곁사슬
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1. 개요
곁사슬은 화학에서 사용되는 용어로, 화합물의 구조식에서 알킬기를 나타내는 "R" 기호로 자주 사용된다. IUPAC 정의에 따르면 고분자 사슬에서 올리고머 또는 중합체 분지를 의미한다. 19세기 프랑스 화학자 샤를 프레데리크 제라르가 처음 제안했으며, 라틴어, 프랑스어, 독일어 등 여러 언어에서 "근원" 또는 "잔여물"을 의미하는 단어의 첫 글자가 "R"인 데 착안했다. 유기화학에서 곁사슬은 고분자 사슬에서 뻗어나온 가지를 의미하며, 중합체의 결정성 및 밀도에 영향을 미친다. 생화학에서는 단백질을 구성하는 아미노산 잔기의 알파 탄소에 부착되어 있으며, 아미노산의 전하 및 극성을 결정하고 단백질의 접힘과 기능에 중요한 역할을 한다.
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곁사슬 | |
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개요 | |
정의 | 주사슬에 붙어 있는 화학 그룹 |
다른 용어 | 펜던트 그룹, 측기 |
2. 관례
화합물의 구조식에서 알킬기(포화 탄화수소) 곁사슬은 일반적으로 "R"로 표시된다. 탄소가 아닌 작용기는 "X", "Y", "Z"로 나타낸다.[16] 국제 순수·응용 화학 연합(IUPAC) 정의에 따르면, 곁사슬은 고분자 사슬에서 올리고머 또는 중합체 가지를 의미한다. 올리고머 분지는 짧은 사슬 분지로, 중합체 분지는 긴 사슬 분지로 명명될 수 있다.
"R" 기호는 19세기 프랑스의 화학자 샤를 프레데리크 제라르가 제안했다.[17] 제라르는 여러 유럽의 언어에서 "근원(root)" 또는 "잔여물(residue)"을 의미하는 단어의 첫 글자가 "R"이라는 점에 착안하여 이 기호를 도입했는데,[17] 이는 라틴어 "radix"(뿌리), "residuum"(잔여물), 프랑스어 "racine"(뿌리), "résidu"(잔여물), 독일어 "Rest"(잔여물, 나머지) 등과 관련이 있다.[17][3][10]
화학 구조식에서, 알킬기(포화 탄화수소) 곁사슬을 나타내는 일반적인 대용어로 '''R'''이 자주 사용된다. 구조도에서 그 외의 탄소 이외의 기를 나타내는 경우에는, '''X''', '''Y''', '''Z'''가 자주 사용된다.
3. 역사
4. 용법
4. 1. 유기화학
화합물의 구조식에서 "'''R'''"은 일반적으로 알킬기(포화 탄화수소)를 나타내는 곁사슬로 자주 사용된다. 화합물의 구조식에서 비탄소 작용기는 "X", "Y" 또는 "Z"로 나타낸다.
고분자과학에서 곁사슬은 올리고머 또는 중합체의 가지로, 고분자의 주쇄로부터 뻗어 나온다. 곁사슬은 고분자의 특성, 특히 결정성과 밀도에 상당한 영향을 미친다. 올리고머 가지는 짧은 사슬 가지라고 할 수 있고, 고분자 가지는 긴 사슬 가지라고 할 수 있다. 측기(펜던트기)는 곁사슬과 다르며, 올리고머도 고분자도 아니다.[18][4][11] 고분자 화학에서는 올리고머나 폴리머의 분기 측쇄는 폴리머의 주쇄에서 뻗어 나온 것을 말한다. 측쇄는 폴리머의 특성(주로 결정화도와 밀도)에 큰 영향을 미친다. 올리고머의 분기는 단쇄 분기(short-chain branch|쇼트 체인 브랜치영어)라고 불리며, 폴리머의 분기는 장쇄 분기(long-chain branch|롱 체인 브랜치영어)라고 불리는 경우가 있다.[11]
4. 2. 생화학
단백질은 아미노산 잔기로 구성되며, 곁사슬은 아마이드 골격의 알파 탄소 원자에 부착되어 있다. 알파 탄소에 연결된 곁사슬은 각각의 아미노산에 특이적이고, 아미노산의 전하 및 극성을 결정하는 역할을 한다.[19] 또한 아미노산의 곁사슬은 적절한 단백질 접힘 및 단백질의 기능을 유도하는 많은 상호작용을 일으킨다.[19] 극성이 비슷한 아미노산들은 보통 서로 끌어당기고, 반면 비극성 및 극성 곁사슬들은 보통 서로 밀어낸다. 비극성/극성 상호작용은 단백질 전체에서 상대적으로 많이 일어나기 때문에 2차 구조를 안정화시키는데 중요한 역할을 할 수 있다.[20] 곁사슬 원자의 공간적 위치는 곁사슬 재구성을 위한 계산 도구를 사용하여 단백질 주쇄 기하학을 기반으로 예측할 수 있다.[7]
5. 관련 항목
참조
[1]
논문
Glossary of basic terms in polymer science (IUPAC Recommendations 1996)
http://pac.iupac.org[...]
[2]
서적
Organic Chemistry, 7th Edition
https://archive.org/[...]
Pearson Prentice Hall
[3]
간행물
[4]
서적
IUPAC Compendium of Chemical Terminology
http://goldbook.iupa[...]
IUPAC
[5]
서적
Fundamentals of Biochemistry: Life at the Molecular Level
https://archive.org/[...]
John Wiley & Sons, Inc.
2013
[6]
논문
Stabilizing nonpolar/polar side-chain interactions in the alpha-helix
2001-12-01
[7]
논문
Computational reconstruction of atomistic protein structures from coarse-grained models
2019-12-26
[8]
논문
Glossary of basic terms in polymer science (IUPAC Recommendations 1996)
http://pac.iupac.org[...]
[9]
서적
Organic Chemistry, 7th Edition
Pearson Prentice Hall
[10]
간행물
[11]
서적
IUPAC Compendium of Chemical Terminology
http://goldbook.iupa[...]
IUPAC
[12]
서적
Fundamentals of Biochemistry: Life at the Molecular Level
John Wiley & Sons, Inc.
2013
[13]
논문
Stabilizing nonpolar/polar side-chain interactions in the alpha-helix
2001-12-01
[14]
논문
Computational reconstruction of atomistic protein structures from coarse-grained models
2019-12-26
[15]
서적
Organic Chemistry, 7th Edition
Pearson Prentice Hall
[16]
저널
Glossary of basic terms in polymer science (IUPAC Recommendations 1996)
http://pac.iupac.org[...]
2019-05-16
[17]
간행물
[18]
서적
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http://goldbook.iupa[...]
IUPAC
[19]
서적
Fundamentals of Biochemistry: Life at the Molecular Level
John Wiley & Sons, Inc.
2013
[20]
저널
Stabilizing nonpolar/polar side-chain interactions in the alpha-helix
2001-12-01
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