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셀레노시스테인

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1. 개요

셀레노시스테인은 시스테인의 셀레늄 유사체로, 생체 내에서는 공기 산화에 민감하여 산화된 형태인 셀레노시스틴으로 존재한다. 셀레노시스테인은 항산화 활성에 기여하며, 셀레노단백질과 셀레노효소의 구성 요소로 작용한다. 유전 암호에 직접 암호화되지 않고, UGA 코돈을 통해 재코딩 방식으로 암호화되며, mRNA의 SECIS 요소가 셀레노시스테인 삽입을 돕는다. 세포 내에는 자유로운 형태로 존재하지 않으며, 특수한 tRNA를 통해 운반되고, 셀레노시스테인 합성효소에 의해 합성된다. 셀레노시스테인은 PET 연구, 단백질의 X선 결정학, NMR 등 다양한 분야에 응용된다.

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셀레노시스테인 - [화학 물질]에 관한 문서
일반 정보
IUPAC 명칭2-아미노-3-셀라닐프로판산
다른 이름L-셀레노시스테인
3-셀라닐-L-알라닌
셀레늄 시스테인
화학식C3H7NO2Se
분자량168.06 g/mol
CAS 등록번호3614-08-2
확인된 정보
ChemSpider ID23436
ChEMBL109962
KEGGC05688
InChI1/C3H7NO2Se/c4-2(1-7)3(5)6/h2,7H,1,4H2,(H,5,6)/t2-/m0/s1
InChIKeyZKZBPNGNEQAJSX-REOHCLBHBZ
StdInChI1S/C3H7NO2Se/c4-2(1-7)3(5)6/h2,7H,1,4H2,(H,5,6)/t2-/m0/s1
StdInChIKeyZKZBPNGNEQAJSX-REOHCLBHSA-N
PubChem25076
DrugBankDB02345
ChEBI16633
UNII0CH9049VIS
SMILESO=C(O)[C@@H](N)C[SeH]
SMILES (쯔비터이온)O=C([O-])[C@@H]([NH3+])C[SeH]
성질
pKa5.24, 5.43

2. 화학적 특성

셀레노시스테인은 시스테인의 셀레늄 유사체로, 셀레놀(-SeH)기를 가지고 있다. Se-H 결합은 시스테인의 S-H 결합보다 산성도가 높아(pKa = 5.43[3]) 생리적 pH에서 쉽게 탈양성자화된다.[10]

셀레노시스테인은 공기 산화에 매우 민감하여 생체 조직 외부에서는 거의 발견되지 않는다. 산화된 유도체인 셀레노시스틴은 Se-Se 결합을 가지고 있어 더 흔하게 발견된다.[9] 셀레노시스테인과 셀레노시스틴은 모두 백색 고체이다.

2. 1. 구조

셀레노시스테인은 시스테인과 구조가 같지만, 일반적인 황 원자 대신 셀레늄 원자가 자리 잡고 있다. 셀레노시스테인은 셀레놀기를 가지고 있다. 다른 천연 단백질 생성 아미노산과 마찬가지로, 시스테인과 셀레노시스테인은 D/L-글리세르알데하이드와의 상동성을 기반으로 한 오래된 D/L 표기법에서 L 키랄성을 갖는다. 비대칭 탄소 근처의 원자의 원자 번호를 기반으로 하는 새로운 R/S 키랄성 지정 시스템에서는, 황 또는 셀레늄이 비대칭 탄소의 두 번째 이웃으로 존재하기 때문에 R 키랄성을 갖는다. 그 위치에 더 가벼운 원자만 있는 나머지 키랄 아미노산은 S 키랄성을 갖는다.[11]

3. 생물학적 특성

셀레노시스테인은 시스테인보다 낮은 환원 전위를 가지고 있어 항산화 활성에 관여하는 단백질에 매우 적합하다.[12]

생명체의 3역에서 발견되지만, 모든 생물체에 보편적으로 존재하는 것은 아니다.[13] 셀레노시스테인을 포함하는 단백질을 셀레노단백질이라고 하며, 촉매 활성을 갖는 셀레노단백질을 셀레노효소라고 한다.

