내재성 막 단백질
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1. 개요
내재성 막 단백질은 생체막에 영구적으로 결합되어 있는 막 단백질의 한 종류이다. X선 결정학 및 핵자기 공명 분광학을 통해 3차원 구조가 밝혀졌으며, 막관통 단백질과 단일막 단백질로 분류된다. 막관통 단백질은 생체막을 한 번 이상 통과하며, 단일 통과, 다중 통과, 유형 I, II, III, IV, V, VI 단백질로 나뉜다. 단일막 단백질은 세포막의 한 면에만 결합하며, α-나선, 소수성 루프, 지질과의 상호작용을 통해 막에 고정된다. 내재성 막 단백질은 수송, 연결, 채널, 수용체, 효소, 세포 부착 등 다양한 기능을 수행하며, 박테리오로돕신, 인슐린 수용체, 인테그린 등이 대표적인 예시이다.
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내재성 막 단백질 | |
---|---|
기본 정보 | |
유형 | 막 단백질 |
위치 | 생체막 |
기능 | 막을 가로질러 분자를 수송, 세포 신호 전달 |
구조 | 하나 이상의 막 횡단 영역을 가짐 |
상세 정보 | |
정의 | 생물학적 막에 영구적으로 부착된 막 단백질의 유형 |
특성 | 소수성 상호작용을 통해 막 지질과 직접 상호작용 막에서 분리하려면 막을 파괴하는 파괴적 조건이 필요 |
구성 | 하나 이상의 막 횡단 영역으로 구성, 알파 나선 또는 베타 시트 구조를 가짐 |
기능적 역할 | |
수송 단백질 | 이온, 작은 분자, 거대 분자와 같은 분자를 막을 가로질러 수송 |
막 앵커 | 세포막에 다른 단백질을 부착 |
수용체 | 세포 외부에서 신호를 수신하고 세포 내부로 전달 |
효소 | 막 근처에서 화학 반응을 촉매 |
참고 문헌 |
2. 구조
X선 결정학이나 핵자기 공명 분광학과 같은 방법을 통해 약 160여 개의 내재성 막 단백질(IMP) 3차원 구조가 원자 수준에서 밝혀졌다. 하지만, 이러한 단백질은 추출 및 결정화가 어렵기 때문에 연구하기가 쉽지 않다. 단백질 정보 은행(Protein Data Bank)에서는 막 고정 α-나선을 제거하여 추출 및 결정을 용이하게 만든, 수용액-가용성 단백질 도메인 구조를 확인할 수 있다.
내재성 막 단백질은 크게 두 그룹으로 나눌 수 있다.
# 통합 폴리토프 단백질
# 내재성 모노토프 단백질
2. 1. 막관통 단백질 (Integral polytopic protein)
막관통 단백질(통합 폴리토프 단백질)은 전체 생체막에 걸쳐 있는 가장 일반적인 유형의 내재성 막 단백질이다. 이들은 다음과 같이 분류할 수 있다.- '''단일 통과 막 단백질''': 막을 한 번만 통과한다.
- 유형 I: 카복실 말단(C-말단)이 세포질을 향한다.
- 유형 II: 아미노 말단(N-말단)이 세포질을 향한다.
- '''다중 통과 막 단백질''': 막을 여러 번 통과한다.
- 유형 III: 단일 폴리펩타이드에 여러 개의 막관통 도메인을 가진다.
- 유형 IV: 막을 통과하는 채널에서 함께 조립된 여러 개의 서로 다른 폴리펩타이드로 구성된다.
- 유형 V: 공유 결합된 지질을 통해 지질 이중층에 고정된다.
- 유형 VI: 막관통 도메인과 지질 앵커를 모두 가진다.[13][4]

약 160개의 서로 다른 내재성 막 단백질의 3차원 구조가 X선 결정학 또는 핵 자기 공명 분광학으로 원자 수준에서 밝혀졌다. 그러나 추출 및 결정화의 어려움으로 인해 연구하기가 쉽지 않다.
2. 2. 단일막 단백질 (Integral monotopic protein)
내재성 단일막 단백질(Integral monotopic protein)은 세포막의 한쪽 면에만 영구적으로 결합하는 단백질이다.[5] 이들은 지질 이중층을 완전히 관통하지 않는다.내재성 단일막 단백질과 세포막 간의 상호작용은 다음과 같은 방식으로 이루어진다.
1. 막면에 평행한 양쪽성 α-나선에 의한 상호작용
2. 소수성 루프에 의한 상호작용
3. 공유 결합된 막 지질에 의한 상호작용 (지질화)
4. 막 지질과의 정전기적 또는 이온 상호작용 (예: 칼슘 이온을 통해)
다음은 3차원 구조가 밝혀진 내재성 단일막 단백질의 예시이다.
