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버지의 세균분류학 편람

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목차

1. 개요

《버지의 세균분류학 편람》(Bergey's Manual of Determinative Bacteriology)은 세균 분류에 관한 권위 있는 참고 문헌으로, 1923년 데이비드 헨드릭스 버지를 중심으로 초판이 출판된 이후 여러 차례 개정되었다. 초기에는 세균의 형태, 생리, 생화학적 특성을 기반으로 분류 체계가 구성되었으며, 1984년 이후에는 16S rRNA 염기서열 분석 기술 도입을 통해 계통발생학적 분류 체계가 도입되었다. 2015년에는 《버지의 계통분류학 편람》이 출판되었으며, 2019년에는 게놈 분류 데이터베이스(GTDB) 정보를 활용하여 세균 분류에 유전체학적 분석을 적용하는 등 최신 동향을 반영하고 있다. 버지 매뉴얼 트러스트는 이 편람의 출판을 지원하며, 세균 분류학 발전에 기여한 인물에게 버지 상과 버지 메달을 수여한다.

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버지의 세균분류학 편람
개요
버지 매뉴얼 표지
버지 매뉴얼 표지
유형세균학 매뉴얼
언어영어
주제세균
고세균
미생물학
분류학
출판초판: 1923년
최신판: 2015년
OCLC477075227, 654937548
상세 정보
설명버지의 세균분류학 편람은 세균과 고세균을 식별하는 데 사용되는 주요 매뉴얼임
역사데이비드 헨드릭스 버지가 1923년에 창간함
다양한 판과 버전으로 출판됨
내용종의 식별을 위한 형태학적, 생화학적, 생리적, 유전적 특성 포함
분류학적 배열 및 설명 제공
중요성미생물학, 의학, 농업 및 기타 과학 분야의 연구자에게 필수적인 참고 자료임
새로운 종을 식별하고 이미 존재하는 종을 분류하는 데 도움이 됨

2. 편람의 역사

2. 1. 초창기 (결정적 분류학)

버지의 세균분류학 편람은 1923년 데이비드 헨드릭스 버지(David Hendricks Bergey)를 중심으로 해리슨(F.C. Harrison), 브리드(R.S. Breed), 해머(B.W. Hammer), 헌튼(F.M. Huntoon) 등이 편집하여 제1판이 출판되었다. 이후 1974년 제8판까지 발행되었다. 이 시기에는 세균의 형태, 생리, 생화학적 특성을 기반으로 분류 체계가 구성되었다.

초판은 1923년에 The Williams & Wilkins Co에서 출판되었으며, 442쪽 분량이었다. 제2판은 1925년, 제3판은 1930년, 제4판은 1934년에 출판되었다. 1939년에는 제5판이 출판되었으며, 편집진에 약간의 변화가 있었다. 제6판은 1948년, 제7판은 1957년에 출판되었으며, 이때는 브리드(R.S. Breed), 머레이(E.G.D. Murray), 스미스(N.R. Smith) 등이 편집을 맡았다. 1974년에는 부캐넌(R.E. Buchanan)과 기번스(N.R. Gibbons)가 편집한 제8판이 출판되었다. 1994년에는 존 G. 홀트(John G. Holt)가 편집한 제9판이 출판되었다.

2. 2. 계통발생학적 분류 체계 도입

1984년 ''버지의 세균분류학 편람''(Bergey's Manual of Systematic Bacteriology) 제1판이 발행된 이후, 세균 분류 체계에는 큰 변화가 있었다. 특히, 16S rRNA 염기서열 분석 기술이 도입되면서 세균의 계통발생학적 관계를 파악하는 데 획기적인 발전이 이루어졌다. 이 기술은 세균 간의 유전적 유사성을 객관적으로 비교할 수 있게 해주어, 이전까지 형태학적, 생화학적 특성에 의존하던 분류 체계의 한계를 극복하는 데 기여했다.

2. 3. 최신 동향 (계통유전체학)

2015년에는 ''버지의 계통분류학 편람(Bergey's manual of systematics of archaea and bacteria)''이 출판되었다. 이 편람은 고균과 세균의 계통분류학에 대한 최신 정보를 제공한다.

2019년, 버지 매뉴얼 트러스트는 세균 명명에 게놈 분류 데이터베이스(GTDB) 정보를 활용하기로 결정했다. GTDB는 세균 및 고균의 계통 발생을 게놈 서열에 기반하여 분류하는 데이터베이스이다. 이러한 결정은 세균 분류학의 최신 동향을 반영하며, 유전체학적 분석 방법이 세균 분류에 중요한 역할을 하고 있음을 보여준다.

