맨위로가기

산화적 탈카복실화

"오늘의AI위키"는 AI 기술로 일관성 있고 체계적인 최신 지식을 제공하는 혁신 플랫폼입니다.
"오늘의AI위키"의 AI를 통해 더욱 풍부하고 폭넓은 지식 경험을 누리세요.

1. 개요

산화적 탈카복실화는 피루브산 탈수소효소 복합체에 의해 촉매되는 반응으로, 일반적인 탈카복실화 반응과 구별된다. 이 반응은 3가지 효소와 5가지 보조 인자를 필요로 하며, 피루브산의 탈카복실화, 아세틸기의 연결, 산화 반응을 포함한다. 산화적 탈카복실화는 해당과정과 시트르산 회로를 연결하는 중요한 과정이며, 피루브산의 아세틸-CoA로의 산화적 탈카복실화를 통해 진행된다. 티아민 피로인산은 산화적 탈카복실화와 비산화적 탈카복실화 모두에서 중요한 역할을 하며, 피루브산 탈수소효소 복합체와 α-케토글루타르산 탈수소효소 복합체는 유사한 구조와 기능을 가진다.

더 읽어볼만한 페이지

  • 치환 반응 - 탈카복실화
    탈카복실화는 유기화학 및 생화학에서 카복실산으로부터 이산화 탄소가 제거되는 반응으로, 유기화학에서는 수소 원자로 치환되며, 생화학에서는 아민 생합성 등 다양한 생체 반응에 관여한다.
  • 치환 반응 - 친전자성 방향족 치환
    친전자성 방향족 치환은 방향족 고리의 수소 원자가 친전자체로 치환되는 유기 반응으로, 아레니움 이온 중간체를 거쳐 진행되며, 벤젠 고리의 치환기는 반응 속도와 치환 위치에 영향을 미쳐 다양한 화학 제품 생산에 활용된다.
산화적 탈카복실화

2. 산화적 탈카복실화와 단순 탈카복실화의 비교

피루브산 탈수소효소 복합체에 의해 촉매되는 산화적 탈카복실화는 일반적인 탈카복실화(단순 탈카복실화)와는 다르다. 산화적 탈카복실화는 3가지 효소(피루브산 탈수소효소(E1), 다이하이드로리포일 아세틸기전이효소(E2), 다이하이드로리포일 탈수소효소(E3))와 5가지 보조 인자(티아민 피로인산(TPP), 리포산, 조효소 A(CoA), 플라빈 아데닌 다이뉴클레오타이드(FAD), 니코틴아마이드 아데닌 다이뉴클레오타이드(NAD+))를 필요로 한다. 반면, 일반적인 탈카복실화는 피루브산 탈카복실화효소티아민 피로인산(TPP)만을 필요로 한다.[9][2]

산화적 탈카복실화에서는 피루브산이 탈카복실화된 후 아세틸-CoA가 생성되는 반면, 단순 탈카복실화에서는 아세트알데하이드가 생성된다. 또한, 산화적 탈카복실화는 산화 반응을 포함하는 반면, 단순 탈카복실화는 산화 반응을 포함하지 않는다.

2. 1. 산화적 탈카복실화

피루브산 탈수소효소 복합체에 의해 촉매되는 반응은 일반적인 탈카복실화 반응과 다른 특별한 탈카복실화 반응인 산화적 탈카복실화를 사용한다.[9]

산화적 탈카복실화 반응은 피루브산 탈수소효소(E1), 다이하이드로리포일 아세틸기전이효소(E2), 다이하이드로리포일 탈수소효소(E3)의 3가지 효소와 티아민 피로인산(TPP), 리포산, 조효소 A(CoA), 플라빈 아데닌 다이뉴클레오타이드(FAD), 니코틴아마이드 아데닌 다이뉴클레오타이드(NAD+)의 5가지 보조 인자를 포함하는 피루브산 탈수소효소 복합체에 의해 촉매된다.[9]

반응 중에 피루브산 탈수소효소(E1)는 피루브산의 탈카복실화에 참여하고, 반응 후에 티아민 피로인산(TPP)은 아세틸기를 연결한다. 아세틸기의 카보닐기는 티아민 피로인산(TPP)의 티아졸 고리에 있는 탄소 음이온의 카보닐기와 반응하여 하이드록시에틸기를 생성한다. 그런 다음 다이하이드로리포일 아세틸기전이효소(E2)의 촉매 작용으로 티아민 피로인산(TPP)은 하이드록시에틸기를 리포아마이드로 보내고, 이는 아세틸기로 재산화되어 싸이오에스터 결합을 생성한다. 이때 화합물은 아세틸 다이하이드로리포아마이드이며 다이하이드로리포일 아세틸기전이효소(E2)에 의해 촉매되고 아세틸기가 전달되어 아세틸-CoA를 형성한다.

