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엔올레이스

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1. 개요

엔올레이스는 엔올레이스 슈퍼패밀리에 속하는 효소로, 2-포스포글리세르산을 포스포엔올피루브산으로 전환하는 반응을 촉매한다. 사람에게는 α, β, γ의 세 가지 소단위체가 존재하며, 이들의 조합으로 αα, αβ, αγ, ββ, γγ의 5가지 동질효소가 형성된다. 이 효소는 구조적으로 두 개의 도메인과 활성 부위를 가지며, 뇌종양, 심근 경색, 뇌졸중 등의 진단 지표로 활용될 수 있고, 저해제를 통해 암과 전염병 치료 연구에 활용된다.

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엔올레이스
효소 정보
이름포스포피루브산 히드라타제
EC 번호4.2.1.11
CAS 번호9014-08-8
GO 코드0004634
효모 에놀레이스 이합체
효모 에놀레이스 이합체
단백질 패밀리 정보
심볼Enolase_N
이름에놀레이스, N-말단 도메인
바닷가재 에놀레이스의 X선 구조 및 촉매 메커니즘
바닷가재 에놀레이스의 X선 구조 및 촉매 메커니즘
PfamPF03952
Pfam 클랜CL0227
InterProIPR020811
스마트해당 없음
PROSITEPDOC00148
MEROPS해당 없음
SCOP1els
TCDB해당 없음
OPM 패밀리해당 없음
OPM 단백질해당 없음
CAZy해당 없음
CDD해당 없음
Pfam 박스
심볼Enolase
이름에놀레이스
PfamPF00113
InterProIPR000941
PROSITEPDOC00148
PDB1e9i
1ebg
1ebh
1els
1iyx
1l8p
1nel
1oep
1one
1p43
이합체 베타 인간 에놀레이스 ENO3의 결정 구조
이합체 베타 인간 에놀레이스 ENO3의 결정 구조
일반 정보
EC 번호4.2.1.11
CAS 번호9014-08-8
GO 코드0004634
설명해당과정에 관여하는 효소
다른 이름2-phospho-D-glycerate hydro-lyase (phosphoenolpyruvate-forming)
phosphopyruvate hydratase
관련 연구Multifunctional alpha-enolase: its role in diseases
Purification and properties of enolase of human erythrocytes
Über die enzymatische umwandlung von phosphoglyzerinsäure in brenztraubensäure und phosphorsäure
유전자 정보
심볼해당 없음
대체 심볼해당 없음
HGNC ID해당 없음
염색체해당 없음
q
11
유전자좌 추가 정보해당 없음
OMIM해당 없음
Entrez 유전자해당 없음
RefSeq해당 없음
UniProt해당 없음
PDB해당 없음

2. 동질효소

사람에게는 α(알파), β(베타), γ(감마)의 3가지 엔올레이스 소단위체가 있으며, 이들은 각각 별개의 유전자에 의해 암호화된다. 이 소단위체들은 서로 조합되어 αα, αβ, αγ, ββ, γγ의 5가지 동질효소를 형성한다.[42][45] 이들 중 αα, ββ, γγ의 3가지 동종이량체는 사람의 성인 세포에서 일반적으로 발견된다.

2. 1. αα (알파-엔올레이스, 비뉴런 엔올레이스, 엔올레이스 1)

αα 또는 비뉴런 엔올레이스는 엔올레이스 1이라고도 한다. 엔올레이스 1은 , , 콩팥, 지라, 지방 조직을 포함한 다양한 조직에서 발견된다. 엔올레이스 1은 모든 정상적인 사람 세포에 어느 정도 존재한다.[42][45]

2. 2. ββ (베타-엔올레이스, 근육 특이적 엔올레이스, 엔올레이스 3)

ββ 또는 근육 특이적 엔올레이스는 엔올레이스 3이라고도 한다. 엔올레이스 3은 분포 장소가 근육으로 크게 제한되며, 근육에 매우 높은 수준으로 존재한다.[42][45]

2. 3. γγ (감마-엔올레이스, 뉴런 특이적 엔올레이스, 엔올레이스 2)

γγ (감마-엔올레이스, 뉴런 특이적 엔올레이스, 엔올레이스 2)는 뉴런 및 신경 조직에서 매우 높은 수준으로 발현되며, 총 가용성 단백질의 3%를 차지할 수 있다.[42][45] 대부분의 포유류 세포에서는 훨씬 낮은 수준으로 발현된다.

동일한 세포에 존재할 때, 서로 다른 동질효소들은 이종이량체를 쉽게 형성한다.

