쿠마시 브릴리언트 블루
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1. 개요
쿠마시 브릴리언트 블루는 다양한 종류의 청색 염료를 지칭하는 이름으로, 19세기 말 염료 제조 회사에서 상표명으로 사용되었다. 쿠마시 브릴리언트 블루는 단백질의 정량 분석법인 브래드퍼드 분석법과 전기영동, 웨스턴 블랏 등에 사용되며, 망막 수술 보조제와 척수 손상 치료 연구에도 활용된다. 또한, 지문 분석에도 적용되어 생물학적 성별 식별에 기여한다.
"쿠마시"라는 이름은 19세기 말, 영국 브래클리 기반 염료 제조업체인 레빈스타인(Levinstein Ltd)이 산성 울 염색약 상표명으로 채택하면서 사용되기 시작했다.[36] 1896년 제4차 앵글로 아샨티 전쟁 당시, 영국군이 쿠마시(현대 가나의 쿠마시)를 점령하면서 이 이름이 알려지게 되었다. 레빈스타인은 1918년 브리티시염료, 1926년 ICI(Imperial Chemical Industries)의 일부가 되었다.[37] ICI는 현재도 쿠마시 상표권을 보유하고 있으나, 염료를 생산하지는 않는다.
쿠마시 브릴리언트 블루 염료는 용액의 산성도(pH)에 따라 색이 변하며, 단백질이나 도데실황산 나트륨(SDS)과 같은 특정 화학 물질과 결합하는 성질을 가지고 있다. 이러한 성질은 브래드포드 분석법 등 단백질 농도 측정에 활용된다.
2. 이름과 발견
청색 디설폰화 트리페닐 메탄 염료는 1913년 독일 엘버펠트의 막스 웨일러가 처음 제조했다.[38] 이후 유기 합성에 대한 다양한 특허가 출원되었다.
생화학 저널에 발표된 논문들은 사용된 염료를 명확히 밝히지 않고 단순히 "쿠마시"라고만 칭하는 경우가 많다. 색상 지수에는 "쿠마시"라는 이름이 포함된 염료가 40개 이상 등재되어 있다. 머크 색인(10판)에는 구조가 다른 쿠마시 블루 RL(Coomassie Blue RL) (Acid Blue 92, CI 13390)도 수록되어 있다.
2. 1. 명칭의 유래
쿠마시(Coomassie)라는 이름은 19세기 말 블랙리(Blackley)에 위치한 염료 제조사 레빈스타인 유한회사(Levinstein Ltd)가 다양한 종류의 산성 양모 염료를 판매하면서 상표명으로 채택했다.[2] 1896년 제4차 영국-아샨티 전쟁 동안 영국군은 가나(Ghana)의 현대적인 쿠마시(Kumasi)인 쿠마시(Coomassie)를 점령했다. 1918년 레빈스타인 유한회사는 영국 염료 회사(British Dyestuffs)의 일부가 되었고, 1926년에는 임페리얼 케미컬 인더스트리(Imperial Chemical Industries)의 일부가 되었다.[3] ICI는 여전히 쿠마시(Coomassie) 상표를 소유하고 있지만, 더 이상 이 염료를 생산하지는 않는다.
푸른색 이황산화 트리페닐메탄 염료는 1913년 독일 엘버펠트(Elberfeld)에 거주하던 막스 바이러(Max Weiler)에 의해 처음 생산되었다.[4] 이후 유기 합성에 대한 다양한 특허가 출원되었다.[5][6][7]
생화학 저널에 발표된 논문은 어떤 염료가 사용되었는지 명시하지 않고 이러한 염료를 단순히 "쿠마시(Coomassie)"라고 언급하는 경우가 많다. 실제로, 색상 지수는 이름에 "쿠마시(Coomassie)"가 포함된 40개 이상의 염료를 나열하고 있다. 다른 쿠마시 "블루" 염료도 있다. 예를 들어, 머크 색인(Merck Index) (10판)에는 구조가 완전히 다른 쿠마시 블루 RL (산성 블루 92, C.I. 13390)이 나열되어 있다.
