분석법
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1. 개요
분석법은 시료의 특성을 파악하기 위한 일련의 과정을 의미하며, 어원은 시도하다는 뜻의 고대 프랑스어에서 유래되었다. 분석법은 사전 분석, 분석, 사후 분석 단계를 거치며, 측정 시간 및 횟수, 검출된 분석물의 수, 결과 유형, 샘플 유형 및 방법, 신호 증폭, 탐지 방법 및 기술에 따라 다양한 유형으로 분류된다. DNA, 단백질, RNA, 세포, 환경 오염 물질, 약물 등 다양한 대상을 측정하며, 신뢰도 및 품질 관리를 통해 분석 결과의 정확성과 유용성을 확보한다. 바이오 분석 데이터베이스는 분석법의 생물 활성 결과와 프로토콜 데이터를 제공한다.
화폐 분석에서는 금이나 은, 동전의 진정한 가치를 나타내기 위해 사용된 귀금속 성분의 순도 분석을 의미한다. 이는 14세기 이후 일반적인 분석의 의미로 확장되었을 가능성이 있다. 예를 들어, 혼합물 안에 포함된 표적의 중요하거나 주요한 성분을 분석하는 경우가 있는데, 약리학적 약제 처방에서 불활성 부형제(첨가제)에 포함된 의약품의 유효 성분을 생물에 대한 실제 작용(치사량이나 억제량)으로 측정하는 것이 이에 해당한다.
분석은 사전 분석, 분석, 사후 분석 단계로 이루어진다.[27] 각 단계별 주요 내용은 다음과 같다.
2. 역사
2. 1. 어원
영어 "Assay"는 "시도하다, 노력하다"라는 뜻의 앵글로-프랑스어 "assaier"에서 유래되었으며, 이는 다시 고대 프랑스어 "essai" (시도)에서 파생되었다.[3][15] 14세기 중반부터 "품질 테스트, 성격 테스트"를 의미하는 명사로 사용되었고, 금속의 순도 테스트라는 의미는 14세기 후반부터 사용되었다.
3. 일반적인 단계
각 단계에서 발생할 수 있는 오류를 최소화하고, 정확하고 신뢰성 있는 결과를 얻기 위한 노력이 필요하다.
4. 분석 유형
분석은 측정 시간 및 횟수, 검출된 분석물 수, 결과 유형, 샘플 유형 및 방법, 신호 증폭 여부, 탐지 방법 및 기술 등 다양한 기준에 따라 분류할 수 있다.
측정되는 분석물의 수에 따라 단순 분석과 다중 분석법으로 나뉜다. 단순 분석은 하나의 분석물만을 측정하는 반면, 다중 분석은 여러 분석물을 동시에 측정하여 면역학, 유전학, 약동학 등 다양한 분야에서 효율적인 샘플 검사를 가능하게 한다.[7]
결과 유형에 따라서는 정성 분석법, 반정량 분석법, 정량 분석법, 기능 분석법으로 나뉜다.[1] 정성 분석법은 합격/불합격, 양성/음성처럼 정확한 양이 아닌 정성적인 등급을, 반정량 분석법은 1+~4+와 같이 대략적인 척도로 나타낸다. 정량 분석법은 VWF 항원 분석법처럼 정확한 수치로 측정하며, 기능 분석법은 리스토세틴 보조인자 분석법과 같이 활성 물질의 양과 기능을 함께 측정한다.
샘플 유형 및 방법에 따라서는 생물학적 분석, 리간드 결합 분석, 면역 분석법 등으로 분류된다. 생물학적 분석은 생체 내/외 실험과 같이 살아있는 유기체의 활동을 이용한다. 리간드 결합 분석은 리간드가 수용체에 결합하는 정도를, 면역 분석법은 항원-항체 반응을 이용한다.