위의 모든 반응은 탈카복실화 반응만 포함하고 수소(H)의 이동은 포함하지 않지만 피루브산 탈수소효소 복합체의 실제적인 탈수소화 효과는 반응의 다음 단계에 반영된다. 아세틸기가 없는 아세틸 다이하이드로리포아마이드는 소실된다. 즉, 다이하이드로리포아마이드가 다시 반응에 참여하려면 리포아마이드로 재산화되어야 한다. 이때 다이하이드로리포일 탈수소효소(E3)는 촉매 반응에 참여해야 하며 다이하이드로리포아마이드로부터 제거된 수소는 FAD로 전달되어 FADH2를 생성하고, FADH2는 NAD+와 반응하여 NADH와 H+를 생성한다.

정리하면, 산화적 탈카복실화 반응에는 산화 반응과 탈카복실화 반응이 모두 존재한다.

2. 2. 단순 탈카복실화

일반적인 탈카복실화 반응에서 이 반응에 관여하는 효소는 피루브산 탈카복실화효소이며, 이는 산화적 탈카복실화와 다르다. 반응 과정에서 피루브산티아민 피로인산(TPP)의 티아졸 고리와 직접적으로 결합하며, 결합 후 피루브산의 카복실기가 제거되어 이산화 탄소가 생성된다. 그런 다음 티아민 피로인산(TPP)으로부터 하이드록시에틸기가 분리되어 아세트알데하이드가 생성된다.[9][2]

3. 해당과정과 시트르산 회로의 연결

호기성 조건에서 해당과정의 산물인 피루브산은 대사 분기점이다. 해당과정에서 시트르산 회로까지의 호기성 대사의 중심 경로를 따르는 단계로서 피루브산의 다양한 운명을 고려한 관점이 제시되고 있다. 또한 생화학에서 일반적인 카복실화탈카복실화 반응의 더 넓은 맥락을 고려해야 한다.[10]

피루브산의 가장 중요한 운명은 아세틸-CoA로의 산화적 탈카복실화이다. 이 반응은 피루브산 탈수소효소 복합체라는 효소 소단위체들의 매우 큰 집합체에 의해 촉매된다. 이 거대한 초분자 집합체에는 3가지 다른 유형의 소단위체가 여러 개 포함되어 있다. 이들 소단위체는 전체 반응의 다양한 단계들을 촉매한다. 피루브산 탈수소효소 복합체 작동의 핵심은 주요 촉매 보조 인자인 티아민 피로인산(TPP)이다.[10]

탄소 음이온 중간생성물의 형성

4. 티아민(Thiamine)의 생화학

티아민 피로인산(TPP)은 α-케토산의 비산화적 및 산화적 탈카복실화를 촉매하는 효소에 사용되는 주요 촉매 보조 인자이다. 예를 들어, 피루브산은 티아민 피로인산(TPP)과 관련된 두 가지 유형의 탈카복실화를 겪는다. 발효를 하는 생물에서 피루브산은 TPP 의존성 효소인 피루브산 탈카복실화효소에 의해 비산화적으로 탈카복실화된다. 피루브산 탈수소효소 복합체의 일부로서 티아민 피로인산은 피루브산의 산화적 탈카복실화를 돕는다. 티아민 피로인산(TPP)은 진정한 촉매 보조 인자이다. 모든 반응에 공통된 기계론적인 특징에서 티아민 피로인산은 활성화된 알데하이드 부분의 운반체이다. 티아민 피로인산의 티아졸 고리의 2번 탄소(C2)에 부착된 수소는 비정상적으로 낮은 pKa를 나타낸다. 티아민의 결핍은 각기병의 원인이 된다.