쿠마시(Kumasi)라는 이름은 가나의 도시 쿠마시에서 유래되었으며, 개발 당시(19세기 말) 영국이 이곳을 식민지화한 것을 기념하고 있다. 이 외에도 염료 이름에는 수단, 콩고 등 아프리카 지명을 딴 것이 많다.
2. 2. 초기 개발 역사
"쿠마시(Coomassie)"라는 이름은 19세기 말 블랙리에 위치한 염료 제조사 레빈스타인 유한회사가 다양한 종류의 산성 양모 염료를 판매하면서 상표명으로 채택했다.[2] 1896년 제4차 영국-아샨티 전쟁 동안 영국군은 가나의 현대적인 쿠마시인 쿠마시(Coomassie)를 점령했다. 1918년 레빈스타인 유한회사는 영국 염료 회사(British Dyestuffs)의 일부가 되었고, 1926년에는 임페리얼 케미컬 인더스트리(Imperial Chemical Industries)의 일부가 되었다.[3] ICI는 여전히 쿠마시 상표를 소유하고 있지만, 더 이상 이 염료를 생산하지는 않는다.
푸른색 이황산화 트리페닐메탄 염료는 1913년 독일 엘버펠트에 거주하던 막스 바이러(Max Weiler)에 의해 처음 생산되었다.[4] 이후 유기 합성에 대한 다양한 특허가 출원되었다.[5][6][7]
생화학 저널에 발표된 논문은 어떤 염료가 사용되었는지 명시하지 않고 이러한 염료를 단순히 "쿠마시"라고 언급하는 경우가 많다. 실제로, 색상 지수는 이름에 "쿠마시"가 포함된 40개 이상의 염료를 나열하고 있다. 다른 쿠마시 "블루" 염료도 있다. 예를 들어, 머크 색인 (10판)에는 구조가 완전히 다른 쿠마시 블루 RL (산성 블루 92, C.I. 13390)이 나열되어 있다.
3. 염료의 특성
3. 1. 화학적 성질
쿠마시 브릴리언트 블루 R-250의 이름에 있는 "R"은 붉은색(Red)을 의미하며, 이는 푸른색 염료가 약간 붉은 기를 띠기 때문이다. "G" 변종은 파란색이 좀 더 녹색을 띤다. "250"은 원래 염료의 순도를 나타내는 숫자였다.
두 염료의 색깔은 용액의 산성도(pH)에 따라 달라진다. "G" 형태 염료에 대한 연구가 자세히 이루어졌다.[39] pH가 0보다 낮으면 염료는 465nm 파장에서 최대 흡수를 보이는 붉은색을 나타낸다. pH가 대략 1 정도에서는 620nm에서 최대 흡수를 보이는 녹색을 나타내며, pH 2 이상에서는 595nm에서 최대 흡수를 보이는 밝은 파란색을 띤다. pH 7에서 염료는 43,000 M-1 cm-1의 흡광 계수를 가진다.[39]
염료는 단백질의 아미노기 및 카복실기와 정전기적으로 상호작용하지만, 비공유 결합을 한다. 염료 분자는 양모(케라틴)를 포함한 단백질과 결합하여 단백질-염료 복합체를 형성한다. 복합체가 형성되면 용액 내 대부분의 분자가 양이온 형태를 띠는 산성 조건에서도 음전하를 띤 염료의 음이온 형태가 안정화되어 파란색을 띠게 된다.[40] 이는 단백질에 결합하는 쿠마시 브릴리언트 블루 염료를 사용하는 단백질 정량 분석법인 브래드포드 분석법의 기본 원리이다. 염료가 단백질에 결합하면 염료의 최대 흡수 파장이 465nm에서 595nm로 이동하며, 595nm에서의 흡수 증가를 측정하여 단백질의 농도를 알 수 있다.[41]
염료는 음이온성 계면활성제인 도데실황산 나트륨(SDS)과도 복합체를 형성한다.[42] 이 복합체 형성은 중성 상태의 녹색 염료 형태를 안정화시킨다. 이러한 효과는 브래드포드 분석법을 이용한 단백질 농도 추정에 방해가 될 수 있다. 또한, 음이온성 계면활성제는 단백질과 결합하기 위해 염료와 경쟁하는 경향이 있다.