신호 증폭 여부에 따라 효소 분석, 광 검출 시스템, 방사성 동위원소 표지, 중합 효소 연쇄 반응 분석 등으로 나뉜다. 효소 분석은 효소 작용으로 인한 변화를, 광 검출 시스템은 빛 증폭을, 방사성 동위원소 표지는 방사성 동위원소를 이용해 검출하며, 중합 효소 연쇄 반응 분석은 DNA/RNA 표적 자체를 증폭시킨다.
탐지 방법 및 기술에 따라 집락 형성, 광도법/분광 광도법, 투과율, 탁도법, 네펠로법, 반사 측정법, 점탄성 측정, 계수 분석, 이미지 분석, 전기적 검출, 기타 물리적 특성 기반 분석 등으로 분류 가능하다.
4. 1. 측정 시간 및 횟수
분석은 단일 시점을 보는지 또는 여러 시점에서 측정을 하는지에 따라 다음과 같이 분류할 수 있다.- '''종말점 분석법'''은 고정된 배양 기간 후에 단일 측정을 수행하는 분석법이다.[6]
- '''동역학적 분석법'''은 고정된 시간 간격 동안 여러 번 측정을 수행하는 분석법이다. 동역학적 분석법의 결과는 수치적으로 (예: 시간 경과에 따른 신호 변화율을 나타내는 기울기 매개변수) 또는 그래프로 (예: 각 시간 지점에서 측정된 신호의 그래프) 시각화될 수 있다. 동역학적 분석법의 경우, 시간에 따른 측정된 반응의 크기와 형태 모두 중요한 정보를 제공한다.[6]
- '''고속 처리 분석법'''은 일반적으로 96, 384 또는 1536웰 마이크로플레이트 형식('''고속 처리량 스크리닝''')의 자동화된 플랫폼에서 수행되는 종점 분석법 또는 동역학적 분석법일 수 있다. 이러한 분석법은 다수의 화합물 또는 분석물을 테스트하거나, 자극 및/또는 테스트 중인 화합물에 대한 반응으로 기능적 생물학적 판독값을 얻을 수 있다.[6]
4. 2. 검출된 분석물 수
일반적인 분석은 다중 분석이라고 명시되지 않는 한, 기본값인 단순 또는 단일 표적 분석이다.[29]측정되는 표적 또는 분석물의 수에 따라 다음과 같이 나뉜다.
# 단순 분석(Simplex assay): 하나의 분석물을 측정한다.
# 다중 분석법(Multiplex assay): 여러 분석물을 동시에 측정한다. 다중 분석의 출현으로 면역학, 세포 화학, 유전학/유전체학, 약동학, 독성학 등 많은 분야에서 빠르고 효율적인 샘플 검사가 가능해졌다.[7]
4. 3. 결과 유형
분석법은 생성되는 결과의 품질에 따라 다음과 같이 분류할 수 있다.- '''정성 분석법'''[1]: 일반적으로 합격 또는 불합격, 양성 또는 음성과 같이 정확한 양이 아닌 소수의 정성적 등급만 제공하는 분석법이다.
- '''반정량 분석법'''[1]: 물질의 양을 정확한 숫자가 아닌 대략적인 방식으로 나타내는 분석법이다. 예를 들어 1+에서 4+까지의 척도로 점수를 매기는 경우가 있다. 이는 혈액형 검사에서 혈액형 시약(혈액형 항원에 대한 항체)에 대한 반응으로 응집된 적혈구(RBC)를 기반으로 사용된다.[1]
- '''정량 분석법'''[1]: 시료 내 물질의 양을 정확하고 정확한 수치로 측정하는 분석법이다. 폰빌레브란트병에 사용되는 응고 검사의 예시로, VWF 항원 분석법은 면역 분석법으로 혈액 시료에 존재하는 VWF의 양을 측정한다.[1]
- '''기능 분석법'''[1]: 활성 물질의 양뿐만 아니라 그 기능을 정량화하려는 분석법이다. VWF 항원 분석법의 기능적 대응물은 리스토세틴 보조인자 분석법으로, 외인성 포름알데히드-고정 혈소판을 첨가하고 리스토세틴이라는 약물의 양을 점차 증가시키면서 고정된 혈소판의 응집을 측정하여 환자의 혈장에 존재하는 VWF의 기능적 활성을 측정한다.[1] 리스토세틴 유도 혈소판 응집 (RIPA)는 리스토세틴 및 VWF에 대한 환자의 내인성 살아있는 혈소판의 반응을 테스트한다.[1]
4. 4. 샘플 유형 및 방법
'''생물학적 분석(Bioassay)'''은 살아있는 유기체의 생물학적 활동을 이용하는 분석법이다. 다음과 같은 예시가 있다.- 생체 내(in vivo) 실험: 쥐와 같이 살아있는 동물 전체에 약물 등을 투여하여 반응을 관찰한다.
