엔도뉴클레아제
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1. 개요
엔도뉴클레아제는 DNA를 절단하는 효소의 일종으로, 세포사멸 과정에서 중요한 역할을 한다. 이 효소는 미토콘드리아 내막 공간에 위치하며, 세포 사멸 신호에 따라 미토콘드리아에서 핵으로 이동하여 DNA를 분해한다. 엔도뉴클레아제 G는 산화 스트레스 및 세포 사멸 신호 전달에 중요한 구성 요소이며, 심혈관 질환, 신경 퇴행성 질환, 암 등 다양한 질병과 관련되어 연구되고 있다. 특히, 심장 마비와 같은 허혈-재관류 손상 시 세포 손상 및 사멸에 기여하며, 파킨슨병과 같은 퇴행성 신경 질환에서도 DNA 단편화를 유도하는 것으로 알려져 있다. 엔도뉴클레아제 G의 발현 조절자 및 억제제는 관련 질병의 치료 표적으로 연구되고 있다.
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엔도뉴클레아제 | |
---|---|
기본 정보 | |
![]() | |
유전자 기호 | ENDOG |
염색체 위치 | 9q34.3 |
NCBI 유전자 ID | 2021 |
OMIM | 131230 |
Unigene | 444782 |
RefSeq | NM_004431 |
기능 | |
단백질 기능 | 세포 사멸 시 DNA 손상 및 절단, 미토콘드리아 기능 조절 |
관련 질병 | 파킨슨병 |
상호작용 | 히스톤 H2B, DNA 토포아이소머라제 II 알파 |
2. 구조
EndoG는 두 개의 단량체(monomer)가 활성 부위가 서로 반대쪽으로 향하고 있는 매우 독특한 이량체(dimer) 형태를 하고 있으며, 활성 부위에는 ββα-모티프를 갖는 EndoG 단백질의 전형적인 Mg-water cluster가 발견되었다. 원핵생물 상동체와 비교했을 때, 쥐의 EndoG 구조는 αβ mixed-globular-fold 단량체로부터 N-terminal loop이 길게 뻗어 있는 것을 확인할 수 있었고, molecule의 main body로부터 hairpin-like β-strand(B7 and B8)가 튀어나와 있는 것을 확인할 수 있었다. EndoG의 효소 활성(enzymatic activity)에는 Mg2+ 이온이 필요하다. EndoG의 active site에 Mg2+ 이온이 존재하며, 이 금속 이온 주위에 His138, Asn169, Glu177 등의 잔기들이 있다. 특히 Asn169는 5개의 water molecule과 함께 active site에 있는 Mg2+ 이온 주위에 8면체의 water cluster를 형성되어있다. Arg 잔기는 뉴클레이스 활성(nuclease activity)에 필수적인 잔기로 기질(substrate)의 잘라지기 쉬운 phosphate의 산소(oxygen)를 잡아줌으로써 전이상태(transition state)를 안정화하는 역할을 한다.[5][6][7] H-N-N 모티프(His-141, Asn-163, Asn-172)는 단백질의 촉매 기능과 기질 특이성에 매우 중요하며, His-141 아미노산은 마그네슘 배위에 필수적이다. 아미노산 Asn-251도 촉매 역할을 하는 것으로 보이며, Glu-271도 다른 마그네슘 리간드 역할을 하는 것으로 보이지만, 둘 다 H-N-N 모티프에서 멀리 떨어져 있어 상호작용이 불분명하다.[7]
EndoG는 두 개의 단량체(monomer)가 활성 부위가 서로 반대쪽으로 향하고 있는 매우 독특한 이량체(dimer) 형태를 하고 있으며, 활성 부위에는 ββα-모티프를 갖는 EndoG 단백질의 전형적인 Mg-water cluster가 발견된다. 원핵생물 상동체와 비교하였을 때, 쥐의 EndoG 구조는 αβ mixed-globular-fold monomer로부터 N-terminal loop이 길게 뻗어 있는 것을 확인할 수 있었고, molecule의 main body로부터 hairpin-like β-strand(B7 and B8)가 튀어나와 있는 것을 확인할 수 있었다. EndoG의 효소 활성(enzymatic activity)에는 Mg2+ 이온이 필요하다. EndoG의 active site에 Mg2+ 이온이 존재하며, 이 금속 이온 주위에 His138, Asn169, Glu177 등의 잔기들이 있다. 특히 Asn169는 5개의 water molecule과 함께 active site에 있는 Mg2+ 이온 주위에 8면체의 water cluster를 형성되어있다. Arg 잔기는 뉴클레이스 활성(nuclease activity)에 필수적인 잔기로 기질(substrate)의 잘라지기 쉬운 phosphate의 산소(oxygen)를 잡아줌으로써 전이상태(transition state)를 안정화하는 역할을 한다.