셀레노시스테인은 셀레노시스테인 리아제 효소에 의해 L-알라닌과 셀레나이드(selenide)로 분해된다.[22]

2021년 기준으로, 37개 과(family)에 속하는 136개의 인간 단백질(셀레노단백질)이 셀레노시스테인을 포함하는 것으로 알려져 있다.[23]

셀레노시스테인 유도체인 γ-글루타밀-''Se''-메틸셀레노시스테인과 ''Se''-메틸셀레노시스테인은 ''알리움''속과 ''브라시카''속 식물에 자연적으로 존재한다.[24]

3. 1. 생합성 및 번역 메커니즘

셀레노시스테인은 다른 생체 단백질 상의 아미노산과는 다르게, 유전 암호에 직접 암호화되지 않는다.[14] 대신, 일반적으로 "오팔" 종결 코돈인 UGA 코돈에 의해 특별한 방식으로 암호화된다.[15] 이러한 메커니즘을 번역 후 재코딩이라고 한다.[15] mRNA의 셀레노시스테인 삽입 서열(SECIS) 요소의 존재에 의해 UGA 코돈이 셀레노시스테인을 암호화하도록 만들어진다. SECIS 요소는 특징적인 뉴클레오티드 서열과 이차 구조 염기쌍 패턴으로 정의된다. 세균에서 SECIS 요소는 일반적으로 셀레노단백질의 읽기 프레임 내에서 UGA 코돈 바로 뒤에 위치한다.[17] 고세균진핵생물에서는 SECIS 요소가 mRNA의 3' 비번역 영역(3′ UTR)에 있으며, 여러 UGA 코돈이 셀레노시스테인 잔기를 암호화하도록 유도할 수 있다.[18]

세포가 셀레늄이 없는 환경에서 배양될 경우, 셀레노단백질의 번역은 UGA 코돈에서 종결되어 잘려진 비기능성 효소를 생성한다.

다른 아미노산과 달리, 세포 내에는 자유로운 셀레노시스테인 풀이 존재하지 않는다. 높은 반응성으로 인해 세포에 손상을 입힐 수 있기 때문이다.[19] 대신 세포는 덜 반응성이 높은 산화된 형태인 셀레노시스틴(selenocystine)이나 메틸화된 형태인 셀레노메티오닌(selenomethionine)으로 셀레늄을 저장한다. 셀레노시스테인 합성은 특수한 tRNA에서 일어나며, 이는 새로 생성되는 폴리펩타이드에 셀레노시스테인을 포함시키는 기능도 한다.

셀레노시스테인 특이적 tRNA인 tRNASec의 1차 및 2차 구조는 표준 tRNA와 여러 면에서 다르다. 가장 두드러진 차이점은 8개의 염기쌍(세균) 또는 10개의 염기쌍(진핵생물) 수용체 줄기, 긴 가변 영역 팔, 그리고 여러 잘 보존된 염기 위치에서의 치환이다. 셀레노시스테인 tRNA는 처음에 세릴-tRNA 리가아제에 의해 세린으로 충전되지만, 결과적으로 생성된 Ser-tRNASec는 일반적인 번역 신장 인자(세균의 EF-Tu, 진핵생물의 eEF1A)에 의해 인식되지 않기 때문에 번역에 사용되지 않는다.

대신, tRNA에 결합된 세릴 잔기는 피리독살 인산 함유 효소인 셀레노시스테인 합성효소에 의해 셀레노시스테인 잔기로 전환된다. 진핵생물과 고세균에서는 tRNA에 결합된 세릴 잔기를 tRNA 셀레노시스테이닐 잔기로 전환하는 데 두 가지 효소가 필요하다: PSTK (''O''-포스포세릴-tRNA[Ser]Sec 키나제)와 셀레노시스테인 합성효소.[20][21] 마지막으로, 생성된 Sec-tRNASec는 대체 번역 신장 인자(SelB 또는 mSelB(또는 eEFSec))에 특이적으로 결합하며, 이는 셀레노단백질에 대한 mRNA를 번역하는 리보솜에 표적 방식으로 전달한다. 이 전달 메커니즘의 특이성은 추가적인 단백질 도메인(세균의 SelB) 또는 추가적인 소단위체(SBP2, 진핵생물의 mSelB/eEFSec)의 존재에 의해 이루어지는데, 이들은 셀레노단백질 mRNA의 SECIS 요소에 의해 형성된 해당 RNA 이차 구조에 결합한다.