대한민국에서도 미생물의 계통 및 분류학 연구가 활발하게 진행되고 있다. 특히, 김치나 된장과 같은 전통 발효 식품에서 분리된 미생물에 대한 연구는 한국의 고유한 미생물 자원을 확보하고, 이를 산업적으로 활용하는 데 중요한 기여를 하고 있다.

3. 편람 구성

1980년에 새로운 계약을 통해 "'세균 분류학'"으로 변경되면서 새로운 스타일은 "유기체 간의 관계"를 포함하고 전반적으로 "범위가 확장"되었다.[7] 이 새로운 스타일은 1984년에 처음 출판된 4권 세트에 적용되었다.[7]

버지의 세균분류학 편람 제1판은 1984년부터 1989년까지 총 4권으로 출판되었다.


  • 제1권 (1984): "의학적 및 산업적 중요성"이 있는 것으로 간주되는 모든 종류의 그람 음성 세균에 대한 정보를 포함했다.[8]
  • 제2권 (1986): 모든 종류의 그람 양성 세균에 대한 정보를 포함했다.[8]
  • 제3권 (1989): 나머지, 약간 다른 그람 음성 세균과 고세균을 다루었다.[8]
  • 제4권 (1989): 사상 방선균 및 기타 유사한 세균에 대한 정보를 담고 있다.[8]


버지의 세균분류학 편람 제2판은 총 5권으로 구성되어 있다. 현재 권들은 표현형이 아닌 16S 계통발생에만 근거하여 많은 상위 분류군이 정의되어 있다는 점에서 이전 권들과 크게 다르다. 이는 Proteobacteria 내의 클래스 경우와 같다.[10]

  • 제1권 (2001): 고세균과 깊이 분기된 광합성 세균[9]
  • 제2권 (2005): Proteobacteria — 세 권으로 나뉨:
  • * 2A: 소개 에세이[10]
  • * 2B: 감마프로테오박테리아[11]
  • * 2C: 기타 Proteobacteria 클래스[12]
  • 제3권 (2009): Firmicutes[13]
  • 제4권 (2011): Bacteroidetes, Spirochaetes, Tenericutes (Mollicutes), Acidobacteria, Fibrobacteres, Fusobacteria, Dictyoglomi, Gemmatimonadetes, Lentisphaerae, Verrucomicrobia, Chlamydiae, 및 Planctomycetes[14]
  • 제5권 (두 부분으로) (2012): Actinobacteria[15]

3. 1. 제1판 (1984-1989)

버지의 세균분류학 편람 제1판은 1984년부터 1989년까지 총 4권으로 출판되었다.[18][19][20][21][22][23][24]

  • 제1권 (1984): 그람 음성 세균을 다룬다.[18]
  • 제2권 (1986): 그람 양성 세균을 다룬다.[19]
  • 제3권 (1989): 고균을 포함하여, 진화상으로 분기한 지 오래된 세균, 광영양 세균 등 다양한 세균을 다룬다.
  • 제4권 (1989): 방선균과 같은 사상균을 다룬다.

3. 2. 제2판 (2001-2012)

버지의 세균분류학 편람 제2판은 총 5권으로 구성되어 있다.[18][19][20][21][22][23][24] 1권은 고균과 진화상으로 분기한 지 오래된 세균, 광영양 세균을 다룬다.[18] 2권은 프로테오박테리아를 3개의 책으로 나누어 다루는데, 2A권은 개요,[19] 2B권은 감마프로테오박테리아,[20] 2C권은 프로테오박테리아에 속하는 기타 강을 다룬다.[21] 3권은 후벽균에 대한 내용을 담고 있다.[22] 4권에서는 의간균류, 스피로헤타균류, 테네리쿠테스균류(몰리쿠테스강), 산간균류, 섬유균류, 사간균류, 망단균류, 아단포균류, 렌티스페라균류, 우미균류, 클라미디아균류, 부유균류를 다룬다.[23] 마지막 5권은 방선균을 다룬다.[24]

3. 3. 판본별 상세 목록


  • R.E. 부캐넌(Buchanan), J.G. 홀트(Holt) & E.F. 레슬 주니어(Lessel Jr) (1966). ''버지의 세균분류학 편람(Index Bergeyana: An Annotated Alphabetic Listing of Names of the Taxa of the Bacteria)''. The Williams and Wilkins Co., 볼티모어, 메릴랜드주.
  • J.G. 홀트(Holt) (편집, 1977). ''더 쇼터 버지 매뉴얼 오브 디터미네이티브 박테리아학(The Shorter Bergey's Manual of Determinative Bacteriology)'', 제8판, The Williams and Wilkins Co., 볼티모어, 메릴랜드주.
  • N.E. 기번스(Gibbons), K.B. 패티(Pattee) & J.G. 홀트(Holt) (편집, 1981). ''버지아나 색인 보충(Supplement to Index Bergeyana)''. The Williams and Wilkins Co., 볼티모어, 메릴랜드주.
  • W. B. Whitman 외 15인 (2015). ''Bergey's manual of systematics of archaea and bacteria''. John Wiley & Sons, 호보컨, 뉴저지주. ISBN 9781118960608