- 프로스타글란딘 H2 합성효소 1 및 2 (사이클로옥시게나아제)
- 라노스테롤 합성효소 및 스쿠알렌-호펜 시클라제
- 미세소체 프로스타글란딘 E 합성효소
- 카르니틴 O-팔미토일트랜스퍼라제 2
- 포스포글리코실 트랜스퍼라제 C
또한, 막횡단 단백질의 내재성 단일위치 도메인의 구조도 알려져 있다.
- 모노아민 산화 효소 A 및 B
- 지방산 아미드 가수분해 효소
- 포유류 시토크롬 P450 산화 효소
- 코르티코스테로이드 11-베타-탈수소 효소
2. 3. 단백질 구조 결정
X선 결정학 또는 핵 자기 공명 분광학을 통해 약 160개의 서로 다른 내재성 막 단백질(IMP)의 3차원 구조가 원자 분해능 수준에서 밝혀졌다. 그러나 내재성 막 단백질은 추출 및 결정화가 어려워 연구하기 까다로운 대상이다.[14] Protein Data Bank에서는 막 고정 α-나선을 제거하여 추출 및 단백질 결정화를 용이하게 만든, 내재성 막 단백질의 많은 수용성 단백질 도메인의 구조를 확인할 수 있다.미국 국립보건원(NIH) 산하 국립 일반 의학 연구소(NIGMS)가 지원하는 단백질 구조 계획(PSI)은 막 단백질을 포함한 구조 생물학 연구를 위한 3차원 단백질 구조 결정 및 관련 기술 개발을 목표로 한다. 상동성 모델링 기법은 아미노산 서열과 상동성을 갖는 단백질의 실험적 3차원 구조를 바탕으로 "표적" 내재성 막 단백질의 원자 수준 모델을 구축하는 데 사용될 수 있다. 이 방법은 리간드 -G 단백질 결합 수용체(GPCR) 및 그 복합체의 구조 예측에 널리 활용되었다.[7]
3. 기능
내재성 막 단백질은 수송체, 링커, 채널, 수용체, 효소, 구조적 막 고정 도메인, 에너지 축적 및 변환에 관여하는 단백질, 세포 부착을 담당하는 단백질을 포함한다.[15] 수송체의 분류는 수송체 분류 데이터베이스에서 찾을 수 있다.[15]
내재성 막 단백질과 인지질 이중층에 의해 형성된 막 사이의 관계 예시는 세균성 광포착 색소인 박테리오로돕신이다. 박테리오로돕신의 경우 통합 막 단백질은 인지질 이중층에 7번 걸쳐 있다. 이중층의 소수성 영역에 포함된 단백질 부분은 알파 나선이며 주로 소수성 아미노산으로 구성된다. 단백질의 C 말단은 세포질에 있고 N 말단 영역은 세포 외부에 있다. 이 단백질을 포함하는 막은 광합성에서 기능할 수 있다.[16]
4. 예시
- 인슐린 수용체
- 인테그린, 캐드헤린, NCAM, 셀렉틴과 같은 일부 유형의 세포 부착 단백질 또는 세포 부착 분자(CAM)
- 일부 유형의 수용체 단백질
- 글리코포린
- 로돕신
- 밴드 3
- CD36
- 포도당 투과효소
- 이온 채널 및 게이트
- 갭 접합 단백질
- G 단백질 결합 수용체 (예: 베타-아드레날린성 수용체)
- 세이핀
- 광계 I[10]
참조
[1]
웹사이트
intrinsic protein ! biology
https://www.britanni[...]
2022-07-04
[2]
서적
Medical cell biology
https://books.google[...]
Academic Press
2010-11-24
[3]
학술지
Genome-wide analysis of integral membrane proteins from eubacterial, archaean, and eukaryotic organisms
[4]
서적
Principles of Biochemistry
W.H. Freeman and Company
[5]
학술지
A Computational Protocol for the Integration of the Monotopic Protein Prostaglandin H2 Synthase into a Phospholipid Bilayer
2006-07
[6]
학술지
Cytosolic and Transmembrane Protein Extraction Methods of Breast and Ovarian Cancer Cells: A Comparative Study
2018
[7]
학술지
Structural model of ligand-G protein-coupled receptor (GPCR) complex based on experimental double mutant cycle data: MT7 snake toxin bound to dimeric hM1 muscarinic receptor.
2011-09
[8]
학술지
The Transporter Classification Database: recent advances
null
2009-01
[9]
웹사이트
Integral membrane proteins
https://web.archive.[...]
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Structure, function and organization of the Photosystem I reaction center complex
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