3. 기능
이 유전자에 의해 암호화된 단백질은 미토콘드리아 내막 공간에 위치하는 핵 암호화된 엔도뉴클레아제이다.[2][8] 이 암호화된 단백질은 동물들에게 널리 분포하며 GC 서열에서 DNA를 절단한다. 이 단백질은 DNA 중합효소 감마에 필요한 RNA 프라이머를 생성할 수 있다.[2]
3. 1. 세포 사멸에서의 역할
생화학적, 유전학적인 연구를 통해 세포 사멸 동안 DNA 분열에 중요한 역할을 하는 CAD와 EndoG라는 두 가지 엔도뉴클레아제가 확인되었다. 세포 사멸이 활성화되면 사이토크롬 c(cytochrome c), procaspases, Smac/DIABLO, AIF, EndoG와 같은 많은 Apoptogenic factor들이 미토콘드리아로부터 방출된다. 사이토크롬 c와 Smac/DIABLO는 캐스페이스를 활성화하는 역할을 한다. 캐스페이스 의존성 세포사멸에서 작용하는 핵산분해효소인 CAD는 세포사멸 안의 caspases protease에 의해 ICAD와의 결합이 끊어짐으로써 활성화되며, chromatin 구조를 응축시키는 topo II, histone H1과 같은 chromatin 구성 요소들과 결합함으로써 DNA에 binding하게 된다. AIF와 EndoG는 캐스페이스 비의존성 세포사명의 최종단계에서 DNA분열에 관여하는 핵산분해효소로 세포사멸 자극을 받으면 미토콘드리아에서 방출되어 핵으로 이동한다.[2][8]
일부 세포 사멸 경로에서, EndoG는 미토콘드리아에서 방출되어 핵으로 이동하여 다른 핵 단백질의 도움을 받아 크로마틴을 분해한다.[3][5][7] 카스파제-비의존적 세포 사멸에서, EndoG 발현 조절자인 E3 연결효소 Hsc-70 상호작용 단백질의 C-말단(CHIP)은 산화 스트레스에 대한 보호 기전으로 작용한다. 정상적인 조건에서는 EndoG는 Hsp70 및 CHIP에 결합된 상태로 유지되지만, 산화 스트레스를 받으면 EndoG는 Hsp70 및 CHIP으로부터 분리되어 핵으로 전위되어 DNA를 분해하여 세포 사멸을 유발한다. 따라서, 낮은 수준의 EndoG를 유지하는 것은 스트레스 조건으로 인한 세포 사멸을 예방할 수 있다.[9] 상피 세포에서, EndoG의 핵 국소화 및 세포 사멸 기능은 세포 노화에 역할을 하게 한다.[6]
DNA 분해 외에도, EndoG는 또한 효소 억제제 세포 사멸 억제 단백질(IAPs)을 자극하여 단백질을 프로테아좀 분해 대상으로 한다.[10]
4. 임상적 중요성
세포자멸사는 세포가 적절한 신호 자극을 받았을 때 스스로를 파괴하는 기작으로, 자연계에서 널리 관찰된다. 세포자멸사는 노인성 치매, 파킨슨병 등의 퇴행성 신경계 질환, 자가면역 질환, 바이러스 감염, AIDS, 암과 같은 인간 질병의 발달과 깊은 관련이 있다.
이전 연구에서는 높은 EndoG 수준에서 항암제의 효능이 더 높다고 보고했다. 따라서 CHIP와 같은 EndoG 조절자는 암 및 노화에서 산화 스트레스 유발 세포 사멸의 치료 표적이 될 수 있다.[9] EndoG는 상피 세포에서 세포 노화와 연관되어 동맥 경화와 같은 연령 관련 혈관 질환을 유발할 수 있다.[6] EndoG의 근핵 국소화는 위축된 노화 골격근과 관련되며, 이는 증가된 자멸사 신호 전달 및 근육량 감소로 이어진다.