3. 구조

엔올레이스는 엔올레이스 슈퍼패밀리에 속하는 효소이다. 분자량은 동질효소의 종류에 따라 82,000~100,000 Da이다.[42][43] 활성 부위에는 2개의 Mg2+ 보조 인자가 있으며, 이는 기질의 음전하를 안정화시킨다.[42][45]

최근에는 플라스미노겐과의 상호작용과 같은 엔올레이스의 문라이팅(moonlighting) 기능이 효소의 촉매 루프 및 구조적 다양성과 관련하여 주목받고 있다.[46][47]

3. 1. 소단위체 구조

사람의 알파-엔올레이스에서 2개의 소단위체는 역평행으로 배열되어, 한 소단위체의 Glu20이 다른 소단위체의 Arg414이온 결합을 형성한다.[42] 각 소단위체는 N-말단 도메인과 C-말단 도메인의 두 개의 도메인으로 구성된다. N-말단 도메인은 3개의 α-나선 및 4개의 β-시트로 구성되어 있다.[42][45] C-말단 도메인은 2개의 β-시트로 시작하고 이어서 2개의 α-나선으로 이어지며, β-시트가 α-나선으로 둘러싸이도록 배열된 β-시트와 α-나선이 번갈아가며 구성된 배럴로 끝난다.[42][45] 효소의 조밀하고 구형인 구조는 이들 두 도메인 사이의 상당한 소수성 상호작용에 기인한다.

3. 2. 4차 구조

엔올레이스는 커다란 엔올레이스 슈퍼패밀리의 일원이다. 엔올레이스의 분자량은 동질효소의 종류에 따라 82,000~100,000 Da이다.[42][43] 사람의 알파 엔올레이스에서, 2개의 소단위체는 역평행 방향으로 배열되어 한 소단위체의 Glu20이 다른 소단위체의 Arg414이온 결합을 형성한다.[42] 각각의 소단위체는 두 개의 별개 도메인을 갖는다. 더 작은 N-말단 도메인은 3개의 α-나선 및 4개의 β-시트로 구성되어 있다.[42][45] 더 큰 C 말단 도메인은 2개의 β-시트로 시작하고 이어서 2개의 α-나선으로 이어지며, β-시트가 α-나선으로 둘러싸이도록 배열된 β-시트와 α-나선이 번갈아가며 구성된 배럴로 끝난다.[42][45] 효소의 조밀하고 구형인 구조는 이들 두 도메인 사이의 상당한 소수성 상호작용에 기인한다.

3. 3. 활성 부위

엔올레이스는 활성에 특히 중요한 5개의 잔기를 가지고 있는 고도로 보존된 효소이다. 활성 부위에는 2개의 Mg2+ 보조 인자가 존재하며, 이는 기질의 음전하를 안정화시키는 역할을 한다.[42][45] 야생형 엔올레이스와 비교했을 때, Glu168, Glu211, Lys345 또는 Lys396 잔기에서의 돌연변이는 엔올레이스의 활성 수준을 크게 감소시킨다.[42] 또한, His159에 영향을 미치는 돌연변이는 원래 촉매 활성의 0.01%만 가지게 된다.[42]

4. 메커니즘

엔올레이스는 2-포스포글리세르산(2-PG)을 포스포엔올피루브산(PEP)으로 전환하는 반응을 촉매한다. 이 반응은 카르보음이온 중간생성물을 포함하는 E1cB-제거 반응으로 제안된다.[48]

4. 1. 반응 단계

엔올레이스에 의해 2-포스포글리세르산이 포스포엔올피루브산으로 전환되는 메커니즘.


동위원소 탐침을 사용한 2-포스포글리세르산포스포엔올피루브산으로의 전환 반응의 전체적인 메커니즘은 카르보음이온 중간생성물을 포함하는 E1cB-제거 반응으로 제안된다.[48] 자세한 메커니즘은 효소의 결정 구조 및 효소 반응 속도론에 대한 연구를 기반으로 한다.[42][49][50][51][52][53][54]

2-포스포글리세르산이 α-엔올레이스에 결합할 때, 2-포스포글리세르산의 카복실기는 효소의 활성 부위에서 2개의 마그네슘 이온 보조 인자에 위치하게 된다. 이는 알파 수소의 산성도를 증가시키면서 탈양성자화된 산소의 음전하를 안정화시킨다. 엔올레이스의 Lys345는 알파 수소를 탈양성자화시키고, 생성된 음전하는 카복실산 산소에 대한 공명 및 마그네슘 이온 보조 인자에 의해 안정화된다. 탄소 음이온 중간생성물의 생성에 이어 C3 상의 수산화물은 Glu211의 도움으로 물로 제거되고, 포스포엔올피루브산이 생성된다.

