SARS-CoV-2 세타 변이
1. 개요
SARS-CoV-2 세타 변이는 2021년 1월 필리핀에서 처음 보고된 SARS-CoV-2의 변이 바이러스이다. P.3 계통으로 명명되었으며, 세계 보건 기구(WHO)는 6월 1일 그리스 문자를 사용하여 세타(θ:Theta)로 명명했다. 세타 변이는 스파이크 단백질을 포함하여 14개의 아미노산 치환이 확인되었으며, E484K, N501Y, D614G, P681H 변이 등이 특징이다. 2021년 2월 필리핀에서 처음 발견되었으며, 이후 일본, 영국, 말레이시아 등에서 보고되었다. 2021년 11월 19일 기준, 필리핀에서 가장 많은 확진자가 보고되었으며, 대한민국에서도 2건의 사례가 확인되었다.
| 다른 이름 | VUI-21MAR-02 계통 B.1.1.28.3 필리핀 변이 |
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| 종류 | SARS-CoV-2의 변이 |
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| 확인 | DOH (필리핀 보건부)에서 중앙 비사야스에서 새로운 COVID-19 변이 확인 |
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| 발견 | 일본에서 필리핀발 여행객에게서 새로운 코로나바이러스 변이 발견 |
| 추적 | WHO에서 SARS-CoV-2 변이 추적 |
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SARS-CoV-2 변이주 -
SARS-CoV-2 감마 변이
SARS-CoV-2 감마 변이는 2021년 1월 브라질에서 처음 발견되어 면역 회피 변이와 높은 전염성 및 치사율을 보이며 국제적 우려를 낳았으나, 백신 효과가 다양하게 나타난 후 2022년 3월 WHO에 의해 유행 종식이 선언되었다. -
SARS-CoV-2 변이주 -
SARS-CoV-2 베타 변이
SARS-CoV-2 베타 변이는 남아프리카공화국에서 처음 발견되어 WHO에 의해 명명되었으며, 스파이크 단백질에 여러 돌연변이를 가져 전파력이 높고 백신 효능을 감소시키며 젊은층 감염률이 높았으나, 2022년 3월 이전 유행 변이로 분류되었다.
2. 분류
SARS-CoV-2 세타 변이는 세계 보건 기구(WHO)가 그리스 문자를 사용하여 지정한 명칭이다. 유전학적 계통 분류인 PANGO 계통에서는 P.3으로 분류된다. 이 변이는 필리핀에서 처음 발견되었으며, 고유한 아미노산 변이 조합을 가지고 있다.
2.1. 명명
2021년 1월, 이 계통은 필리핀에서 처음 기록되었으며, 이후 계통 P.3 (lineage P.3)으로 명명되었다.
2021년 3월 17일, 영국 공중 보건국(PHE)은 계통 P.3을 VUI-21MAR-02로 명명했다.
2021년 5월 말, 세계 보건 기구(WHO)는 우려 변이(VOC) 및 주시 변이(VOI)에 그리스 문자를 사용하는 새로운 명명 방침을 도입하였다. 이에 따라 2021년 6월 1일, WHO는 계통 P.3을 세타 (θ:Theta) 변이로 명명했다.
2.2. 변이
세타 변이의 모든 샘플에서 총 14개의 아미노산 치환이 공통적으로 관찰되었다. 여기에는 7개의 스파이크 단백질 변이가 포함된다. 스파이크 단백질 변이 중 E484K, N501Y, D614G, P681H 4개는 이전에 다른 주요 우려 변이에서도 확인된 것들이다. 또한 스파이크 단백질의 C-말단 영역에서 E1092K, H1101Y, V1176F 3개의 추가 치환이 발견되었다. ORF8 유전자에서는 K2Q 아미노산 치환이 모든 샘플에서 공통적으로 나타났다.
한편, 조사된 33개 샘플 중 32개에서는 스파이크 단백질의 141~143번 위치에서 3개의 아미노산(LGV)이 결실된 변이(LGV141_143del)를 포함한 3개의 다른 변이가 추가로 확인되었다. 이 외에도 단백질 서열에는 변화를 주지 않는 5개의 동의 변이(synonymous mutation)도 모든 샘플에서 발견되었다.
3. 역사
세타 변이는 2021년 2월 18일 필리핀 중부 비사야 지역에서 처음으로 그 존재가 확인되었다. 당시 필리핀 보건부는 환자 검체 분석을 통해 E484K와 N501Y 돌연변이를 가진 새로운 변이 바이러스의 등장을 알렸으나, 아직 공식 명칭은 없었다.
이후 이 변이는 국제적으로 확산되었다. 2021년 3월 12일 일본에서 필리핀발 여행객을 통해 처음 발견되었고, 다음 날인 3월 13일 필리핀 보건부는 이 변이를 공식적으로 P.3 계통으로 명명했다. 3월 17일에는 영국에서도 첫 사례가 보고되었으며, 영국 공중 보건청(Public Health England, PHE)은 이를 VUI-21MAR-02로 분류했다. 이어 2021년 4월 30일에는 말레이시아 사라왁 주에서도 P.3 계통 감염 사례가 확인되었다.
3.1. 필리핀
2021년 2월 18일, 필리핀 보건부는 환자 검체를 게놈 염기 서열 분석을 위해 보낸 후 중부 비사야 지역에서 코로나19의 두 가지 변이(E484K와 N501Y)가 검출되었음을 확인했다. 이 변이들은 50개 검체 중 37개에서 발견되었으며, 이 중 29개에서는 두 변이가 함께 나타났다. 당시에는 해당 변이에 대한 공식 명칭이 없었고, 전체 염기서열 정보도 아직 확인되지 않았다.
2021년 3월 12일, 일본은 필리핀에서 온 여행객에게서 이 변이를 발견했다고 발표했다.
2021년 3월 13일, 필리핀 보건부는 이 변이가 새로운 변이로서 계통 P.3으로 지정되었다고 공식 확인했다. 같은 날, 필리핀 내에서 계통 P.1(감마 변이)의 첫 사례도 확인되었다. P.1과 P.3 계통은 동일한 B.1.1.28 계통에서 유래했지만, 보건부는 P.3 계통이 백신 효능과 전염성에 미치는 영향은 아직 밝혀지지 않았다고 덧붙였다.
2021년 3월 17일, 영국에서 첫 2건의 P.3 계통 사례가 확인되었으며, 영국 보건 안전청(PHE)은 이를 VUI-21MAR-02로 명명했다.
2021년 4월 30일, 말레이시아 사라왁 주에서 8건의 계통 P.3 사례가 검출되었다.
3.3. 영국
2021년 3월 17일, 영국에서 첫 번째 2건의 사례가 확인되었다. 영국 공중 보건청(Public Health England, PHE)은 이를 VUI-21MAR-02로 명명했다.