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글리세롤 3-인산 탈수소효소

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목차

1. 개요

글리세롤 3-인산 탈수소효소(GPDH)는 지질 생합성 및 산화환원 전위 유지에 중요한 역할을 하는 효소이다. GPDH는 다이하이드록시아세톤 인산을 글리세롤 3-인산으로 환원시키며, 세포질과 미토콘드리아에서 글리세롤 3-인산 셔틀을 통해 NADH를 NAD+로 산화하는 반응을 촉매한다. GPDH는 두 가지 형태로 존재하며, 세포질의 GPD1은 NADH를 사용하여 다이하이드록시아세톤 인산을 글리세롤 3-인산으로 전환하고, 미토콘드리아의 GPD2는 FAD를 보조 인자로 사용하여 글리세롤 3-인산을 다이하이드록시아세톤 인산으로 산화시킨다. GPDH는 pH 변화에 큰 영향을 받지 않지만, 고염 농도에서는 GPD1의 활성이 증가하며, 비만, 브루가다 증후군, 당뇨병과 같은 질병과 관련이 있다.

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글리세롤 3-인산 탈수소효소
효소 정보
EC 번호1.1.1.8
CAS 번호9075-65-4
GO 코드0004367
사람 글리세롤-3-인산 탈수소효소 1의 결정 구조
사람 글리세롤-3-인산 탈수소효소 1의 결정 구조
효소 정보 (퀴논)
EC 번호1.1.5.3
CAS 번호9001-49-4
단백질 군 정보 (N-말단)
심볼NAD_Gly3P_dh_N
이름NAD-의존성 글리세롤-3-인산 탈수소효소 N-말단
아르트로박터 종의 n-(1-D-카복실레틸)-L-노르발린 탈수소효소의 결정 구조
아르트로박터 종의 n-(1-D-카복실레틸)-L-노르발린 탈수소효소의 결정 구조
PfamPF01210
Pfam 클랜CL0063
InterProIPR011128
PROSITEPDOC00740
MEROPS해당 없음
SCOP1m66
TCDB해당 없음
OPM 패밀리해당 없음
OPM 단백질해당 없음
CAZy해당 없음
CDD해당 없음
단백질 군 정보 (C-말단)
심볼NAD_Gly3P_dh_C
이름NAD-의존성 글리세롤-3-인산 탈수소효소 C-말단
아르카에오글로부스 풀기두스의 글리세롤-3-인산 탈수소효소 구조
아르카에오글로부스 풀기두스의 글리세롤-3-인산 탈수소효소 구조
PfamPF07479
Pfam 클랜CL0106
InterProIPR006109
PROSITEPDOC00740
MEROPS해당 없음
SCOP1m66
TCDB해당 없음
OPM 패밀리해당 없음
OPM 단백질해당 없음
CAZy해당 없음
CDD해당 없음

2. 대사 기능

글리세롤 3-인산 탈수소효소(GPDH)는 지질 생합성에서 중요한 역할을 한다. GPDH는 다이하이드록시아세톤 인산을 글리세롤 3-인산으로 환원시켜 글리세롤 3-인산을 글리세롤로 빠르게 탈인산화할 수 있게 한다.[19] 또한 GPDH는 미토콘드리아 내막을 가로질러 산화환원 전위를 유지하는 데 관여한다.[19]

NAD+/NADH 조효소는 물질대사의 산화환원반응에서 전자를 한 반응에서 다른 반응으로 운반하는 저장소 역할을 한다.[21] 이러한 반응의 대부분은 미토콘드리아에서 일어난다. 세포질의 NADH는 추가 사용을 위해 NAD+로 다시 산화되어야 하는데, 미토콘드리아 내막은 NADH와 NAD+에 대해 불투과성이므로 이들은 세포질과 미토콘드리아 기질 사이를 자유롭게 이동할 수 없다.[20]

이러한 환원 당량을 막 사이로 이동시키는 한 가지 방법은 글리세롤 3-인산 셔틀을 이용하는 것이다. 글리세롤 3-인산 셔틀은 두 가지 형태의 GPDH를 사용한다.[20]



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3. 반응

글리세롤 3-인산 탈수소효소는 다이하이드록시아세톤 인산과 글리세롤 3-인산을 상호전환시키는 반응을 촉매한다. 이 효소는 미토콘드리아와 세포질에 각각 다른 형태로 존재하며, 글리세롤 3-인산 셔틀에서 핵심적인 역할을 한다.