5. 피루브산 탈수소효소 복합체 (PDH complex)



피루브산의 산화 및 시트르산 회로


호기성 조건에서 해당과정의 산물인 피루브산은 대사 분기점이다. 해당과정에서 시트르산 회로까지 이어지는 호기성 대사의 중심 경로에서 피루브산의 다양한 운명을 고려해야 한다. 또한 생화학에서 일반적인 카복실화탈카복실화 반응도 함께 고려해야 한다.

피루브산의 가장 중요한 운명은 아세틸-CoA로의 산화적 탈카복실화이다. 이 반응은 피루브산 탈수소효소 복합체라는 매우 큰 효소 소단위체 집합체에 의해 촉매된다. 이 거대한 초분자 집합체에는 3가지 유형의 소단위체가 여러 개 포함되어 있으며, 이들은 전체 반응의 다양한 단계를 촉매한다. 피루브산 탈수소효소 복합체 작동의 핵심은 주요 촉매 보조 인자인 티아민 피로인산(TPP)이다.[10]

산화적 대사는 피루브산의 추가적인 이화작용을 수반한다. 피루브산 탈수소효소 복합체는 피루브산으로부터 아세틸-CoA를 생성하는 산화적 탈카복실화 과정을 수행한다.

왼쪽부터 시작하여, 티아졸 고리의 비정상적으로 산성인 C2로부터 H+가 떨어져 나가면서 생성된 탄소 음이온인 TPP 보조 인자의 티아졸리움 형태는 피루브산의 카보닐 탄소를 공격하여 그림 상단에 표시된 화합물을 형성한다. 이 화합물은 쉽게 탈카복실화(카복실기가 떨어져 나감)를 겪을 수 있으며, 생성물인 하이드록시에틸 TPP는 공명에 의해 안정화된다. 다음 단계는 티아민 피로인산(TPP)의 하이드록시에틸 부분을 리포아마이드 보조 인자의 산화된 형태로 전달하는 것이다. 하이드록시에틸기는 전자가 풍부하여 리포아마이드와의 반응에서 카복실기 수준으로 산화되는 반면, 리포아마이드는 환원된다. 이 반응은 두 단계로 나눌 수 있다. 첫 번째 단계에서는 티아민 피로인산(TPP)에 부착된 하이드록시에틸기의 전자가 풍부한 탄소 원자가 강한 친핵체로서 산화된 리포아마이드의 분자 내 이황화물의 상대적으로 전자가 부족한 황 원자 중 하나를 공격한다. 그 결과 헤미 싸이오케탈 형태의 중간생성물이 생성된다. 다음 단계에서 티아민 피로인산(TPP)이 이탈기로 떨어져 나가면서 결합으로부터 하이드록시에틸기로 전자를 가져가고, 하이드록시에틸은 효소 유래 염기의 도움을 받아 O-H 결합으로부터 전자를 모집하여 생성된 수소 이온을 받아들인다. 이 두 단계의 결과는 싸이오에스터 아세틸 리포아마이드의 생성 및 보조 인자인 티아민 피로인산(TPP)의 재생이다. 이러한 모든 반응은 피루브산 탈수소효소(E1)에 의해 촉매된다.

피루브산 탈수소효소 복합체의 나머지 화학적 과정은 그림 하단에 표시되어 있다. 아세틸기는 다이하이드로리포일 아세틸기전이효소(E2)의 활성에 의해 환원된 리포아마이드로부터 조효소 A(CoA)로 전달된다. 이것은 하나의 싸이오에스터가 다른 싸이오에스터로 등가에너지적으로 전환되는 것이다. 유리된 다이하이드로리포아마이드(리포아마이드의 환원형)는 다시 산화되어야 하며, 이는 다이하이드로리포일 탈수소효소(E3)의 활성에 의해 달성된다. 다이하이드로리포일 탈수소효소(E3)의 보조 인자는 단단히 결합된 플라빈 아데닌 다이뉴클레오타이드(FAD)이다. 다이하이드로리포아마이드의 전자는 FAD를 통해 NAD+로 전달되어 NADH를 생성한다.

5. 1. 구성 요소

피루브산 탈수소효소 복합체피루브산의 산화적 탈카복실화 반응을 촉매하여 아세틸-CoA를 생성하는 다중효소 복합체이다. 이 복합체는 해당과정시트르산 회로를 연결하는 중요한 역할을 한다.