- 생체 외(ex vivo) 실험: 개구리 다리, 개 심장, 장의 일부 등과 같이 생체에서 분리된 신체 부위, 기관, 조직 등을 이용하여 반응을 관찰한다.
- 세포(예: 혈소판)를 이용한 실험
- 조직(예: 말발굽 게 용해물)을 이용한 실험
'''리간드 결합 분석(Ligand binding assay)'''은 리간드(주로 작은 분자)가 수용체(주로 큰 단백질)에 결합하는 정도를 측정하는 분석법이다.
'''면역 분석법'''은 항원-항체 반응을 이용하는 분석법이다.
4. 5. 신호 증폭
- '''효소 분석''': 효소는 여러 기질에 대해 반복적으로 작용하여 기질이 줄어들거나 생성물이 만들어질 때 나타나는 색, 특정 파장이나 빛의 흡광도, 전기화학발광, 전기/산화 환원 활성 등의 변화를 측정하여 분석할 수 있다.
- '''광 검출 시스템''': 광다이오드, 광전자 증배관, 냉각 전하 결합 소자 등을 사용해 빛을 증폭시켜 측정한다.
- '''방사성 동위원소 표지''': 방사면역 측정법 및 평형 투석 분석법에 사용되며, 감마 계수기, X선 필름, 광자극 발광 장치에서 증폭을 통해 검출할 수 있다.
- '''중합 효소 연쇄 반응 분석''': DNA (또는 RNA) 표적 자체를 증폭시킨다.
- '''조합 방법''': 감도를 높이기 위해 위에서 언급된 방법들과 다른 증폭 방법을 함께 사용한다. 예를 들어 효소 결합 면역 분석법 (EIA), 효소 결합 면역 흡착 분석법 등이 있다.
4. 6. 탐지 방법 및 기술
- 광도법/분광 광도법: 액체 시험 시료의 큐벳을 통해 고정된 경로 길이의 빛을 통과시키면서 특정 파장의 빛의 흡광도를 측정하고, 그 흡광도를 블랭크 및 표준물질과 비교하여 목표 화합물의 등급을 매긴다. 방출된 빛이 특정 가시광선 파장인 경우 이를 비색법이라고 한다. 레이저를 사용하여 매우 특정한 파장의 광학 필터를 통해 감지되는 다른 특정 파장의 형광 신호를 방출하는 방식을 사용할 수 있다.
- 투과율: 빛의 투과율은 혈소판 응집 반응 동안 덩어리 수 감소로 인해 부유 입자에 의해 생성된 액체의 불투명도를 측정하는 데 사용될 수 있다.
- 탁도법: 액체 샘플을 통과하는 직선 투과광의 불투명도가 광원을 가로질러 직선으로 배치된 검출기로 측정된다.
- 점탄성 측정: 점도계, 탄성조영술(예: 혈전탄성조영술) 등이 있다.
- 계수 분석: 광학 Flow cytometric 셀 또는 입자 계수기 또는 coulter/임피던스 원리 기반 세포 계수기 등이 있다.