세포질의 글리세롤 3-인산 탈수소효소(GPDH-C)는 NADH를 NAD+로 산화시키면서 다이하이드록시아세톤 인산을 글리세롤 3-인산으로 환원시킨다. 미토콘드리아의 글리세롤 3-인산 탈수소효소(GPDH-M)는 FAD를 보조 인자로 사용하여 글리세롤 3-인산을 다시 다이하이드록시아세톤 인산으로 산화시키고, 이 과정에서 퀴논을 퀴놀로 환원시킨다. 이러한 짝지음 반응을 통해 글리세롤 3-인산 셔틀이 작동하며, 결과적으로 ATP 1분자에 해당하는 에너지가 순손실된다.[23]

3. 1. 글리세롤 3-인산 셔틀

NAD+/NADH 조효소 커플은 물질대사의 산화환원반응을 위한 전자 저장소 역할을 하며 한 반응에서 다른 반응으로 전자를 운반한다.[21] 이러한 물질대사 반응의 대부분은 미토콘드리아에서 일어난다. 추가적인 사용을 위해 NAD+를 재생하려면 세포질의 NADH 풀을 재산화해야 한다. 미토콘드리아 내막은 NADH와 NAD+ 모두에 대해 불투과성이므로 이들은 세포질과 미토콘드리아 기질 사이에서 자유롭게 교환될 수 없다.[20]

막을 가로질러 이 환원 당량을 이동시키는 한 가지 방법은 2가지 형태의 글리세롤 3-인산 탈수소효소를 사용하는 글리세롤 3-인산 셔틀을 이용하는 것이다.

  • 세포질의 글리세롤 3-인산 탈수소효소(GPDH) 또는 GPD1은 세포질과 마주하는 미토콘드리아 외막에 국한되어 있으며 다이하이드록시아세톤 인산을 글리세롤 3-인산으로 환원하는 것을 촉매한다.
  • 이와 함께 미토콘드리아의 글리세롤 3-인산 탈수소효소(GPDH) 또는 GPD2는 세포질을 내려다보는 미토콘드리아 내막의 바깥쪽 표면에 묻혀 있으며 글리세롤 3-인산을 다이하이드록시아세톤 인산으로 산화하는 것을 촉매한다.[22]


세포질의 글리세롤 3-인산 탈수소효소(가용성) 및 미토콘드리아의 글리세롤 3-인산 탈수소효소에 의해 촉매되는 반응은 다음과 같다.



미토콘드리아의 글리세롤 3-인산 탈수소효소와 세포질의 글리세롤 3-인산 탈수소효소는 서로 협력하여 작동한다. 세포질의 글리세롤 3-인산 탈수소효소에 의해 NADH는 NAD+로 산화되고 다이하이드록시아세톤 인산이 글리세롤 3-인산으로 전환된다. 일단 글리세롤 3-인산이 미토콘드리아 내막을 통해 이동하면 퀴논을 산화제로 사용하고 FAD를 보조 인자로 사용하는 미토콘드리아의 글리세롤 3-인산 탈수소효소에 의해 다이하이드록시아세톤 인산으로 산화될 수 있다. 결과적으로 ATP 1분자에 필적하는 에너지의 순손실이 일어난다.[23]

이러한 효소의 조합된 작용은 NAD+/NADH 비율을 유지하여 대사의 지속적인 작동을 가능하게 한다.