마우스의 EndoG 유전자 녹다운은 유해한 손상을 완화시켰다. 따라서 EndoG를 억제하거나 침묵시키는 치료 전략은 손상 및 질병 발생 시 조직을 보호하는 데 도움이 될 수 있다. 지금까지 두 개의 EndoG 억제제인 PNR-3-80 (5-((1-(2-naphthoyl)-5-chloro-1H-indol-3-yl)methylene)-2-thioxodihydropyrimidine-4,6(1H,5H)-dione) 및 PNR-3-82 (5-((1-(2-naphthoyl)-5-methoxy-1H-indol-3-yl)methylene)-2-thioxodihydropyrimidine-4,6(1H,5H)-dione)가 테스트되고 확인되었다.[5]
4. 1. 심혈관 질환
엔도뉴클레아제 G 효소는 산화 스트레스 및 세포자멸사 신호 전달에 중요한 구성 요소이며, 특히 미토콘드리아 사멸 경로 및 심근 세포 자멸사 신호 전달의 일부로 작용한다.[11] 세포자멸사는 특징적인 형태학적, 생화학적 및 분자적 변화로 정의되는 세포 사멸의 한 방식이다.BNIP3 경로는 엔도뉴클레아제 G의 미토콘드리아 방출 및 핵 이동을 포함한다.[13][14] BNIP3가 전압 의존성 음이온 채널(VDAC)과 상호 작용하여 엔도뉴클레아제 G의 미토콘드리아 방출 및 핵 이동을 직접 유도한다는 것이 밝혀졌다.[15]
특히 엔도뉴클레아제 G는 허혈-재관류 손상에 의한 산화 스트레스 동안, 특히 심장 마비(허혈성 심장 질환이라고도 함)의 일부인 심근에서 중요하다. 주요 관상 동맥 중 하나의 혈관 폐쇄로 인해 발생하는 허혈성 심장 질환은 현재 서구 사회에서 여전히 이환율 및 사망 원인의 주요 원인이다.[16][17] 허혈 재관류 동안, ROS 방출은 세포에 직접적인 영향을 미치고 자멸사 신호를 통해 세포 손상 및 사멸에 실질적으로 기여한다.
최근, 엔도뉴클레아제 G는 심장 비대의 결정 요인으로 간주된다. 엔도뉴클레아제 G와 미토콘드리아 기능 사이의 연관성이 확립되었으며, 이는 부분적으로 Endo G가 Mfn2와 Jp2에 미치는 영향, 부적응성 심장 비대에서 Mfn2와 Jp2에 의해 제어되는 과정 간의 상호 작용에서 엔도뉴클레아제 G의 역할을 밝혀냈다.[18]
4. 2. 신경 퇴행성 질환
세포사멸은 노인성 치매, 파킨슨병 등의 퇴행성 신경계 질병과 깊은 관련이 있다.[4] 엔도뉴클레아제 G(EndoG)는 파킨슨병과 관련이 있는데, 미토콘드리아에서 핵으로 이동할 때 뉴런에서 DNA 단편화를 유도하기 때문이다. 이 과정은 키누레닌 경로와 투과성 전이 기공을 포함한다. 따라서 이 경로의 분자를 표적으로 하면 EndoG 매개 세포 사멸을 예방하고 환자의 파킨슨병을 효과적으로 치료하는 데 도움이 될 수 있다.[4]4. 3. 암
세포자멸사는 노인성 치매, 파킨슨병 등의 퇴행성 신경계 질병, 자가면역 질환, 바이러스 감염, AIDS, 암과 같은 질병 발달에 중요한 역할을 한다.[11] 정상적인 배아 발생 과정, 세포 손상(예: 심장 마비, 뇌졸중 시 허혈-재관류 손상), 암 발달 과정에서 세포자멸사 세포는 세포 수축, 세포막 블레빙, 핵 응축, DNA 및 세포핵 분열 등의 구조적 변화를 겪는다.[12]높은 엔도뉴클레아제 G (EndoG) 수준에서 항암제 효능이 더 높다는 연구 결과가 보고되었다. 따라서 CHIP와 같은 EndoG 조절자는 암 및 노화에서 산화 스트레스 유발 세포 사멸의 치료 표적이 될 수 있다.[9]
4. 4. 기타 질환
세포사멸은 노인성 치매, 파킨슨병 등의 퇴행성 신경계 질병, 자가면역 질환, 바이러스 감염, AIDS, 암과 같은 질병 발생에 중요한 역할을 한다.[11] 프로그램된 세포사는 후생동물에 필수적이며, 성공적인 배아 발달과 정상적인 조직 항상성 유지에 필요하다. 세포 사멸 경로는 다른 필수 세포 경로와 밀접하게 얽혀 있다. 정상적인 배아 발생 과정, 세포 손상(예: 심장 마비 및 뇌졸중 시의 허혈-재관류 손상), 암 발생 과정에서 세포자멸사 세포는 세포 수축, 세포막 블레빙, 핵 응축, DNA 및 세포핵 분열을 포함한 구조적 변화를 겪는다.[12]특히 엔도뉴클레아제 G는 심장 마비(허혈성 심장 질환)와 같은 허혈-재관류 손상에 의한 산화 스트레스 상황에서 심근 세포에 중요한 영향을 미친다. 주요 관상 동맥의 혈관 폐쇄로 발생하는 허혈성 심장 질환은 서구 사회에서 이환율 및 사망 원인의 주요 원인이다.[16][17] 최근 엔도뉴클레아제 G는 심장 비대의 결정 요인으로도 간주된다.[18]