4. 명명법

IUPAC와 IUBMB의 합동 명명 위원회는 셀레노시스테인의 3문자 표기를 Sec, 1문자 표기를 U로 공식 제안했다.

5. 응용

셀레노시스테인은 양전자 방출 단층촬영(PET) 연구에 사용될 수 있다. 73Se 표지 셀레노시스테인(73Se의 반감기 = 7.2시간) 및 75Se 표지 셀레노시스테인(75Se의 반감기 = 118.5일)이 특정 방사성 표지에 사용된다.[6] 또한 셀레노시스테인 단독 또는 셀레노시스테인과 셀레노메티오닌(SeMet)을 함께 도입하여 단백질의 X선 결정학에서 다파장 이상 산란을 이용한 위상 결정을 촉진할 수 있다.[6] 핵 스핀이 1/2인 안정적인 77Se 동위원소는 고해상도 핵자기 공명(NMR)에 사용될 수 있다.[6]

참조

[1] 서적 Merck Index
[2] 논문 Comparison of the chemical properties of selenocysteine and selenocystine with their sulfur analogs https://dx.doi.org/1[...] 1967-10-01
[3] 논문 Theoretical Calculation of p K a 's of Selenols in Aqueous Solution Using an Implicit Solvation Model and Explicit Water Molecules https://pubs.acs.org[...] 2016-11-10
[4] 웹사이트 Nomenclature and Symbolism for Amino Acids and Peptides http://www.chem.qmul[...] IUPAC-IUB Joint Commission on Biochemical Nomenclature 2018-03-05
[5] 논문 IUPAC-IUBMB Joint Commission on Biochemical Nomenclature (JCBN) and Nomenclature Committee of IUBMB (NC-IUBMB) 1999-08-17
[6] 논문 Selenocysteine in proteins—properties and biotechnological use 2005-10-01
[7] 웹사이트 Stadtman Pioneer of Selenium Biochemistry - Office of NIH History and Stetten Museum https://history.nih.[...] 2023-04-06
[8] 논문 Selenium biochemistry 1974-03-01
[9] 논문 Crystal structure of seleno-L-cystine dihydrochloride 2015
[10] 논문 Why nature chose selenium 2016-04-01
[11] 논문 Selenium-containing enzymes in mammals: chemical perspectives http://repository.ia[...] 2005
[12] 논문 Conformational preferences and pK(a) value of selenocysteine residue 2011-05-01
[13] 논문 A forgotten debate: is selenocysteine the 21st amino acid? 2004-04-01
[14] 논문 Selenoprotein synthesis: an expansion of the genetic code 1991-12-01
[15] 논문 Recoding: translational bifurcations in gene expression 2002-03-01
[16] 논문 The efficiency of selenocysteine incorporation is regulated by translation initiation factors 2010-07-01
[17] 서적 Recoding: Expansion of Decoding Rules Enriches Gene Expression https://books.google[...] Springer 2009
[18] 논문 Functional characterization of the eukaryotic SECIS elements which direct selenocysteine insertion at UGA codons 1993-08-01
[19] 논문 On the nature of selenium toxicity and carcinostatic activity https://linkinghub.e[...] 1994-07-01
[20] 논문 Biosynthesis of selenocysteine on its tRNA in eukaryotes 2007-01-01
[21] 논문 RNA-dependent conversion of phosphoserine forms selenocysteine in eukaryotes and archaea 2006-12-01
[22] 논문 Selenoproteins: molecular pathways and physiological roles 2014-07-01
[23] 논문 SelenoDB 2.0: annotation of selenoprotein genes in animals and their genetic diversity in humans http://selenodb.crg.[...] 2014-01-01
[24] 서적 Garlic and Other Alliums: The Lore and the Science https://books.google[...] Royal Society of Chemistry 2010
[25] 서적 Merck Index
[26] 논문 Comparison of the chemical properties of selenocysteine and selenocystine with their sulfur analogs https://dx.doi.org/1[...] 1967-10-01
[27] 논문 Theoretical Calculation of p K a 's of Selenols in Aqueous Solution Using an Implicit Solvation Model and Explicit Water Molecules https://pubs.acs.org[...] 2016-11-10
[28] 웹사이트 Nomenclature and Symbolism for Amino Acids and Peptides http://www.chem.qmul[...] IUPAC-IUB Joint Commission on Biochemical Nomenclature 2018-03-05
[29] 서적 Merck Index



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