- 이미지 분석:
- 세포 계측법: 세포의 크기 통계가 이미지 프로세서에 의해 평가된다.
- 전기적 검출: 전류 측정법, 전압 전류법, 전위차 측정법과 관련된 많은 유형의 정량적 측정에 직접 또는 간접적으로 사용될 수 있다.
5. 측정 대상
분석법에서 측정 대상은 다음과 같다.
- '''DNA''': DNase 발자국 분석, 필터 결합 분석, 젤 이동 분석
- '''단백질''': 바이신코닌산 분석법(BCA 분석법), 브래드포드 단백질 분석법, 로우리가 단백질 분석법[9], 분비 분석법
- '''RNA''': 핵 전사체 분석, 리보솜 프로파일링
- '''세포''': 세포 계수 분석은 살아있는 세포, 죽은 세포, 또는 세포 유형 비율(예: 백혈구와 적혈구 수)을 측정한다. 측정 방법에는 광 투과, 전류 변화(물리적 방법), 세포 구조 및 생리학 탐구(생화학적 방법, 염색) 등이 있다. 세포 배양 모니터링(세포 증식 또는 세포 독성 분석)에도 활용된다.
세포 독성 분석은 화학 화합물의 독성을 측정한다.
- MTT 분석, 세포 계수 키트-8 (WST-8 기반), SRB (설포로다민 B) 분석, CellTiter-Glo® 발광 세포 생존능력 분석
- 세포 계수 기기 및 방법: CASY 세포 계수 기술, 콜터 계수기, 전기 세포-기질 임피던스 감지
- 세포 생존능력 분석: 레사주린 방법, ATP 검사, 에티듐 호미머 이량체 분석(죽거나 죽어가는 세포 검출), 세균학적 물 분석, 집락 형성 분석 등
- '''환경 및 식품 오염 물질''': 비스페놀 F는 환경 오염 물질 중 하나이며, 수생 독성 시험을 통해 연구된다.
- '''계면활성제''': MBAS 분석법은 물 속의 음이온성 계면활성제를 검출하는 데 사용되며, 푸른색 반응을 통해 확인한다.
- '''기타 세포 분석''':
- 루시퍼라제, 셀렌테라진 등을 사용한 칼슘 신호 분석[1]
- 현미경을 이용한 세포 면역 염색법(면역조직화학 또는 형광), ELISpot을 포함한 광도계에 의한 마이크로플레이트 상의 광도법, 유세포 분석[1]
- DNA 마이크로어레이, 생체 내 혼성화, PCR, 계산 유전체학 및 형질 감염과 결합된 분자 생물학 기술; 세포 분획 또는 면역 침전법[1]
- 이동 분석, 주화성 분석[1]
- 분비 분석[1]
- DNA 사다리 형성 분석, 니콜레티 분석 등 세포 사멸 분석[1]
- 화학 감수성 분석은 암 약물에 의해 사멸되는 종양 세포의 수를 측정한다.[1]
- 테트라머 분석은 항원 특이적 T 세포를 감지한다.[1]
- 겐타마이신 보호 분석은 병원체(박테리아)가 진핵 세포에 침입하는 능력을 평가한다.[1]
- 전이 분석[1]
- '''석유화학''': 원유 분석은 원유의 화학적 조성을 평가한다.
- '''바이러스학''':
- HPCE 기반 바이러스 역가 분석법은 바큘로바이러스의 역가를 측정한다.
- 트로파일 분석법은 HIV 트로피즘을 결정한다.
- 바이러스 플라크 분석법은 샘플에 존재하는 바이러스의 수를 계산한다.