3. 2. 색 변화와 산도(pH)
쿠마시 브릴리언트 블루 R-250의 이름에 있는 "R"은 붉은색(Red)을 의미하며, 이는 파란색 염료가 약간 붉은 기운을 띠기 때문이다. "G" 변종은 파란색이 좀 더 녹색을 띤다. "250"은 원래 염료의 순도를 나타내는 숫자였다.
두 염료의 색깔은 용액의 산도(pH)에 따라 달라진다. "G" 형태 염료에 대한 연구가 자세히 이루어졌다.[39] pH가 0보다 낮으면 염료는 465nm 파장에서 최대 흡수를 나타내는 붉은색을 띤다. pH가 대략 1 정도에서는 620nm에서 최대 흡수를 보이는 녹색을 나타내며, pH 2 이상에서는 595nm에서 최대 흡수를 보이는 밝은 파란색을 띤다. pH 7에서 염료는 43,000 M-1 cm-1의 흡광 계수를 가진다.[39]
염료는 단백질의 아미노기 및 카복실기와 정전기적으로 상호작용하지만, 비공유 결합을 형성한다. 염료 분자는 양모(케라틴)를 포함한 단백질과 결합하여 단백질-염료 복합체를 만든다. 이 복합체가 형성되면, 용액 내 대부분의 분자가 양이온 형태를 띠는 산성 조건에서도 음전하를 띤 음이온 형태의 염료가 안정화되어 파란색을 띠게 된다.[40] 이는 쿠마시 브릴리언트 블루 염료를 사용하여 단백질을 정량하는 브래드포드 분석법의 기본 원리이다. 염료가 단백질에 결합하면, 염료의 최대 흡수 파장이 465nm에서 595nm로 이동한다. 595nm에서의 흡수 증가를 측정하여 단백질 농도를 알 수 있다.[41]
염료는 음이온성 세제인 SDS(sodium dodecylsulfate)와도 복합체를 형성한다.[42] 이 복합체는 중성 상태의 녹색 염료 형태를 안정화시킨다. 이러한 현상은 브래드포드 분석법을 이용한 단백질 농도 측정에 방해가 될 수 있다. 또한, 음이온성 세제는 단백질과 결합하기 위해 염료와 경쟁하는 경향이 있다.
3. 3. 단백질과의 결합
쿠마시 브릴리언트 블루는 단백질의 아미노기 및 카복실기와 정전기적으로 상호작용하지만, 비공유 결합을 통해 결합한다. 염료 분자는 양모(케라틴)를 포함한 단백질과 결합하여 단백질-염료 복합체를 형성한다. 이러한 복합체 형성은 용액 내 대부분의 분자가 양이온 형태를 띠는 산성 조건에서도 음전하를 띤 염료의 음이온 형태를 안정화시켜 파란색을 띠게 한다.[40] 이는 브래드포드 분석법의 기본 원리로, 쿠마시 브릴리언트 블루 염료가 단백질에 결합하는 성질을 이용한다. 염료가 단백질에 결합하면 최대 흡수 파장이 465nm에서 595nm로 이동하며, 595nm에서의 흡광도 증가를 측정하여 단백질의 농도를 알 수 있다.[41]
이 염료는 음이온성 세제인 도데실황산 나트륨(SDS)과도 복합체를 형성할 수 있다.[42] 이러한 복합체 형성은 중성 상태의 녹색 염료 형태를 안정화시키는데, 이는 브래드포드 분석법을 이용한 단백질 농도 측정에 방해가 될 수 있다. 또한, 음이온성 세제는 단백질과의 결합을 두고 염료와 경쟁 관계를 형성한다.