또한, 촉매 작용을 돕는 효소 내에서 입체구조의 변화가 일어난다. 사람의 α-엔올레이스에서, 기질을 2개의 촉매 마그네슘 이온, Gln167 및 Lys396과의 상호작용으로 인해 효소에 결합할 때 위치로 회전한다. 루프의 이동으로 인해 Ser36에서 His43으로, Ser158에서 Gly162로, Asp255에서 Asn256으로 이동하면 Ser39는 Mg2+와 조정하여 활성 부위를 폐쇄할 수 있다. 촉매 마그네슘 이온과의 배위에 더하여, His159에 의한 포스포릴기의 양성자화 및 Arg374에의 근접성으로 인해 기질의 알파 수소의 pKa가 낮아진다. Arg374는 또한 활성 부위의 Lys345가 탈양성자화되도록 하여, 메커니즘에서의 역할을 대비하기 위해 Lys345를 준비시킨다.

4. 2. 입체구조 변화

엔올레이스는 촉매 작용을 돕기 위해 효소 내에서 입체구조의 변화를 일으킨다. 사람의 α-엔올레이스에서, 기질은 두 개의 촉매 마그네슘 이온, Gln167, 및 Lys396과의 상호 작용으로 인해 효소에 결합되면 제자리로 회전한다. Ser36에서 His43, Ser158에서 Gly162, Asp255에서 Asn256으로의 루프 이동을 통해 Ser39가 Mg2+와 배위 결합하고 활성 부위를 닫을 수 있다.[42][49][50][51][52][53][54]

촉매 마그네슘 이온과의 배위 결합 외에도, 기질의 알파 수소의 pKa는 His159에 의한 인산기 양성자화와 Arg374와의 근접성으로 인해 감소한다. Arg374는 또한 활성 부위의 Lys345가 탈양성자화되도록 하여, Lys345가 메커니즘에서 그 역할을 수행할 수 있도록 한다.[42][49][50][51][52][53][54]

5. 진단용

최근 의료 실험에서 엔올레이스 농도는 특정 질병과 그 심각성을 진단하는데 사용되었다. 뇌척수액에서 높은 농도의 엔올레이스는 별아교세포종과 강한 상관관계를 보였고,[55] 뇌척수액 엔올레이스 수치가 높은 환자일수록 종양 성장 속도가 빨랐다. 심근 경색 또는 뇌졸중을 겪은 환자에게서도 엔올레이스 수치가 증가했다.[56] α-엔올레이스에 대한 자가항체는 하시모토 뇌병증과 관련이 있다.[58]

5. 1. 뇌척수액 엔올레이스

최근 의료 실험에서 뇌척수액 내 엔올레이스 농도가 높으면 알돌레이스, 피루브산 키네이스, 크레아틴 키네이스, 젖산 탈수소효소 등 다른 효소보다 저등급 별아교세포종과 더 강한 상관관계를 보였다.[55] 같은 연구에서 뇌척수액 엔올레이스 수치가 가장 높은 환자에게서 종양 성장 속도가 가장 빠른 것으로 나타났다.[55] 심근 경색이나 뇌졸중을 겪은 환자에게서도 엔올레이스 수치가 증가했다.[56] 뇌척수액 뉴런-특이적 엔올레이스, 혈청 뉴런-특이적 엔올레이스, 크레아틴 키네이스(BB형) 수치는 심정지 환자의 예후 평가 지표로 확인되었다.[56] 다른 연구에서는 뇌혈관 사고 환자의 뉴런-특이적 엔올레이스 수치의 예후 값을 중점적으로 다루었다.[57]

5. 2. 혈청 엔올레이스

최근 의료 실험에서 심근 경색 또는 뇌졸중을 겪은 환자에게서 엔올레이스 수치가 증가하는 경향이 확인되었다.[55] 뇌척수액 뉴런-특이적 엔올레이스(NSE), 혈청 NSE 및 크레아틴 키네이스(BB형) 수치는 심정지 환자의 예후 평가 지표로 사용될 수 있다.[56] 다른 연구에서는 뇌혈관 사고 환자의 NSE 수치가 예후를 예측하는 데 유용할 수 있다고 밝혔다.[57]