- '''세포 분비물''': ELISA 기술을 사용하여 특정 항체 또는 사이토카인을 검출할 수 있다. ELISPOT 분석을 통해 특정 물질을 분비하는 세포의 수를 확인할 수 있다.[1]
- '''약물''': 불법 약물 검사, 방사성 리간드 결합 분석, 도핑 검사
5. 1. DNA
단백질-DNA 상호작용을 연구하는 분석법에는 다음이 포함된다.- DNase 발자국 분석
- 필터 결합 분석
- 젤 이동 분석
5. 2. 단백질
바이신코닌산 분석법(BCA 분석법), 브래드포드 단백질 분석법, 로우리가 단백질 분석법[9], 분비 분석법, Bicinchoninic acid assay|비신코닌산 분석법영어 (BCA 분석법), 로우리법 단백질 분석법[21] 등이 있다.5. 3. RNA
- 핵 전사체 분석
- 리보솜 프로파일링
- Nuclear run-on|핵 런온 분석영어
- Ribosome profiling|리보솜 프로파일링 분석영어
5. 4. 세포
세포 계수 분석은 살아있는 세포의 수, 죽은 세포의 수 또는 한 세포 유형과 다른 세포 유형의 비율을 결정할 수 있다. 예를 들어 서로 다른 유형의 백혈구에 대한 적혈구의 수를 세고 유형을 분류하는 것이다. 이는 다양한 물리적 방법(광 투과, 전류 변화)으로 측정된다. 그러나 다른 방법은 세포 구조 또는 생리학을 생화학적으로 탐구한다(염색). 또 다른 응용 분야는 세포 배양을 모니터링하는 것이다 (세포 증식 또는 세포 독성#세포 독성 측정 분석).세포 독성 분석은 화학 화합물이 세포에 얼마나 독성이 있는지 측정한다.
- MTT 분석
- 세포 계수 키트-8(WST-8 기반 세포 생존능력 분석)
- SRB (설포로다민 B) 분석
- CellTiter-Glo® 발광 세포 생존능력 분석
- 세포 계수 기기 및 방법: CASY 세포 계수 기술, 콜터 계수기, 전기 세포-기질 임피던스 감지
- 세포 생존능력 분석: 레사주린 방법, ATP 검사, 에티듐 호미머 이량체 분석 (죽거나 죽어가는 세포 검출), 세균학적 물 분석, 집락 형성 분석 등
5. 5. 환경 및 식품 오염 물질
비스페놀 F는 환경 오염 물질 중 하나이며, 수생 독성 시험을 통해 그 영향이 연구되고 있다.5. 6. 계면활성제
MBAS 분석법은 물 속의 음이온성 계면활성제를 검출하는 데 사용되는 방법으로, 푸른색 반응을 통해 이를 확인할 수 있다. MBAS assay|메틸렌블루 활성 물질 분석영어(MBAS)는 물 속의 음이온 계면활성제가 있을 때 나타나는 발색 반응을 말한다.5. 7. 기타 세포 분석
- 루시퍼라제, 셀렌테라진, CFSE 또는 칼세인을 사용한 칼슘 신호 분석을 이용한 리포터 분석[1]
- 현미경을 이용한 슬라이드 상의 세포 면역 염색법(면역조직화학 또는 형광), ELISpot (및 변종 FluoroSpot)을 포함한 광도계에 의한 마이크로플레이트 상의 광도법 (B세포 또는 항원 특이적 세포를 열거), 유세포 분석에 의한 용액 분석[1]
- DNA 마이크로어레이, 생체 내 혼성화, PCR, 계산 유전체학 및 형질 감염과 결합된 분자 생물학 기술; 세포 분획 또는 면역 침전법[1]
- 이동 분석, 주화성 분석[1]
- 분비 분석[1]
- DNA 사다리 형성 분석, 니콜레티 분석, 카스파제 활성 분석, Annexin V 염색과 같은 세포 사멸 분석[1]
- 화학 감수성 분석은 암 약물에 의해 사멸되는 종양 세포의 수를 측정한다.[1]
- 테트라머 분석은 항원 특이적 T 세포의 존재를 감지한다.[1]
- 겐타마이신 보호 분석 또는 생존 분석 또는 침입 분석은 병원체(박테리아)가 진핵 세포에 침입하는 능력을 평가한다.[1]
- 전이 분석[1]
5. 8. 석유화학
원유 분석은 원유의 화학적 조성을 평가하는 과정이다.5. 9. 바이러스학
HPCE 기반 바이러스 역가 분석법은 자체 개발한 고성능 모세관 전기영동 시스템을 사용하여 바큘로바이러스의 역가를 측정한다.트로파일 분석법은 HIV 트로피즘을 결정하는 데 사용된다.