4. 생화학 분야의 응용
쿠마시 브릴리언트 블루 R-250은 1963년 파제카스 드 생 그로스와 동료들이 단백질 시각화에 처음 사용했다. 단백질 샘플은 아세트산 셀룰로스 시트에서 전기영동으로 분리되었다. 그런 다음 시트를 단백질 밴드를 고정하기 위해 술포살리실산에 담그고 염료 용액으로 옮겼다.[11]
1965년, Meyer와 Lambert는 폴리아크릴아마이드 젤에서 전기영동 분리 후 단백질 샘플을 염색하기 위해 쿠마시 브릴리언트 블루 R-250을 사용했다. 그들은 메탄올, 아세트산 및 물을 포함하는 염료 용액에 젤을 담갔다. 염료가 단백질뿐만 아니라 폴리아크릴아마이드 젤도 염색했기 때문에 단백질 밴드를 시각화하기 위해 젤을 탈색해야 했는데, 이를 전기영동으로 수행했다.[12] 이후 연구에서는 아세트산 용액을 사용하여 폴리아크릴아마이드 젤을 성공적으로 탈색할 수 있다고 보고했다.
1967년에는 G 형태의 염료를 사용하여 폴리아크릴아마이드 젤에서 단백질 밴드를 시각화한 최초의 보고서가 발표되었으며, 염료는 메탄올을 함유한 아세트산 용액에 용해되었다.[13] 그 후, 메탄올이 없는 트리클로로아세트산 용액에서 G 형태의 염료 콜로이드를 사용하여 폴리아크릴아마이드를 염색하지 않고 단백질 밴드를 염색할 수 있다는 사실이 밝혀졌다. 이 절차를 사용하면 더 이상 젤을 탈색할 필요가 없었다.[14] 현대 제형은 일반적으로 인산, 에탄올 (또는 메탄올) 및 황산 암모늄 (또는 황산 알루미늄)을 포함하는 용액에서 G 형태의 염료 콜로이드를 사용한다.[15][16][17][18]
4. 1. 브래드퍼드 단백질 정량법
브래드포드 분석법은 용액 내 단백질의 양을 측정하기 위해 쿠마시 브릴리언트 블루 G-250의 스펙트럼 특성을 이용한다.[43] 단백질 샘플을 인산과 에탄올이 들어있는 염료 용액에 첨가한다. 산성 조건에서 염료는 보통 갈색을 띠지만, 단백질에 결합하면 파란색을 띤다. 용액의 흡광도는 595nm 파장에서 측정한다. 이 염료는 5 μg의 단백질만으로도 그 차이를 구분할 수 있을 정도로 민감하다.[44] 하지만, 이 방법은 단백질의 종류에 따라 색 발달 정도가 다르다는 단점이 있다. 즉, 단백질의 단위 질량 당 흡광도 변화는 단백질의 형태에 따라 달라진다.[44]음전하를 띤 쿠마시 브릴리언트 블루 G-250 염료 분자는 단백질에 결합하면 단백질이 전반적으로 음전하를 띠게 한다. 이 특성은 블루 네이티브 PAGE라는 기술에서 비변성 조건 하에 폴리아크릴아마이드 겔 전기영동을 사용하여 단백질 또는 단백질 복합체를 분리하는 데 사용될 수 있다.[45][46] 폴리아크릴아마이드 겔에서 복합체의 이동성은 단백질 복합체의 크기(즉, 분자량)와 단백질에 결합된 염료의 양 모두에 의존한다.
쿠마시 블루 염색은 로딩 컨트롤 염색 방법으로 웨스턴 블랏 분석에 사용될 수도 있다.[47] 음이온성 사전 항체 염료로 적용된다.
4. 2. 전기영동 (SDS-PAGE, Blue Native-PAGE)
단백질에 결합하면 음전하를 띠는 쿠마시 브릴리언트 블루 G-250 염료 분자는 단백질이 전반적으로 음전하를 띠게 한다.[45] 이러한 특징은 블루 네이티브 PAGE(Blue Native PAGE)라는 기술에서 비변성 조건 하에서 폴리아크릴아마이드 겔 전기영동을 사용하여 단백질 또는 단백질 복합체를 분리하는 데 사용될 수 있다.[46] 폴리아크릴아마이드 겔에서 복합체의 이동성은 단백질 복합체의 크기(즉, 분자량)와 단백질에 결합된 염료의 양 모두에 의존한다.쿠마시 블루 염색은 웨스턴 블롯 분석에서 로딩 컨트롤 염색 방법으로 사용할 수 있다.[23] 음이온성 사전 항체 염료로 적용된다.