5. 3. 자가항체

α-엔올레이스에 대한 자가항체는 하시모토 뇌병증 및 류마티스 관절염과 관련이 있다.[58][20][19]

6. 저해제

엔올레이스 저해제는 효소의 촉매 메커니즘을 연구하고, 암과 같은 질병의 치료제를 개발하는 데 사용된다.[59][60]

최근 활성 부위 전이 상태 유사 엔올레이스 억제제가 다양한 미생물 병원체 치료 및 ENO1 유전자 결손(1p36 동형 접합 결손) 종양에 대한 정밀 종양학 분야에서 전임상적으로 연구되고 있다.[31][35][36][37][38][39][40]

SF2312의 유도체인 HEX와 이의 전구약물(프로드럭)인 POMHEX는 전임상 두개 내 정위 마우스 모델에서 ENO1 결손 신경교종에 대한 항종양 활성을 보였다.[31]

6. 1. 작용 기전

대부분의 엔올레이스 저해제는 금속 킬레이트 특성을 가지며, 마그네슘 이온과의 상호작용을 통해 효소에 결합한다.[61][62] 이들 중 가장 강력한 것은 포스포아세토하이드록사메이트이며,[62] 양성자화되지 않은 형태로 효소에 대한 pM 친화도를 갖는다. 포스포노아세토하이드록사메이트는 2-포스포글리세르산과 포스포엔올피루브산 사이에서 추정되는 촉매 중간생성물과 구조적으로 유사하다.

플루오린화물은 엔올레이스의 기질2-포스포글리세르산과 엔올레이스의 활성 부위를 두고 경쟁하는 것으로 알려져 있다. 플루오린화물은 마그네슘 및 인산과 복합체를 형성할 수 있으며, 이는 2-포스포글리세르산 대신에 엔올레이스의 활성 부위에 결합할 수 있다.[43]

6. 2. 주요 저해제

엔올레이스의 저분자 저해제는 효소의 촉매 메커니즘을 연구하기 위한 화학적 탐침(기질 유사체)으로 합성되었으며, 최근에는 암과 전염병의 잠재적 치료제로 연구되고 있다.[59][60] 대부분의 저해제는 금속 킬레이트 특성을 가지며, 마그네슘과의 상호작용으로 효소와 결합한다.[61][62]

  • 포스포노아세토하이드록사메이트: 가장 강력한 저해제 중 하나로, 양성자화되지 않은 형태로 효소에 대한 pM 친화도를 갖는다.[62] 2-포스포글리세르산과 포스포엔올피루브산 사이에서 추정되는 촉매 중간생성물과 구조적으로 유사하다. 트리파노소마 치료제[63] 및 항암제[64]로 연구되고 있다. 특히 교모세포종과 같이 ENO1 유전자의 동형 접합 결실(합성치사)로 인해 엔올레이스가 결핍된 경우에 사용하려는 시도가 있었다.
  • SF2312: 포스폰산 항생제로, 그람 양성 및 음성 세균에 대해 활성을 가지며, 특히 혐기성 조건에서 엔올레이스를 강력하게 저해한다.[65][66] 포스포노아세토하이드록사메이트와 유사한 방식으로 결합한다. 진핵생물 및 원핵생물 기원의 엔올레이스 활성을 모두 억제한다.[29] SF2312의 3S-에난티오머만 엔올레이스 억제 활성 및 생물학적 활성을 나타낸다.[30]
  • ENOblock: 알로스테릭 결합제로, 처음에는 엔올레이스 저해제로 알려졌으나, 실제로는 효소 분석을 방해하는 것으로 밝혀졌다.[67] 이후 세포 및 동물 조직에서 엔올레이스 활성을 저해하는 것으로 확인되었다.[69]
  • 메틸글리옥살: 사람 엔올레이스의 저해제로 알려져 있다.[70]
  • 플루오린화물: 2-포스포글리세르산과 경쟁적으로 엔올레이스 활성 부위에 결합하여 효소 활성을 저해한다.[43] 플루오린화물은 마그네슘 및 인산과 복합체를 형성하여 2-포스포글리세르산 대신 결합한다. 세균의 엔올레이스를 억제하여 충치 예방 효과를 나타낼 수 있다.[71]

7. 슈퍼패밀리

엔올레이스는 엔올레이스 슈퍼패밀리의 대표적인 구성원이다. 이 슈퍼패밀리에는 만델산 라세미레이스 등 유사한 반응 메커니즘을 가지지만 다양한 기질에 작용하는 진화적으로 관련된 효소들이 포함된다.

참조

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