CHIP와 같은 EndoG 조절자는 암 및 노화에서 산화 스트레스 유발 세포 사멸의 치료 표적이 될 수 있다.[9] EndoG는 상피 세포에서 세포 노화와 연관되어 동맥 경화와 같은 연령 관련 혈관 질환을 유발할 수 있다.[6] EndoG의 근핵 국소화는 위축된 노화 골격근과 관련되며, 이는 증가된 자멸사 신호 전달 및 근육량 감소로 이어진다. EndoG는 파킨슨병(PD)과도 관련 있는데, 미토콘드리아에서 핵으로 이동하면 뉴런에서 DNA 단편화를 유도하기 때문이다.[4] 따라서 EndoG를 억제하거나 침묵시키는 치료 전략은 손상 및 질병 발생 시 조직을 보호하는 데 도움이 될 수 있다. 현재까지 두 가지 EndoG 억제제가 테스트 및 확인되었다.[5]
참조
[1]
논문
Chromosomal localization of mitochondrial transcription factor A (TCF6), single-stranded DNA-binding protein (SSBP), and endonuclease G (ENDOG), three human housekeeping genes involved in mitochondrial biogenesis
1995-01
[2]
웹사이트
Entrez Gene: ENDOG endonuclease G
https://www.ncbi.nlm[...]
[3]
논문
Endonuclease G interacts with histone H2B and DNA topoisomerase II alpha during apoptosis
2012-04
[4]
논문
Endonuclease G mediates α-synuclein cytotoxicity during Parkinson's disease
2013-11
[5]
논문
Novel cytoprotective inhibitors for apoptotic endonuclease G
2015-02
[6]
논문
Role of endonuclease G in senescence-associated cell death of human endothelial cells
http://hw.oeaw.ac.at[...]
2010-08
[7]
논문
Mutagenesis identifies the critical amino acid residues of human endonuclease G involved in catalysis, magnesium coordination, and substrate specificity
2009-01-15
[8]
논문
No death without life: vital functions of apoptotic effectors
2008-07
[9]
논문
CHIP has a protective role against oxidative stress-induced cell death through specific regulation of endonuclease G
2013-06-13
[10]
논문
Cellular inhibitor of apoptosis protein 1 ubiquitinates endonuclease G but does not affect endonuclease G-mediated cell death
2014-09
[11]
논문
Cell death: critical control points
2004-01
[12]
논문
Apoptosis: a basic biological phenomenon with wide-ranging implications in tissue kinetics
1972-08
[13]
논문
Mitochondrial BNIP3 upregulation precedes endonuclease G translocation in hippocampal neuronal death following oxygen-glucose deprivation
2009-09-08
[14]
논문
BNIP3 upregulation and EndoG translocation in delayed neuronal death in stroke and in hypoxia
2007-05
[15]
논문
The proapoptotic protein BNIP3 interacts with VDAC to induce mitochondrial release of endonuclease G
2014
[16]
논문
Alternative projections of mortality and disability by cause 1990-2020: Global Burden of Disease Study
1997-05
[17]
논문
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1985-11
[18]
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