene cassettes and integrons: capture and spread of genes by site-specific recombination 2006-10-27
_[4] 논문 Structural basis for broad DNA-specificity in integron recombination http://dx.doi.org/10[...] 2006
_[5] 논문 The SOS Response Controls Integron Recombination https://www.science.[...] 2009-05-22
_[6] 논문 Mobile Gene Cassettes and Integrons
_[7] 논문 Mobile gene cassettes and integrons in evolution.
_[8] 논문 Mobile gene cassettes and integrons: Capture and spread of genes by site-specific recombination
_[9] 논문 Profile and resistance levels of 136 integron resistance genes 2023
_[10] 논문 Integrons or super integrons?
_[11] 논문 A Distinctive Class of Integron in the Vibrio cholerae Genome
_[12] 논문 Differences in Integron Cassette Excision Dynamics Shape a Trade-Off between Evolvability and Genetic Capacitance 2017-05-03
_[13] 논문 Integrons: agents of bacterial evolution https://www.ncbi.nlm[...] 2006-08
_[14] 논문
_[15] 논문 Mobile gene cassettes and integrons in evolution https://www.ncbi.nlm[...] 1999-05-18
_[16] 논문 Mobile gene cassettes and integrons: Capture and spread of genes by site-specific recombination
_[17] 논문 Integrons or super integrons?
_[18] 논문 A Distinctive Class of Integron in the Vibrio cholerae Genome
_[19] 논문 "ASMscience {{!}} The Integron: Adaptation On Demand" http://www.asmscienc[...]
_[20] 논문 Integrons: agents of bacterial evolution
_[21] 논문 Mobile Gene Cassettes and Integrons
_[22] 논문 Mobile gene cassettes and integrons in evolution.
_[23] 논문 Mobile gene cassettes and integrons: Capture and spread of genes by site-specific recombination
_[24] 논문 Integrons or super integrons?
_[25] 논문 A Distinctive Class of Integron in the Vibrio cholerae Genome