바이러스 플라크 분석법은 샘플에 존재하는 바이러스의 수를 계산하는 데 사용된다. 이 기술에서는 바이러스 접종제에 의해 형성된 바이러스 플라크 수를 세어 실제 바이러스 농도를 결정할 수 있다.
5. 10. 세포 분비물
다양한 세포 분비물(예: 특정 항체 또는 사이토카인)은 ELISA 기술을 사용하여 검출할 수 있다. 특정 물질을 분비하는 세포의 수는 관련된 기술인 ELISPOT 분석을 사용하여 확인할 수 있다.[1]5. 11. 약물
- 불법 약물 검사
- 방사성 리간드 결합 분석
- 도핑 검사
6. 신뢰도 및 품질 관리
여러 분석법이 동일한 대상을 측정할 때, 그 결과와 유용성은 분석법의 특성, 방법론, 신뢰도 등에 따라 비교될 수도 있고 그렇지 않을 수도 있다. 이러한 비교는 분석법의 일반적인 품질 속성 연구를 통해 이루어진다.
다음은 분석법 비교 시 고려해야 할 요소들이다.
요소 | 설명 |
---|---|
측정 원리 | 식별, 증폭, 검출 방법을 포함한다. |
검출의 동적 범위 | 일반적으로 표준 곡선의 선형성 범위를 의미한다. |
분석 감도 | |
기능 감도 | |
분석 특이성 | |
양성 예측도 | |
음성 예측도 | |
처리 시간 | 사전 분석 단계부터 사후 분석 단계(보고서 발송/전송) 완료까지 걸리는 총 시간이다. |
처리량 | 단위 시간당 수행되는 분석 수 (일반적으로 시간당) |
의료 진단 및 예후, 환경 분석, 법의학 절차, 제약 연구 개발 등 전문적인 목적으로 분석을 수행하는 기관이나 실험실은 잘 규제된 품질 보증 절차를 거쳐야 한다.
또한, 관련 규제 기관의 적절한 인증을 문서화하여 분석의 신뢰성을 확립해야 한다. 이는 특히 분석 결과의 품질에 대해 법적으로 허용되고, 책임을 유지하며, 고객이 분석을 상업적/전문적으로 사용하도록 설득하는 데 중요하다.
7. 바이오 분석 데이터베이스
생물 활성 데이터베이스는 문헌, 특허 및 스크리닝 프로그램에서 얻은 생물 검정법의 생물 활성 결과와 구조 또는 기타 화학 정보를 연관시킨다.
이름 | 개발자 | 최초 출시 |
---|---|---|
ScrubChem | 제이슨 브렛 해리스 | 2016[10] |
PubChem-BioAssay | NIH(미국 국립 보건원) | 2004[11] |
ChEMBL | EMBL-EBI | 2009 |
프로토콜 데이터베이스는 바이오어세이의 결과를 실험 조건이나 프로토콜 설계에 관한 메타데이터와 연결한다.
이름 | 개발자 | 최초 출시 |
---|---|---|
BioMetaData 또는 BioAssayExpress | Collaborative Drug Discovery | 2016[24] |
PubChem-BioAssay | NIH (미국 국립 보건원) | 2004 |
8. 관련 항목
참조
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Multiplexed Assays in the Life Sciences
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간행물
Nephelometry
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