4. 버지 매뉴얼 트러스트 (Bergey's Manual Trust)

버지 매뉴얼 트러스트(Bergey's Manual Trust)는 버지의 세균분류학 편람 출판을 지속하기 위해 1936년에 설립되었다. 이 트러스트는 세균 분류학에 뛰어난 공헌을 한 개인에게 버지 상(Bergey Award)과 버지 메달(Bergey Medal)을 수여하며, 이는 트러스트와 매뉴얼 출판사인 스프링거(Springer)의 기금으로 공동 지원된다.

버지 매뉴얼 트러스트는 존 와일리 앤 선스(John Wiley & Sons, Inc.)와 공동으로 온라인 백과사전인 ''고세균 및 세균 계통 분류학 버지 매뉴얼(Bergey's Manual of Systematics of Archaea and Bacteria, BMSAB)''을 출판한다. 2019년, 트러스트는 게놈 분류 데이터베이스(Genome Taxonomy Database, GTDB)에서 제공하는 분류를 사용하여 BMSAB에 계통유전체를 포함하기로 결정했다.

5. 평가

《내과학 연보(Annals of Internal Medicine)》는 이 책들을 "명확하게 쓰여졌고, 정확하며 읽기 쉽다"고 묘사했으며 "특히 분류학에 관심 있는 사람들을 위해 설계되었다"고 평했다.[17]

참조

[1] 간행물 Bergey's Manual of Systematic Bacteriology https://www.microbio[...] Int. J. of Syst. Bact. 1985-07
[2] 웹사이트 History of the Manual http://www.microbiol[...] 2008-12-08
[3] 서적 Bergey's manual of systematics of archaea and bacteria
[4] 서적 Taxonomic Outline of the Procaryotes, Release 1.0. ''Bergey's Manual of Systematic Bacteriology'' https://www.bergeys.[...] Springer-Verlag 2001
[5] 서적 Taxonomic Outline of the Bacteria and Archaea, Release 7.7 Michigan State University Board of Trustees
[6] 서적 Bergey's manual of systematics of archaea and bacteria https://www.bergeys.[...]
[7] 서적 Microbiology https://books.google[...] Kendall Hunt 2003
[8] 서적 Bergey's Manuals https://books.google[...] Springer 2003
[9] 서적 The Archaea and the Deeply Branching and Phototrophic Bacteria https://archive.org/[...] Springer 2001-05-18
[10] 서적 Introductory Essays https://www.springer[...] Springer 2005-07-26
[11] 서적 The Gammaproteobacteria https://www.springer[...] Springer 2005-07-26
[12] 서적 The Proteobacteria https://archive.org/[...] Springer 2005-07-26
[13] 서적 The Firmicutes https://www.springer[...] Springer 2009-09-15
[14] 서적 The Bacteroidetes, Spirochaetes, Tenericutes (Mollicutes), Acidobacteria, Fibrobacteres, Fusobacteria, Dictyoglomi, Gemmatimonadetes, Lentisphaerae, Verrucomicrobia, Chlamydiae, and Planctomycetes https://www.springer[...] Springer 2010-11-24
[15] 서적 The Actinobacteria https://www.springer[...] Springer 2012-01-29
[16] 웹사이트 Recent News. Incorporation of Phylogenomics into BMSAB https://www.bergeys.[...] 2019
[17] 뉴스 Bergey's Manual of Systematic Bacteriology http://www.annals.or[...] Annals of Internal Medicine
[18] 서적 The Archaea and the Deeply Branching and Phototrophic Bacteria http://www.springer.[...] Springer 2001-05-18
[19] 서적 Introductory Essays http://www.springer.[...] Springer 2005-07-26
[20] 서적 The Gammaproteobacteria http://www.springer.[...] Springer 2005-07-26
[21] 서적 The Proteobacteria http://www.springer.[...] Springer 2005-07-26
[22] 서적 The Firmicutes http://www.springer.[...] Springer 2009-09-15
[23] 서적 The Bacteroidetes, Spirochaetes, Tenericutes (Mollicutes), Acidobacteria, Fibrobacteres, Fusobacteria, Dictyoglomi, Gemmatimonadetes, Lentisphaerae, Verrucomicrobia, Chlamydiae, and Planctomycetes http://www.springer.[...] Springer 2010-11-24
[24] 서적 The Actinobacteria http://www.springer.[...] Springer 2012-01-29


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