4. 종류

글리세롤 3-인산 탈수소효소(GPDH)는 글리세롤 3-인산 셔틀을 통해 미토콘드리아 내막을 가로질러 산화환원 전위를 유지하는 데 관여한다.[19]

NAD+/NADH 조효소는 물질대사의 산화환원반응에서 전자를 운반하는 역할을 한다.[21] 미토콘드리아 내막은 NADH와 NAD+에 대해 불투과성이기 때문에, 이들은 글리세롤 3-인산 셔틀을 통해 세포질과 미토콘드리아 기질 사이를 이동한다.[20]

글리세롤 3-인산 셔틀은 두 가지 형태의 글리세롤 3-인산 탈수소효소를 이용한다.[22]



글리세롤 3-인산 탈수소효소에는 다음과 같은 두 가지 형태가 있다.

효소단백질유전자
EC 번호이름공여자/수용체이름세포 내 위치약칭이름기호
1.1.1.8글리세롤 3-인산 탈수소효소NADH / NAD+글리세롤 3-인산 탈수소효소 [NAD+]세포질GPDH-C글리세롤 3-인산 탈수소효소 1 (가용성)GPD1
1.1.5.3글리세롤 3-인산 탈수소효소퀴놀 / 퀴논글리세롤 3-인산 탈수소효소미토콘드리아GPDH-M글리세롤 3-인산 탈수소효소 2 (미토콘드리아)GPD2


4. 1. GPD1 (세포질)

세포질 글리세롤 3-인산 탈수소효소(GPD1)는 다이하이드록시아세톤 인산을 글리세롤 3-인산으로 환원시키는 NAD+ 의존성 효소이다.[24] 이와 동시에 NADH는 NAD+로 산화된다. 이러한 과정을 통해 추가적인 대사를 위해 NAD+가 재생성된다.

세포질의 글리세롤 3-인산 탈수소효소(GPD1)의 반응 메커니즘


GPD1은 두 개의 소단위체로 구성되어 있으며,[25] 다이하이드록시아세톤 인산 및 NAD+와 반응한다.

4. 2. GPD2 (미토콘드리아)

미토콘드리아의 글리세롤 3-인산 탈수소효소(GPD2)는 글리세롤 3-인산을 다이하이드록시아세톤 인산으로 비가역적으로 산화시키는 반응을 촉매하며, 동시에 2개의 전자를 FAD로 전달하여 FADH2를 생성한다.[26] GPD2는 4개의 동일한 소단위체로 구성된다.[26]

미토콘드리아의 글리세롤 3-인산 탈수소효소(GPD2)의 반응 메커니즘

5. 환경 스트레스 반응

글리세롤 3-인산 탈수소효소는 pH 변화에 대해 대부분 영향을 받지 않는다. 특정 pH 조건에서 GPD1이나 GPD2가 선호되지 않는다.[27] 높은 염 농도(예: NaCl)에서 배지의 염도가 증가하면 반응으로 글리세롤이 축적되기 때문에 GPD1의 활성이 GPD2보다 향상된다. 온도의 변화는 GPD1과 GPD2 모두에게 유리한 것으로 보이지 않는다.[27]

6. 질병과의 관련성

글리세롤 3-인산 탈수소효소(GPDH)는 NAD+/NADH 균형 유지 및 지질 대사에 관여하기 때문에 비만이나 브루가다 증후군과 같은 질환과 관련이 있다.[28][29] 또한 미토콘드리아 글리세롤 3-인산 탈수소효소는 제2형 당뇨병의 치료제인 메트포르민에 의해 억제되는 것으로 알려져 있다.[30][14]

6. 1. 비만

NAD+/NADH 퍼텐셜을 유지하는 글리세롤 3-인산 탈수소효소의 기본적인 역할과 지질 대사에서의 역할은 글리세롤 3-인산 탈수소효소를 비만과 같은 지질 불균형 질환의 요인으로 만든다.[28]

글리세롤 3-인산 탈수소효소의 활성 향상, 특히 GPD2는 글리세롤의 생산을 증가시킨다. 글리세롤은 지질 대사의 주요 소단위체이기 때문에 글리세롤이 풍부하면 세포 수준에서 트라이글리세라이드의 축적이 쉽게 증가할 수 있다. 그 결과 지방 조직이 형성되어 비만에 유리한 지방이 축적되는 경향이 있다.[28]