피루브산 탈수소효소 복합체는 세 가지 효소와 다섯 가지 보조 인자로 구성된다.[12][13][14]

피루브산 탈수소효소 복합체의 구성 요소
효소보조 인자



E1티아민 피로인산(TPP)을 보조 인자로 사용하여 피루브산을 탈카복실화하고, E2리포산조효소 A(CoA)를, E3플라빈 아데닌 다이뉴클레오타이드(FAD)와 니코틴아마이드 아데닌 다이뉴클레오타이드(NAD+)를 보조 인자로 사용한다.

5. 2. 반응 단계

피루브산 탈수소효소 복합체해당과정시트르산 회로 사이를 연결하며, 피루브산의 산화적 탈카복실화 반응을 촉매하여 아세틸-CoA를 생성한다. 이 과정에는 3가지 효소(피루브산 탈수소효소(E1), 다이하이드로리포일 아세틸기전이효소(E2), 다이하이드로리포일 탈수소효소(E3))와 5가지 보조 인자(티아민 피로인산(TPP), 리포산, 조효소 A(CoA), 플라빈 아데닌 다이뉴클레오타이드(FAD), 니코틴아마이드 아데닌 다이뉴클레오타이드(NAD+))가 필요하다.[12][13][14]

피루브산 탈수소효소 복합체의 반응 단계는 다음과 같다.

# '''탈카복실화''' (E1): 피루브산티아민 피로인산(TPP)과 반응하여 탈카복실화되고, 하이드록시에틸-TPP가 형성된다.

# '''산화''' : 하이드록시에틸기가 리포아마이드로 전달되어 아세틸기로 산화되고, 리포아마이드는 환원된다.

# '''아세틸기 전달''': 아세틸기가 환원된 리포아마이드에서 CoA로 전달되어 아세틸-CoA가 생성된다.

# '''다이하이드로리포아마이드의 산화''' (E3): 환원된 다이하이드로리포아마이드가 플라빈 아데닌 다이뉴클레오타이드(FAD)와 니코틴아마이드 아데닌 다이뉴클레오타이드(NAD+)에 의해 다시 리포아마이드로 산화된다.

이 과정을 통해 생성된 아세틸-CoA는 시트르산 회로로 들어가 추가적인 에너지 생산에 사용된다.

α-케토글루타르산 탈수소효소 복합체는 시트르산 회로에서 유사한 반응을 수행하며, E3는 피루브산 탈수소효소 복합체와 동일하고, E1은 기질 특이성이 다르며, E2는 석시닐기전이효소이다.

참조

[1] 서적 Organic reaction mechanism Chemical Industry Press
[2] 서적 Organic Chemistry 7th Edition
[3] 서적 Biochemistry
[4] 서적 Fundamentals of Biochemistry
[5] 논문 The biochemistry of the pyruvate dehydrogenase complex 2003
[6] 서적 A Mechanistic Approach Oxford University Press
[7] 서적 The Organic Chemistry of Enzyme-Catalyzed Reactions Academic Press
[8] 서적 Organic reaction mechanism Chemical Industry Press
[9] 서적 Organic Chemistry 7th Edition
[10] 서적 Biochemistry
[11] 서적 Fundamentals of Biochemistry
[12] 논문 The biochemistry of the pyruvate dehydrogenase complex 2003
[13] 서적 A Mechanistic Approach Oxford University Press
[14] 서적 The Organic Chemistry of Enzyme-Catalyzed Reactions Academic Press



본 사이트는 AI가 위키백과와 뉴스 기사,정부 간행물,학술 논문등을 바탕으로 정보를 가공하여 제공하는 백과사전형 서비스입니다.
모든 문서는 AI에 의해 자동 생성되며, CC BY-SA 4.0 라이선스에 따라 이용할 수 있습니다.
하지만, 위키백과나 뉴스 기사 자체에 오류, 부정확한 정보, 또는 가짜 뉴스가 포함될 수 있으며, AI는 이러한 내용을 완벽하게 걸러내지 못할 수 있습니다.
따라서 제공되는 정보에 일부 오류나 편향이 있을 수 있으므로, 중요한 정보는 반드시 다른 출처를 통해 교차 검증하시기 바랍니다.

문의하기 : help@durumis.com