쿠마시는 도데실황산나트륨(SDS)-폴리아크릴아미드 겔 전기영동(SDS-PAGE) 염색에 사용된다(보통 R250을 사용한다). 감도는 은 염색보다 낮지만, 염색액에 담가 탈색하는 것만으로(1시간 정도면 된다) 간단하기 때문에 널리 사용된다. 투명한 겔 안에서 단백질이 파란 밴드로 보인다. SDS-PAGE에서는 단백질 분자를 SDS로 변성시켜 전기영동하므로 펩티드 사슬의 길이에 따라(즉, 분자량에 따라) 분리할 수 있다.
이 외에도 SDS를 사용하지 않고, 대신 쿠마시로 처리한 단백질을 전기영동하는 방법(블루 네이티브 PAGE, BN-PAGE)도 있다. 이를 사용하면 변성되지 않은 자연 상태에 가까운 단백질 분자를, 그 분자(또는 분자 복합체)의 분자량이 아닌 크기에 따라 분리할 수 있다. 쿠마시 분자는 음전하를 가지므로, 이를 단백질에 섞으면 단백질 분자가 음으로 띠게 되어 모두 양극으로 이동하게 된다(SDS와 같은 효과).
4. 3. 웨스턴 블랏 (Western Blot)
쿠마시 블루 염색은 웨스턴 블랏 분석에서 로딩 컨트롤(loading control) 염색법으로 사용할 수 있다.[47] 이것은 음이온 전-항체 염색으로 적용된다.5. 의료 분야의 응용
브릴리언트 블루 G는 상표명 '브릴리언트 필(Brilliant Peel)'로 망막 외과 수술에 사용된다.[48]
2009년에는 실험 쥐의 척수 손상 치료를 위한 과학적 실험에 사용되었다.[24] 이 물질은 신체의 자연적인 부기 반응을 감소시켜 해당 부위의 뉴런이 대사 스트레스로 인해 죽는 것을 막는 작용을 한다. 쥐 실험에서 염료를 투여받은 쥐가 그렇지 않은 쥐보다 운동 검사에서 더 나은 결과를 보였다.[25] 그러나 이 치료법이 인간에게 효과적인지는 아직 알려지지 않았다. 동물 실험에서는 부상 후 15분 이내에 염료를 투여했지만, 실제 상황에서는 환자가 응급실에 도착하는 데 시간이 걸릴 수 있으므로, 부상 후 최대 2시간까지 투여해도 효과가 있어야 한다. 보고된 유일한 부작용은 쥐가 일시적으로 파란색으로 변했다는 것이다.[24][26][27]
5. 1. 망막 수술 보조제
브릴리언트 블루 G는 상표명 브릴리언트 필(Brilliant Peel)로 망막 외과 수술에 사용된다.[48] 2019년 12월에는 브릴리언트 블루 G (상품명 TissueBlue, DORC International, 네덜란드)가 미국에서 인체 사용 승인을 받았으며[29][30][31], 2021년 1월에는 Tissueblue가 캐나다에서 의료용으로 승인되었다.[32][33]6. 법과학 분야의 응용
쿠마시 염료는 방향족 그룹(페닐알라닌, 티로신, 트립토판)과 염기성 측쇄(라이신, 아르기닌, 히스티딘)를 가진 아미노산을 표적할 수 있다. 이러한 특성 덕분에 지문 분석에 브래드포드 분석법을 사용할 수 있게 되었다. 이 분석법은 지문의 생물학적 성별을 식별하는 데 성공적으로 사용되었는데, 유사한 파장에서 테스트했을 때 여성 샘플이 남성 샘플보다 더 높은 흡광도를 나타냈다. 이는 분석해야 하는 아미노산의 수를 23개에서 6개로 줄여 지문 분석을 더 간단하게 만든다. 또한, 가열 및 효소 반응과 같은 분석 준비가 필요한 닌히드린 화학 분석법과 달리 분석 준비가 거의 또는 전혀 필요하지 않다는 장점이 있다.
7. 추가 정보
(참조할 원본 소스가 제공되지 않았으므로, 이전 출력을 수정할 수 없습니다. 원본 소스가 제공되면 지침에 따라 수정하겠습니다.)
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