6. 2. 브루가다 증후군

GPDH는 NAD+/NADH의 균형을 유지하는 기본적인 역할과 지질 대사에 관여하는 역할 때문에 브루가다 증후군의 요인이 될 수 있다. GPD1을 암호화하는 유전자의 돌연변이는 전자 전달계의 결함을 유발하는 것으로 입증되었다. 세포 내 NAD+/NADH 수치의 불일치는 심장 나트륨 이온 채널 조절의 결함에 기여하고 영아기에 치명적인 부정맥을 유발할 수 있다고 여겨진다.[13]

6. 3. 당뇨병

미토콘드리아의 글리세롤 3-인산 탈수소효소는 제2형 당뇨병의 1차 치료제인 메트포르민에 의해 억제되는 것으로 생각된다.[30][14]

7. 구조

글리세롤 3-인산 탈수소효소는 두 개의 단백질 도메인으로 구성된다. N-말단 도메인은 NAD 결합 도메인이고, C-말단 도메인은 기질 결합 도메인으로 작용한다.[31] 그러나 글리세롤 3-인산 탈수소효소는 RNA 결합 및 안정성의 조절을 포함하여 여러 달빛(moonlighting) 활성을 나타낼 수 있기 때문에 이량체 및 사량체 계면 잔기는 글리세롤 3-인산 탈수소효소와 RNA의 결합에 관여한다.[32]

참조

[1] 논문 Crystal structures of human glycerol 3-phosphate dehydrogenase 1 (GPD1) 2006-03
[2] 논문 Crystal structures of human glycerol 3-phosphate dehydrogenase 1 (GPD1) 2006-03
[3] 논문 Role of glycerol 3-phosphate dehydrogenase in glyceride metabolism. Effect of diet on enzyme activities in chicken liver 1975-01
[4] 논문 Physiological and genetic engineering of cytosolic redox metabolism in Saccharomyces cerevisiae for improved glycerol production 2006-11
[5] 논문 The two isoenzymes for yeast NAD+-dependent glycerol 3-phosphate dehydrogenase encoded by GPD1 and GPD2 have distinct roles in osmoadaptation and redox regulation 1997-05
[6] 논문 Role of glycerol-3-phosphate dehydrogenase 2 in mouse sperm capacitation 2010-09
[7] 서적 Biochemistry W.H. Freeman
[8] 논문 The influence of obstructive sleep apnea on the expression of glycerol-3-phosphate dehydrogenase 1 gene http://ebm.rsmjourna[...] 2011-05-16
[9] 논문 Competition of electrons to enter the respiratory chain: a new regulatory mechanism of oxidative metabolism in Saccharomyces cerevisiae 2005-02
[10] 논문 Tyrosine phosphoproteome of hamster spermatozoa: role of glycerol-3-phosphate dehydrogenase 2 in sperm capacitation 2009-04
[11] 논문 Differential response of the catalase, superoxide dismutase and glycerol-3-phosphate dehydrogenase to different environmental stresses in Debaryomyces nepalensis NCYC 3413 2011-02
[12] 논문 Attenuating effect of casein glycomacropeptide on proliferation, differentiation, and lipid accumulation of in vitro Sprague-Dawley rat preadipocytes 2011-02
[13] 논문 Molecular and functional characterization of novel glycerol-3-phosphate dehydrogenase 1 like gene (GPD1-L) mutations in sudden infant death syndrome 2007-11
[14] 논문 The target of metformin in type 2 diabetes 2014-10
[15] 논문 A potential target enzyme for trypanocidal drugs revealed by the crystal structure of NAD-dependent glycerol-3-phosphate dehydrogenase from Leishmania mexicana 2000-05
[16] 논문 A dimer interface mutation in glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase regulates its binding to AU-rich RNA 2015-01
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